MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012583	GAA	2	6	580145	580150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119801
11002	NC_012583	CAG	2	6	580322	580327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119801
11003	NC_012583	ATG	2	6	580329	580334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119801
11004	NC_012583	ATA	2	6	580401	580406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119801
11005	NC_012583	ATG	2	6	580428	580433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119801
11006	NC_012583	AACCAG	2	12	580587	580598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227119801
11007	NC_012583	GGC	2	6	580625	580630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119801
11008	NC_012583	AGA	2	6	580686	580691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119801
11009	NC_012583	CAGC	2	8	580711	580718	25 %	0 %	25 %	50 %	227119801
11010	NC_012583	A	6	6	580723	580728	100 %	0 %	0 %	0 %	227119801
11011	NC_012583	CTGG	2	8	580744	580751	0 %	25 %	50 %	25 %	227119801
11012	NC_012583	CATG	2	8	580783	580790	25 %	25 %	25 %	25 %	227119801
11013	NC_012583	GA	3	6	580854	580859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_012583	GTTA	2	8	580898	580905	25 %	50 %	25 %	0 %	227119802
11015	NC_012583	TCA	2	6	580951	580956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119802
11016	NC_012583	CTT	2	6	581081	581086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119802
11017	NC_012583	CTT	2	6	581090	581095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119802
11018	NC_012583	CAA	2	6	581111	581116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119802
11019	NC_012583	GC	4	8	581139	581146	0 %	0 %	50 %	50 %	227119802
11020	NC_012583	TGA	2	6	581150	581155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119802
11021	NC_012583	AGT	2	6	581237	581242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119802
11022	NC_012583	CAC	2	6	581273	581278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119802
11023	NC_012583	AGA	2	6	581556	581561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119802
11024	NC_012583	ATG	2	6	581602	581607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119802
11025	NC_012583	GCC	2	6	581679	581684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119802
11026	NC_012583	CG	3	6	581697	581702	0 %	0 %	50 %	50 %	227119802
11027	NC_012583	GTT	2	6	581706	581711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119802
11028	NC_012583	AGG	2	6	581762	581767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119802
11029	NC_012583	CA	3	6	581810	581815	50 %	0 %	0 %	50 %	227119802
11030	NC_012583	ACC	2	6	581839	581844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119802
11031	NC_012583	GCG	2	6	581867	581872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119802
11032	NC_012583	TCA	2	6	581876	581881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119802
11033	NC_012583	CAG	2	6	581904	581909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119802
11034	NC_012583	GTCAG	2	10	581971	581980	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11035	NC_012583	GCA	2	6	582087	582092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119803
11036	NC_012583	GCT	2	6	582110	582115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119803
11037	NC_012583	AGA	2	6	582132	582137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119803
11038	NC_012583	CAA	2	6	582216	582221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119803
11039	NC_012583	GCG	2	6	582263	582268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119803
11040	NC_012583	ATC	2	6	582278	582283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119803
11041	NC_012583	A	6	6	582301	582306	100 %	0 %	0 %	0 %	227119803
11042	NC_012583	AGA	2	6	582315	582320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119803
11043	NC_012583	AGC	2	6	582321	582326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119803
11044	NC_012583	CCA	2	6	582452	582457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119803
11045	NC_012583	TGT	2	6	582519	582524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119803
11046	NC_012583	CA	3	6	582603	582608	50 %	0 %	0 %	50 %	227119803
11047	NC_012583	CTT	2	6	582675	582680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119803
11048	NC_012583	ACCG	2	8	582718	582725	25 %	0 %	25 %	50 %	227119803
11049	NC_012583	CCG	2	6	582797	582802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119803
11050	NC_012583	GCCA	2	8	582822	582829	25 %	0 %	25 %	50 %	227119803
11051	NC_012583	ACC	2	6	582903	582908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119803
11052	NC_012583	CCAGCC	2	12	582964	582975	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	227119803
11053	NC_012583	A	7	7	582979	582985	100 %	0 %	0 %	0 %	227119803
11054	NC_012583	TGA	2	6	583047	583052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119803
11055	NC_012583	GAGCGG	2	12	583091	583102	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	227119803
11056	NC_012583	ATC	2	6	583106	583111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119803
11057	NC_012583	AAT	2	6	583179	583184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119803
