MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012668	TCA	2	6	229426	229431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606328
4502	NC_012668	ATA	2	6	229468	229473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606328
4503	NC_012668	CGA	2	6	229519	229524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606328
4504	NC_012668	GCG	2	6	229602	229607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606328
4505	NC_012668	CTT	2	6	229643	229648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606328
4506	NC_012668	AG	3	6	229651	229656	50 %	0 %	50 %	0 %	229606328
4507	NC_012668	GC	3	6	229841	229846	0 %	0 %	50 %	50 %	229606328
4508	NC_012668	TCG	2	6	229882	229887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606328
4509	NC_012668	CTT	2	6	229895	229900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606328
4510	NC_012668	AACA	2	8	229956	229963	75 %	0 %	0 %	25 %	229606328
4511	NC_012668	GA	3	6	229999	230004	50 %	0 %	50 %	0 %	229606328
4512	NC_012668	GGC	2	6	230067	230072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606328
4513	NC_012668	ACC	2	6	230100	230105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606328
4514	NC_012668	AG	3	6	230166	230171	50 %	0 %	50 %	0 %	229606328
4515	NC_012668	TCA	2	6	230269	230274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606328
4516	NC_012668	TGTC	2	8	230346	230353	0 %	50 %	25 %	25 %	229606328
4517	NC_012668	ATC	2	6	230395	230400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606328
4518	NC_012668	GC	3	6	230521	230526	0 %	0 %	50 %	50 %	229606328
4519	NC_012668	CAA	2	6	230546	230551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606328
4520	NC_012668	GGTT	2	8	230615	230622	0 %	50 %	50 %	0 %	229606328
4521	NC_012668	TAA	2	6	230834	230839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606328
4522	NC_012668	ACC	2	6	230961	230966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606328
4523	NC_012668	ATCA	2	8	230967	230974	50 %	25 %	0 %	25 %	229606328
4524	NC_012668	GTT	2	6	230984	230989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606328
4525	NC_012668	GTT	2	6	231005	231010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606328
4526	NC_012668	CTT	2	6	231017	231022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606328
4527	NC_012668	CA	3	6	231068	231073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_012668	TGA	2	6	231148	231153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_012668	AC	4	8	231208	231215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_012668	GAGAA	2	10	231217	231226	60 %	0 %	40 %	0 %	229606329
4531	NC_012668	CTA	2	6	231234	231239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606329
4532	NC_012668	CT	3	6	231253	231258	0 %	50 %	0 %	50 %	229606329
4533	NC_012668	TTA	2	6	231281	231286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606329
4534	NC_012668	ACT	2	6	231310	231315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606329
4535	NC_012668	GAT	2	6	231336	231341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606329
4536	NC_012668	TCAA	2	8	231389	231396	50 %	25 %	0 %	25 %	229606329
4537	NC_012668	TCT	2	6	231462	231467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606329
4538	NC_012668	CTTT	2	8	231560	231567	0 %	75 %	0 %	25 %	229606329
4539	NC_012668	CT	3	6	231578	231583	0 %	50 %	0 %	50 %	229606329
4540	NC_012668	AAG	2	6	231842	231847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606329
4541	NC_012668	TTA	2	6	231874	231879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606329
4542	NC_012668	AG	3	6	232062	232067	50 %	0 %	50 %	0 %	229606329
4543	NC_012668	CTG	2	6	232129	232134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606329
4544	NC_012668	AAG	2	6	232169	232174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606329
4545	NC_012668	CT	3	6	232339	232344	0 %	50 %	0 %	50 %	229606329
4546	NC_012668	ATTG	2	8	232377	232384	25 %	50 %	25 %	0 %	229606329
4547	NC_012668	TGA	2	6	232406	232411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606329
4548	NC_012668	GAAA	2	8	232507	232514	75 %	0 %	25 %	0 %	229606329
4549	NC_012668	CAAT	2	8	232521	232528	50 %	25 %	0 %	25 %	229606329
4550	NC_012668	AAC	3	9	232547	232555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606329
4551	NC_012668	GTT	2	6	232566	232571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_012668	T	6	6	232602	232607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_012668	CTG	2	6	232755	232760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012668	AAG	2	6	232894	232899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_012668	GAT	2	6	232915	232920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012668	A	6	6	232998	233003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_012668	TAA	2	6	233027	233032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_012668	GCGGA	2	10	233036	233045	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4559	NC_012668	CCGCT	2	10	233104	233113	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4560	NC_012668	GTTTC	2	10	233189	233198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4561	NC_012668	CAA	2	6	233295	233300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_012668	CA	4	8	233324	233331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_012668	AC	3	6	233436	233441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_012668	AAC	2	6	233467	233472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_012668	AGC	2	6	233635	233640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_012668	ACG	2	6	233689	233694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_012668	TGA	2	6	233769	233774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_012668	CCG	2	6	233797	233802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_012668	ACC	2	6	233884	233889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_012668	CTC	2	6	234003	234008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_012668	GAG	2	6	234022	234027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_012668	CCA	2	6	234047	234052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_012668	GGT	2	6	234107	234112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012668	GTA	2	6	234204	234209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_012668	ATTTCA	2	12	234263	234274	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4576	NC_012668	CAT	2	6	234302	234307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_012668	GCC	2	6	234377	234382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_012668	TAA	2	6	234502	234507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012668	TC	3	6	234629	234634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_012668	ACC	2	6	234659	234664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NC_012668	GTA	2	6	234747	234752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_012668	CGT	2	6	234759	234764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_012668	AG	4	8	234776	234783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012668	C	6	6	234859	234864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4585	NC_012668	GAG	2	6	234990	234995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_012668	CGACT	2	10	235167	235176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4587	NC_012668	CTTT	2	8	235191	235198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_012668	ATG	2	6	235201	235206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_012668	GCT	2	6	235207	235212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_012668	GTT	2	6	235296	235301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_012668	