MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_012583	GAT	2	6	471832	471837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119701
9003	NC_012583	CAAAC	2	10	471843	471852	60 %	0 %	0 %	40 %	227119701
9004	NC_012583	A	6	6	471879	471884	100 %	0 %	0 %	0 %	227119701
9005	NC_012583	A	6	6	471900	471905	100 %	0 %	0 %	0 %	227119701
9006	NC_012583	AATGG	2	10	471954	471963	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_012583	CAT	2	6	471976	471981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_012583	CA	3	6	472088	472093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_012583	CGC	2	6	472111	472116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9010	NC_012583	TGC	2	6	472195	472200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119702
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9012	NC_012583	TGAG	2	8	472302	472309	25 %	25 %	50 %	0 %	227119702
9013	NC_012583	CAT	2	6	472315	472320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119702
9014	NC_012583	CAT	2	6	472444	472449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119702
9015	NC_012583	GAT	2	6	472459	472464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119702
9016	NC_012583	TAC	2	6	472511	472516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119702
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9018	NC_012583	A	6	6	472829	472834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9021	NC_012583	GCA	2	6	472932	472937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119703
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9023	NC_012583	CCAA	2	8	473142	473149	50 %	0 %	0 %	50 %	227119704
9024	NC_012583	TTCAC	2	10	473155	473164	20 %	40 %	0 %	40 %	227119704
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9039	NC_012583	CG	3	6	473769	473774	0 %	0 %	50 %	50 %	227119704
9040	NC_012583	ATACCC	2	12	473917	473928	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227119704
9041	NC_012583	GA	3	6	473967	473972	50 %	0 %	50 %	0 %	227119704
9042	NC_012583	GC	3	6	474088	474093	0 %	0 %	50 %	50 %	227119704
9043	NC_012583	TCT	2	6	474106	474111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119704
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9046	NC_012583	ACAGA	2	10	474287	474296	60 %	0 %	20 %	20 %	227119704
9047	NC_012583	CGAT	2	8	474329	474336	25 %	25 %	25 %	25 %	227119704
9048	NC_012583	TGT	2	6	474341	474346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119704
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9052	NC_012583	TGC	2	6	474849	474854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119705
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9054	NC_012583	T	6	6	474893	474898	0 %	100 %	0 %	0 %	227119705
9055	NC_012583	GCA	2	6	474907	474912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119705
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9232	NC_012583	GCATG	2	10	484399	484408	20 %	20 %	40 %	20 %	227119711
9233	NC_012583	TGGC	2	8	484507	484514	0 %	25 %	50 %	25 %	227119711
9234	NC_012583	TGCG	2	8	484542	484549	0 %	25 %	50 %	25 %	227119711
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9240	NC_012583	ACACC	2	10	484982	484991	40 %	0 %	0 %	60 %	227119712
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9247	NC_012583	GA	3	6	485509	485514	50 %	0 %	50 %	0 %	227119712
9248	NC_012583	CCT	2	6	485523	485528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119712
9249	NC_012583	CTTG	2	8	485587	485594	0 %	50 %	25 %	25 %	227119712
9250	NC_012583	TTCC	2	8	485886	485893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9251	NC_012583	TCA	2	6	486040	486045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119713
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9273	NC_012583	TCAT	2	8	487195	487202	25 %	50 %	0 %	25 %	227119714
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9278	NC_012583	TAG	2	6	487670	487675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9294	NC_012583	TCTGC	2	10	488943	488952	0 %	40 %	20 %	40 %	227119716
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9493	NC_012583	GTC	2	6	500533	500538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119728
9494	NC_012583	CTG	2	6	500546	500551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119728
9495	NC_012583	AGA	2	6	500561	500566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119728
9496	NC_012583	GGTT	2	8	500572	500579	0 %	50 %	50 %	0 %	227119728
9497	NC_012583	GCG	2	6	500585	500590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119728
9498	NC_012583	CATTT	2	10	500633	500642	20 %	60 %	0 %	20 %	227119728
9499	NC_012583	T	7	7	500640	500646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9500	NC_012583	GCAA	2	8	500684	500691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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