MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_012583	GCCA	2	8	824921	824928	25 %	0 %	25 %	50 %	227120041
15502	NC_012583	GCA	2	6	824935	824940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120041
15503	NC_012583	CGC	2	6	824989	824994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120041
15504	NC_012583	CTCG	2	8	825065	825072	0 %	25 %	25 %	50 %	227120041
15505	NC_012583	GCG	2	6	825090	825095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120041
15506	NC_012583	TTG	2	6	825123	825128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120041
15507	NC_012583	GTG	2	6	825132	825137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120041
15508	NC_012583	TCA	2	6	825258	825263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120041
15509	NC_012583	TGG	3	9	825327	825335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120041
15510	NC_012583	GTG	2	6	825443	825448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120041
15511	NC_012583	ATT	2	6	825488	825493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120041
15512	NC_012583	CAC	2	6	825508	825513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120041
15513	NC_012583	CGT	2	6	825638	825643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120041
15514	NC_012583	ATTCG	2	10	825741	825750	20 %	40 %	20 %	20 %	227120041
15515	NC_012583	TGG	2	6	825912	825917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120041
15516	NC_012583	GAT	2	6	826042	826047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120041
15517	NC_012583	AAC	2	6	826161	826166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_012583	TGC	2	6	826176	826181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_012583	GCC	2	6	826227	826232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120042
15520	NC_012583	T	6	6	826250	826255	0 %	100 %	0 %	0 %	227120042
15521	NC_012583	GGA	2	6	826370	826375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120042
15522	NC_012583	GT	3	6	826422	826427	0 %	50 %	50 %	0 %	227120043
15523	NC_012583	CTG	2	6	826445	826450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120043
15524	NC_012583	CG	3	6	826517	826522	0 %	0 %	50 %	50 %	227120043
15525	NC_012583	TTCAA	2	10	826524	826533	40 %	40 %	0 %	20 %	227120043
15526	NC_012583	AATGA	2	10	826644	826653	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_012583	GCACG	2	10	826720	826729	20 %	0 %	40 %	40 %	227120044
15528	NC_012583	GC	3	6	826731	826736	0 %	0 %	50 %	50 %	227120044
15529	NC_012583	TGA	2	6	826813	826818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120044
15530	NC_012583	CGC	2	6	826823	826828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120044
15531	NC_012583	AAC	2	6	826869	826874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120044
15532	NC_012583	A	6	6	826880	826885	100 %	0 %	0 %	0 %	227120044
15533	NC_012583	CT	3	6	826925	826930	0 %	50 %	0 %	50 %	227120044
15534	NC_012583	GGC	2	6	827027	827032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120044
15535	NC_012583	ACG	2	6	827079	827084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120044
15536	NC_012583	TAA	2	6	827101	827106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120044
15537	NC_012583	AGC	2	6	827141	827146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120044
15538	NC_012583	CCA	2	6	827188	827193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120044
15539	NC_012583	GAGC	2	8	827293	827300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15540	NC_012583	TTGA	2	8	827362	827369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_012583	ATGGA	2	10	827408	827417	40 %	20 %	40 %	0 %	227120045
15542	NC_012583	ACG	2	6	827509	827514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120045
15543	NC_012583	GCT	3	9	827589	827597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120045
15544	NC_012583	TTG	2	6	827600	827605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120045
15545	NC_012583	G	6	6	827661	827666	0 %	0 %	100 %	0 %	227120045
15546	NC_012583	GTT	2	6	827724	827729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120045
15547	NC_012583	CGC	2	6	827772	827777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120045
15548	NC_012583	CTG	2	6	827821	827826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120045
15549	NC_012583	TCA	2	6	827881	827886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120045
15550	NC_012583	TGG	2	6	827941	827946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120045
15551	NC_012583	GTG	2	6	827948	827953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120045
15552	NC_012583	AGGA	2	8	827993	828000	50 %	0 %	50 %	0 %	227120045
15553	NC_012583	CGT	3	9	828162	828170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120045
15554	NC_012583	CTC	2	6	828194	828199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227120045
15555	NC_012583	GC	3	6	828325	828330	0 %	0 %	50 %	50 %	227120045
15556	NC_012583	TCGC	2	8	828374	828381	0 %	25 %	25 %	50 %	227120045
15557	NC_012583	G	6	6	828392	828397	0 %	0 %	100 %	0 %	227120045
15558	NC_012583	TCG	2	6	828419	828424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120045
15559	NC_012583	CTT	2	6	828440	828445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120045
15560	NC_012583	TTC	2	6	828481	828486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120045
15561	NC_012583	TG	3	6	828596	828601	0 %	50 %	50 %	0 %	227120045
15562	NC_012583	GGT	2	6	828623	828628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120045
15563	NC_012583	GGTA	2	8	828711	828718	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_012583	AAG	2	6	828724	828729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_012583	TCA	2	6	828758	828763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_012583	GC	3	6	828777	828782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15567	NC_012583	CA	3	6	828801	828806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15568	NC_012583	GGTA	2	8	828884	828891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_012583	TGAG	2	8	828907	828914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_012583	A	6	6	829024	829029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_012583	CAC	2	6	829045	829050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15572	NC_012583	TGC	2	6	829086	829091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_012583	CTG	2	6	829094	829099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15574	NC_012583	TCA	2	6	829119	829124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_012583	TCT	2	6	829203	829208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_012583	TCT	2	6	829245	829250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_012583	CGA	2	6	829257	829262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_012583	TTC	2	6	829406	829411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15579	NC_012583	TTG	2	6	829451	829456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_012583	GCA	2	6	829542	829547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15581	NC_012583	CCA	2	6	829570	829575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15582	NC_012583	TCAT	2	8	829716	829723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15583	NC_012583	AGGAA	2	10	829765	829774	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_012583	GAA	2	6	829797	829802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_012583	A	6	6	829801	829806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_012583	AGA	2	6	829816	829821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_012583	TGA	2	6	829828	829833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15589	NC_012583	TTG	2	6	829959	829964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
