MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012583	ATG	2	6	799026	799031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120011
15002	NC_012583	AAC	2	6	799080	799085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_012583	AGTG	2	8	799108	799115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_012583	ATAG	2	8	799129	799136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_012583	GAAC	2	8	799153	799160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15006	NC_012583	A	6	6	799201	799206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_012583	TC	3	6	799214	799219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15008	NC_012583	TCTT	2	8	799255	799262	0 %	75 %	0 %	25 %	227120012
15009	NC_012583	TCG	2	6	799298	799303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120012
15010	NC_012583	AGG	2	6	799338	799343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227120012
15011	NC_012583	GC	3	6	799388	799393	0 %	0 %	50 %	50 %	227120012
15012	NC_012583	GAT	2	6	799395	799400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120012
15013	NC_012583	CGTACC	2	12	799440	799451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227120012
15014	NC_012583	GACA	2	8	799545	799552	50 %	0 %	25 %	25 %	227120012
15015	NC_012583	CTT	2	6	799595	799600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120012
15016	NC_012583	CTT	2	6	799655	799660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120012
15017	NC_012583	GT	3	6	799720	799725	0 %	50 %	50 %	0 %	227120012
15018	NC_012583	TGA	2	6	799790	799795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120012
15019	NC_012583	ATCA	2	8	799914	799921	50 %	25 %	0 %	25 %	227120012
15020	NC_012583	ACG	2	6	799992	799997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120012
15021	NC_012583	GAC	2	6	800027	800032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120012
15022	NC_012583	GAC	2	6	800108	800113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120012
15023	NC_012583	AAT	2	6	800144	800149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120012
15024	NC_012583	TCAT	2	8	800167	800174	25 %	50 %	0 %	25 %	227120012
15025	NC_012583	TAAG	2	8	800187	800194	50 %	25 %	25 %	0 %	227120013
15026	NC_012583	TTC	2	6	800241	800246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120013
15027	NC_012583	CAT	2	6	800319	800324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120013
15028	NC_012583	TG	4	8	800399	800406	0 %	50 %	50 %	0 %	227120013
15029	NC_012583	CGA	2	6	800590	800595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120013
15030	NC_012583	GCA	2	6	800624	800629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120013
15031	NC_012583	GAA	2	6	800691	800696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120013
15032	NC_012583	TTG	2	6	800752	800757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120013
15033	NC_012583	TCT	2	6	800762	800767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120013
15034	NC_012583	TG	3	6	800875	800880	0 %	50 %	50 %	0 %	227120013
15035	NC_012583	CTT	2	6	800927	800932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120013
15036	NC_012583	TCT	2	6	800992	800997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120013
15037	NC_012583	AC	3	6	801108	801113	50 %	0 %	0 %	50 %	227120013
15038	NC_012583	TGA	2	6	801174	801179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120013
15039	NC_012583	GCC	2	6	801213	801218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120013
15040	NC_012583	GAA	2	6	801228	801233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227120013
15041	NC_012583	CCG	2	6	801436	801441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120013
15042	NC_012583	CTT	2	6	801521	801526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227120013
15043	NC_012583	CT	3	6	801615	801620	0 %	50 %	0 %	50 %	227120013
15044	NC_012583	TACA	2	8	801635	801642	50 %	25 %	0 %	25 %	227120013
15045	NC_012583	GTT	2	6	801716	801721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120013
15046	NC_012583	CTA	2	6	801758	801763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120013
15047	NC_012583	TTG	2	6	801771	801776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120013
15048	NC_012583	CAG	2	6	801798	801803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120013
15049	NC_012583	TATT	2	8	801805	801812	25 %	75 %	0 %	0 %	227120013
15050	NC_012583	TGT	2	6	801857	801862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120013
15051	NC_012583	CG	3	6	801917	801922	0 %	0 %	50 %	50 %	227120013
15052	NC_012583	TGA	2	6	801958	801963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227120013
15053	NC_012583	A	6	6	802014	802019	100 %	0 %	0 %	0 %	227120013
15054	NC_012583	GTT	2	6	802076	802081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227120013
15055	NC_012583	AG	3	6	802104	802109	50 %	0 %	50 %	0 %	227120013
15056	NC_012583	GT	3	6	802185	802190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_012583	ATA	2	6	802197	802202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_012583	GTTA	2	8	802222	802229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_012583	CA	3	6	802231	802236	50 %	0 %	0 %	50 %	227120014
15060	NC_012583	TTCAT	2	10	802255	802264	20 %	60 %	0 %	20 %	227120014
15061	NC_012583	AAAC	2	8	802367	802374	75 %	0 %	0 %	25 %	227120014
15062	NC_012583	ATTC	2	8	802390	802397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15063	NC_012583	CAAC	2	8	802433	802440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15064	NC_012583	GTT	2	6	802469	802474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_012583	TACA	2	8	802484	802491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_012583	TTA	2	6	802547	802552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227120015
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15070	NC_012583	TGG	2	6	802764	802769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227120015
15071	NC_012583	GTTT	2	8	802803	802810	0 %	75 %	25 %	0 %	227120015
15072	NC_012583	CTG	2	6	802823	802828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120015
15073	NC_012583	GCT	2	6	802881	802886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120015
15074	NC_012583	TCG	2	6	802896	802901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120015
15075	NC_012583	GCT	2	6	802942	802947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227120015
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15078	NC_012583	A	6	6	803054	803059	100 %	0 %	0 %	0 %	227120015
15079	NC_012583	AGAA	2	8	803062	803069	75 %	0 %	25 %	0 %	227120015
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15089	NC_012583	TACCT	2	10	803532	803541	20 %	40 %	0 %	40 %	227120016
15090	NC_012583	CGC	2	6	803557	803562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227120016
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15101	NC_012583	CG	3	6	804109	804114	0 %	0 %	50 %	50 %	227120016
15102	NC_012583	TCAA	2	8	804181	804188	50 %	25 %	0 %	25 %	227120016
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15112	NC_012583	A	6	6	804459	804464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_012583	CCG	2	6	804531	804536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15114	NC_012583	GATT	2	8	804543	804550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15240	NC_012583	AATA	2	8	810659	810666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15241	NC_012583	A	6	6	810680	810685	100 %	0 %	0 %	0 %	227120024
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15243	NC_012583	CA	3	6	811029	811034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15244	NC_012583	TTAA	2	8	811086	811093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15245	NC_012583	GTT	2	6	811119	811124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15488	NC_012583	ATT	2	6	824293	824298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_012583	AAC	2	6	824349	824354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227120040
15490	NC_012583	AGC	2	6	824410	824415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120040
15491	NC_012583	TCA	2	6	824424	824429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120040
15492	NC_012583	GATA	2	8	824437	824444	50 %	25 %	25 %	0 %	227120040
15493	NC_012583	TGC	3	9	824492	824500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15494	NC_012583	GT	3	6	824550	824555	0 %	50 %	50 %	0 %	227120041
15495	NC_012583	AAT	2	6	824561	824566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227120041
15496	NC_012583	CT	3	6	824578	824583	0 %	50 %	0 %	50 %	227120041
15497	NC_012583	ACT	2	6	824658	824663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120041
15498	NC_012583	A	6	6	824676	824681	100 %	0 %	0 %	0 %	227120041
15499	NC_012583	CAT	2	6	824791	824796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227120041
15500	NC_012583	GCA	2	6	824866	824871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227120041

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