MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52003	NC_012668	TGA	2	6	2724214	2724219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52004	NC_012668	TCT	2	6	2724252	2724257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608537
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52006	NC_012668	GGT	2	6	2724450	2724455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608537
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52008	NC_012668	GTTT	2	8	2724543	2724550	0 %	75 %	25 %	0 %	229608537
52009	NC_012668	GAA	2	6	2724565	2724570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608537
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52118	NC_012668	CAA	2	6	2730490	2730495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608542
52119	NC_012668	GCG	2	6	2730516	2730521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608542
52120	NC_012668	CAG	2	6	2730569	2730574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608542
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52122	NC_012668	TCTT	2	8	2730670	2730677	0 %	75 %	0 %	25 %	229608542
52123	NC_012668	CCG	2	6	2730709	2730714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608542
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52125	NC_012668	GTT	2	6	2730822	2730827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608542
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52148	NC_012668	TTG	2	6	2732033	2732038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52149	NC_012668	T	7	7	2732128	2732134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52152	NC_012668	TGA	2	6	2732263	2732268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608543
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52222	NC_012668	TGG	2	6	2735375	2735380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608546
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52224	NC_012668	CGCAG	2	10	2735533	2735542	20 %	0 %	40 %	40 %	229608546
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52227	NC_012668	CGA	2	6	2735732	2735737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608546
52228	NC_012668	TGA	2	6	2735738	2735743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608546
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52237	NC_012668	GAA	2	6	2736277	2736282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608546
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52352	NC_012668	TCT	2	6	2742331	2742336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608554
52353	NC_012668	ACC	2	6	2742359	2742364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608554
52354	NC_012668	CAGA	2	8	2742394	2742401	50 %	0 %	25 %	25 %	229608554
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52356	NC_012668	AGA	2	6	2742560	2742565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608554
52357	NC_012668	CTT	2	6	2742592	2742597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608554
52358	NC_012668	TCTT	2	8	2742645	2742652	0 %	75 %	0 %	25 %	229608554
52359	NC_012668	CAC	2	6	2742697	2742702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608554
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52364	NC_012668	CTG	2	6	2742970	2742975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608554
52365	NC_012668	TTC	2	6	2743011	2743016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608554
52366	NC_012668	TTC	2	6	2743020	2743025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608554
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52377	NC_012668	A	7	7	2743542	2743548	100 %	0 %	0 %	0 %	229608555
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52379	NC_012668	GCTTC	2	10	2743612	2743621	0 %	40 %	20 %	40 %	229608555
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52445	NC_012668	T	6	6	2747092	2747097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52459	NC_012668	CTTTT	2	10	2747630	2747639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52460	NC_012668	T	7	7	2747636	2747642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52469	NC_012668	CCA	2	6	2748265	2748270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608561
52470	NC_012668	CA	3	6	2748293	2748298	50 %	0 %	0 %	50 %	229608561
52471	NC_012668	AAC	2	6	2748307	2748312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608561
52472	NC_012668	CAT	2	6	2748340	2748345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608561
52473	NC_012668	TCTGC	2	10	2748361	2748370	0 %	40 %	20 %	40 %	229608561
52474	NC_012668	C	6	6	2748463	2748468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52475	NC_012668	CACAA	2	10	2748492	2748501	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
52476	NC_012668	CAAA	2	8	2748543	2748550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52477	NC_012668	A	6	6	2748598	2748603	100 %	0 %	0 %	0 %	229608562
52478	NC_012668	A	6	6	2748647	2748652	100 %	0 %	0 %	0 %	229608562
52479	NC_012668	CAT	2	6	2748802	2748807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608562
52480	NC_012668	GCA	2	6	2748814	2748819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608562
52481	NC_012668	GCT	2	6	2748862	2748867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608562
52482	NC_012668	CGC	2	6	2748875	2748880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608562
52483	NC_012668	TCGT	2	8	2748952	2748959	0 %	50 %	25 %	25 %	229608562
52484	NC_012668	TCAAAA	2	12	2748963	2748974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	229608562
52485	NC_012668	GAAA	2	8	2749021	2749028	75 %	0 %	25 %	0 %	229608562
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52487	NC_012668	A	7	7	2749226	2749232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52488	NC_012668	ACG	2	6	2749242	2749247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52489	NC_012668	AGC	2	6	2749261	2749266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52490	NC_012668	TCC	2	6	2749289	2749294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52491	NC_012668	GGT	2	6	2749428	2749433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52492	NC_012668	GTA	2	6	2749457	2749462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52493	NC_012668	C	6	6	2749498	2749503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52494	NC_012668	CCA	2	6	2749508	2749513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52495	NC_012668	T	6	6	2749544	2749549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52496	NC_012668	TA	3	6	2749552	2749557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52497	NC_012668	A	6	6	2749566	2749571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52498	NC_012668	AGC	2	6	2749612	2749617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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