11058	NC_012583	ACAT	2	8	583262	583269	50 %	25 %	0 %	25 %	227119803
11059	NC_012583	AATG	2	8	583281	583288	50 %	25 %	25 %	0 %	227119803
11060	NC_012583	ATT	2	6	583485	583490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119804
11061	NC_012583	CCG	2	6	583533	583538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119804
11062	NC_012583	CGCT	2	8	583551	583558	0 %	25 %	25 %	50 %	227119804
11063	NC_012583	TGT	2	6	583693	583698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119804
11064	NC_012583	TGA	2	6	583899	583904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119804
11065	NC_012583	GCGA	2	8	583914	583921	25 %	0 %	50 %	25 %	227119804
11066	NC_012583	TTGAAT	2	12	583985	583996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227119804
11067	NC_012583	GC	3	6	584078	584083	0 %	0 %	50 %	50 %	227119804
11068	NC_012583	T	6	6	584128	584133	0 %	100 %	0 %	0 %	227119804
11069	NC_012583	GCA	2	6	584134	584139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119804
11070	NC_012583	GGC	2	6	584158	584163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119804
11071	NC_012583	CAG	2	6	584216	584221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119804
11072	NC_012583	GCCA	2	8	584308	584315	25 %	0 %	25 %	50 %	227119804
11073	NC_012583	TCG	2	6	584335	584340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119804
11074	NC_012583	GAT	2	6	584348	584353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119804
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11078	NC_012583	AGCGA	2	10	584559	584568	40 %	0 %	40 %	20 %	227119804
11079	NC_012583	CAA	2	6	584615	584620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119804
11080	NC_012583	CCA	2	6	584635	584640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119804
11081	NC_012583	GCA	3	9	584650	584658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119804
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11084	NC_012583	GCCA	2	8	584804	584811	25 %	0 %	25 %	50 %	227119804
11085	NC_012583	AGTA	2	8	584895	584902	50 %	25 %	25 %	0 %	227119804
11086	NC_012583	GGT	2	6	585027	585032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119805
11087	NC_012583	GCAAA	2	10	585036	585045	60 %	0 %	20 %	20 %	227119805
11088	NC_012583	GTGAAC	2	12	585100	585111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227119805
11089	NC_012583	ACTTCA	2	12	585182	585193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119805
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11091	NC_012583	CACT	2	8	585297	585304	25 %	25 %	0 %	50 %	227119805
11092	NC_012583	T	6	6	585361	585366	0 %	100 %	0 %	0 %	227119805
11093	NC_012583	GAT	2	6	585397	585402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119805
11094	NC_012583	GAT	2	6	585478	585483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119805
11095	NC_012583	CCA	2	6	585615	585620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119805
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11097	NC_012583	CTA	2	6	585767	585772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_012583	TTA	2	6	585778	585783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_012583	AGGC	2	8	585858	585865	25 %	0 %	50 %	25 %	227119806
11100	NC_012583	T	7	7	585867	585873	0 %	100 %	0 %	0 %	227119806
11101	NC_012583	TCGG	2	8	585894	585901	0 %	25 %	50 %	25 %	227119806
11102	NC_012583	GAT	2	6	585906	585911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119806
11103	NC_012583	ATCA	2	8	585912	585919	50 %	25 %	0 %	25 %	227119806
11104	NC_012583	TGGAG	2	10	585964	585973	20 %	20 %	60 %	0 %	227119806
11105	NC_012583	CAG	2	6	586083	586088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119806
11106	NC_012583	TGCG	2	8	586092	586099	0 %	25 %	50 %	25 %	227119806
11107	NC_012583	ACC	2	6	586159	586164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119806
11108	NC_012583	AAAC	2	8	586208	586215	75 %	0 %	0 %	25 %	227119806
11109	NC_012583	T	7	7	586231	586237	0 %	100 %	0 %	0 %	227119806
11110	NC_012583	CAT	3	9	586422	586430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119806
11111	NC_012583	CCAC	2	8	586455	586462	25 %	0 %	0 %	75 %	227119806
11112	NC_012583	T	6	6	586467	586472	0 %	100 %	0 %	0 %	227119806
11113	NC_012583	GTG	2	6	586527	586532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119806
11114	NC_012583	AGA	2	6	586682	586687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119806
11115	NC_012583	GT	3	6	586794	586799	0 %	50 %	50 %	0 %	227119806
11116	NC_012583	ACC	2	6	586813	586818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119806
11117	NC_012583	ATTGCG	2	12	586890	586901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227119806
11118	NC_012583	CAAG	2	8	586923	586930	50 %	0 %	25 %	25 %	227119806
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11230	NC_012583	TAC	2	6	592957	592962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119812
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11235	NC_012583	TAAG	2	8	593123	593130	50 %	25 %	25 %	0 %	227119812
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11239	NC_012583	TCA	2	6	593331	593336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119812
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11363	NC_012583	GTG	2	6	599687	599692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119820
