MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012583	TGA	2	6	289698	289703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5502	NC_012583	CGCT	2	8	289768	289775	0 %	25 %	25 %	50 %	227119451
5503	NC_012583	GCT	2	6	289791	289796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119451
5504	NC_012583	GGT	2	6	289873	289878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119451
5505	NC_012583	TGA	2	6	289947	289952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5506	NC_012583	CT	3	6	290059	290064	0 %	50 %	0 %	50 %	227119451
5507	NC_012583	ATG	2	6	290084	290089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5508	NC_012583	TGG	2	6	290097	290102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119451
5509	NC_012583	TGGC	2	8	290237	290244	0 %	25 %	50 %	25 %	227119451
5510	NC_012583	GCC	2	6	290245	290250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119451
5511	NC_012583	AAGA	2	8	290251	290258	75 %	0 %	25 %	0 %	227119451
5512	NC_012583	TGA	2	6	290346	290351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5513	NC_012583	GAT	2	6	290404	290409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5514	NC_012583	CCG	2	6	290438	290443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119451
5515	NC_012583	GTC	2	6	290517	290522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119452
5516	NC_012583	ACC	2	6	290671	290676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119452
5517	NC_012583	GT	3	6	290683	290688	0 %	50 %	50 %	0 %	227119452
5518	NC_012583	GTTT	2	8	290709	290716	0 %	75 %	25 %	0 %	227119452
5519	NC_012583	CG	3	6	290752	290757	0 %	0 %	50 %	50 %	227119452
5520	NC_012583	CAT	2	6	290844	290849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_012583	TGA	2	6	290916	290921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119453
5522	NC_012583	TCT	2	6	290955	290960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119453
5523	NC_012583	CAA	2	6	290971	290976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_012583	A	7	7	290975	290981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_012583	A	6	6	290996	291001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_012583	ATT	2	6	291028	291033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_012583	AAT	2	6	291035	291040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_012583	TCA	2	6	291144	291149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5529	NC_012583	TGAT	2	8	291163	291170	25 %	50 %	25 %	0 %	227119454
5530	NC_012583	CCG	3	9	291277	291285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119454
5531	NC_012583	ATC	3	9	291286	291294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5532	NC_012583	TAG	2	6	291355	291360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119454
5533	NC_012583	CGG	2	6	291383	291388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119454
5534	NC_012583	TGA	2	6	291416	291421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119454
5535	NC_012583	GCTCC	2	10	291459	291468	0 %	20 %	20 %	60 %	227119454
5536	NC_012583	GCT	2	6	291498	291503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119454
5537	NC_012583	CCA	2	6	291554	291559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119454
5538	NC_012583	TC	3	6	291592	291597	0 %	50 %	0 %	50 %	227119454
5539	NC_012583	ACAA	2	8	291607	291614	75 %	0 %	0 %	25 %	227119454
5540	NC_012583	CCG	2	6	291623	291628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119454
5541	NC_012583	TAC	2	6	291654	291659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5542	NC_012583	CAA	2	6	291686	291691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119454
5543	NC_012583	TGA	2	6	291808	291813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119454
5544	NC_012583	CAT	2	6	291845	291850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5545	NC_012583	TGA	2	6	291859	291864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119454
5546	NC_012583	A	6	6	291864	291869	100 %	0 %	0 %	0 %	227119454
5547	NC_012583	TTAC	2	8	292012	292019	25 %	50 %	0 %	25 %	227119454
5548	NC_012583	ATC	2	6	292060	292065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5549	NC_012583	ATC	2	6	292074	292079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5550	NC_012583	GGT	2	6	292086	292091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119454
5551	NC_012583	CGC	2	6	292116	292121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119454
5552	NC_012583	AGC	2	6	292178	292183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119454
5553	NC_012583	CAT	2	6	292202	292207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119454
5554	NC_012583	GCT	2	6	292220	292225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119454
5555	NC_012583	GAA	2	6	292257	292262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119454
5556	NC_012583	CAG	2	6	292275	292280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119454
5557	NC_012583	ACG	2	6	292304	292309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_012583	TGT	2	6	292486	292491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119455
5559	NC_012583	GCA	2	6	292496	292501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119455
5560	NC_012583	TGA	2	6	292612	292617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119455
5561	NC_012583	TCAA	2	8	292723	292730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_012583	GAG	2	6	292815	292820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119456
