MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012583	A	6	6	420471	420476	100 %	0 %	0 %	0 %	227119629
8002	NC_012583	TCT	2	6	420484	420489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119629
8003	NC_012583	AAT	2	6	420528	420533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119629
8004	NC_012583	ATA	2	6	420813	420818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_012583	ATC	2	6	420916	420921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119630
8006	NC_012583	ACTGT	2	10	420925	420934	20 %	40 %	20 %	20 %	227119630
8007	NC_012583	GTG	2	6	420954	420959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119630
8008	NC_012583	ACT	2	6	420997	421002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119630
8009	NC_012583	CA	3	6	421063	421068	50 %	0 %	0 %	50 %	227119630
8010	NC_012583	TATC	2	8	421078	421085	25 %	50 %	0 %	25 %	227119630
8011	NC_012583	TGG	2	6	421127	421132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119630
8012	NC_012583	CAG	2	6	421158	421163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119630
8013	NC_012583	GAA	2	6	421171	421176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119630
8014	NC_012583	GTC	2	6	421250	421255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119630
8015	NC_012583	AGC	2	6	421311	421316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119630
8016	NC_012583	GTA	2	6	421343	421348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119630
8017	NC_012583	GGT	2	6	421470	421475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_012583	GTT	2	6	421480	421485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_012583	GGCG	2	8	421523	421530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_012583	GTGA	2	8	421554	421561	25 %	25 %	50 %	0 %	227119631
8021	NC_012583	AAT	2	6	421574	421579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119631
8022	NC_012583	ATT	2	6	421682	421687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119631
8023	NC_012583	GTTT	2	8	421696	421703	0 %	75 %	25 %	0 %	227119631
8024	NC_012583	T	6	6	421719	421724	0 %	100 %	0 %	0 %	227119631
8025	NC_012583	CTGG	2	8	421803	421810	0 %	25 %	50 %	25 %	227119631
8026	NC_012583	T	6	6	421814	421819	0 %	100 %	0 %	0 %	227119631
8027	NC_012583	AGT	2	6	421829	421834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119631
8028	NC_012583	TCGCAA	2	12	421862	421873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227119631
8029	NC_012583	GGT	2	6	421948	421953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_012583	GTT	2	6	421958	421963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_012583	GGCG	2	8	422001	422008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_012583	TTGT	2	8	422091	422098	0 %	75 %	25 %	0 %	227119632
8033	NC_012583	CT	3	6	422189	422194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_012583	TTAC	2	8	422222	422229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_012583	TGT	2	6	422343	422348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119633
8036	NC_012583	GGT	2	6	422585	422590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_012583	GTT	2	6	422595	422600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_012583	GGCG	2	8	422639	422646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8039	NC_012583	AATA	2	8	422841	422848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_012583	TC	3	6	422916	422921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_012583	TGT	2	6	422942	422947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_012583	TTA	2	6	422965	422970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012583	GGT	2	6	423032	423037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_012583	GTT	2	6	423042	423047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_012583	GTG	3	9	423061	423069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_012583	GGCG	2	8	423086	423093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8047	NC_012583	CTT	2	6	423098	423103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_012583	ATC	2	6	423114	423119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_012583	CTT	2	6	423130	423135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_012583	CAA	2	6	423251	423256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_012583	GTT	2	6	423273	423278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_012583	AGC	2	6	423313	423318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_012583	CTTT	2	8	423337	423344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_012583	GT	3	6	423426	423431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_012583	GGT	2	6	423568	423573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_012583	GTT	2	6	423578	423583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_012583	GTTTGG	2	12	423586	423597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_012583	GGCG	2	8	423622	423629	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_012583	TTG	2	6	423766	423771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_012583	TGT	2	6	423824	423829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_012583	AGT	2	6	423833	423838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_012583	CAA	2	6	423840	423845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_012583	TAGCT	2	10	423874	423883	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8065	NC_012583	ATG	2	6	423934	423939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119634
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8069	NC_012583	GTT	2	6	424088	424093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_012583	GGCG	2	8	424132	424139	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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8078	NC_012583	AGCTC	2	10	424549	424558	20 %	20 %	20 %	40 %	227119636
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8084	NC_012583	CA	3	6	424814	424819	50 %	0 %	0 %	50 %	227119636
8085	NC_012583	GTT	2	6	424899	424904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_012583	GGCG	2	8	425528	425535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8098	NC_012583	TAT	2	6	425539	425544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_012583	ATAA	2	8	425564	425571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_012583	ATTTTA	2	12	425590	425601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119638
8101	NC_012583	A	6	6	425674	425679	100 %	0 %	0 %	0 %	227119638
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8108	NC_012583	TG	3	6	426151	426156	0 %	50 %	50 %	0 %	227119639
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8112	NC_012583	GTTG	2	8	426355	426362	0 %	50 %	50 %	0 %	227119639
8113	NC_012583	TCG	2	6	426397	426402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119639
8114	NC_012583	TCA	2	6	426424	426429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119639
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8117	NC_012583	AC	3	6	426469	426474	50 %	0 %	0 %	50 %	227119639
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