MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_012583	T	6	6	983354	983359	0 %	100 %	0 %	0 %	227120185
18503	NC_012583	TGC	2	6	983418	983423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185
18504	NC_012583	TGC	2	6	983547	983552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185
18505	NC_012583	ATC	2	6	983567	983572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120185
18506	NC_012583	CGG	2	6	983611	983616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120185
18507	NC_012583	CGT	2	6	983690	983695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185
18508	NC_012583	CCA	2	6	983752	983757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120185
18509	NC_012583	CAGC	2	8	983773	983780	25 %	0 %	25 %	50 %	227120185
18510	NC_012583	TGC	2	6	983787	983792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185
18511	NC_012583	TGAG	2	8	983853	983860	25 %	25 %	50 %	0 %	227120185
18512	NC_012583	TGC	2	6	983913	983918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185
18513	NC_012583	CGCCAA	2	12	983987	983998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227120185
18514	NC_012583	GA	3	6	984101	984106	50 %	0 %	50 %	0 %	227120185
18515	NC_012583	A	6	6	984140	984145	100 %	0 %	0 %	0 %	227120185
18516	NC_012583	TCT	2	6	984249	984254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18517	NC_012583	CT	3	6	984253	984258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18518	NC_012583	ACT	2	6	984272	984277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120186
18519	NC_012583	TCAA	2	8	984307	984314	50 %	25 %	0 %	25 %	227120186
18520	NC_012583	GGC	2	6	984353	984358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120186
18521	NC_012583	TTC	2	6	984412	984417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120186
18522	NC_012583	GCT	2	6	984446	984451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
18523	NC_012583	CAT	2	6	984533	984538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120186
18524	NC_012583	TGC	2	6	984574	984579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
18525	NC_012583	TGC	2	6	984617	984622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
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18527	NC_012583	CTG	2	6	984748	984753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
18528	NC_012583	CAC	2	6	984777	984782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120186
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18532	NC_012583	TGC	2	6	984941	984946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
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18534	NC_012583	TGA	2	6	985003	985008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120186
18535	NC_012583	GA	3	6	985033	985038	50 %	0 %	50 %	0 %	227120186
18536	NC_012583	TGC	2	6	985046	985051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120186
18537	NC_012583	AACTC	2	10	985121	985130	40 %	20 %	0 %	40 %	227120186
18538	NC_012583	GCC	2	6	985141	985146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120186
18539	NC_012583	ATT	2	6	985222	985227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_012583	CAAT	2	8	985241	985248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18541	NC_012583	ACG	3	9	985420	985428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120187
18542	NC_012583	ACC	2	6	985434	985439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120187
18543	NC_012583	AAAG	2	8	985479	985486	75 %	0 %	25 %	0 %	227120187
18544	NC_012583	CAT	2	6	985514	985519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120187
18545	NC_012583	GCAGC	2	10	985586	985595	20 %	0 %	40 %	40 %	227120187
18546	NC_012583	A	6	6	985612	985617	100 %	0 %	0 %	0 %	227120187
18547	NC_012583	CAA	2	6	985674	985679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120187
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18549	NC_012583	CGC	2	6	985738	985743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120187
18550	NC_012583	TGCAAG	2	12	985753	985764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227120187
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18552	NC_012583	TGA	2	6	985826	985831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120187
18553	NC_012583	GC	3	6	985867	985872	0 %	0 %	50 %	50 %	227120187
18554	NC_012583	TTG	2	6	985941	985946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120187
18555	NC_012583	AGG	2	6	985979	985984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120187
18556	NC_012583	ATT	2	6	985997	986002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120188
18557	NC_012583	AACC	2	8	986005	986012	50 %	0 %	0 %	50 %	227120188
18558	NC_012583	AAC	2	6	986020	986025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120188
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18562	NC_012583	GAT	2	6	986172	986177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120188
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18565	NC_012583	TGG	2	6	986410	986415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120188
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18567	NC_012583	GGC	2	6	986480	986485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120188
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18590	NC_012583	CGCC	2	8	987875	987882	0 %	0 %	25 %	75 %	227120189
18591	NC_012583	GC	3	6	988015	988020	0 %	0 %	50 %	50 %	227120189
18592	NC_012583	GGC	2	6	988105	988110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120189
18593	NC_012583	GCA	2	6	988138	988143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120189
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18596	NC_012583	TGA	2	6	988253	988258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_012583	A	6	6	988290	988295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_012583	ACG	2	6	988396	988401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120190
18599	NC_012583	CT	3	6	988513	988518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18600	NC_012583	GCC	2	6	988527	988532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18601	NC_012583	CCCA	2	8	988612	988619	25 %	0 %	0 %	75 %	227120191
18602	NC_012583	TC	3	6	988716	988721	0 %	50 %	0 %	50 %	227120191
18603	NC_012583	CCA	2	6	988758	988763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120191
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18605	NC_012583	CTG	2	6	988862	988867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120191
18606	NC_012583	CCA	2	6	988870	988875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120191
18607	NC_012583	GTTG	2	8	988908	988915	0 %	50 %	50 %	0 %	227120191
18608	NC_012583	TGA	2	6	989022	989027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120191
18609	NC_012583	TGGC	2	8	989126	989133	0 %	25 %	50 %	25 %	227120191
18610	NC_012583	TTACG	2	10	989137	989146	20 %	40 %	20 %	20 %	227120191
18611	NC_012583	A	6	6	989174	989179	100 %	0 %	0 %	0 %	227120191
18612	NC_012583	TCG	2	6	989226	989231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120191
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18618	NC_012583	TCACCG	2	12	989583	989594	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227120191
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18979	NC_012583	GGCGCT	2	12	1007389	1007400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227120215
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18981	NC_012583	T	6	6	1007529	1007534	0 %	100 %	0 %	0 %	227120215
18982	NC_012583	TTC	2	6	1007544	1007549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120215
18983	NC_012583	A	6	6	1007638	1007643	100 %	0 %	0 %	0 %	227120215
18984	NC_012583	GTAA	2	8	1007687	1007694	50 %	25 %	25 %	0 %	227120215
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18987	NC_012583	CTG	2	6	1007822	1007827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120215
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