MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_012583	AGA	2	6	528106	528111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119759
10003	NC_012583	CAA	2	6	528194	528199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119759
10004	NC_012583	AAG	2	6	528204	528209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119759
10005	NC_012583	T	6	6	528234	528239	0 %	100 %	0 %	0 %	227119759
10006	NC_012583	ACC	2	6	528299	528304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119759
10007	NC_012583	TATT	2	8	528319	528326	25 %	75 %	0 %	0 %	227119759
10008	NC_012583	TGC	2	6	528442	528447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119759
10009	NC_012583	TGG	2	6	528463	528468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119759
10010	NC_012583	GCT	2	6	528503	528508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119759
10011	NC_012583	T	6	6	528566	528571	0 %	100 %	0 %	0 %	227119759
10012	NC_012583	T	8	8	528612	528619	0 %	100 %	0 %	0 %	227119759
10013	NC_012583	AGA	2	6	528640	528645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119759
10014	NC_012583	A	7	7	528652	528658	100 %	0 %	0 %	0 %	227119759
10015	NC_012583	ATT	2	6	528707	528712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119759
10016	NC_012583	A	6	6	528753	528758	100 %	0 %	0 %	0 %	227119759
10017	NC_012583	TTA	2	6	528861	528866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119759
10018	NC_012583	TGG	2	6	528874	528879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119759
10019	NC_012583	GATGC	2	10	528908	528917	20 %	20 %	40 %	20 %	227119759
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10022	NC_012583	CCTATT	2	12	529038	529049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227119759
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10025	NC_012583	CAA	2	6	529259	529264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119759
10026	NC_012583	GAA	2	6	529366	529371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119759
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10028	NC_012583	TGA	2	6	529492	529497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119759
10029	NC_012583	ATA	3	9	529566	529574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119759
10030	NC_012583	AAAG	2	8	529778	529785	75 %	0 %	25 %	0 %	227119759
10031	NC_012583	ATG	2	6	529833	529838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119759
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10033	NC_012583	AATC	2	8	530010	530017	50 %	25 %	0 %	25 %	227119759
10034	NC_012583	A	6	6	530046	530051	100 %	0 %	0 %	0 %	227119759
10035	NC_012583	T	7	7	530090	530096	0 %	100 %	0 %	0 %	227119759
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10037	NC_012583	TA	4	8	530148	530155	50 %	50 %	0 %	0 %	227119759
10038	NC_012583	TAAA	2	8	530217	530224	75 %	25 %	0 %	0 %	227119759
10039	NC_012583	GAT	2	6	530315	530320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119759
10040	NC_012583	TAT	2	6	530335	530340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119759
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10043	NC_012583	TCCC	2	8	530795	530802	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10044	NC_012583	TTG	2	6	530937	530942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_012583	TATT	2	8	530946	530953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_012583	GAG	2	6	531013	531018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_012583	TATT	2	8	531045	531052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_012583	TCC	2	6	531094	531099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_012583	AGGGGG	2	12	531106	531117	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_012583	ATTT	2	8	531144	531151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_012583	CTC	2	6	531320	531325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_012583	CAT	2	6	531371	531376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119760
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10054	NC_012583	CAC	2	6	531414	531419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119760
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10057	NC_012583	GC	3	6	531644	531649	0 %	0 %	50 %	50 %	227119760
10058	NC_012583	TTCC	2	8	531738	531745	0 %	50 %	0 %	50 %	227119760
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10062	NC_012583	ATC	2	6	531868	531873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119760
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10065	NC_012583	TCTGAG	2	12	531934	531945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227119760
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10103	NC_012583	TGAT	2	8	533752	533759	25 %	50 %	25 %	0 %	227119762
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10105	NC_012583	GTG	2	6	533793	533798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119762
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10107	NC_012583	GGC	2	6	533827	533832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119762
10108	NC_012583	GCGGT	2	10	533893	533902	0 %	20 %	60 %	20 %	227119762
10109	NC_012583	GCG	2	6	533988	533993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119762
10110	NC_012583	T	6	6	534024	534029	0 %	100 %	0 %	0 %	227119762
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10114	NC_012583	GCTCG	2	10	534242	534251	0 %	20 %	40 %	40 %	227119762
10115	NC_012583	TTAT	2	8	534252	534259	25 %	75 %	0 %	0 %	227119762
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10120	NC_012583	GCTC	2	8	534509	534516	0 %	25 %	25 %	50 %	227119763
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10122	NC_012583	AGC	2	6	534551	534556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119763
10123	NC_012583	GGC	2	6	534721	534726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119763
10124	NC_012583	AGC	2	6	534731	534736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119763
10125	NC_012583	CTG	2	6	534778	534783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119763
10126	NC_012583	CTCG	2	8	534801	534808	0 %	25 %	25 %	50 %	227119763
10127	NC_012583	A	6	6	534820	534825	100 %	0 %	0 %	0 %	227119763
10128	NC_012583	GCA	2	6	534855	534860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119763
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10141	NC_012583	CTTT	2	8	535440	535447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10142	NC_012583	ACA	2	6	535464	535469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_012583	CGAT	2	8	535592	535599	25 %	25 %	25 %	25 %	227119764
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10238	NC_012583	TCGT	2	8	540613	540620	0 %	50 %	25 %	25 %	227119769
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10486	NC_012583	GCT	2	6	554126	554131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119781
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