MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012583	TA	3	6	956367	956372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_012583	GGC	2	6	956617	956622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_012583	GAAC	2	8	956669	956676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18004	NC_012583	ATT	2	6	956740	956745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_012583	GTT	2	6	956761	956766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_012583	TCA	2	6	956824	956829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120167
18007	NC_012583	CT	3	6	956830	956835	0 %	50 %	0 %	50 %	227120167
18008	NC_012583	TGC	2	6	956858	956863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120167
18009	NC_012583	TGC	2	6	956951	956956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120167
18010	NC_012583	CGC	2	6	957177	957182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120167
18011	NC_012583	TC	3	6	957261	957266	0 %	50 %	0 %	50 %	227120168
18012	NC_012583	AGT	2	6	957299	957304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120168
18013	NC_012583	CAT	2	6	957312	957317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
18014	NC_012583	CAAAA	2	10	957327	957336	80 %	0 %	0 %	20 %	227120168
18015	NC_012583	ATC	2	6	957373	957378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
18016	NC_012583	CCAG	2	8	957385	957392	25 %	0 %	25 %	50 %	227120168
18017	NC_012583	AAC	2	6	957625	957630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120168
18018	NC_012583	AATAA	2	10	957667	957676	80 %	20 %	0 %	0 %	227120168
18019	NC_012583	CCA	2	6	957707	957712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120168
18020	NC_012583	AAAC	2	8	957779	957786	75 %	0 %	0 %	25 %	227120168
18021	NC_012583	ATC	2	6	957787	957792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
18022	NC_012583	CAT	2	6	957807	957812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
18023	NC_012583	GTT	2	6	957884	957889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120168
18024	NC_012583	ATG	2	6	958153	958158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120168
18025	NC_012583	GATTT	2	10	958170	958179	20 %	60 %	20 %	0 %	227120168
18026	NC_012583	CTGTCG	2	12	958328	958339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120168
18027	NC_012583	A	6	6	958386	958391	100 %	0 %	0 %	0 %	227120168
18028	NC_012583	GC	3	6	958398	958403	0 %	0 %	50 %	50 %	227120168
18029	NC_012583	ACCC	2	8	958449	958456	25 %	0 %	0 %	75 %	227120168
18030	NC_012583	ACT	2	6	958479	958484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120168
18031	NC_012583	TCCCT	2	10	958519	958528	0 %	40 %	0 %	60 %	227120168
18032	NC_012583	TTG	2	6	958541	958546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120168
18033	NC_012583	TTTG	2	8	958564	958571	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_012583	TTC	2	6	958576	958581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_012583	A	6	6	958593	958598	100 %	0 %	0 %	0 %	227120169
18036	NC_012583	AAAT	2	8	958639	958646	75 %	25 %	0 %	0 %	227120169
18037	NC_012583	TTAA	2	8	958658	958665	50 %	50 %	0 %	0 %	227120169
18038	NC_012583	ACAG	2	8	958677	958684	50 %	0 %	25 %	25 %	227120169
18039	NC_012583	GAA	2	6	958696	958701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120169
18040	NC_012583	A	6	6	958706	958711	100 %	0 %	0 %	0 %	227120169
18041	NC_012583	TAT	2	6	958725	958730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120169
18042	NC_012583	GAA	2	6	958813	958818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120170
18043	NC_012583	AG	3	6	958819	958824	50 %	0 %	50 %	0 %	227120170
18044	NC_012583	CTGA	2	8	958879	958886	25 %	25 %	25 %	25 %	227120170
18045	NC_012583	TGC	2	6	958961	958966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120170
18046	NC_012583	CCG	2	6	958968	958973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120170
18047	NC_012583	TTG	2	6	959112	959117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120170
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18049	NC_012583	TGCG	2	8	959168	959175	0 %	25 %	50 %	25 %	227120170
18050	NC_012583	CGC	2	6	959251	959256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120170
18051	NC_012583	CAG	2	6	959266	959271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120170
18052	NC_012583	AC	3	6	959286	959291	50 %	0 %	0 %	50 %	227120170
18053	NC_012583	GCA	2	6	959357	959362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120170
18054	NC_012583	CT	3	6	959402	959407	0 %	50 %	0 %	50 %	227120170
18055	NC_012583	AGA	2	6	959467	959472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120170
18056	NC_012583	TTCA	2	8	959509	959516	25 %	50 %	0 %	25 %	227120170
18057	NC_012583	TCA	2	6	959577	959582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120170
18058	NC_012583	GCA	2	6	959585	959590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120170
18059	NC_012583	GTG	2	6	959645	959650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120170
18060	NC_012583	TG	3	6	959657	959662	0 %	50 %	50 %	0 %	227120170
18061	NC_012583	GGT	2	6	959665	959670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120170
18062	NC_012583	AG	3	6	959728	959733	50 %	0 %	50 %	0 %	227120170
18063	NC_012583	AGC	2	6	959801	959806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120170
