MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_012583	CAA	2	6	1034343	1034348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120239
19503	NC_012583	TCT	2	6	1034417	1034422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120239
19504	NC_012583	CAT	2	6	1034517	1034522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120239
19505	NC_012583	CTT	2	6	1034526	1034531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120239
19506	NC_012583	TGG	2	6	1034532	1034537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120239
19507	NC_012583	GGC	2	6	1034589	1034594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120239
19508	NC_012583	GCGG	2	8	1034599	1034606	0 %	0 %	75 %	25 %	227120239
19509	NC_012583	GT	3	6	1034615	1034620	0 %	50 %	50 %	0 %	227120239
19510	NC_012583	CTGGT	2	10	1034642	1034651	0 %	40 %	40 %	20 %	227120239
19511	NC_012583	CTG	2	6	1034686	1034691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120239
19512	NC_012583	TAA	2	6	1034697	1034702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120239
19513	NC_012583	GT	3	6	1034722	1034727	0 %	50 %	50 %	0 %	227120239
19514	NC_012583	GCAGCG	2	12	1034737	1034748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227120239
19515	NC_012583	TGA	2	6	1034774	1034779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120239
19516	NC_012583	A	7	7	1034899	1034905	100 %	0 %	0 %	0 %	227120239
19517	NC_012583	ATT	2	6	1034929	1034934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120239
19518	NC_012583	A	7	7	1034989	1034995	100 %	0 %	0 %	0 %	227120239
19519	NC_012583	ACTC	2	8	1035041	1035048	25 %	25 %	0 %	50 %	227120239
19520	NC_012583	CACC	2	8	1035072	1035079	25 %	0 %	0 %	75 %	227120239
19521	NC_012583	AAT	2	6	1035136	1035141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120239
19522	NC_012583	CAG	2	6	1035268	1035273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120239
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19525	NC_012583	TAA	2	6	1035357	1035362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120239
19526	NC_012583	ACCT	2	8	1035433	1035440	25 %	25 %	0 %	50 %	227120239
19527	NC_012583	GCG	2	6	1035551	1035556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120239
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19529	NC_012583	ACC	2	6	1035616	1035621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120239
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19531	NC_012583	CCA	2	6	1035704	1035709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120239
19532	NC_012583	ACCTC	2	10	1035775	1035784	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19533	NC_012583	GA	3	6	1035792	1035797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19534	NC_012583	AGGT	2	8	1035812	1035819	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_012583	TCA	2	6	1035952	1035957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120240
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19537	NC_012583	CCG	2	6	1036020	1036025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120240
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19539	NC_012583	CAT	2	6	1036177	1036182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120240
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19553	NC_012583	CAA	2	6	1036943	1036948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120240
19554	NC_012583	CT	3	6	1036956	1036961	0 %	50 %	0 %	50 %	227120240
19555	NC_012583	A	6	6	1036999	1037004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19557	NC_012583	A	6	6	1037085	1037090	100 %	0 %	0 %	0 %	227120241
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19585	NC_012583	AG	3	6	1038689	1038694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19586	NC_012583	TGA	2	6	1038736	1038741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19588	NC_012583	TGCT	2	8	1039025	1039032	0 %	50 %	25 %	25 %	227120243
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19596	NC_012583	CTGA	2	8	1039760	1039767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19598	NC_012583	A	6	6	1039859	1039864	100 %	0 %	0 %	0 %	227120244
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19609	NC_012583	A	6	6	1040569	1040574	100 %	0 %	0 %	0 %	227120244
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19615	NC_012583	TCA	2	6	1040937	1040942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120245
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19975	NC_012583	TTG	2	6	1058115	1058120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120262
19976	NC_012583	TTC	2	6	1058167	1058172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120262
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19978	NC_012583	T	6	6	1058347	1058352	0 %	100 %	0 %	0 %	227120262
19979	NC_012583	CGA	2	6	1058372	1058377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120262
19980	NC_012583	TTG	2	6	1058380	1058385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120262
19981	NC_012583	ACG	2	6	1058433	1058438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120262
19982	NC_012583	CAAG	2	8	1058543	1058550	50 %	0 %	25 %	25 %	227120262
19983	NC_012583	GCT	2	6	1058597	1058602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120262
19984	NC_012583	GGC	2	6	1058901	1058906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120262
19985	NC_012583	CAAT	2	8	1058912	1058919	50 %	25 %	0 %	25 %	227120262
19986	NC_012583	GCT	2	6	1059010	1059015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120262
19987	NC_012583	CTT	2	6	1059020	1059025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120262
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19989	NC_012583	GTA	2	6	1059108	1059113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120262
19990	NC_012583	GTCT	2	8	1059142	1059149	0 %	50 %	25 %	25 %	227120262
19991	NC_012583	CTAACT	2	12	1059161	1059172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120262
19992	NC_012583	TTC	2	6	1059189	1059194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120262
19993	NC_012583	GCT	2	6	1059215	1059220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120262
19994	NC_012583	ACTTTC	2	12	1059273	1059284	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227120262
19995	NC_012583	CGCC	2	8	1059288	1059295	0 %	0 %	25 %	75 %	227120262
19996	NC_012583	GCG	2	6	1059325	1059330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120262
19997	NC_012583	CGC	3	9	1059336	1059344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120262
19998	NC_012583	AGC	2	6	1059692	1059697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19999	NC_012583	CGCT	2	8	1059807	1059814	0 %	25 %	25 %	50 %	227120263
20000	NC_012583	CTG	2	6	1059819	1059824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120263

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