MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_012583	GAT	2	6	606705	606710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119828
11503	NC_012583	ATA	2	6	606845	606850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119828
11504	NC_012583	CCG	2	6	607014	607019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119828
11505	NC_012583	TC	3	6	607069	607074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_012583	TAA	2	6	607228	607233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_012583	GT	3	6	607237	607242	0 %	50 %	50 %	0 %	227119829
11508	NC_012583	GAA	2	6	607269	607274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119829
11509	NC_012583	CAA	2	6	607275	607280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119829
11510	NC_012583	CAA	2	6	607311	607316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119829
11511	NC_012583	ACG	2	6	607353	607358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11512	NC_012583	TCA	2	6	607372	607377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119829
11513	NC_012583	GCT	2	6	607427	607432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11514	NC_012583	A	6	6	607436	607441	100 %	0 %	0 %	0 %	227119829
11515	NC_012583	GCG	2	6	607476	607481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119829
11516	NC_012583	CAC	2	6	607497	607502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119829
11517	NC_012583	GAA	2	6	607535	607540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119829
11518	NC_012583	CGG	2	6	607553	607558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119829
11519	NC_012583	CAA	2	6	607596	607601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119829
11520	NC_012583	CCA	2	6	607663	607668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119829
11521	NC_012583	TTA	2	6	607683	607688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119829
11522	NC_012583	A	7	7	607707	607713	100 %	0 %	0 %	0 %	227119829
11523	NC_012583	TTG	2	6	607749	607754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119829
11524	NC_012583	TGT	2	6	607852	607857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119829
11525	NC_012583	ATG	2	6	608016	608021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119829
11526	NC_012583	GAC	2	6	608066	608071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11527	NC_012583	AAG	2	6	608074	608079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119829
11528	NC_012583	GGC	2	6	608093	608098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119829
11529	NC_012583	ACTC	2	8	608175	608182	25 %	25 %	0 %	50 %	227119829
11530	NC_012583	TCA	2	6	608186	608191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119829
11531	NC_012583	ATTG	2	8	608192	608199	25 %	50 %	25 %	0 %	227119829
11532	NC_012583	TGC	2	6	608288	608293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11533	NC_012583	GAC	2	6	608297	608302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11534	NC_012583	GCA	2	6	608324	608329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11535	NC_012583	TGC	2	6	608393	608398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11536	NC_012583	GC	3	6	608459	608464	0 %	0 %	50 %	50 %	227119829
11537	NC_012583	CA	3	6	608489	608494	50 %	0 %	0 %	50 %	227119829
11538	NC_012583	TGT	2	6	608521	608526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119829
11539	NC_012583	GCA	2	6	608609	608614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11540	NC_012583	TGC	2	6	608647	608652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11541	NC_012583	TGC	2	6	608675	608680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119829
11542	NC_012583	GCGATG	2	12	608784	608795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227119829
11543	NC_012583	A	9	9	608887	608895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_012583	TTTCAG	2	12	608929	608940	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11545	NC_012583	CTG	2	6	608994	608999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119830
11546	NC_012583	CA	3	6	609101	609106	50 %	0 %	0 %	50 %	227119830
11547	NC_012583	GTG	2	6	609190	609195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119830
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11550	NC_012583	T	6	6	609268	609273	0 %	100 %	0 %	0 %	227119830
11551	NC_012583	CAC	2	6	609296	609301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119830
11552	NC_012583	GAA	2	6	609345	609350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119830
11553	NC_012583	CGC	2	6	609369	609374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119830
11554	NC_012583	CGT	2	6	609393	609398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119830
11555	NC_012583	CCA	2	6	609406	609411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119830
11556	NC_012583	CAG	2	6	609420	609425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119830
11557	NC_012583	TCA	2	6	609433	609438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119830
11558	NC_012583	TTG	2	6	609441	609446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119830
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11560	NC_012583	CG	3	6	609547	609552	0 %	0 %	50 %	50 %	227119830
11561	NC_012583	TGTT	2	8	609568	609575	0 %	75 %	25 %	0 %	227119830
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11569	NC_012583	ACC	2	6	610308	610313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119830
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11574	NC_012583	ATGA	2	8	610606	610613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_012583	TG	4	8	610665	610672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11579	NC_012583	CCTGA	2	10	610806	610815	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11580	NC_012583	GGT	2	6	610920	610925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119831
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11584	NC_012583	TGA	2	6	611154	611159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119831
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11592	NC_012583	GGC	2	6	611647	611652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119831
11593	NC_012583	CA	3	6	611748	611753	50 %	0 %	0 %	50 %	227119831