11364	NC_012583	CGA	2	6	599769	599774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119820
11365	NC_012583	TTG	2	6	599789	599794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119820
11366	NC_012583	CAT	2	6	599827	599832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119820
11367	NC_012583	GAT	2	6	599939	599944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119821
11368	NC_012583	GCA	2	6	599963	599968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119821
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11370	NC_012583	CCA	2	6	600094	600099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119821
11371	NC_012583	TCT	2	6	600200	600205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119821
11372	NC_012583	TCA	2	6	600209	600214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119821
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11374	NC_012583	GATT	2	8	600278	600285	25 %	50 %	25 %	0 %	227119821
11375	NC_012583	TAT	2	6	600294	600299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119821
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11381	NC_012583	TGA	2	6	600514	600519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119821
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11385	NC_012583	GTGA	2	8	600681	600688	25 %	25 %	50 %	0 %	227119821
11386	NC_012583	TGG	2	6	600701	600706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119821
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11398	NC_012583	AAAAG	2	10	601287	601296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11399	NC_012583	GAT	2	6	601375	601380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119822
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11406	NC_012583	AACACA	2	12	601940	601951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119822
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11425	NC_012583	ATGT	2	8	602749	602756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11426	NC_012583	AATT	2	8	602772	602779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11427	NC_012583	TTG	2	6	602900	602905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11428	NC_012583	GAT	2	6	602936	602941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11429	NC_012583	GGAT	2	8	602952	602959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11430	NC_012583	TCA	2	6	602999	603004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119823
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11432	NC_012583	CA	3	6	603054	603059	50 %	0 %	0 %	50 %	227119823
11433	NC_012583	AGA	2	6	603067	603072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119823
11434	NC_012583	CATGG	2	10	603154	603163	20 %	20 %	40 %	20 %	227119823
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11446	NC_012583	CAC	3	9	603727	603735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119824
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11451	NC_012583	CTG	2	6	603956	603961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119824
11452	NC_012583	GC	3	6	604000	604005	0 %	0 %	50 %	50 %	227119824
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11465	NC_012583	CTG	2	6	604405	604410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119824
11466	NC_012583	TTG	2	6	604450	604455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119824
11467	NC_012583	TAG	2	6	604478	604483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119824
11468	NC_012583	GCAC	2	8	604529	604536	25 %	0 %	25 %	50 %	227119824
11469	NC_012583	ATG	2	6	604613	604618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119824
11470	NC_012583	T	7	7	604658	604664	0 %	100 %	0 %	0 %	227119824
11471	NC_012583	TTGA	2	8	604756	604763	25 %	50 %	25 %	0 %	227119824
11472	NC_012583	AAT	2	6	604840	604845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119824
11473	NC_012583	GCA	2	6	604950	604955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11474	NC_012583	AAT	2	6	604966	604971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11475	NC_012583	A	6	6	605041	605046	100 %	0 %	0 %	0 %	227119825
11476	NC_012583	TGT	2	6	605063	605068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119825
11477	NC_012583	ATGG	2	8	605103	605110	25 %	25 %	50 %	0 %	227119825
11478	NC_012583	ACG	2	6	605232	605237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119825
11479	NC_012583	A	6	6	605247	605252	100 %	0 %	0 %	0 %	227119825
11480	NC_012583	AAG	2	6	605373	605378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119825
11481	NC_012583	GC	3	6	605413	605418	0 %	0 %	50 %	50 %	227119825
11482	NC_012583	TTA	2	6	605424	605429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119825
11483	NC_012583	GGAT	2	8	605605	605612	25 %	25 %	50 %	0 %	227119825
11484	NC_012583	A	6	6	605691	605696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11487	NC_012583	GCA	2	6	606037	606042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119826
11488	NC_012583	TGA	2	6	606070	606075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119826
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11500	NC_012583	TATT	2	8	606655	606662	25 %	75 %	0 %	0 %	227119828

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