MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_012668	AC	3	6	2670783	2670788	50 %	0 %	0 %	50 %	229608487
51003	NC_012668	AAT	2	6	2670827	2670832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608487
51004	NC_012668	GCA	2	6	2670876	2670881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608487
51005	NC_012668	TCGC	2	8	2670912	2670919	0 %	25 %	25 %	50 %	229608487
51006	NC_012668	CGC	2	6	2670928	2670933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608487
51007	NC_012668	GAC	2	6	2670943	2670948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608487
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51028	NC_012668	GAA	3	9	2671720	2671728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51034	NC_012668	ATAC	2	8	2671844	2671851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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51053	NC_012668	T	6	6	2673123	2673128	0 %	100 %	0 %	0 %	229608489
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51119	NC_012668	CTCAAG	2	12	2676953	2676964	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229608492
51120	NC_012668	T	8	8	2677021	2677028	0 %	100 %	0 %	0 %	229608492
51121	NC_012668	GCT	2	6	2677030	2677035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608492
51122	NC_012668	CGCA	2	8	2677097	2677104	25 %	0 %	25 %	50 %	229608492
51123	NC_012668	TG	3	6	2677398	2677403	0 %	50 %	50 %	0 %	229608493
51124	NC_012668	CCA	2	6	2677415	2677420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608493
51125	NC_012668	CA	3	6	2677441	2677446	50 %	0 %	0 %	50 %	229608493
51126	NC_012668	GACT	2	8	2677526	2677533	25 %	25 %	25 %	25 %	229608493
51127	NC_012668	GCG	2	6	2677597	2677602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608493
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51129	NC_012668	AACG	2	8	2677668	2677675	50 %	0 %	25 %	25 %	229608494
51130	NC_012668	TAA	2	6	2677847	2677852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608494
51131	NC_012668	AAT	2	6	2677897	2677902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608494
51132	NC_012668	AAT	2	6	2678435	2678440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608494
51133	NC_012668	AGA	2	6	2678463	2678468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608494
51134	NC_012668	AACCAA	2	12	2678528	2678539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608494
51135	NC_012668	GATAA	2	10	2678558	2678567	60 %	20 %	20 %	0 %	229608494
51136	NC_012668	GCCA	2	8	2678631	2678638	25 %	0 %	25 %	50 %	229608494
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51138	NC_012668	ATA	2	6	2678692	2678697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608494
51139	NC_012668	A	6	6	2678799	2678804	100 %	0 %	0 %	0 %	229608494
51140	NC_012668	ATC	2	6	2678838	2678843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608494
51141	NC_012668	CAC	2	6	2678921	2678926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608495
51142	NC_012668	ACA	2	6	2678943	2678948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608495
51143	NC_012668	CAG	2	6	2679034	2679039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608495
51144	NC_012668	CCAT	2	8	2679062	2679069	25 %	25 %	0 %	50 %	229608495
51145	NC_012668	TAA	2	6	2679105	2679110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608495
51146	NC_012668	AG	3	6	2679112	2679117	50 %	0 %	50 %	0 %	229608495
51147	NC_012668	CACT	2	8	2679132	2679139	25 %	25 %	0 %	50 %	229608495
51148	NC_012668	ATTG	2	8	2679174	2679181	25 %	50 %	25 %	0 %	229608495
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51152	NC_012668	AG	3	6	2679507	2679512	50 %	0 %	50 %	0 %	229608495
51153	NC_012668	GCA	2	6	2679569	2679574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608495
51154	NC_012668	TCAT	2	8	2679587	2679594	25 %	50 %	0 %	25 %	229608495
51155	NC_012668	CAA	2	6	2679597	2679602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608495
51156	NC_012668	ATAA	2	8	2679611	2679618	75 %	25 %	0 %	0 %	229608495
51157	NC_012668	CGAT	2	8	2679620	2679627	25 %	25 %	25 %	25 %	229608495
51158	NC_012668	AAGC	2	8	2679678	2679685	50 %	0 %	25 %	25 %	229608495
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51162	NC_012668	CAATT	2	10	2679959	2679968	40 %	40 %	0 %	20 %	229608495
51163	NC_012668	ATAA	3	12	2679973	2679984	75 %	25 %	0 %	0 %	229608495
51164	NC_012668	CAATAA	2	12	2679993	2680004	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	229608495
51165	NC_012668	GAT	2	6	2680021	2680026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608495
51166	NC_012668	CAG	2	6	2680030	2680035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608495
51167	NC_012668	GCAC	2	8	2680127	2680134	25 %	0 %	25 %	50 %	229608495
51168	NC_012668	CAC	2	6	2680144	2680149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608495
51169	NC_012668	AC	3	6	2680164	2680169	50 %	0 %	0 %	50 %	229608495
51170	NC_012668	GA	4	8	2680182	2680189	50 %	0 %	50 %	0 %	229608495
51171	NC_012668	CTGA	2	8	2680380	2680387	25 %	25 %	25 %	25 %	229608496
51172	NC_012668	ATC	2	6	2680399	2680404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608496
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51174	NC_012668	ACC	2	6	2680429	2680434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608496
51175	NC_012668	TTGC	2	8	2680451	2680458	0 %	50 %	25 %	25 %	229608496
51176	NC_012668	TAAT	2	8	2680487	2680494	50 %	50 %	0 %	0 %	229608496
51177	NC_012668	CGC	2	6	2680503	2680508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608496
51178	NC_012668	CAT	2	6	2680509	2680514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608496
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51181	NC_012668	TGT	2	6	2680582	2680587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608496
