MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_012667	AAACT	2	10	1029275	1029284	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19502	NC_012667	CAA	2	6	1029291	1029296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_012667	ACC	2	6	1029302	1029307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19504	NC_012667	AC	3	6	1029444	1029449	50 %	0 %	0 %	50 %	229606000
19505	NC_012667	A	7	7	1029531	1029537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_012667	CGA	2	6	1029550	1029555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19507	NC_012667	AAC	2	6	1029597	1029602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19508	NC_012667	TTG	2	6	1029619	1029624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19509	NC_012667	TTG	2	6	1029644	1029649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19510	NC_012667	AAG	2	6	1029774	1029779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_012667	CGCC	2	8	1029784	1029791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19512	NC_012667	ACA	2	6	1029828	1029833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19513	NC_012667	ACC	2	6	1029840	1029845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19514	NC_012667	CAC	2	6	1030081	1030086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606001
19515	NC_012667	GACA	2	8	1030134	1030141	50 %	0 %	25 %	25 %	229606001
19516	NC_012667	AGC	2	6	1030158	1030163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606001
19517	NC_012667	GTAA	2	8	1030201	1030208	50 %	25 %	25 %	0 %	229606001
19518	NC_012667	CAA	2	6	1030239	1030244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606001
19519	NC_012667	CAA	2	6	1030264	1030269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606001
19520	NC_012667	ACT	2	6	1030394	1030399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19521	NC_012667	CGCC	2	8	1030422	1030429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19522	NC_012667	ACA	2	6	1030466	1030471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19523	NC_012667	ACC	2	6	1030478	1030483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19524	NC_012667	ACA	2	6	1030618	1030623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19525	NC_012667	TATC	2	8	1030624	1030631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19526	NC_012667	CCA	2	6	1030651	1030656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19527	NC_012667	ACT	2	6	1030674	1030679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19528	NC_012667	A	6	6	1030680	1030685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_012667	CT	3	6	1030710	1030715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19530	NC_012667	TCA	2	6	1030748	1030753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19531	NC_012667	TTC	2	6	1030771	1030776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19532	NC_012667	A	8	8	1030827	1030834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19533	NC_012667	AG	3	6	1030880	1030885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19534	NC_012667	CGC	2	6	1030933	1030938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19535	NC_012667	GT	3	6	1031008	1031013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_012667	CTA	2	6	1031053	1031058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606002
19537	NC_012667	ACT	2	6	1031127	1031132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606002
19538	NC_012667	TGA	2	6	1031334	1031339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_012667	CGCC	2	8	1031348	1031355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19540	NC_012667	ACC	2	6	1031404	1031409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19541	NC_012667	ATG	2	6	1031524	1031529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606003
19542	NC_012667	CAGA	2	8	1031611	1031618	50 %	0 %	25 %	25 %	229606003
19543	NC_012667	TAA	2	6	1031629	1031634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606003
19544	NC_012667	TGA	2	6	1031697	1031702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606003
19545	NC_012667	TCT	2	6	1031710	1031715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606003
19546	NC_012667	GTT	3	9	1031793	1031801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606003
19547	NC_012667	TCA	2	6	1031848	1031853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606003
19548	NC_012667	CGCC	2	8	1031883	1031890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19549	NC_012667	ACA	2	6	1031926	1031931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606004
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19551	NC_012667	ATT	2	6	1032055	1032060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606004
19552	NC_012667	ACTC	2	8	1032171	1032178	25 %	25 %	0 %	50 %	229606005
19553	NC_012667	TGAA	2	8	1032290	1032297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_012667	CTG	2	6	1032324	1032329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19555	NC_012667	CGCC	2	8	1032351	1032358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19556	NC_012667	CAA	2	6	1032396	1032401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19557	NC_012667	AATCA	2	10	1032498	1032507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19558	NC_012667	ACTC	2	8	1032641	1032648	25 %	25 %	0 %	50 %	229606006
19559	NC_012667	GACA	2	8	1032701	1032708	50 %	0 %	25 %	25 %	229606006
19560	NC_012667	GTAA	2	8	1032768	1032775	50 %	25 %	25 %	0 %	229606006
19561	NC_012667	CAA	2	6	1032806	1032811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606006
19562	NC_012667	CAA	2	6	1032831	1032836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606006
