MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012667	T	6	6	522945	522950	0 %	100 %	0 %	0 %	229605516
10002	NC_012667	AGG	2	6	522991	522996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605516
10003	NC_012667	CGT	2	6	523140	523145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605516
10004	NC_012667	TTC	2	6	523218	523223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605516
10005	NC_012667	ATCGA	2	10	523338	523347	40 %	20 %	20 %	20 %	229605516
10006	NC_012667	T	6	6	523353	523358	0 %	100 %	0 %	0 %	229605516
10007	NC_012667	TCA	2	6	523425	523430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605516
10008	NC_012667	A	6	6	523430	523435	100 %	0 %	0 %	0 %	229605516
10009	NC_012667	ATCC	2	8	523465	523472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_012667	ACTG	2	8	523474	523481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_012667	CTT	2	6	523611	523616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_012667	CGT	2	6	523618	523623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_012667	AG	3	6	523625	523630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_012667	ACG	2	6	523826	523831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605517
10015	NC_012667	TG	3	6	523856	523861	0 %	50 %	50 %	0 %	229605517
10016	NC_012667	GACAA	2	10	523867	523876	60 %	0 %	20 %	20 %	229605517
10017	NC_012667	CAA	2	6	524023	524028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605517
10018	NC_012667	T	6	6	524035	524040	0 %	100 %	0 %	0 %	229605517
10019	NC_012667	ACC	2	6	524057	524062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605517
10020	NC_012667	GCC	2	6	524179	524184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605517
10021	NC_012667	GTG	2	6	524191	524196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605517
10022	NC_012667	CGCGG	2	10	524209	524218	0 %	0 %	60 %	40 %	229605517
10023	NC_012667	TGATGG	2	12	524319	524330	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229605517
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10025	NC_012667	AATA	2	8	524430	524437	75 %	25 %	0 %	0 %	229605517
10026	NC_012667	GATC	2	8	524454	524461	25 %	25 %	25 %	25 %	229605517
10027	NC_012667	AG	3	6	524479	524484	50 %	0 %	50 %	0 %	229605517
10028	NC_012667	CTT	2	6	524491	524496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605517
10029	NC_012667	T	8	8	524502	524509	0 %	100 %	0 %	0 %	229605517
10030	NC_012667	CGG	2	6	524538	524543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605517
10031	NC_012667	CTG	2	6	524570	524575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605517
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10033	NC_012667	GA	3	6	524601	524606	50 %	0 %	50 %	0 %	229605517
10034	NC_012667	TTAA	2	8	524635	524642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_012667	TGC	2	6	524728	524733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_012667	TGG	2	6	524734	524739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012667	AGTA	2	8	524792	524799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_012667	AT	3	6	524840	524845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_012667	T	6	6	524852	524857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_012667	ACT	2	6	524866	524871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_012667	TTG	2	6	524996	525001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_012667	TCAT	2	8	525005	525012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_012667	TGA	2	6	525218	525223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605518
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10047	NC_012667	AAC	2	6	525350	525355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_012667	ATG	2	6	525379	525384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_012667	AGA	2	6	525403	525408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_012667	ATT	2	6	525453	525458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_012667	ATG	2	6	525470	525475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_012667	TG	3	6	525497	525502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_012667	TG	3	6	525508	525513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_012667	GC	3	6	525521	525526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_012667	AAC	2	6	525538	525543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_012667	A	6	6	525554	525559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10081	NC_012667	TTGA	2	8	526558	526565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_012667	ACC	2	6	527328	527333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605520
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10105	NC_012667	CAG	2	6	527514	527519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605520
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10111	NC_012667	CG	3	6	527943	527948	0 %	0 %	50 %	50 %	229605520
10112	NC_012667	ACGT	2	8	527980	527987	25 %	25 %	25 %	25 %	229605520
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10124	NC_012667	GTC	2	6	528352	528357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605520
10125	NC_012667	CATGT	2	10	528417	528426	20 %	40 %	20 %	20 %	229605520
10126	NC_012667	ACCT	2	8	528484	528491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_012667	GTT	2	6	528519	528524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_012667	CCG	2	6	528571	528576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605521
10129	NC_012667	ATG	2	6	528612	528617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605521
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10132	NC_012667	TTGA	2	8	528722	528729	25 %	50 %	25 %	0 %	229605521
10133	NC_012667	TCT	2	6	528732	528737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605521
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10137	NC_012667	GA	3	6	528906	528911	50 %	0 %	50 %	0 %	229605521
10138	NC_012667	GCT	2	6	528919	528924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605521
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10161	NC_012667	TTA	2	6	530152	530157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_012667	T	6	6	530234	530239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_012667	A	6	6	530249	530254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10234	NC_012667	GT	3	6	534057	534062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_012667	GTTATT	2	12	534064	534075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_012667	T	6	6	534088	534093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_012667	ATT	2	6	534284	534289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_012667	TCA	2	6	534321	534326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10239	NC_012667	CAGT	2	8	534383	534390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10240	NC_012667	GAT	2	6	534402	534407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_012667	GAG	2	6	534422	534427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_012667	AACG	2	8	534500	534507	50 %	0 %	25 %	25 %	229605524
10243	NC_012667	ACC	2	6	534513	534518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605524
10244	NC_012667	CATTC	2	10	534658	534667	20 %	40 %	0 %	40 %	229605524
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10246	NC_012667	AAC	2	6	534828	534833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605524
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10248	NC_012667	CAT	2	6	535040	535045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605524
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10366	NC_012667	TGA	2	6	541690	541695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605531
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10483	NC_012667	GAC	2	6	547319	547324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
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10485	NC_012667	AGC	2	6	547472	547477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10486	NC_012667	TGGCG	2	10	547507	547516	0 %	20 %	60 %	20 %	229605534
10487	NC_012667	GAT	2	6	547538	547543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
10488	NC_012667	GGC	2	6	547636	547641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605534
10489	NC_012667	TGC	2	6	547731	547736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605534
10490	NC_012667	ACCA	2	8	547755	547762	50 %	0 %	0 %	50 %	229605534
10491	NC_012667	GAT	2	6	547799	547804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605534
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