51182	NC_012668	TGC	2	6	2680657	2680662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608496
51183	NC_012668	TAA	2	6	2680672	2680677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608496
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51185	NC_012668	CAT	2	6	2681079	2681084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608496
51186	NC_012668	TGAGA	2	10	2681093	2681102	40 %	20 %	40 %	0 %	229608496
51187	NC_012668	ATA	2	6	2681159	2681164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608496
51188	NC_012668	CAC	2	6	2681211	2681216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608496
51189	NC_012668	TTG	2	6	2681263	2681268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608496
51190	NC_012668	CAC	2	6	2681354	2681359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608496
51191	NC_012668	C	6	6	2681372	2681377	0 %	0 %	0 %	100 %	229608496
51192	NC_012668	AG	3	6	2681388	2681393	50 %	0 %	50 %	0 %	229608496
51193	NC_012668	ACTT	2	8	2681422	2681429	25 %	50 %	0 %	25 %	229608497
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51196	NC_012668	TAC	2	6	2681836	2681841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608497
51197	NC_012668	AGT	2	6	2681883	2681888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608497
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51200	NC_012668	CCG	2	6	2682024	2682029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608498
51201	NC_012668	GC	4	8	2682081	2682088	0 %	0 %	50 %	50 %	229608498
51202	NC_012668	CAA	2	6	2682160	2682165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608498
51203	NC_012668	ATC	2	6	2682226	2682231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608498
51204	NC_012668	GCAA	2	8	2682259	2682266	50 %	0 %	25 %	25 %	229608498
51205	NC_012668	CAT	2	6	2682330	2682335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608498
51206	NC_012668	TTG	2	6	2682506	2682511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608498
51207	NC_012668	AG	3	6	2682520	2682525	50 %	0 %	50 %	0 %	229608498
51208	NC_012668	CCG	2	6	2682585	2682590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608498
51209	NC_012668	CCA	2	6	2682674	2682679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608498
51210	NC_012668	AC	3	6	2682726	2682731	50 %	0 %	0 %	50 %	229608498
51211	NC_012668	CT	3	6	2682854	2682859	0 %	50 %	0 %	50 %	229608498
51212	NC_012668	ACC	2	6	2682863	2682868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608498
51213	NC_012668	GCC	2	6	2682905	2682910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608498
51214	NC_012668	CCA	2	6	2682969	2682974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608498
51215	NC_012668	TTG	2	6	2683082	2683087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608498
51216	NC_012668	GCT	2	6	2683154	2683159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608498
51217	NC_012668	TTA	2	6	2683199	2683204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608498
51218	NC_012668	TGA	2	6	2683221	2683226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51219	NC_012668	TG	3	6	2683285	2683290	0 %	50 %	50 %	0 %	229608499
51220	NC_012668	GTCA	2	8	2683319	2683326	25 %	25 %	25 %	25 %	229608499
51221	NC_012668	GTA	2	6	2683327	2683332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608499
51222	NC_012668	TGT	2	6	2683353	2683358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608499
51223	NC_012668	TGGT	2	8	2683359	2683366	0 %	50 %	50 %	0 %	229608499
51224	NC_012668	CTT	2	6	2683459	2683464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608499
51225	NC_012668	GCC	2	6	2683469	2683474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608499
51226	NC_012668	AGTC	2	8	2683477	2683484	25 %	25 %	25 %	25 %	229608499
51227	NC_012668	TG	3	6	2683492	2683497	0 %	50 %	50 %	0 %	229608499
51228	NC_012668	CTG	2	6	2683529	2683534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608499
51229	NC_012668	TCAA	2	8	2683539	2683546	50 %	25 %	0 %	25 %	229608499
51230	NC_012668	TGC	2	6	2683638	2683643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608499
51231	NC_012668	CCA	3	9	2683683	2683691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608499
51232	NC_012668	CGG	2	6	2683701	2683706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608499
51233	NC_012668	CT	3	6	2683758	2683763	0 %	50 %	0 %	50 %	229608499
51234	NC_012668	CAA	2	6	2683811	2683816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608499
51235	NC_012668	ATCA	2	8	2683820	2683827	50 %	25 %	0 %	25 %	229608499
51236	NC_012668	GCA	2	6	2683873	2683878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608499
51237	NC_012668	ATA	2	6	2684021	2684026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608499
51238	NC_012668	GCA	2	6	2684040	2684045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608499
51239	NC_012668	ACT	2	6	2684093	2684098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608499
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51348	NC_012668	A	7	7	2689931	2689937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51349	NC_012668	AG	4	8	2689946	2689953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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51352	NC_012668	TAT	2	6	2690126	2690131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51353	NC_012668	TTGA	2	8	2690149	2690156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51354	NC_012668	GAAAA	2	10	2690194	2690203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51355	NC_012668	CCA	2	6	2690290	2690295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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