15590	NC_012583	CAT	2	6	829997	830002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
15591	NC_012583	CCA	2	6	830006	830011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
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15593	NC_012583	GTT	2	6	830054	830059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120046
15594	NC_012583	CAC	2	6	830088	830093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
15595	NC_012583	ATCA	2	8	830094	830101	50 %	25 %	0 %	25 %	227120046
15596	NC_012583	TCG	2	6	830155	830160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15597	NC_012583	ACC	2	6	830226	830231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
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15599	NC_012583	AGC	2	6	830287	830292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15600	NC_012583	CCA	2	6	830312	830317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227120046
15601	NC_012583	ATC	2	6	830325	830330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
15602	NC_012583	GAT	2	6	830342	830347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
15603	NC_012583	CAG	2	6	830349	830354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15604	NC_012583	GCT	2	6	830409	830414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15605	NC_012583	GT	3	6	830452	830457	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
15606	NC_012583	CTCC	2	8	830459	830466	0 %	25 %	0 %	75 %	227120046
15607	NC_012583	ACT	2	6	830476	830481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
15608	NC_012583	GA	3	6	830504	830509	50 %	0 %	50 %	0 %	227120046
15609	NC_012583	TGC	2	6	830552	830557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15610	NC_012583	GAT	2	6	830579	830584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
15611	NC_012583	CTG	2	6	830682	830687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15612	NC_012583	CT	3	6	830764	830769	0 %	50 %	0 %	50 %	227120046
15613	NC_012583	GATT	2	8	830831	830838	25 %	50 %	25 %	0 %	227120046
15614	NC_012583	CTGC	2	8	830974	830981	0 %	25 %	25 %	50 %	227120046
15615	NC_012583	TCA	2	6	831029	831034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
15616	NC_012583	CAT	2	6	831035	831040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
15617	NC_012583	GT	3	6	831043	831048	0 %	50 %	50 %	0 %	227120046
15618	NC_012583	CAGT	2	8	831083	831090	25 %	25 %	25 %	25 %	227120046
15619	NC_012583	TCA	2	6	831106	831111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
15620	NC_012583	ATCA	2	8	831168	831175	50 %	25 %	0 %	25 %	227120046
15621	NC_012583	GC	3	6	831182	831187	0 %	0 %	50 %	50 %	227120046
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15623	NC_012583	GCT	2	6	831393	831398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
15624	NC_012583	GAT	2	6	831411	831416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
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15725	NC_012583	GTA	2	6	838087	838092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120046
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15728	NC_012583	GTTT	2	8	838147	838154	0 %	75 %	25 %	0 %	227120046
15729	NC_012583	GCT	2	6	838166	838171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120046
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15732	NC_012583	GCC	2	6	838371	838376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120046
15733	NC_012583	ATCA	2	8	838404	838411	50 %	25 %	0 %	25 %	227120046
15734	NC_012583	CAGT	2	8	838541	838548	25 %	25 %	25 %	25 %	227120046
15735	NC_012583	TTCA	2	8	838584	838591	25 %	50 %	0 %	25 %	227120046
15736	NC_012583	CAT	2	6	838631	838636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120046
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15738	NC_012583	C	6	6	838747	838752	0 %	0 %	0 %	100 %	227120046
15739	NC_012583	GGCT	2	8	838774	838781	0 %	25 %	50 %	25 %	227120046
15740	NC_012583	AAT	2	6	838872	838877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120046
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15744	NC_012583	GCA	2	6	838994	838999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120046
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15858	NC_012583	AAAG	2	8	844399	844406	75 %	0 %	25 %	0 %	227120051
15859	NC_012583	TGC	2	6	844412	844417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120051
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15983	NC_012583	GCG	2	6	851253	851258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227120059
15984	NC_012583	GC	3	6	851322	851327	0 %	0 %	50 %	50 %	227120059
15985	NC_012583	CG	3	6	851373	851378	0 %	0 %	50 %	50 %	227120059
15986	NC_012583	GAT	2	6	851393	851398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120059
15987	NC_012583	GTT	2	6	851441	851446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120059
15988	NC_012583	GCCA	2	8	851470	851477	25 %	0 %	25 %	50 %	227120059
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15990	NC_012583	TGAA	2	8	851505	851512	50 %	25 %	25 %	0 %	227120059
15991	NC_012583	CAA	2	6	851537	851542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120059
15992	NC_012583	AGC	2	6	851552	851557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120059
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15995	NC_012583	GC	3	6	851686	851691	0 %	0 %	50 %	50 %	227120059
15996	NC_012583	A	7	7	851850	851856	100 %	0 %	0 %	0 %	227120059
15997	NC_012583	TTA	2	6	851964	851969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120060
15998	NC_012583	TGA	2	6	852013	852018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120060
15999	NC_012583	GGT	2	6	852046	852051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120060
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