MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012667	TCG	2	6	548249	548254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10502	NC_012667	TGG	2	6	548427	548432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605534
10503	NC_012667	AACGG	2	10	548483	548492	40 %	0 %	40 %	20 %	229605534
10504	NC_012667	CAG	2	6	548639	548644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10505	NC_012667	AGCAA	2	10	548706	548715	60 %	0 %	20 %	20 %	229605534
10506	NC_012667	TAT	2	6	548852	548857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605534
10507	NC_012667	TGT	2	6	548911	548916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605534
10508	NC_012667	CTGC	2	8	548918	548925	0 %	25 %	25 %	50 %	229605534
10509	NC_012667	CAA	2	6	548936	548941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605534
10510	NC_012667	ACT	2	6	548997	549002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605534
10511	NC_012667	AGC	2	6	549131	549136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10512	NC_012667	ATG	2	6	549150	549155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
10513	NC_012667	GCA	2	6	549168	549173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10514	NC_012667	ACA	2	6	549207	549212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605534
10515	NC_012667	CCAA	2	8	549299	549306	50 %	0 %	0 %	50 %	229605534
10516	NC_012667	TTA	2	6	549325	549330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605534
10517	NC_012667	CAA	2	6	549343	549348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605534
10518	NC_012667	CGG	2	6	549372	549377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605534
10519	NC_012667	CCA	2	6	549429	549434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605534
10520	NC_012667	TGAT	2	8	549483	549490	25 %	50 %	25 %	0 %	229605534
10521	NC_012667	AGTGA	2	10	549608	549617	40 %	20 %	40 %	0 %	229605534
10522	NC_012667	GTTC	2	8	549661	549668	0 %	50 %	25 %	25 %	229605534
10523	NC_012667	TTA	2	6	549763	549768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605534
10524	NC_012667	GCA	2	6	549912	549917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10525	NC_012667	TTA	2	6	549969	549974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605534
10526	NC_012667	TCA	2	6	550012	550017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605534
10527	NC_012667	CAT	2	6	550069	550074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605534
10528	NC_012667	ATG	2	6	550335	550340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
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10530	NC_012667	AAT	2	6	550562	550567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605534
10531	NC_012667	GCA	2	6	550610	550615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10532	NC_012667	CGG	2	6	550653	550658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605534
10533	NC_012667	TCC	2	6	550675	550680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605534
10534	NC_012667	GATT	2	8	550903	550910	25 %	50 %	25 %	0 %	229605534
10535	NC_012667	AAT	2	6	550919	550924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605534
10536	NC_012667	GCAG	2	8	550985	550992	25 %	0 %	50 %	25 %	229605534
10537	NC_012667	TGG	2	6	551010	551015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605534
10538	NC_012667	TGG	2	6	551022	551027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605534
10539	NC_012667	CTG	2	6	551066	551071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10540	NC_012667	CAA	2	6	551086	551091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605534
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10543	NC_012667	CAG	2	6	551245	551250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10544	NC_012667	TAA	2	6	551317	551322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605534
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10550	NC_012667	CG	3	6	551616	551621	0 %	0 %	50 %	50 %	229605534
10551	NC_012667	GAC	2	6	551659	551664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10552	NC_012667	TGA	2	6	551680	551685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
10553	NC_012667	TC	3	6	551718	551723	0 %	50 %	0 %	50 %	229605534
10554	NC_012667	CAG	3	9	551740	551748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10555	NC_012667	ACCG	2	8	551833	551840	25 %	0 %	25 %	50 %	229605534
10556	NC_012667	AAG	2	6	551952	551957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605534
10557	NC_012667	CTCA	2	8	552047	552054	25 %	25 %	0 %	50 %	229605534
10558	NC_012667	TGA	2	6	552178	552183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
10559	NC_012667	AGC	2	6	552209	552214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10560	NC_012667	TGG	2	6	552267	552272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605534
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10562	NC_012667	CCGA	2	8	552425	552432	25 %	0 %	25 %	50 %	229605534
10563	NC_012667	CGG	3	9	552478	552486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605534
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10565	NC_012667	TGA	2	6	552673	552678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
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10569	NC_012667	TGG	2	6	552889	552894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605534
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10579	NC_012667	TGAT	2	8	553482	553489	25 %	50 %	25 %	0 %	229605534
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10584	NC_012667	TGA	2	6	553623	553628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
10585	NC_012667	GCAG	2	8	553676	553683	25 %	0 %	50 %	25 %	229605534
10586	NC_012667	AATC	2	8	553819	553826	50 %	25 %	0 %	25 %	229605534
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10588	NC_012667	CAG	2	6	553970	553975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
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10592	NC_012667	AGT	2	6	554176	554181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
10593	NC_012667	AC	3	6	554200	554205	50 %	0 %	0 %	50 %	229605534
10594	NC_012667	AGC	2	6	554243	554248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
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10601	NC_012667	TGA	2	6	554383	554388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
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10607	NC_012667	CAAT	2	8	554626	554633	50 %	25 %	0 %	25 %	229605534
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10614	NC_012667	T	6	6	554851	554856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_012667	TTTCC	2	10	554882	554891	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10616	NC_012667	ATGA	2	8	554934	554941	50 %	25 %	25 %	0 %	229605535
10617	NC_012667	TGG	2	6	555082	555087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605535
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