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18066	NC_012583	TCT	2	6	960048	960053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120170
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18073	NC_012583	A	6	6	960490	960495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_012583	AAT	2	6	960565	960570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_012583	A	7	7	960599	960605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_012583	TTG	2	6	960667	960672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_012583	AG	4	8	960691	960698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_012583	CAT	2	6	960769	960774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
18079	NC_012583	GC	3	6	960882	960887	0 %	0 %	50 %	50 %	227120171
18080	NC_012583	AC	3	6	960956	960961	50 %	0 %	0 %	50 %	227120171
18081	NC_012583	AAG	2	6	960966	960971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120171
18082	NC_012583	TCT	2	6	960979	960984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120171
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18084	NC_012583	CCACC	2	10	961120	961129	20 %	0 %	0 %	80 %	227120171
18085	NC_012583	GTGCG	2	10	961171	961180	0 %	20 %	60 %	20 %	227120171
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18089	NC_012583	GTG	2	6	961398	961403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120171
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18093	NC_012583	GCA	2	6	961537	961542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120171
18094	NC_012583	GTTTG	2	10	961573	961582	0 %	60 %	40 %	0 %	227120171
18095	NC_012583	GTG	2	6	961590	961595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120171
18096	NC_012583	GC	3	6	961616	961621	0 %	0 %	50 %	50 %	227120171
18097	NC_012583	GCA	2	6	961642	961647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120171
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18101	NC_012583	CTT	2	6	961873	961878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120171
18102	NC_012583	ATCC	2	8	961927	961934	25 %	25 %	0 %	50 %	227120171
18103	NC_012583	CA	3	6	961935	961940	50 %	0 %	0 %	50 %	227120171
18104	NC_012583	AGC	2	6	961974	961979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120171
18105	NC_012583	ACC	2	6	961982	961987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120171
18106	NC_012583	AG	3	6	962019	962024	50 %	0 %	50 %	0 %	227120171
18107	NC_012583	AG	3	6	962076	962081	50 %	0 %	50 %	0 %	227120171
18108	NC_012583	CTC	2	6	962096	962101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120171
18109	NC_012583	T	7	7	962167	962173	0 %	100 %	0 %	0 %	227120171
18110	NC_012583	TCA	2	6	962214	962219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
18111	NC_012583	TACT	2	8	962286	962293	25 %	50 %	0 %	25 %	227120171
18112	NC_012583	T	6	6	962309	962314	0 %	100 %	0 %	0 %	227120171
18113	NC_012583	TCA	2	6	962346	962351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
18114	NC_012583	T	6	6	962357	962362	0 %	100 %	0 %	0 %	227120171
18115	NC_012583	TCA	2	6	962433	962438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
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18117	NC_012583	GAG	2	6	962542	962547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120171
18118	NC_012583	ACTC	2	8	962558	962565	25 %	25 %	0 %	50 %	227120171
18119	NC_012583	T	6	6	962628	962633	0 %	100 %	0 %	0 %	227120171
18120	NC_012583	TCA	2	6	962701	962706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120171
18121	NC_012583	GGC	2	6	962833	962838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120171
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18123	NC_012583	TTGA	2	8	962913	962920	25 %	50 %	25 %	0 %	227120171
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18484	NC_012583	CCA	2	6	982245	982250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120184
18485	NC_012583	GCC	2	6	982274	982279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120184
18486	NC_012583	CGC	2	6	982282	982287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120184
18487	NC_012583	GCC	2	6	982354	982359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120184
18488	NC_012583	CTG	2	6	982448	982453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120184
18489	NC_012583	AGCTG	2	10	982489	982498	20 %	20 %	40 %	20 %	227120184
18490	NC_012583	GCGCT	2	10	982643	982652	0 %	20 %	40 %	40 %	227120184
18491	NC_012583	TTGT	2	8	982672	982679	0 %	75 %	25 %	0 %	227120184
18492	NC_012583	ATT	2	6	982739	982744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120184
18493	NC_012583	GCA	2	6	982754	982759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120184
18494	NC_012583	A	6	6	982831	982836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18495	NC_012583	AAG	2	6	982846	982851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_012583	TG	3	6	982944	982949	0 %	50 %	50 %	0 %	227120185
18497	NC_012583	AC	3	6	983096	983101	50 %	0 %	0 %	50 %	227120185
18498	NC_012583	TGC	2	6	983121	983126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185
18499	NC_012583	ACGT	2	8	983157	983164	25 %	25 %	25 %	25 %	227120185
18500	NC_012583	GCT	2	6	983206	983211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120185

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