MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012583	CAG	3	9	156288	156296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3002	NC_012583	TTG	2	6	156310	156315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119319
3003	NC_012583	ACA	2	6	156347	156352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119319
3004	NC_012583	AGC	2	6	156418	156423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3005	NC_012583	AAT	2	6	156424	156429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119319
3006	NC_012583	GCG	2	6	156485	156490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119319
3007	NC_012583	ATC	2	6	156516	156521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119319
3008	NC_012583	CTG	2	6	156661	156666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3009	NC_012583	GA	3	6	156667	156672	50 %	0 %	50 %	0 %	227119319
3010	NC_012583	AAT	2	6	156674	156679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119319
3011	NC_012583	TCA	2	6	156709	156714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119319
3012	NC_012583	CGA	2	6	156770	156775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3013	NC_012583	GCA	2	6	156799	156804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3014	NC_012583	TGC	2	6	156821	156826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3015	NC_012583	GCT	2	6	156860	156865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3016	NC_012583	GAT	2	6	156879	156884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119319
3017	NC_012583	AG	3	6	156897	156902	50 %	0 %	50 %	0 %	227119319
3018	NC_012583	TTG	2	6	157002	157007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119319
3019	NC_012583	ATC	2	6	157029	157034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119319
3020	NC_012583	GT	3	6	157052	157057	0 %	50 %	50 %	0 %	227119319
3021	NC_012583	TCA	2	6	157070	157075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119319
3022	NC_012583	GCGCT	2	10	157152	157161	0 %	20 %	40 %	40 %	227119319
3023	NC_012583	CAG	2	6	157215	157220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119319
3024	NC_012583	GGC	2	6	157356	157361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_012583	CAA	2	6	157401	157406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_012583	CGTT	2	8	157446	157453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_012583	ACTC	2	8	157489	157496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_012583	GCC	2	6	157501	157506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_012583	GTT	2	6	157522	157527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012583	ATTG	2	8	157572	157579	25 %	50 %	25 %	0 %	227119320
3031	NC_012583	GAC	3	9	157582	157590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3032	NC_012583	GCG	2	6	157672	157677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119320
3033	NC_012583	AGC	2	6	157682	157687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3034	NC_012583	CGC	2	6	157695	157700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119320
3035	NC_012583	GTG	2	6	157702	157707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119320
3036	NC_012583	TGG	2	6	157748	157753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119320
3037	NC_012583	GTCA	2	8	157906	157913	25 %	25 %	25 %	25 %	227119320
3038	NC_012583	CTG	2	6	158011	158016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3039	NC_012583	TGG	2	6	158093	158098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119320
3040	NC_012583	AGCG	2	8	158119	158126	25 %	0 %	50 %	25 %	227119320
3041	NC_012583	CGGTG	2	10	158220	158229	0 %	20 %	60 %	20 %	227119320
3042	NC_012583	GGA	2	6	158234	158239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119320
3043	NC_012583	TGC	2	6	158330	158335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3044	NC_012583	CCG	2	6	158482	158487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119320
3045	NC_012583	CGA	2	6	158502	158507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3046	NC_012583	TGC	2	6	158513	158518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3047	NC_012583	GCT	2	6	158586	158591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3048	NC_012583	GAA	3	9	158704	158712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119320
3049	NC_012583	CAG	2	6	158717	158722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119320
3050	NC_012583	AGTGA	2	10	158803	158812	40 %	20 %	40 %	0 %	227119320
3051	NC_012583	GTTTG	2	10	158862	158871	0 %	60 %	40 %	0 %	227119320
3052	NC_012583	AGG	2	6	158894	158899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119320
3053	NC_012583	TCA	2	6	158917	158922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_012583	TTA	2	6	158937	158942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012583	CG	3	6	159003	159008	0 %	0 %	50 %	50 %	227119321
3056	NC_012583	CGG	2	6	159014	159019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119321
3057	NC_012583	T	6	6	159020	159025	0 %	100 %	0 %	0 %	227119321
3058	NC_012583	TCT	2	6	159120	159125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_012583	AAT	2	6	159181	159186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119322
3060	NC_012583	GCC	2	6	159239	159244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119322
3061	NC_012583	GAA	2	6	159284	159289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119322
3062	NC_012583	GGA	2	6	159320	159325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119322
3063	NC_012583	TTA	2	6	159328	159333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119322
3064	NC_012583	TGA	2	6	159441	159446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119322
3065	NC_012583	GGGC	2	8	159501	159508	0 %	0 %	75 %	25 %	227119322
