MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012667	CT	3	6	263794	263799	0 %	50 %	0 %	50 %	229605280
5002	NC_012667	TGC	2	6	263801	263806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605280
5003	NC_012667	CG	5	10	263916	263925	0 %	0 %	50 %	50 %	229605280
5004	NC_012667	GC	3	6	263953	263958	0 %	0 %	50 %	50 %	229605280
5005	NC_012667	GCT	2	6	264039	264044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605280
5006	NC_012667	GAT	2	6	264061	264066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605280
5007	NC_012667	ACCA	2	8	264106	264113	50 %	0 %	0 %	50 %	229605280
5008	NC_012667	GCA	2	6	264146	264151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605280
5009	NC_012667	CTG	2	6	264163	264168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605280
5010	NC_012667	CTG	2	6	264223	264228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605280
5011	NC_012667	CCA	2	6	264242	264247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605280
5012	NC_012667	CATT	2	8	264264	264271	25 %	50 %	0 %	25 %	229605280
5013	NC_012667	TGA	2	6	264273	264278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605280
5014	NC_012667	ACC	2	6	264427	264432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605280
5015	NC_012667	AAG	2	6	264485	264490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605280
5016	NC_012667	CTA	2	6	264528	264533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605280
5017	NC_012667	TCA	2	6	264627	264632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605281
5018	NC_012667	TGG	2	6	264660	264665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605281
5019	NC_012667	T	6	6	264697	264702	0 %	100 %	0 %	0 %	229605281
5020	NC_012667	GA	3	6	264744	264749	50 %	0 %	50 %	0 %	229605281
5021	NC_012667	CTTG	2	8	264795	264802	0 %	50 %	25 %	25 %	229605281
5022	NC_012667	CGG	2	6	264902	264907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605281
5023	NC_012667	TTG	2	6	264923	264928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605281
5024	NC_012667	GTT	2	6	264930	264935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605281
5025	NC_012667	ATG	2	6	264956	264961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605281
5026	NC_012667	CT	3	6	265001	265006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_012667	CACT	2	8	265032	265039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_012667	TTA	2	6	265066	265071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012667	GCAA	2	8	265116	265123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_012667	ATACCG	2	12	265178	265189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_012667	AAT	2	6	265206	265211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012667	CTTT	2	8	265268	265275	0 %	75 %	0 %	25 %	229605282
5033	NC_012667	ATG	2	6	265304	265309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605282
5034	NC_012667	TACTT	2	10	265310	265319	20 %	60 %	0 %	20 %	229605282
5035	NC_012667	ATG	2	6	265373	265378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605282
5036	NC_012667	GAT	2	6	265463	265468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605282
5037	NC_012667	TTA	2	6	265547	265552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605282
5038	NC_012667	CGA	2	6	265560	265565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605282
5039	NC_012667	TAT	2	6	265664	265669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605282
5040	NC_012667	GC	4	8	265799	265806	0 %	0 %	50 %	50 %	229605282
5041	NC_012667	AGA	2	6	265807	265812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605282
5042	NC_012667	TA	3	6	265830	265835	50 %	50 %	0 %	0 %	229605282
5043	NC_012667	CTGG	2	8	265838	265845	0 %	25 %	50 %	25 %	229605282
5044	NC_012667	GCT	2	6	265852	265857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605282
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5046	NC_012667	CAT	2	6	265903	265908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605282
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5048	NC_012667	AG	3	6	266038	266043	50 %	0 %	50 %	0 %	229605282
5049	NC_012667	CAT	2	6	266053	266058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605282
5050	NC_012667	TCAA	2	8	266067	266074	50 %	25 %	0 %	25 %	229605282
5051	NC_012667	GCA	2	6	266080	266085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605282
5052	NC_012667	AGAGA	2	10	266153	266162	60 %	0 %	40 %	0 %	229605282
5053	NC_012667	AAC	2	6	266219	266224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605282
5054	NC_012667	AAT	2	6	266228	266233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605282
5055	NC_012667	CGAC	2	8	266268	266275	25 %	0 %	25 %	50 %	229605282
5056	NC_012667	GCTC	2	8	266300	266307	0 %	25 %	25 %	50 %	229605282
5057	NC_012667	GAA	2	6	266324	266329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605282
5058	NC_012667	CAG	2	6	266341	266346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605282
5059	NC_012667	CCT	2	6	266428	266433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605282
5060	NC_012667	CG	3	6	266458	266463	0 %	0 %	50 %	50 %	229605282
5061	NC_012667	CA	3	6	266552	266557	50 %	0 %	0 %	50 %	229605282
5062	NC_012667	TAC	2	6	266629	266634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605282
5063	NC_012667	A	6	6	266670	266675	100 %	0 %	0 %	0 %	229605282
5064	NC_012667	TAT	2	6	266695	266700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605282
5065	NC_012667	AGAGC	2	10	266734	266743	40 %	0 %	40 %	20 %	229605282
5066	NC_012667	CGG	2	6	266802	266807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605282
5067	NC_012667	TGG	2	6	266874	266879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605282
5068	NC_012667	GTT	2	6	266897	266902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012667	AGC	2	6	267009	267014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605283
5070	NC_012667	ATC	2	6	267163	267168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605283
5071	NC_012667	CAAT	2	8	267169	267176	50 %	25 %	0 %	25 %	229605283
5072	NC_012667	GC	3	6	267215	267220	0 %	0 %	50 %	50 %	229605283
5073	NC_012667	AGCC	2	8	267239	267246	25 %	0 %	25 %	50 %	229605283
5074	NC_012667	CCA	2	6	267266	267271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605283
5075	NC_012667	AG	3	6	267318	267323	50 %	0 %	50 %	0 %	229605283
5076	NC_012667	GC	3	6	267367	267372	0 %	0 %	50 %	50 %	229605283
5077	NC_012667	CTGCC	2	10	267378	267387	0 %	20 %	20 %	60 %	229605283
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5079	NC_012667	CA	3	6	267464	267469	50 %	0 %	0 %	50 %	229605283
5080	NC_012667	ACC	2	6	267504	267509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605283
