MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_012583	GA	3	6	634637	634642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_012583	GCG	2	6	634678	634683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119856
12003	NC_012583	TTC	2	6	634693	634698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119856
12004	NC_012583	CAA	2	6	634852	634857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119856
12005	NC_012583	CCA	2	6	634887	634892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119856
12006	NC_012583	GC	3	6	634954	634959	0 %	0 %	50 %	50 %	227119856
12007	NC_012583	TGC	2	6	634982	634987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119856
12008	NC_012583	CGC	2	6	635065	635070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119856
12009	NC_012583	CGG	2	6	635085	635090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119856
12010	NC_012583	GAT	2	6	635194	635199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119857
12011	NC_012583	ATTG	2	8	635292	635299	25 %	50 %	25 %	0 %	227119857
12012	NC_012583	TCA	2	6	635390	635395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119857
12013	NC_012583	TG	3	6	635435	635440	0 %	50 %	50 %	0 %	227119857
12014	NC_012583	CAA	2	6	635572	635577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119857
12015	NC_012583	CT	3	6	635605	635610	0 %	50 %	0 %	50 %	227119857
12016	NC_012583	GCC	3	9	635746	635754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119857
12017	NC_012583	T	6	6	635767	635772	0 %	100 %	0 %	0 %	227119857
12018	NC_012583	CAA	2	6	635988	635993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119857
12019	NC_012583	GCT	2	6	636000	636005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119857
12020	NC_012583	TGTGC	2	10	636018	636027	0 %	40 %	40 %	20 %	227119857
12021	NC_012583	GC	3	6	636026	636031	0 %	0 %	50 %	50 %	227119857
12022	NC_012583	CTT	2	6	636173	636178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119858
12023	NC_012583	TGC	2	6	636287	636292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119858
12024	NC_012583	AAG	2	6	636295	636300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119858
12025	NC_012583	CGC	2	6	636320	636325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119858
12026	NC_012583	GCT	3	9	636330	636338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119858
12027	NC_012583	TGAG	2	8	636386	636393	25 %	25 %	50 %	0 %	227119858
12028	NC_012583	ACC	2	6	636400	636405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119858
12029	NC_012583	ATC	2	6	636454	636459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119858
12030	NC_012583	A	6	6	636481	636486	100 %	0 %	0 %	0 %	227119858
12031	NC_012583	TGA	2	6	636611	636616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119858
12032	NC_012583	TTG	2	6	636625	636630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119858
12033	NC_012583	GC	3	6	636650	636655	0 %	0 %	50 %	50 %	227119858
12034	NC_012583	GGC	2	6	636673	636678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119858
12035	NC_012583	TGA	2	6	636722	636727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119858
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12037	NC_012583	ATGG	2	8	636849	636856	25 %	25 %	50 %	0 %	227119858
12038	NC_012583	GGTG	2	8	636981	636988	0 %	25 %	75 %	0 %	227119858
12039	NC_012583	TGC	3	9	637031	637039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119858
12040	NC_012583	TGA	2	6	637112	637117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119858
12041	NC_012583	TGT	2	6	637136	637141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119858
12042	NC_012583	GGA	2	6	637179	637184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119858
12043	NC_012583	GAT	2	6	637196	637201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119858
12044	NC_012583	AGCT	2	8	637221	637228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12045	NC_012583	TAG	2	6	637267	637272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_012583	ATT	2	6	637318	637323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_012583	AAGT	2	8	637326	637333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_012583	ATG	2	6	637345	637350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_012583	CTGG	2	8	637363	637370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12050	NC_012583	CAT	2	6	637659	637664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119859
12051	NC_012583	CTG	2	6	637694	637699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119859
12052	NC_012583	GT	3	6	637751	637756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_012583	AG	3	6	637772	637777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_012583	GAA	2	6	637820	637825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_012583	A	6	6	637824	637829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_012583	TTA	2	6	637850	637855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119860
12057	NC_012583	GTC	2	6	637944	637949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119860
12058	NC_012583	TCA	2	6	638212	638217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119861
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12061	NC_012583	CAT	2	6	638518	638523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119861
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12064	NC_012583	ATCA	2	8	638579	638586	50 %	25 %	0 %	25 %	227119861
12065	NC_012583	AGCG	2	8	638594	638601	25 %	0 %	50 %	25 %	227119861
