MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012583	GGT	2	6	314832	314837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119480
6002	NC_012583	AC	3	6	314855	314860	50 %	0 %	0 %	50 %	227119480
6003	NC_012583	GCG	2	6	314869	314874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119480
6004	NC_012583	ACA	2	6	314877	314882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119480
6005	NC_012583	TGG	2	6	314954	314959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119480
6006	NC_012583	CATC	2	8	314975	314982	25 %	25 %	0 %	50 %	227119480
6007	NC_012583	GC	3	6	315056	315061	0 %	0 %	50 %	50 %	227119480
6008	NC_012583	AGA	2	6	315113	315118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119480
6009	NC_012583	AGA	2	6	315126	315131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119480
6010	NC_012583	TG	3	6	315141	315146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_012583	TGAA	2	8	315150	315157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_012583	TGA	2	6	315202	315207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012583	CT	3	6	315376	315381	0 %	50 %	0 %	50 %	227119481
6014	NC_012583	GAA	2	6	315542	315547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119481
6015	NC_012583	TGC	2	6	315590	315595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119481
6016	NC_012583	TGG	2	6	315607	315612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119481
6017	NC_012583	TCA	2	6	315613	315618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119481
6018	NC_012583	ATC	2	6	315639	315644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119481
6019	NC_012583	CTT	2	6	315698	315703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119481
6020	NC_012583	TCAGAA	2	12	315712	315723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227119481
6021	NC_012583	ATTC	2	8	315783	315790	25 %	50 %	0 %	25 %	227119481
6022	NC_012583	GCA	2	6	315845	315850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119482
6023	NC_012583	ATAG	2	8	315859	315866	50 %	25 %	25 %	0 %	227119482
6024	NC_012583	AGT	2	6	315951	315956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119482
6025	NC_012583	T	6	6	316009	316014	0 %	100 %	0 %	0 %	227119482
6026	NC_012583	A	6	6	316145	316150	100 %	0 %	0 %	0 %	227119482
6027	NC_012583	ATG	2	6	316184	316189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119482
6028	NC_012583	CAGC	2	8	316368	316375	25 %	0 %	25 %	50 %	227119482
6029	NC_012583	TGC	2	6	316418	316423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119482
6030	NC_012583	TTCA	2	8	316537	316544	25 %	50 %	0 %	25 %	227119482
6031	NC_012583	TAAG	2	8	316612	316619	50 %	25 %	25 %	0 %	227119482
6032	NC_012583	GA	3	6	316639	316644	50 %	0 %	50 %	0 %	227119482
6033	NC_012583	GTG	2	6	316645	316650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119482
6034	NC_012583	CT	3	6	316654	316659	0 %	50 %	0 %	50 %	227119482
6035	NC_012583	TCA	2	6	316721	316726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119482
6036	NC_012583	TGC	2	6	316841	316846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119482
6037	NC_012583	GTA	2	6	316915	316920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119482
6038	NC_012583	GA	3	6	316935	316940	50 %	0 %	50 %	0 %	227119482
6039	NC_012583	T	6	6	317058	317063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012583	CA	3	6	317067	317072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_012583	TACT	2	8	317134	317141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_012583	AGA	2	6	317147	317152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012583	TCA	2	6	317184	317189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119483
6044	NC_012583	A	7	7	317209	317215	100 %	0 %	0 %	0 %	227119483
6045	NC_012583	CGG	2	6	317246	317251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119483
6046	NC_012583	AGA	2	6	317343	317348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119483
6047	NC_012583	GC	3	6	317350	317355	0 %	0 %	50 %	50 %	227119483
6048	NC_012583	TTA	2	6	317362	317367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119483
6049	NC_012583	AGA	3	9	317388	317396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119483
6050	NC_012583	AAG	2	6	317429	317434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119483
6051	NC_012583	AAC	2	6	317553	317558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012583	T	6	6	317646	317651	0 %	100 %	0 %	0 %	227119484
6053	NC_012583	A	6	6	317652	317657	100 %	0 %	0 %	0 %	227119484
6054	NC_012583	TAA	2	6	317745	317750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119484
6055	NC_012583	TTG	2	6	317757	317762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119484
6056	NC_012583	CGA	2	6	317908	317913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119484
6057	NC_012583	TTG	2	6	317915	317920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119484
6058	NC_012583	GGT	3	9	317976	317984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119484
6059	NC_012583	CT	3	6	317995	318000	0 %	50 %	0 %	50 %	227119484
6060	NC_012583	ATCA	2	8	318033	318040	50 %	25 %	0 %	25 %	227119484
6061	NC_012583	ATG	2	6	318142	318147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119484
6062	NC_012583	CGG	2	6	318189	318194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119484
6063	NC_012583	AGCGA	2	10	318219	318228	40 %	0 %	40 %	20 %	227119484
6064	NC_012583	GAG	2	6	318239	318244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119484
6065	NC_012583	AAT	2	6	318363	318368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119484
6066	NC_012583	TGT	2	6	318406	318411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012583	GA	3	6	318419	318424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_012583	GC	3	6	318442	318447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_012583	ATGA	2	8	318459	318466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_012583	TC	3	6	318491	318496	0 %	50 %	0 %	50 %	227119485
