MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012583	CCT	2	6	852138	852143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120060
16002	NC_012583	AATG	2	8	852151	852158	50 %	25 %	25 %	0 %	227120060
16003	NC_012583	TGGC	2	8	852238	852245	0 %	25 %	50 %	25 %	227120060
16004	NC_012583	CAT	2	6	852298	852303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120060
16005	NC_012583	TTA	2	6	852368	852373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120060
16006	NC_012583	CCG	2	6	852393	852398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120060
16007	NC_012583	TGC	2	6	852406	852411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120060
16008	NC_012583	TCA	2	6	852426	852431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120060
16009	NC_012583	A	6	6	852609	852614	100 %	0 %	0 %	0 %	227120060
16010	NC_012583	GCG	2	6	852627	852632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120060
16011	NC_012583	CG	3	6	852702	852707	0 %	0 %	50 %	50 %	227120060
16012	NC_012583	GCA	2	6	852735	852740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120060
16013	NC_012583	AAAC	2	8	852761	852768	75 %	0 %	0 %	25 %	227120060
16014	NC_012583	A	7	7	852875	852881	100 %	0 %	0 %	0 %	227120060
16015	NC_012583	TAC	2	6	852947	852952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120060
16016	NC_012583	ACC	2	6	853088	853093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120060
16017	NC_012583	TGC	2	6	853258	853263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120060
16018	NC_012583	CAC	2	6	853297	853302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120060
16019	NC_012583	AGC	2	6	853510	853515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120060
16020	NC_012583	CATT	2	8	853601	853608	25 %	50 %	0 %	25 %	227120060
16021	NC_012583	CAA	2	6	853645	853650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120060
16022	NC_012583	CTG	2	6	853665	853670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120060
16023	NC_012583	GCG	2	6	853697	853702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120060
16024	NC_012583	CTA	2	6	853733	853738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120060
16025	NC_012583	T	6	6	853751	853756	0 %	100 %	0 %	0 %	227120060
16026	NC_012583	GAT	2	6	853838	853843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120060
16027	NC_012583	TGCT	2	8	853846	853853	0 %	50 %	25 %	25 %	227120060
16028	NC_012583	AGC	2	6	853884	853889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120060
16029	NC_012583	GCG	2	6	853928	853933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120060
16030	NC_012583	AAT	2	6	853985	853990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120060
16031	NC_012583	ACCAC	2	10	854000	854009	40 %	0 %	0 %	60 %	227120060
16032	NC_012583	CTTG	2	8	854122	854129	0 %	50 %	25 %	25 %	227120060
16033	NC_012583	GTTCA	2	10	854183	854192	20 %	40 %	20 %	20 %	227120060
16034	NC_012583	TTG	2	6	854217	854222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120060
16035	NC_012583	CAT	2	6	854255	854260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120060
16036	NC_012583	CTT	2	6	854354	854359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_012583	T	6	6	854402	854407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_012583	A	6	6	854417	854422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_012583	TAA	2	6	854499	854504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_012583	ATAA	2	8	854513	854520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_012583	TTA	2	6	854535	854540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_012583	AAC	2	6	854567	854572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_012583	TGC	2	6	854748	854753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120061
16044	NC_012583	GGT	2	6	854758	854763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120061
16045	NC_012583	TTG	2	6	854777	854782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120061
16046	NC_012583	CAAAAA	2	12	854834	854845	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	227120061
16047	NC_012583	CAT	2	6	854999	855004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120061
16048	NC_012583	T	6	6	855009	855014	0 %	100 %	0 %	0 %	227120061
16049	NC_012583	CAA	2	6	855038	855043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120061
16050	NC_012583	CT	3	6	855061	855066	0 %	50 %	0 %	50 %	227120061
16051	NC_012583	A	6	6	855107	855112	100 %	0 %	0 %	0 %	227120061
16052	NC_012583	AGT	2	6	855173	855178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120061
16053	NC_012583	TGA	2	6	855180	855185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120061
16054	NC_012583	ATT	2	6	855296	855301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120061
16055	NC_012583	TGA	2	6	855382	855387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120061
16056	NC_012583	GGC	2	6	855424	855429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120061
16057	NC_012583	CCT	2	6	855495	855500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120061
16058	NC_012583	TA	3	6	855531	855536	50 %	50 %	0 %	0 %	227120061
16059	NC_012583	A	6	6	855690	855695	100 %	0 %	0 %	0 %	227120061
16060	NC_012583	TGG	2	6	855696	855701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120061
16061	NC_012583	ACA	2	6	855721	855726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120061
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16063	NC_012583	TC	3	6	855745	855750	0 %	50 %	0 %	50 %	227120061
16064	NC_012583	ACCAA	2	10	855795	855804	60 %	0 %	0 %	40 %	227120061
16065	NC_012583	GCG	2	6	855833	855838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120061
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16069	NC_012583	GTG	2	6	855935	855940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120061
16070	NC_012583	TC	3	6	855990	855995	0 %	50 %	0 %	50 %	227120061
16071	NC_012583	CAT	2	6	856039	856044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120061
16072	NC_012583	CGG	2	6	856080	856085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120061
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16074	NC_012583	AGGT	2	8	856165	856172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_012583	ACATG	2	10	856230	856239	40 %	20 %	20 %	20 %	227120062
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16087	NC_012583	TACG	2	8	856668	856675	25 %	25 %	25 %	25 %	227120062
16088	NC_012583	CG	3	6	856708	856713	0 %	0 %	50 %	50 %	227120062
16089	NC_012583	ATCG	2	8	856775	856782	25 %	25 %	25 %	25 %	227120062
16090	NC_012583	GGA	2	6	856822	856827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120062
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16101	NC_012583	T	6	6	857388	857393	0 %	100 %	0 %	0 %	227120062
16102	NC_012583	CCG	2	6	857399	857404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120062
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16104	NC_012583	A	6	6	857515	857520	100 %	0 %	0 %	0 %	227120062
16105	NC_012583	ATC	2	6	857554	857559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120062
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16108	NC_012583	GA	3	6	857684	857689	50 %	0 %	50 %	0 %	227120062
16109	NC_012583	CTG	2	6	857701	857706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120062
16110	NC_012583	CCA	2	6	857754	857759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120062
16111	NC_012583	CTG	2	6	857794	857799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120062
16112	NC_012583	GGC	2	6	857860	857865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120062
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16116	NC_012583	CAT	2	6	857916	857921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120062
16117	NC_012583	AG	3	6	857946	857951	50 %	0 %	50 %	0 %	227120062
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16119	NC_012583	TCAA	2	8	858091	858098	50 %	25 %	0 %	25 %	227120063
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16491	NC_012583	AGCAC	2	10	876323	876332	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16492	NC_012583	TAAAC	2	10	876436	876445	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16493	NC_012583	AAT	2	6	876463	876468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16494	NC_012583	ATT	2	6	876507	876512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_012583	CTT	2	6	876521	876526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16496	NC_012583	GAT	2	6	876543	876548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16497	NC_012583	AAAC	2	8	876556	876563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16498	NC_012583	GA	3	6	876703	876708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16499	NC_012583	ATG	2	6	876759	876764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120083
16500	NC_012583	GTG	2	6	876797	876802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120083

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