5563	NC_012583	TCTT	2	8	292854	292861	0 %	75 %	0 %	25 %	227119456
5564	NC_012583	AGTG	2	8	292928	292935	25 %	25 %	50 %	0 %	227119456
5565	NC_012583	TTCC	2	8	292979	292986	0 %	50 %	0 %	50 %	227119456
5566	NC_012583	TTG	2	6	293028	293033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119456
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5568	NC_012583	AG	3	6	293045	293050	50 %	0 %	50 %	0 %	227119456
5569	NC_012583	TTGC	2	8	293078	293085	0 %	50 %	25 %	25 %	227119456
5570	NC_012583	TTG	2	6	293120	293125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119456
5571	NC_012583	TTG	2	6	293231	293236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119456
5572	NC_012583	TGT	2	6	293263	293268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119456
5573	NC_012583	TAA	2	6	293306	293311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119456
5574	NC_012583	CCTT	2	8	293369	293376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_012583	GT	3	6	293550	293555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_012583	GATGGA	2	12	293563	293574	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_012583	CTG	2	6	293748	293753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119457
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5582	NC_012583	CAG	2	6	293937	293942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119457
5583	NC_012583	CAG	2	6	293979	293984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119457
5584	NC_012583	A	6	6	294026	294031	100 %	0 %	0 %	0 %	227119457
5585	NC_012583	GCGTT	2	10	294033	294042	0 %	40 %	40 %	20 %	227119457
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5588	NC_012583	GAT	2	6	294114	294119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119457
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5590	NC_012583	CAG	3	9	294159	294167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119457
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5592	NC_012583	GCG	2	6	294189	294194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119457
5593	NC_012583	TCA	2	6	294223	294228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119457
5594	NC_012583	GCTG	2	8	294302	294309	0 %	25 %	50 %	25 %	227119457
5595	NC_012583	ACC	2	6	294324	294329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119457
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5598	NC_012583	GCA	2	6	294437	294442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119457
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5600	NC_012583	CAA	2	6	294540	294545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119457
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5602	NC_012583	TGA	3	9	294641	294649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119457
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5605	NC_012583	TTG	2	6	294813	294818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119457
5606	NC_012583	GCA	2	6	294827	294832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119457
5607	NC_012583	AGTTG	2	10	294833	294842	20 %	40 %	40 %	0 %	227119457
5608	NC_012583	TGG	2	6	294928	294933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119457
5609	NC_012583	GCA	2	6	294959	294964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119457
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5612	NC_012583	GAG	2	6	295222	295227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119457
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5614	NC_012583	GAT	2	6	295258	295263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119458
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5617	NC_012583	GAT	2	6	295522	295527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119458
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5619	NC_012583	TG	3	6	295770	295775	0 %	50 %	50 %	0 %	227119458
5620	NC_012583	CGT	2	6	295822	295827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119458
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5622	NC_012583	CGC	2	6	296036	296041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119459
5623	NC_012583	A	6	6	296059	296064	100 %	0 %	0 %	0 %	227119459
5624	NC_012583	CCAT	2	8	296065	296072	25 %	25 %	0 %	50 %	227119459
5625	NC_012583	TCAA	2	8	296119	296126	50 %	25 %	0 %	25 %	227119459
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5673	NC_012583	GCTGC	2	10	298526	298535	0 %	20 %	40 %	40 %	227119462
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5681	NC_012583	GTA	2	6	298891	298896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119463
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5693	NC_012583	TTG	2	6	299601	299606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119464
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5699	NC_012583	GGGCA	2	10	299886	299895	20 %	0 %	60 %	20 %	227119464
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5733	NC_012583	ATG	2	6	301415	301420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119465
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5736	NC_012583	ATG	2	6	301466	301471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119465
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5742	NC_012583	CAT	2	6	301672	301677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119465
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5744	NC_012583	ATG	2	6	301820	301825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119465
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