ACG	2	6	235311	235316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_012668	GT	3	6	235333	235338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_012668	TACT	2	8	235350	235357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_012668	AGT	2	6	235426	235431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_012668	TCGGT	2	10	235541	235550	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4596	NC_012668	CAC	2	6	235727	235732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_012668	GTAC	2	8	235752	235759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_012668	GTCA	2	8	235835	235842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_012668	GGA	2	6	235858	235863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_012668	C	6	6	235868	235873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4601	NC_012668	TCGC	2	8	236015	236022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_012668	CTA	2	6	236025	236030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_012668	TCT	2	6	236049	236054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_012668	AAC	2	6	236301	236306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_012668	TGT	2	6	236410	236415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_012668	ACAA	2	8	236450	236457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_012668	TTG	2	6	236465	236470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_012668	CTT	2	6	236507	236512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_012668	CGG	2	6	236542	236547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_012668	GGT	2	6	236573	236578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_012668	GTG	2	6	236609	236614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_012668	GGA	2	6	236704	236709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_012668	TGG	2	6	236716	236721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_012668	CCG	2	6	236842	236847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_012668	TCTAA	2	10	236901	236910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4616	NC_012668	AATC	2	8	236915	236922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_012668	TG	3	6	236923	236928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_012668	TCA	2	6	236934	236939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_012668	AGG	2	6	236956	236961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_012668	TCC	2	6	237037	237042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_012668	CTT	2	6	237061	237066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_012668	GT	3	6	237097	237102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_012668	ACG	2	6	237198	237203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_012668	GT	3	6	237266	237271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_012668	ATG	2	6	237291	237296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_012668	CGT	2	6	237303	237308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_012668	TCC	2	6	237317	237322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_012668	CCA	2	6	237353	237358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_012668	GAC	2	6	237431	237436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_012668	GCA	2	6	237443	237448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_012668	TTC	2	6	237519	237524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_012668	GCC	2	6	237762	237767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_012668	C	6	6	237826	237831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4634	NC_012668	ACC	2	6	237908	237913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4635	NC_012668	GCT	2	6	237972	237977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4637	NC_012668	ACC	2	6	238039	238044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4639	NC_012668	CTT	2	6	238081	238086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4640	NC_012668	CTG	2	6	238140	238145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4645	NC_012668	GCC	2	6	238454	238459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4655	NC_012668	TTTTC	2	10	238749	238758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4740	NC_012668	T	6	6	242903	242908	0 %	100 %	0 %	0 %	229606334
4741	NC_012668	CAGTGC	2	12	242927	242938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229606334
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4749	NC_012668	TTGA	2	8	243269	243276	25 %	50 %	25 %	0 %	229606334
4750	NC_012668	CAT	2	6	243283	243288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606334
4751	NC_012668	TAA	2	6	243393	243398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4752	NC_012668	AAGA	2	8	243400	243407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4753	NC_012668	AGC	2	6	243553	243558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606335
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4757	NC_012668	AAT	2	6	243621	243626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606335
4758	NC_012668	GCT	2	6	243638	243643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606335
4759	NC_012668	CT	3	6	243657	243662	0 %	50 %	0 %	50 %	229606335
4760	NC_012668	A	6	6	243776	243781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_012668	AAT	2	6	243785	243790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4762	NC_012668	TCA	2	6	243798	243803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606336
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4764	NC_012668	AGCC	2	8	243962	243969	25 %	0 %	25 %	50 %	229606336
4765	NC_012668	GAT	2	6	243979	243984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606336
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4769	NC_012668	CAT	2	6	244319	244324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606336
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4774	NC_012668	GAT	2	6	244508	244513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4783	NC_012668	A	6	6	244890	244895	100 %	0 %	0 %	0 %	229606338
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4811	NC_012668	TAT	2	6	246245	246250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4863	NC_012668	TGAGC	2	10	248283	248292	20 %	20 %	40 %	20 %	229606343
4864	NC_012668	C	6	6	248296	248301	0 %	0 %	0 %	100 %	229606343
4865	NC_012668	CCA	2	6	248323	248328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606343
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4872	NC_012668	GTTG	2	8	248942	248949	0 %	50 %	50 %	0 %	229606345
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4877	NC_012668	CCAA	2	8	249111	249118	50 %	0 %	0 %	50 %	229606345
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4879	NC_012668	TTG	2	6	249299	249304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606345
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4993	NC_012668	TCATC	2	10	256579	256588	20 %	40 %	0 %	40 %	229606354
4994	NC_012668	AAG	2	6	256656	256661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606354
4995	NC_012668	ATTG	2	8	256663	256670	25 %	50 %	25 %	0 %	229606354
4996	NC_012668	CATAG	2	10	256733	256742	40 %	20 %	20 %	20 %	229606354
4997	NC_012668	CTC	2	6	256745	256750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4998	NC_012668	AAG	2	6	256793	256798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_012668	TTC	2	6	256838	256843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606355
5000	NC_012668	GAT	2	6	256844	256849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606355

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