11594	NC_012583	GCG	2	6	611785	611790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119831
11595	NC_012583	AT	3	6	611866	611871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_012583	CT	3	6	611872	611877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_012583	AT	3	6	611881	611886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_012583	GTT	2	6	611924	611929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_012583	GTA	2	6	611984	611989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119832
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11601	NC_012583	TTGA	2	8	612077	612084	25 %	50 %	25 %	0 %	227119832
11602	NC_012583	GT	3	6	612367	612372	0 %	50 %	50 %	0 %	227119832
11603	NC_012583	TGA	2	6	612441	612446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119832
11604	NC_012583	TGC	2	6	612471	612476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119832
11605	NC_012583	CA	3	6	612502	612507	50 %	0 %	0 %	50 %	227119832
11606	NC_012583	TGA	2	6	612651	612656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119832
11607	NC_012583	CGATG	2	10	612665	612674	20 %	20 %	40 %	20 %	227119832
11608	NC_012583	A	6	6	612692	612697	100 %	0 %	0 %	0 %	227119832
11609	NC_012583	TGA	2	6	612828	612833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119832
11610	NC_012583	TGCG	2	8	612973	612980	0 %	25 %	50 %	25 %	227119832
11611	NC_012583	TTGGCG	2	12	612995	613006	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	227119832
11612	NC_012583	TTG	2	6	613052	613057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119832
11613	NC_012583	CGAC	2	8	613120	613127	25 %	0 %	25 %	50 %	227119832
11614	NC_012583	GGT	2	6	613219	613224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119832
11615	NC_012583	TGA	2	6	613233	613238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119832
11616	NC_012583	TAAA	2	8	613239	613246	75 %	25 %	0 %	0 %	227119832
11617	NC_012583	TGG	2	6	613274	613279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119832
11618	NC_012583	CAG	2	6	613399	613404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119832
11619	NC_012583	AG	3	6	613415	613420	50 %	0 %	50 %	0 %	227119832
11620	NC_012583	CAT	2	6	613453	613458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119832
11621	NC_012583	AGC	2	6	613560	613565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119832
11622	NC_012583	TAA	2	6	613571	613576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119832
11623	NC_012583	TCA	2	6	613824	613829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119833
11624	NC_012583	CG	3	6	614002	614007	0 %	0 %	50 %	50 %	227119833
11625	NC_012583	TTG	2	6	614024	614029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119833
11626	NC_012583	TGC	2	6	614046	614051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119833
11627	NC_012583	GCA	2	6	614065	614070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119833
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11630	NC_012583	AT	3	6	614325	614330	50 %	50 %	0 %	0 %	227119833
11631	NC_012583	TGA	2	6	614352	614357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119833
11632	NC_012583	TGCT	2	8	614384	614391	0 %	50 %	25 %	25 %	227119833
11633	NC_012583	TCCA	2	8	614408	614415	25 %	25 %	0 %	50 %	227119833
11634	NC_012583	GAG	2	6	614436	614441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119833
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11636	NC_012583	T	6	6	614473	614478	0 %	100 %	0 %	0 %	227119833
11637	NC_012583	TTGA	2	8	614501	614508	25 %	50 %	25 %	0 %	227119833
11638	NC_012583	TCA	2	6	614574	614579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119833
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11641	NC_012583	ACA	3	9	614872	614880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11642	NC_012583	CTT	2	6	614972	614977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119834
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11651	NC_012583	CCGT	2	8	615713	615720	0 %	25 %	25 %	50 %	227119834
11652	NC_012583	GGT	2	6	615968	615973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119834
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11659	NC_012583	T	6	6	616429	616434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11660	NC_012583	TACT	2	8	616548	616555	25 %	50 %	0 %	25 %	227119835
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11673	NC_012583	TCTTT	2	10	617167	617176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11674	NC_012583	TAA	2	6	617224	617229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11984	NC_012583	TTG	2	6	633909	633914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119854
11985	NC_012583	GCG	2	6	633983	633988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119854
11986	NC_012583	TCT	2	6	633991	633996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119854
11987	NC_012583	TGC	2	6	634072	634077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119854
11988	NC_012583	TGG	2	6	634086	634091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119854
11989	NC_012583	CAT	2	6	634134	634139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11990	NC_012583	A	6	6	634173	634178	100 %	0 %	0 %	0 %	227119855
11991	NC_012583	CAA	2	6	634200	634205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119855
11992	NC_012583	T	6	6	634231	634236	0 %	100 %	0 %	0 %	227119855
11993	NC_012583	AGCG	2	8	634285	634292	25 %	0 %	50 %	25 %	227119855
11994	NC_012583	ATC	2	6	634301	634306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119855
11995	NC_012583	CAAGCG	2	12	634343	634354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119855
11996	NC_012583	AAG	2	6	634371	634376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119855
11997	NC_012583	ATC	2	6	634422	634427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119855
11998	NC_012583	CTG	2	6	634448	634453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119855
11999	NC_012583	GTG	2	6	634463	634468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119855
12000	NC_012583	T	6	6	634512	634517	0 %	100 %	0 %	0 %	227119855

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