MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012583	GGGTA	2	10	445487	445496	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_012583	TA	3	6	445504	445509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_012583	CAA	2	6	445529	445534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_012583	AAT	2	6	445541	445546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_012583	ATA	2	6	445554	445559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_012583	AAC	2	6	445645	445650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_012583	ACA	2	6	445653	445658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_012583	TA	3	6	445669	445674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_012583	TAAG	2	8	445693	445700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_012583	ATT	2	6	445713	445718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_012583	AAT	2	6	445755	445760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_012583	ACA	2	6	445842	445847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_012583	GAA	2	6	445911	445916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_012583	ACCG	2	8	445917	445924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_012583	ATA	2	6	445949	445954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_012583	CCT	2	6	446015	446020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119663
8517	NC_012583	TGAA	2	8	446183	446190	50 %	25 %	25 %	0 %	227119663
8518	NC_012583	GTT	2	6	446209	446214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119663
8519	NC_012583	GAA	2	6	446235	446240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119663
8520	NC_012583	ACA	2	6	446271	446276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119663
8521	NC_012583	CAA	2	6	446279	446284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119663
8522	NC_012583	TAA	2	6	446344	446349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119663
8523	NC_012583	CCT	2	6	446411	446416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119664
8524	NC_012583	CAC	2	6	446533	446538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119664
8525	NC_012583	AAC	2	6	446557	446562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119664
8526	NC_012583	CAT	2	6	446574	446579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119664
8527	NC_012583	ATT	2	6	446581	446586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119664
8528	NC_012583	GGT	2	6	446593	446598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119664
8529	NC_012583	AGA	2	6	446603	446608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119664
8530	NC_012583	TAC	2	6	446632	446637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119664
8531	NC_012583	ACC	2	6	446658	446663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119664
8532	NC_012583	ATTG	2	8	446744	446751	25 %	50 %	25 %	0 %	227119664
8533	NC_012583	AAC	2	6	446768	446773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_012583	AGA	2	6	446777	446782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_012583	GGC	2	6	446855	446860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_012583	GA	3	6	446999	447004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_012583	TGG	2	6	447106	447111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_012583	ACT	2	6	447154	447159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_012583	ACT	2	6	447188	447193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_012583	TTAT	2	8	447271	447278	25 %	75 %	0 %	0 %	227119665
8541	NC_012583	CA	3	6	447279	447284	50 %	0 %	0 %	50 %	227119665
8542	NC_012583	TC	3	6	447304	447309	0 %	50 %	0 %	50 %	227119665
8543	NC_012583	AG	3	6	447454	447459	50 %	0 %	50 %	0 %	227119665
8544	NC_012583	CAA	2	6	447552	447557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119665
8545	NC_012583	CTG	2	6	447605	447610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119665
8546	NC_012583	ATA	2	6	447611	447616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119665
8547	NC_012583	GT	3	6	447632	447637	0 %	50 %	50 %	0 %	227119665
8548	NC_012583	GCTAAT	2	12	447646	447657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227119665
8549	NC_012583	GTT	2	6	447689	447694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119665
8550	NC_012583	TGCAT	2	10	447939	447948	20 %	40 %	20 %	20 %	227119665
8551	NC_012583	GTG	2	6	448066	448071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119665
8552	NC_012583	CTTTAC	2	12	448079	448090	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227119665
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8554	NC_012583	TAA	2	6	448181	448186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119665
8555	NC_012583	TTA	2	6	448216	448221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119665
8556	NC_012583	TGT	2	6	448238	448243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119665
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8558	NC_012583	CT	3	6	448474	448479	0 %	50 %	0 %	50 %	227119665
8559	NC_012583	ATA	2	6	448508	448513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119665
8560	NC_012583	GTT	2	6	448578	448583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119665
8561	NC_012583	GGC	2	6	448631	448636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119665
8562	NC_012583	CTT	2	6	448727	448732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119665
8563	NC_012583	TTGC	2	8	448747	448754	0 %	50 %	25 %	25 %	227119665
8564	NC_012583	CAA	2	6	448778	448783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119665
8565	NC_012583	TTG	2	6	448855	448860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119665
8566	NC_012583	CA	3	6	448913	448918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_012583	TAA	2	6	448923	448928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_012583	ATA	2	6	448953	448958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_012583	ACAA	2	8	448961	448968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8570	NC_012583	CTAAC	2	10	448970	448979	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8571	NC_012583	AACC	2	8	449000	449007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8572	NC_012583	ACA	2	6	449013	449018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_012583	T	6	6	449171	449176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8578	NC_012583	ATAAAC	2	12	449388	449399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227119666
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8581	NC_012583	GAA	2	6	449531	449536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119666
8582	NC_012583	AATA	2	8	449540	449547	75 %	25 %	0 %	0 %	227119666
8583	NC_012583	CAA	2	6	449554	449559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119666
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8585	NC_012583	ACA	2	6	449638	449643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119666
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8587	NC_012583	TAC	2	6	449689	449694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119666
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8589	NC_012583	TAAAT	2	10	449734	449743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_012583	AGC	2	6	449768	449773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_012583	CA	3	6	449789	449794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8592	NC_012583	TTGA	2	8	449799	449806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_012583	ACA	2	6	449862	449867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_012583	AAC	2	6	449939	449944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_012583	TAG	2	6	449953	449958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_012583	GGCG	2	8	449983	449990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8597	NC_012583	TGA	2	6	450048	450053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119667
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8599	NC_012583	CAA	2	6	450129	450134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119667
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8601	NC_012583	TATC	2	8	450224	450231	25 %	50 %	0 %	25 %	227119667
8602	NC_012583	CTT	2	6	450280	450285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119667
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8604	NC_012583	T	6	6	450400	450405	0 %	100 %	0 %	0 %	227119667
8605	NC_012583	TTG	2	6	450437	450442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119667
8606	NC_012583	TCA	2	6	450507	450512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119667
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8608	NC_012583	TGC	2	6	450663	450668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119668
8609	NC_012583	AGC	3	9	450708	450716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119668
8610	NC_012583	TGT	2	6	450795	450800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_012583	CAA	2	6	450839	450844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_012583	CG	3	6	450903	450908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8613	NC_012583	GGT	2	6	450933	450938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_012583	GTT	2	6	450943	450948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_012583	GGCG	2	8	450986	450993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8616	NC_012583	AGA	2	6	451033	451038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119669
8617	NC_012583	TTA	2	6	451079	451084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119669
8618	NC_012583	CTT	2	6	451189	451194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119669
8619	NC_012583	GGT	3	9	451220	451228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119669
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8621	NC_012583	GTTTT	2	10	451263	451272	0 %	80 %	20 %	0 %	227119669
8622	NC_012583	ATC	2	6	451332	451337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119669
8623	NC_012583	TCT	2	6	451342	451347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119669
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8625	NC_012583	A	6	6	451415	451420	100 %	0 %	0 %	0 %	227119669
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