MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012667	GGAA	2	8	418344	418351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_012667	ATG	2	6	418433	418438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605418
8003	NC_012667	GCA	2	6	418546	418551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605418
8004	NC_012667	CCG	2	6	418578	418583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605418
8005	NC_012667	ATG	2	6	418644	418649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605418
8006	NC_012667	AAG	2	6	418653	418658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605418
8007	NC_012667	AG	3	6	418696	418701	50 %	0 %	50 %	0 %	229605418
8008	NC_012667	TTA	2	6	418752	418757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605418
8009	NC_012667	ATGA	2	8	418853	418860	50 %	25 %	25 %	0 %	229605418
8010	NC_012667	CAAA	2	8	418894	418901	75 %	0 %	0 %	25 %	229605418
8011	NC_012667	TGG	2	6	418953	418958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605418
8012	NC_012667	ACCA	2	8	419009	419016	50 %	0 %	0 %	50 %	229605418
8013	NC_012667	AGA	2	6	419071	419076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605418
8014	NC_012667	TGG	2	6	419079	419084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605418
8015	NC_012667	TAA	2	6	419092	419097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605418
8016	NC_012667	GCA	2	6	419185	419190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_012667	A	6	6	419200	419205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_012667	TGT	2	6	419229	419234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_012667	CGG	2	6	419235	419240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_012667	TTCA	2	8	419285	419292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_012667	TAA	2	6	419294	419299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_012667	TGC	2	6	419334	419339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605419
8023	NC_012667	TTC	2	6	419343	419348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605419
8024	NC_012667	AGC	2	6	419364	419369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605419
8025	NC_012667	T	6	6	419376	419381	0 %	100 %	0 %	0 %	229605419
8026	NC_012667	TGT	2	6	419392	419397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605419
8027	NC_012667	TGA	2	6	419501	419506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605419
8028	NC_012667	CGT	2	6	419524	419529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605419
8029	NC_012667	AATAA	2	10	419602	419611	80 %	20 %	0 %	0 %	229605419
8030	NC_012667	GCAATC	2	12	419638	419649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229605419
8031	NC_012667	ACC	2	6	419661	419666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605419
8032	NC_012667	CTT	2	6	419714	419719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605419
8033	NC_012667	TGA	2	6	419792	419797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605419
8034	NC_012667	TCTT	2	8	419860	419867	0 %	75 %	0 %	25 %	229605419
8035	NC_012667	CTTG	2	8	420014	420021	0 %	50 %	25 %	25 %	229605419
8036	NC_012667	ACG	2	6	420063	420068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605419
8037	NC_012667	GTG	2	6	420125	420130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605419
8038	NC_012667	GT	3	6	420188	420193	0 %	50 %	50 %	0 %	229605419
8039	NC_012667	CAA	2	6	420278	420283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605419
8040	NC_012667	CAC	2	6	420288	420293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605419
8041	NC_012667	TGA	2	6	420350	420355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605419
8042	NC_012667	CCG	2	6	420469	420474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605419
8043	NC_012667	GCG	2	6	420684	420689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605419
8044	NC_012667	AGC	2	6	420712	420717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605419
8045	NC_012667	ATG	2	6	420733	420738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605419
8046	NC_012667	TGGA	2	8	420747	420754	25 %	25 %	50 %	0 %	229605419
8047	NC_012667	CG	3	6	420757	420762	0 %	0 %	50 %	50 %	229605419
8048	NC_012667	GCA	2	6	420770	420775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605419
8049	NC_012667	T	6	6	420868	420873	0 %	100 %	0 %	0 %	229605419
8050	NC_012667	ACA	2	6	420883	420888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605419
8051	NC_012667	CAT	2	6	420890	420895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605419
8052	NC_012667	TGG	2	6	420896	420901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605419
8053	NC_012667	ATTCA	2	10	420962	420971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8054	NC_012667	ATTCA	2	10	420977	420986	40 %	40 %	0 %	20 %	229605420
8055	NC_012667	TGC	2	6	421014	421019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605420
8056	NC_012667	TTG	2	6	421057	421062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605420
8057	NC_012667	CTGCG	2	10	421085	421094	0 %	20 %	40 %	40 %	229605420
8058	NC_012667	GCA	2	6	421119	421124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605420
8059	NC_012667	GGT	2	6	421147	421152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605420
8060	NC_012667	GGC	2	6	421158	421163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605420
8061	NC_012667	TTC	2	6	421177	421182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605420
8062	NC_012667	TTGA	2	8	421213	421220	25 %	50 %	25 %	0 %	229605420
8063	NC_012667	CG	3	6	421231	421236	0 %	0 %	50 %	50 %	229605420
8064	NC_012667	TGT	2	6	421251	421256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605420
8065	NC_012667	TCA	2	6	421334	421339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605420
8066	NC_012667	TGTAG	2	10	421368	421377	20 %	40 %	40 %	0 %	229605420
8067	NC_012667	TCT	2	6	421382	421387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605420
8068	NC_012667	CTTG	2	8	421416	421423	0 %	50 %	25 %	25 %	229605420
8069	NC_012667	A	6	6	421442	421447	100 %	0 %	0 %	0 %	229605420
8070	NC_012667	CTG	2	6	421459	421464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605420
8071	NC_012667	AAT	2	6	421530	421535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_012667	TAT	2	6	421564	421569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_012667	GAAG	2	8	421659	421666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_012667	AGC	2	6	421702	421707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605421
8075	NC_012667	CGAT	2	8	421765	421772	25 %	25 %	25 %	25 %	229605421
8076	NC_012667	AGCG	2	8	421789	421796	25 %	0 %	50 %	25 %	229605421
8077	NC_012667	TCAA	2	8	421821	421828	50 %	25 %	0 %	25 %	229605421
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8081	NC_012667	GAGT	2	8	422176	422183	25 %	25 %	50 %	0 %	229605421
8082	NC_012667	CTC	2	6	422194	422199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605421
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8089	NC_012667	AGTA	2	8	422448	422455	50 %	25 %	25 %	0 %	229605421
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8093	NC_012667	TGG	2	6	422753	422758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605421
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8096	NC_012667	GGAT	2	8	422807	422814	25 %	25 %	50 %	0 %	229605421
8097	NC_012667	AAG	2	6	422863	422868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605421
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8105	NC_012667	TGC	2	6	423199	423204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605421
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8110	NC_012667	GA	3	6	423463	423468	50 %	0 %	50 %	0 %	229605421
8111	NC_012667	TGG	2	6	423497	423502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605421
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8118	NC_012667	GC	3	6	423854	423859	0 %	0 %	50 %	50 %	229605421
8119	NC_012667	TGT	2	6	423863	423868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605421
8120	NC_012667	TGA	2	6	423965	423970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605421
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8122	NC_012667	CT	4	8	424043	424050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8124	NC_012667	T	7	7	424136	424142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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