19563	NC_012667	CG	3	6	1033073	1033078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19564	NC_012667	TGCA	2	8	1033142	1033149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19565	NC_012667	CACGA	2	10	1033197	1033206	40 %	0 %	20 %	40 %	229606007
19566	NC_012667	TTA	2	6	1033282	1033287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606007
19567	NC_012667	TGG	2	6	1033292	1033297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606007
19568	NC_012667	CA	3	6	1033455	1033460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19569	NC_012667	AAGA	2	8	1033465	1033472	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19570	NC_012667	CAT	2	6	1033506	1033511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19571	NC_012667	CAACTA	2	12	1033660	1033671	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19572	NC_012667	GC	3	6	1033672	1033677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19573	NC_012667	CGCC	2	8	1033725	1033732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19574	NC_012667	CAA	2	6	1033770	1033775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19575	NC_012667	ACC	2	6	1033781	1033786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19576	NC_012667	TTTG	2	8	1033867	1033874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19577	NC_012667	TTG	2	6	1033883	1033888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19578	NC_012667	T	7	7	1033896	1033902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19579	NC_012667	T	6	6	1033956	1033961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19580	NC_012667	ATC	2	6	1034026	1034031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19581	NC_012667	GCA	2	6	1034095	1034100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19582	NC_012667	CAA	2	6	1034106	1034111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19583	NC_012667	AAC	2	6	1034178	1034183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19584	NC_012667	TCT	2	6	1034273	1034278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19585	NC_012667	CGCC	2	8	1034318	1034325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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19588	NC_012667	T	6	6	1034465	1034470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19589	NC_012667	AAGC	2	8	1034541	1034548	50 %	0 %	25 %	25 %	229606009
19590	NC_012667	AGGTT	2	10	1034570	1034579	20 %	40 %	40 %	0 %	229606009
19591	NC_012667	GAT	2	6	1034623	1034628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606009
19592	NC_012667	CAA	2	6	1034668	1034673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606009
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19595	NC_012667	ACT	2	6	1034715	1034720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606010
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19597	NC_012667	GA	3	6	1034843	1034848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19598	NC_012667	CGCC	2	8	1034855	1034862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19599	NC_012667	ACA	2	6	1034898	1034903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19600	NC_012667	ACC	2	6	1034910	1034915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19601	NC_012667	CGC	2	6	1034937	1034942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19602	NC_012667	TTG	2	6	1035004	1035009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_012667	ACA	2	6	1035048	1035053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19604	NC_012667	GCT	3	9	1035132	1035140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606011
19605	NC_012667	GCA	2	6	1035180	1035185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606011
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19607	NC_012667	ATG	2	6	1035335	1035340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606011
19608	NC_012667	CAA	2	6	1035406	1035411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606012
19609	NC_012667	A	6	6	1035443	1035448	100 %	0 %	0 %	0 %	229606012
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19611	NC_012667	ATC	2	6	1035497	1035502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606012
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19613	NC_012667	CGA	2	6	1035613	1035618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606012
19614	NC_012667	TGT	2	6	1035706	1035711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606012
19615	NC_012667	TTG	2	6	1035714	1035719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606012
19616	NC_012667	TCA	2	6	1035795	1035800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606012
19617	NC_012667	CGCC	2	8	1035858	1035865	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19618	NC_012667	ACA	2	6	1035901	1035906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19619	NC_012667	TATT	2	8	1035979	1035986	25 %	75 %	0 %	0 %	229606013
19620	NC_012667	GCT	2	6	1035987	1035992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606013
19621	NC_012667	A	6	6	1036186	1036191	100 %	0 %	0 %	0 %	229606013
19622	NC_012667	CTTC	2	8	1036248	1036255	0 %	50 %	0 %	50 %	229606013
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19624	NC_012667	TCGAG	2	10	1036364	1036373	20 %	20 %	40 %	20 %	229606013
19625	NC_012667	GTT	2	6	1036399	1036404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606013
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19637	NC_012667	CAA	2	6	1037247	1037252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19647	NC_012667	ACA	2	6	1037755	1037760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19648	NC_012667	ACC	2	6	1037767	1037772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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