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5083	NC_012667	GATC	2	8	267596	267603	25 %	25 %	25 %	25 %	229605283
5084	NC_012667	TGC	2	6	267656	267661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605283
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5090	NC_012667	TGTC	2	8	268229	268236	0 %	50 %	25 %	25 %	229605284
5091	NC_012667	CAT	2	6	268251	268256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605284
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5093	NC_012667	CAT	2	6	268280	268285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605284
5094	NC_012667	TTGGAA	2	12	268290	268301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605284
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5096	NC_012667	GGTA	2	8	268388	268395	25 %	25 %	50 %	0 %	229605284
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5099	NC_012667	T	6	6	268542	268547	0 %	100 %	0 %	0 %	229605284
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5102	NC_012667	TC	3	6	268718	268723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_012667	CTG	2	6	268781	268786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_012667	TGCT	2	8	268911	268918	0 %	50 %	25 %	25 %	229605285
5105	NC_012667	AAG	2	6	268937	268942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605285
5106	NC_012667	T	7	7	268966	268972	0 %	100 %	0 %	0 %	229605285
5107	NC_012667	CAGT	2	8	268979	268986	25 %	25 %	25 %	25 %	229605285
5108	NC_012667	TAAG	2	8	269118	269125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012667	CAA	2	6	269175	269180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605286
5110	NC_012667	TTG	2	6	269276	269281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605286
5111	NC_012667	TTC	2	6	269298	269303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605286
5112	NC_012667	TTG	2	6	269317	269322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605286
5113	NC_012667	GTCAT	2	10	269332	269341	20 %	40 %	20 %	20 %	229605286
5114	NC_012667	CT	3	6	269556	269561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_012667	T	7	7	269703	269709	0 %	100 %	0 %	0 %	229605287
5116	NC_012667	GAT	2	6	269710	269715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605287
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5118	NC_012667	AC	3	6	269752	269757	50 %	0 %	0 %	50 %	229605287
5119	NC_012667	TCA	2	6	269761	269766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605287
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5121	NC_012667	CAAAG	2	10	269864	269873	60 %	0 %	20 %	20 %	229605287
5122	NC_012667	CTG	2	6	269881	269886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605287
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5124	NC_012667	AATCTC	2	12	270093	270104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605287
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5373	NC_012667	CTT	2	6	282060	282065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605295
5374	NC_012667	AGG	2	6	282197	282202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605295
5375	NC_012667	TCA	2	6	282216	282221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605296
5376	NC_012667	TGT	2	6	282230	282235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605296
5377	NC_012667	GCG	2	6	282283	282288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605296
5378	NC_012667	GTG	2	6	282290	282295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605296
5379	NC_012667	TGG	2	6	282428	282433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605296
5380	NC_012667	CAG	2	6	282451	282456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605296
5381	NC_012667	CGT	2	6	282465	282470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605296
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5384	NC_012667	CGT	2	6	282511	282516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605296
5385	NC_012667	TCA	2	6	282614	282619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605296
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5388	NC_012667	TGA	2	6	282828	282833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605296
5389	NC_012667	CCTT	2	8	282835	282842	0 %	50 %	0 %	50 %	229605296
5390	NC_012667	TGC	2	6	282846	282851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605296
5391	NC_012667	ACT	2	6	282933	282938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605296
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5393	NC_012667	TACCG	2	10	283147	283156	20 %	20 %	20 %	40 %	229605297
5394	NC_012667	CG	3	6	283197	283202	0 %	0 %	50 %	50 %	229605297
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5397	NC_012667	CTATA	2	10	283402	283411	40 %	40 %	0 %	20 %	229605297
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5399	NC_012667	T	6	6	283524	283529	0 %	100 %	0 %	0 %	229605297
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5402	NC_012667	GTG	2	6	283767	283772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605298
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5405	NC_012667	CACGG	2	10	283903	283912	20 %	0 %	40 %	40 %	229605298
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5409	NC_012667	CT	3	6	284075	284080	0 %	50 %	0 %	50 %	229605298
5410	NC_012667	CTA	2	6	284092	284097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605298
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5412	NC_012667	TGA	2	6	284172	284177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605298
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5416	NC_012667	CT	3	6	284329	284334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5421	NC_012667	TCT	2	6	284654	284659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605299
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5432	NC_012667	CAG	2	6	285360	285365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605299
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5441	NC_012667	GTT	2	6	285868	285873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5444	NC_012667	TGC	2	6	286008	286013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605301
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5453	NC_012667	A	6	6	286804	286809	100 %	0 %	0 %	0 %	229605301
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5458	NC_012667	TGT	2	6	286974	286979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605301
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5465	NC_012667	AG	3	6	287374	287379	50 %	0 %	50 %	0 %	229605301
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5470	NC_012667	AG	3	6	287796	287801	50 %	0 %	50 %	0 %	229605302
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