MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_012667	TGC	2	6	1081945	1081950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20503	NC_012667	CCTG	2	8	1082018	1082025	0 %	25 %	25 %	50 %	229606064
20504	NC_012667	T	6	6	1082044	1082049	0 %	100 %	0 %	0 %	229606064
20505	NC_012667	GCA	2	6	1082055	1082060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20506	NC_012667	AGC	2	6	1082065	1082070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20507	NC_012667	TGG	2	6	1082083	1082088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606064
20508	NC_012667	TCAA	2	8	1082101	1082108	50 %	25 %	0 %	25 %	229606064
20509	NC_012667	CAG	2	6	1082126	1082131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20510	NC_012667	GCC	2	6	1082187	1082192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606064
20511	NC_012667	CTC	2	6	1082219	1082224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606064
20512	NC_012667	CGC	2	6	1082278	1082283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606064
20513	NC_012667	CGG	2	6	1082323	1082328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606064
20514	NC_012667	ATC	2	6	1082428	1082433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606064
20515	NC_012667	ATG	2	6	1082515	1082520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606064
20516	NC_012667	AGC	2	6	1082532	1082537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20517	NC_012667	GC	3	6	1082573	1082578	0 %	0 %	50 %	50 %	229606064
20518	NC_012667	CAC	2	6	1082587	1082592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606064
20519	NC_012667	CAG	2	6	1082672	1082677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20520	NC_012667	TTGC	2	8	1082715	1082722	0 %	50 %	25 %	25 %	229606064
20521	NC_012667	GCGCT	2	10	1082728	1082737	0 %	20 %	40 %	40 %	229606064
20522	NC_012667	AAG	2	6	1082761	1082766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606064
20523	NC_012667	GCG	2	6	1082774	1082779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606064
20524	NC_012667	CTG	2	6	1082793	1082798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20525	NC_012667	TGA	2	6	1082864	1082869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606064
20526	NC_012667	AG	3	6	1082888	1082893	50 %	0 %	50 %	0 %	229606064
20527	NC_012667	ATC	2	6	1082914	1082919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606064
20528	NC_012667	ACT	2	6	1082953	1082958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606064
20529	NC_012667	GC	3	6	1082982	1082987	0 %	0 %	50 %	50 %	229606064
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20532	NC_012667	GCC	2	6	1083140	1083145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606064
20533	NC_012667	ACTC	2	8	1083261	1083268	25 %	25 %	0 %	50 %	229606064
20534	NC_012667	TCA	2	6	1083319	1083324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606064
20535	NC_012667	GGC	2	6	1083333	1083338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606064
20536	NC_012667	CGT	2	6	1083351	1083356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606064
20537	NC_012667	ATGC	2	8	1083465	1083472	25 %	25 %	25 %	25 %	229606065
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20539	NC_012667	TGC	2	6	1083795	1083800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606065
20540	NC_012667	CTG	3	9	1083842	1083850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606065
20541	NC_012667	TGA	2	6	1083886	1083891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606065
20542	NC_012667	GCT	2	6	1083892	1083897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606065
20543	NC_012667	GCG	2	6	1084002	1084007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606065
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20545	NC_012667	CGC	2	6	1084118	1084123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606066
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20547	NC_012667	CAC	2	6	1084149	1084154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606066
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20553	NC_012667	GCT	2	6	1084572	1084577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606066
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20555	NC_012667	CTG	2	6	1084711	1084716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606066
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20559	NC_012667	GC	3	6	1084998	1085003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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20575	NC_012667	A	6	6	1085894	1085899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20582	NC_012667	T	6	6	1086694	1086699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.