MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_012667	GTGA	2	8	789429	789436	25 %	25 %	50 %	0 %	229605739
15003	NC_012667	GC	3	6	789470	789475	0 %	0 %	50 %	50 %	229605739
15004	NC_012667	ACAA	2	8	789483	789490	75 %	0 %	0 %	25 %	229605739
15005	NC_012667	CATC	2	8	789547	789554	25 %	25 %	0 %	50 %	229605740
15006	NC_012667	GCT	2	6	789592	789597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605740
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15009	NC_012667	CTG	2	6	789647	789652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605740
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15365	NC_012667	GTA	2	6	809551	809556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605758
15366	NC_012667	TCT	2	6	809570	809575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605758
15367	NC_012667	TCAA	2	8	809597	809604	50 %	25 %	0 %	25 %	229605758
15368	NC_012667	CAT	2	6	809650	809655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605758
15369	NC_012667	GAA	2	6	809767	809772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605758
15370	NC_012667	AGC	2	6	809958	809963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605758
15371	NC_012667	TTGGT	2	10	810015	810024	0 %	60 %	40 %	0 %	229605758
15372	NC_012667	TGC	2	6	810237	810242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15373	NC_012667	CGA	2	6	810289	810294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605759
15374	NC_012667	AAGG	2	8	810327	810334	50 %	0 %	50 %	0 %	229605759
15375	NC_012667	TCA	2	6	810358	810363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605759
15376	NC_012667	CA	3	6	810370	810375	50 %	0 %	0 %	50 %	229605759
15377	NC_012667	GC	3	6	810442	810447	0 %	0 %	50 %	50 %	229605759
15378	NC_012667	AGC	2	6	810690	810695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605759
15379	NC_012667	GTT	2	6	810778	810783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605759
15380	NC_012667	TTC	2	6	810788	810793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605759
15381	NC_012667	GGCA	2	8	810830	810837	25 %	0 %	50 %	25 %	229605759
15382	NC_012667	GCG	2	6	810897	810902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605759
15383	NC_012667	GCTTTG	2	12	811026	811037	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	229605759
15384	NC_012667	GAG	2	6	811134	811139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605759
15385	NC_012667	CTT	2	6	811225	811230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605759
15386	NC_012667	ACTG	2	8	811235	811242	25 %	25 %	25 %	25 %	229605759
15387	NC_012667	GGT	2	6	811271	811276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605759
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15391	NC_012667	GC	3	6	811465	811470	0 %	0 %	50 %	50 %	229605759
15392	NC_012667	GCG	2	6	811541	811546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605759
15393	NC_012667	GCT	2	6	811570	811575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605759
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15395	NC_012667	ACC	3	9	811691	811699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605759
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15397	NC_012667	GAAT	2	8	811855	811862	50 %	25 %	25 %	0 %	229605759
15398	NC_012667	TTG	2	6	811875	811880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605759
15399	NC_012667	GCA	2	6	812020	812025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605759
15400	NC_012667	GC	3	6	812070	812075	0 %	0 %	50 %	50 %	229605759
15401	NC_012667	GCGA	2	8	812127	812134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15402	NC_012667	GC	3	6	812197	812202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15403	NC_012667	ATC	2	6	812246	812251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15404	NC_012667	TTAT	2	8	812257	812264	25 %	75 %	0 %	0 %	229605760
15405	NC_012667	TTGG	2	8	812315	812322	0 %	50 %	50 %	0 %	229605760
15406	NC_012667	CTT	3	9	812343	812351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605760
15407	NC_012667	CAG	2	6	812457	812462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605760
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15412	NC_012667	CGC	2	6	812584	812589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605760
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15414	NC_012667	TAAG	2	8	812655	812662	50 %	25 %	25 %	0 %	229605760
15415	NC_012667	AATA	2	8	812686	812693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15416	NC_012667	TTG	2	6	812696	812701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15417	NC_012667	TA	3	6	812812	812817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15418	NC_012667	ATT	2	6	812824	812829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15419	NC_012667	CAA	2	6	812851	812856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15420	NC_012667	GAC	2	6	812859	812864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15424	NC_012667	GAT	2	6	813166	813171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605761
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15433	NC_012667	TCT	2	6	813681	813686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605762
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15437	NC_012667	TGG	2	6	813890	813895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15438	NC_012667	CGC	2	6	813923	813928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15439	NC_012667	ACACT	2	10	813934	813943	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15440	NC_012667	ATC	2	6	813964	813969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15445	NC_012667	TGAC	2	8	814367	814374	25 %	25 %	25 %	25 %	229605763
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15453	NC_012667	GAT	2	6	814750	814755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605764
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15457	NC_012667	GAC	2	6	814951	814956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605764
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15461	NC_012667	ATCA	2	8	815155	815162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15462	NC_012667	AGA	2	6	815202	815207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15463	NC_012667	TAA	2	6	815295	815300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605765
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15470	NC_012667	GGGCA	2	10	815520	815529	20 %	0 %	60 %	20 %	229605765
15471	NC_012667	CA	3	6	815541	815546	50 %	0 %	0 %	50 %	229605765
15472	NC_012667	GGGGC	2	10	815599	815608	0 %	0 %	80 %	20 %	229605765
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15475	NC_012667	CG	3	6	815735	815740	0 %	0 %	50 %	50 %	229605765
15476	NC_012667	AGTG	2	8	815764	815771	25 %	25 %	50 %	0 %	229605765
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15478	NC_012667	TGC	2	6	815923	815928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605765
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15480	NC_012667	CAA	2	6	816002	816007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605765
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15482	NC_012667	CGAT	2	8	816304	816311	25 %	25 %	25 %	25 %	229605766
15483	NC_012667	TGC	3	9	816370	816378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605766
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15486	NC_012667	T	6	6	816491	816496	0 %	100 %	0 %	0 %	229605766
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15488	NC_012667	AGCCC	2	10	816574	816583	20 %	0 %	20 %	60 %	229605766
15489	NC_012667	TCA	2	6	816676	816681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605766
15490	NC_012667	GCC	2	6	816795	816800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605766
15491	NC_012667	TCT	2	6	816853	816858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605766
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