12066	NC_012583	TGA	2	6	638610	638615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119861
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12069	NC_012583	CTCA	2	8	638771	638778	25 %	25 %	0 %	50 %	227119861
12070	NC_012583	ACT	2	6	638789	638794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119861
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12073	NC_012583	CGA	2	6	638893	638898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119861
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12075	NC_012583	CAT	2	6	639046	639051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119861
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12079	NC_012583	CAG	2	6	639402	639407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119862
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12082	NC_012583	TGA	2	6	639548	639553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119862
12083	NC_012583	GAAC	2	8	639599	639606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12084	NC_012583	TCCC	2	8	639699	639706	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12085	NC_012583	CA	3	6	639761	639766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12086	NC_012583	TCC	2	6	639801	639806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12087	NC_012583	TAT	2	6	639895	639900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119863
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12089	NC_012583	GGC	2	6	639983	639988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119863
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12092	NC_012583	ACC	2	6	640041	640046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119863
12093	NC_012583	CATC	2	8	640186	640193	25 %	25 %	0 %	50 %	227119863
12094	NC_012583	CCAAT	2	10	640198	640207	40 %	20 %	0 %	40 %	227119863
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12100	NC_012583	TTTGA	2	10	640407	640416	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_012583	GA	3	6	640454	640459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_012583	TTG	2	6	640635	640640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119865
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12106	NC_012583	T	6	6	640875	640880	0 %	100 %	0 %	0 %	227119865
12107	NC_012583	TAA	2	6	640903	640908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119865
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12109	NC_012583	GTGA	2	8	641030	641037	25 %	25 %	50 %	0 %	227119865
12110	NC_012583	GTG	2	6	641135	641140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119865
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12119	NC_012583	GGCAC	2	10	641513	641522	20 %	0 %	40 %	40 %	227119865
12120	NC_012583	AGA	2	6	641599	641604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119865
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12122	NC_012583	ATC	2	6	641709	641714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119865
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12361	NC_012583	AATA	2	8	655900	655907	75 %	25 %	0 %	0 %	227119879
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12364	NC_012583	ATT	2	6	656038	656043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12365	NC_012583	CAA	2	6	656065	656070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12366	NC_012583	GAC	2	6	656073	656078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12474	NC_012583	AAC	2	6	661875	661880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12475	NC_012583	ACGC	2	8	661886	661893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12476	NC_012583	CGT	2	6	661974	661979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12477	NC_012583	TTC	2	6	661994	661999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12478	NC_012583	GGGTA	2	10	662020	662029	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12479	NC_012583	TCAA	2	8	662056	662063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12480	NC_012583	GAT	2	6	662072	662077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119887
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12485	NC_012583	GTG	2	6	662310	662315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119887
12486	NC_012583	CTC	2	6	662343	662348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119887
12487	NC_012583	AC	3	6	662374	662379	50 %	0 %	0 %	50 %	227119887
12488	NC_012583	T	7	7	662453	662459	0 %	100 %	0 %	0 %	227119887
12489	NC_012583	AC	3	6	662680	662685	50 %	0 %	0 %	50 %	227119887
12490	NC_012583	AAAG	2	8	662844	662851	75 %	0 %	25 %	0 %	227119887
12491	NC_012583	GTCT	2	8	662879	662886	0 %	50 %	25 %	25 %	227119887
12492	NC_012583	CTATC	2	10	662918	662927	20 %	40 %	0 %	40 %	227119887
12493	NC_012583	AGCA	2	8	662946	662953	50 %	0 %	25 %	25 %	227119887
12494	NC_012583	TGC	2	6	663031	663036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119887
12495	NC_012583	TCA	2	6	663089	663094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12496	NC_012583	AGG	2	6	663096	663101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12497	NC_012583	CCT	2	6	663108	663113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12498	NC_012583	TCA	2	6	663127	663132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12499	NC_012583	CAT	2	6	663229	663234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119888
12500	NC_012583	CAG	2	6	663244	663249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119888

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