6071	NC_012583	TCG	2	6	318531	318536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119485
6072	NC_012583	GTGA	2	8	318584	318591	25 %	25 %	50 %	0 %	227119485
6073	NC_012583	T	6	6	318622	318627	0 %	100 %	0 %	0 %	227119485
6074	NC_012583	GTG	2	6	318644	318649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119485
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6078	NC_012583	TGG	2	6	318919	318924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119485
6079	NC_012583	T	6	6	318971	318976	0 %	100 %	0 %	0 %	227119485
6080	NC_012583	GTT	2	6	319053	319058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119485
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6083	NC_012583	TTGC	2	8	319256	319263	0 %	50 %	25 %	25 %	227119485
6084	NC_012583	GCT	2	6	319285	319290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119485
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6087	NC_012583	TATGG	2	10	319391	319400	20 %	40 %	40 %	0 %	227119485
6088	NC_012583	GCACT	2	10	319419	319428	20 %	20 %	20 %	40 %	227119485
6089	NC_012583	TAT	2	6	319481	319486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119485
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6091	NC_012583	GCTC	2	8	319583	319590	0 %	25 %	25 %	50 %	227119485
6092	NC_012583	TTG	2	6	319631	319636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_012583	CAA	2	6	319655	319660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_012583	ATA	2	6	319710	319715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_012583	TAATT	2	10	319735	319744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012583	TCC	2	6	319748	319753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_012583	TCATT	2	10	319838	319847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_012583	CATG	2	8	319893	319900	25 %	25 %	25 %	25 %	227119486
6099	NC_012583	GAA	2	6	319938	319943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119486
6100	NC_012583	CT	4	8	320006	320013	0 %	50 %	0 %	50 %	227119486
6101	NC_012583	GA	3	6	320019	320024	50 %	0 %	50 %	0 %	227119486
6102	NC_012583	TGAT	2	8	320025	320032	25 %	50 %	25 %	0 %	227119486
6103	NC_012583	GTG	2	6	320121	320126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119486
6104	NC_012583	GCG	2	6	320192	320197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119486
6105	NC_012583	G	6	6	320260	320265	0 %	0 %	100 %	0 %	227119486
6106	NC_012583	GAC	2	6	320269	320274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6107	NC_012583	GTC	2	6	320322	320327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6108	NC_012583	ATCAAG	2	12	320352	320363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227119486
6109	NC_012583	A	6	6	320372	320377	100 %	0 %	0 %	0 %	227119486
6110	NC_012583	TTC	2	6	320400	320405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119486
6111	NC_012583	TGA	2	6	320449	320454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6112	NC_012583	CAT	2	6	320455	320460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119486
6113	NC_012583	T	6	6	320525	320530	0 %	100 %	0 %	0 %	227119486
6114	NC_012583	TGA	2	6	320536	320541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6115	NC_012583	AG	3	6	320617	320622	50 %	0 %	50 %	0 %	227119486
6116	NC_012583	TAC	2	6	320666	320671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119486
6117	NC_012583	GAT	2	6	320690	320695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6118	NC_012583	TTG	2	6	320718	320723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119486
6119	NC_012583	GATGTC	2	12	320744	320755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227119486
6120	NC_012583	ATCA	2	8	320825	320832	50 %	25 %	0 %	25 %	227119486
6121	NC_012583	TGC	2	6	320847	320852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6122	NC_012583	TCG	2	6	320902	320907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6123	NC_012583	ATG	2	6	320925	320930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6124	NC_012583	ATG	2	6	320984	320989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6125	NC_012583	AGC	2	6	321023	321028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6126	NC_012583	GAAC	2	8	321058	321065	50 %	0 %	25 %	25 %	227119486
6127	NC_012583	GGT	2	6	321100	321105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119486
6128	NC_012583	TGAG	2	8	321123	321130	25 %	25 %	50 %	0 %	227119486
6129	NC_012583	GC	3	6	321134	321139	0 %	0 %	50 %	50 %	227119486
6130	NC_012583	AATCA	2	10	321162	321171	60 %	20 %	0 %	20 %	227119486
6131	NC_012583	GCA	2	6	321199	321204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6132	NC_012583	AAT	2	6	321221	321226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119486
6133	NC_012583	CTT	2	6	321243	321248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119486
6134	NC_012583	CAAA	2	8	321303	321310	75 %	0 %	0 %	25 %	227119486
6135	NC_012583	CTG	2	6	321359	321364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6136	NC_012583	GCG	2	6	321386	321391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119486
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6138	NC_012583	GTGC	2	8	321437	321444	0 %	25 %	50 %	25 %	227119486
6139	NC_012583	CAC	2	6	321469	321474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119486
6140	NC_012583	CGT	2	6	321520	321525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6141	NC_012583	AGC	2	6	321546	321551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6142	NC_012583	ACG	2	6	321560	321565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6143	NC_012583	ATG	2	6	321602	321607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6144	NC_012583	TGA	2	6	321628	321633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
