MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_012583	TAAC	2	8	902222	902229	50 %	25 %	0 %	25 %	227120104
17002	NC_012583	GAC	2	6	902235	902240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120104
17003	NC_012583	TAT	2	6	902372	902377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120105
17004	NC_012583	TGT	2	6	902384	902389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120105
17005	NC_012583	TGC	2	6	902390	902395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120105
17006	NC_012583	TCA	2	6	902441	902446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120105
17007	NC_012583	AGAT	2	8	902453	902460	50 %	25 %	25 %	0 %	227120105
17008	NC_012583	AAG	2	6	902489	902494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120105
17009	NC_012583	AGT	2	6	902499	902504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120105
17010	NC_012583	GTA	2	6	902605	902610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120105
17011	NC_012583	GTG	2	6	902681	902686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120105
17012	NC_012583	CCA	2	6	902739	902744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120105
17013	NC_012583	TAA	2	6	902821	902826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120105
17014	NC_012583	TGC	2	6	902834	902839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120105
17015	NC_012583	TGT	2	6	902861	902866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120105
17016	NC_012583	T	6	6	902880	902885	0 %	100 %	0 %	0 %	227120105
17017	NC_012583	TTATGC	2	12	902895	902906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227120105
17018	NC_012583	GCT	2	6	902912	902917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120105
17019	NC_012583	GAAT	2	8	902932	902939	50 %	25 %	25 %	0 %	227120105
17020	NC_012583	CGG	2	6	902987	902992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120106
17021	NC_012583	TTG	2	6	903036	903041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120106
17022	NC_012583	TGG	2	6	903079	903084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120106
17023	NC_012583	GGC	2	6	903144	903149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120106
17024	NC_012583	CAT	2	6	903180	903185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120106
17025	NC_012583	CCCG	2	8	903270	903277	0 %	0 %	25 %	75 %	227120106
17026	NC_012583	GAT	2	6	903383	903388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120106
17027	NC_012583	GTA	2	6	903439	903444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120106
17028	NC_012583	ACG	2	6	903502	903507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120106
17029	NC_012583	AATC	2	8	903518	903525	50 %	25 %	0 %	25 %	227120106
17030	NC_012583	GTAGA	2	10	903597	903606	40 %	20 %	40 %	0 %	227120106
17031	NC_012583	TTG	2	6	903624	903629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120106
17032	NC_012583	CAC	2	6	903660	903665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120106
17033	NC_012583	ATC	2	6	903672	903677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120106
17034	NC_012583	TCA	2	6	903772	903777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120106
17035	NC_012583	GA	3	6	903875	903880	50 %	0 %	50 %	0 %	227120106
17036	NC_012583	C	6	6	903894	903899	0 %	0 %	0 %	100 %	227120106
17037	NC_012583	TTTG	2	8	903953	903960	0 %	75 %	25 %	0 %	227120106
17038	NC_012583	CCA	2	6	903992	903997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120106
17039	NC_012583	CGC	2	6	904008	904013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120106
17040	NC_012583	GAA	2	6	904020	904025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120106
17041	NC_012583	TTG	2	6	904101	904106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120106
17042	NC_012583	TCA	2	6	904237	904242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120106
17043	NC_012583	ACA	2	6	904288	904293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17044	NC_012583	TAT	2	6	904368	904373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_012583	AAT	2	6	904387	904392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_012583	AG	3	6	904495	904500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_012583	TTG	2	6	904513	904518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_012583	ATC	2	6	904519	904524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_012583	CTG	2	6	904637	904642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120107
17050	NC_012583	AAG	2	6	904763	904768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120107
17051	NC_012583	AAACCT	2	12	904810	904821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227120107
17052	NC_012583	A	6	6	904831	904836	100 %	0 %	0 %	0 %	227120107
17053	NC_012583	AGCC	2	8	904951	904958	25 %	0 %	25 %	50 %	227120107
17054	NC_012583	CGG	2	6	904961	904966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120107
17055	NC_012583	TGG	2	6	904997	905002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120107
17056	NC_012583	TTGG	2	8	905094	905101	0 %	50 %	50 %	0 %	227120107
17057	NC_012583	AATCA	2	10	905113	905122	60 %	20 %	0 %	20 %	227120107
17058	NC_012583	AGC	2	6	905123	905128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120107
17059	NC_012583	CT	3	6	905134	905139	0 %	50 %	0 %	50 %	227120107
17060	NC_012583	ACA	2	6	905285	905290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120108
17061	NC_012583	TGC	2	6	905353	905358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120108
17062	NC_012583	TGC	2	6	905380	905385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120108
17063	NC_012583	A	6	6	905441	905446	100 %	0 %	0 %	0 %	227120108
17064	NC_012583	GCG	2	6	905562	905567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120108
17065	NC_012583	GCC	2	6	905700	905705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120108
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17067	NC_012583	TGC	2	6	906048	906053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120109
17068	NC_012583	TGAA	2	8	906117	906124	50 %	25 %	25 %	0 %	227120109
17069	NC_012583	CGC	2	6	906265	906270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120109
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17073	NC_012583	CTG	2	6	906419	906424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120110
17074	NC_012583	ACTGA	2	10	906480	906489	40 %	20 %	20 %	20 %	227120110
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17078	NC_012583	TACC	2	8	906562	906569	25 %	25 %	0 %	50 %	227120110
17079	NC_012583	CCG	2	6	906581	906586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120110
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17086	NC_012583	G	6	6	907055	907060	0 %	0 %	100 %	0 %	227120110
17087	NC_012583	CAG	2	6	907105	907110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120110
17088	NC_012583	CGG	2	6	907154	907159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120110
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17091	NC_012583	TCT	2	6	907281	907286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120111
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17093	NC_012583	TTTG	2	8	907428	907435	0 %	75 %	25 %	0 %	227120111
17094	NC_012583	TTGG	2	8	907436	907443	0 %	50 %	50 %	0 %	227120111
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17100	NC_012583	CTGG	2	8	907706	907713	0 %	25 %	50 %	25 %	227120111
17101	NC_012583	GCGA	2	8	907766	907773	25 %	0 %	50 %	25 %	227120111
17102	NC_012583	TGC	2	6	907779	907784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120111
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17104	NC_012583	GC	3	6	907931	907936	0 %	0 %	50 %	50 %	227120111
17105	NC_012583	AG	3	6	907967	907972	50 %	0 %	50 %	0 %	227120111
17106	NC_012583	TGG	2	6	908070	908075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120111
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17110	NC_012583	CAA	2	6	908237	908242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120111
17111	NC_012583	GCT	2	6	908406	908411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120112
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17118	NC_012583	ACTC	2	8	908709	908716	25 %	25 %	0 %	50 %	227120112
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17120	NC_012583	ACA	2	6	908792	908797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120112
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17122	NC_012583	GAA	2	6	908827	908832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120112
17123	NC_012583	CGT	3	9	908841	908849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120112
17124	NC_012583	TCA	2	6	908904	908909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120112
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17129	NC_012583	TCA	2	6	909059	909064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17364	NC_012583	AAC	2	6	922082	922087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17365	NC_012583	TGT	2	6	922114	922119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17500	NC_012583	AGA	2	6	929083	929088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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