3066	NC_012583	CGG	2	6	159751	159756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119322
3067	NC_012583	CT	3	6	159869	159874	0 %	50 %	0 %	50 %	227119322
3068	NC_012583	CAC	2	6	159973	159978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119322
3069	NC_012583	GCG	2	6	160154	160159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119322
3070	NC_012583	TAC	2	6	160163	160168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119322
3071	NC_012583	AAG	2	6	160170	160175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119322
3072	NC_012583	AAAG	2	8	160273	160280	75 %	0 %	25 %	0 %	227119323
3073	NC_012583	TTC	2	6	160293	160298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119323
3074	NC_012583	CCG	2	6	160312	160317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_012583	GCT	2	6	160335	160340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012583	ACCCGT	2	12	160432	160443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_012583	TG	4	8	160475	160482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012583	CTG	2	6	160483	160488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_012583	GAT	2	6	160569	160574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012583	GC	3	6	160577	160582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_012583	TGT	2	6	160640	160645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_012583	AGA	2	6	160689	160694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_012583	CT	3	6	160697	160702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_012583	GAT	2	6	160773	160778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012583	CCG	2	6	160779	160784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_012583	GGTT	2	8	160792	160799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_012583	TCTG	2	8	160820	160827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_012583	GGC	2	6	160857	160862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_012583	CTG	2	6	160896	160901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_012583	GTTCAT	2	12	160967	160978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3091	NC_012583	CTT	2	6	160991	160996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012583	CAT	2	6	161021	161026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_012583	GTG	2	6	161055	161060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012583	G	7	7	161060	161066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_012583	TTA	2	6	161149	161154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_012583	ATG	2	6	161163	161168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_012583	A	6	6	161169	161174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_012583	CGC	2	6	161195	161200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_012583	GCC	2	6	161240	161245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_012583	TCA	2	6	161266	161271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_012583	CGT	2	6	161275	161280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_012583	TTG	2	6	161305	161310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012583	TGC	2	6	161428	161433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_012583	TGG	2	6	161482	161487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012583	CGG	2	6	161509	161514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_012583	TTG	2	6	161536	161541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012583	ACC	2	6	161622	161627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_012583	TGA	2	6	161701	161706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012583	CAA	2	6	161708	161713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_012583	CTG	2	6	161730	161735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_012583	CGG	2	6	161794	161799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_012583	CTG	2	6	161844	161849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_012583	TGG	2	6	161863	161868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_012583	GGC	2	6	161921	161926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_012583	GGC	2	6	161960	161965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_012583	ACA	2	6	162023	162028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_012583	TTA	2	6	162076	162081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012583	TCT	2	6	162082	162087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_012583	GT	3	6	162120	162125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012583	CCA	2	6	162145	162150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_012583	CCG	2	6	162162	162167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_012583	TCA	2	6	162244	162249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_012583	GGC	2	6	162340	162345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_012583	TGC	2	6	162385	162390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_012583	TG	3	6	162429	162434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012583	TTG	2	6	162543	162548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119324
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3247	NC_012583	CACC	2	8	169698	169705	25 %	0 %	0 %	75 %	227119328
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3496	NC_012583	TC	3	6	184331	184336	0 %	50 %	0 %	50 %	227119343
3497	NC_012583	CGG	2	6	184344	184349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119343
3498	NC_012583	A	6	6	184444	184449	100 %	0 %	0 %	0 %	227119343
3499	NC_012583	GCT	2	6	184459	184464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119343
3500	NC_012583	GATT	2	8	184491	184498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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