6145	NC_012583	CA	3	6	321640	321645	50 %	0 %	0 %	50 %	227119486
6146	NC_012583	GCG	3	9	321650	321658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119486
6147	NC_012583	AGC	2	6	321663	321668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119486
6148	NC_012583	AGAC	2	8	321746	321753	50 %	0 %	25 %	25 %	227119486
6149	NC_012583	TAG	2	6	321804	321809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119486
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6151	NC_012583	T	7	7	321938	321944	0 %	100 %	0 %	0 %	227119487
6152	NC_012583	TCGT	2	8	321973	321980	0 %	50 %	25 %	25 %	227119487
6153	NC_012583	ATC	3	9	322029	322037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119487
6154	NC_012583	ACT	2	6	322052	322057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119487
6155	NC_012583	TGA	2	6	322102	322107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119487
6156	NC_012583	CTCG	2	8	322152	322159	0 %	25 %	25 %	50 %	227119487
6157	NC_012583	GAT	2	6	322216	322221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119487
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6159	NC_012583	TGG	2	6	322281	322286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119487
6160	NC_012583	G	6	6	322349	322354	0 %	0 %	100 %	0 %	227119487
6161	NC_012583	ACT	2	6	322467	322472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119487
6162	NC_012583	GCT	2	6	322492	322497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119487
6163	NC_012583	TTGA	2	8	322559	322566	25 %	50 %	25 %	0 %	227119487
6164	NC_012583	GCT	2	6	322587	322592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119487
6165	NC_012583	CAT	2	6	322618	322623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119487
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6168	NC_012583	TGC	2	6	322810	322815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119487
6169	NC_012583	TGA	2	6	322929	322934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119487
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6176	NC_012583	C	6	6	323230	323235	0 %	0 %	0 %	100 %	227119487
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6180	NC_012583	TGAC	2	8	323529	323536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6181	NC_012583	GTG	2	6	323546	323551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6182	NC_012583	TGCT	2	8	323651	323658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6183	NC_012583	CGT	2	6	323763	323768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119488
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6190	NC_012583	CTG	2	6	324334	324339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119488
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6201	NC_012583	GAT	2	6	324929	324934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6202	NC_012583	AC	3	6	324937	324942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6203	NC_012583	CAA	2	6	325006	325011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6210	NC_012583	CT	3	6	325423	325428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6211	NC_012583	TG	3	6	325747	325752	0 %	50 %	50 %	0 %	227119490
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6215	NC_012583	CTT	2	6	325916	325921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6216	NC_012583	AGG	2	6	325933	325938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6217	NC_012583	TGAG	2	8	325958	325965	25 %	25 %	50 %	0 %	227119491
6218	NC_012583	TGA	2	6	326011	326016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119491
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6221	NC_012583	GCT	2	6	326341	326346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119492
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6228	NC_012583	ACT	2	6	326661	326666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119492
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6230	NC_012583	CAA	2	6	326753	326758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119492
6231	NC_012583	AGC	3	9	326760	326768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119492
6232	NC_012583	AAT	2	6	326789	326794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119492
6233	NC_012583	GTCTT	2	10	326820	326829	0 %	60 %	20 %	20 %	227119492
6234	NC_012583	A	6	6	326863	326868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6235	NC_012583	AAATT	2	10	326901	326910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6236	NC_012583	GAT	2	6	326951	326956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6237	NC_012583	GCC	2	6	326984	326989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6238	NC_012583	TGC	2	6	327032	327037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6239	NC_012583	TGA	2	6	327042	327047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6240	NC_012583	A	6	6	327055	327060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_012583	CTT	2	6	327076	327081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6242	NC_012583	ACG	2	6	327120	327125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_012583	TC	3	6	327133	327138	0 %	50 %	0 %	50 %	227119493
6244	NC_012583	CTG	2	6	327150	327155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119493
6245	NC_012583	T	6	6	327171	327176	0 %	100 %	0 %	0 %	227119493
6246	NC_012583	TTC	2	6	327207	327212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119493
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6487	NC_012583	A	7	7	340745	340751	100 %	0 %	0 %	0 %	227119504
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6492	NC_012583	GCTA	2	8	341030	341037	25 %	25 %	25 %	25 %	227119504
6493	NC_012583	GAA	2	6	341045	341050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119504
6494	NC_012583	AAG	2	6	341103	341108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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