MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012583	GGT	2	6	235967	235972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119402
4502	NC_012583	GCC	2	6	236012	236017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119402
4503	NC_012583	ACTCA	2	10	236062	236071	40 %	20 %	0 %	40 %	227119402
4504	NC_012583	CGC	2	6	236073	236078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119402
4505	NC_012583	CGC	2	6	236086	236091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119402
4506	NC_012583	CCA	2	6	236159	236164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119402
4507	NC_012583	CAAAT	2	10	236180	236189	60 %	20 %	0 %	20 %	227119402
4508	NC_012583	AAGCG	2	10	236385	236394	40 %	0 %	40 %	20 %	227119403
4509	NC_012583	A	7	7	236479	236485	100 %	0 %	0 %	0 %	227119403
4510	NC_012583	GCC	2	6	236494	236499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119403
4511	NC_012583	GAC	2	6	236533	236538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119403
4512	NC_012583	ATG	2	6	236539	236544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119403
4513	NC_012583	CAA	2	6	236553	236558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119403
4514	NC_012583	AGC	2	6	236635	236640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119403
4515	NC_012583	TGTT	2	8	236684	236691	0 %	75 %	25 %	0 %	227119403
4516	NC_012583	TATC	2	8	236710	236717	25 %	50 %	0 %	25 %	227119403
4517	NC_012583	GAT	2	6	236722	236727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119403
4518	NC_012583	CGA	2	6	236774	236779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119404
4519	NC_012583	CAA	2	6	236805	236810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119404
4520	NC_012583	GAC	2	6	236886	236891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119404
4521	NC_012583	CCT	2	6	237021	237026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119405
4522	NC_012583	GT	3	6	237054	237059	0 %	50 %	50 %	0 %	227119405
4523	NC_012583	CG	3	6	237140	237145	0 %	0 %	50 %	50 %	227119405
4524	NC_012583	A	7	7	237195	237201	100 %	0 %	0 %	0 %	227119405
4525	NC_012583	CGC	2	6	237215	237220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119406
4526	NC_012583	CGGG	2	8	237238	237245	0 %	0 %	75 %	25 %	227119406
4527	NC_012583	GTG	2	6	237285	237290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119406
4528	NC_012583	ATT	2	6	237342	237347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119406
4529	NC_012583	GTCT	2	8	237520	237527	0 %	50 %	25 %	25 %	227119406
4530	NC_012583	CAT	2	6	237565	237570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119406
4531	NC_012583	A	6	6	237602	237607	100 %	0 %	0 %	0 %	227119406
4532	NC_012583	GACA	2	8	237617	237624	50 %	0 %	25 %	25 %	227119406
4533	NC_012583	AGCC	2	8	237828	237835	25 %	0 %	25 %	50 %	227119407
4534	NC_012583	GCAG	2	8	237876	237883	25 %	0 %	50 %	25 %	227119407
4535	NC_012583	ACC	2	6	237901	237906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119407
4536	NC_012583	GCA	2	6	237960	237965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119407
4537	NC_012583	GAC	2	6	237997	238002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119407
4538	NC_012583	CAA	2	6	238144	238149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119408
4539	NC_012583	GTC	2	6	238178	238183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119408
4540	NC_012583	AGCA	2	8	238206	238213	50 %	0 %	25 %	25 %	227119408
4541	NC_012583	CAA	2	6	238229	238234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119408
4542	NC_012583	CA	3	6	238258	238263	50 %	0 %	0 %	50 %	227119408
4543	NC_012583	AAC	2	6	238269	238274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119408
4544	NC_012583	AG	4	8	238279	238286	50 %	0 %	50 %	0 %	227119408
4545	NC_012583	CAA	2	6	238380	238385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119409
4546	NC_012583	AAG	2	6	238466	238471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119409
4547	NC_012583	TGA	2	6	238484	238489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119409
4548	NC_012583	CGGTA	2	10	238521	238530	20 %	20 %	40 %	20 %	227119409
4549	NC_012583	A	6	6	238566	238571	100 %	0 %	0 %	0 %	227119409
4550	NC_012583	GCG	2	6	238628	238633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119410
4551	NC_012583	TACC	2	8	238638	238645	25 %	25 %	0 %	50 %	227119410
4552	NC_012583	GAT	2	6	238653	238658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119410
4553	NC_012583	TGA	2	6	238785	238790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119411
4554	NC_012583	CAC	2	6	238837	238842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119411
4555	NC_012583	GTG	2	6	238899	238904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119411
4556	NC_012583	CGG	2	6	239001	239006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119411
4557	NC_012583	GGC	2	6	239083	239088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119411
4558	NC_012583	GCG	3	9	239165	239173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119411
4559	NC_012583	GCA	2	6	239243	239248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119411
4560	NC_012583	TAA	2	6	239323	239328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119411
4561	NC_012583	TCA	2	6	239357	239362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119411
4562	NC_012583	CCA	2	6	239421	239426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119411
4563	NC_012583	GCC	2	6	239441	239446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119411
4564	NC_012583	CCTT	2	8	239460	239467	0 %	50 %	0 %	50 %	227119411
4565	NC_012583	GGC	2	6	239468	239473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119411
4566	NC_012583	TCTT	2	8	239504	239511	0 %	75 %	0 %	25 %	227119411
4567	NC_012583	TC	3	6	239605	239610	0 %	50 %	0 %	50 %	227119411
4568	NC_012583	TTCGG	2	10	239618	239627	0 %	40 %	40 %	20 %	227119411
4569	NC_012583	GCAAA	2	10	239656	239665	60 %	0 %	20 %	20 %	227119411
4570	NC_012583	TGA	2	6	239668	239673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119411
4571	NC_012583	GCTC	2	8	239674	239681	0 %	25 %	25 %	50 %	227119411
4572	NC_012583	GCA	2	6	239795	239800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119411
4573	NC_012583	GCA	2	6	239838	239843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119411
4574	NC_012583	CACTG	2	10	239899	239908	20 %	20 %	20 %	40 %	227119411
4575	NC_012583	ATC	2	6	239921	239926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119411
4576	NC_012583	CT	4	8	239953	239960	0 %	50 %	0 %	50 %	227119411
4577	NC_012583	ATG	2	6	239984	239989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119411
4578	NC_012583	AGG	2	6	239992	239997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119411
4579	NC_012583	TGC	2	6	240061	240066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119411
4580	NC_012583	GGT	2	6	240118	240123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119411
4581	NC_012583	TGG	2	6	240170	240175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119411
4582	NC_012583	ATC	2	6	240218	240223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119411
4583	NC_012583	GCC	2	6	240227	240232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119411
4584	NC_012583	AACCC	2	10	240322	240331	40 %	0 %	0 %	60 %	227119411
4585	NC_012583	AAC	2	6	240461	240466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119411
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4587	NC_012583	GGC	2	6	240536	240541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119411
4588	NC_012583	CGG	2	6	240617	240622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119412
4589	NC_012583	CTG	2	6	240765	240770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119412
4590	NC_012583	ATT	2	6	240804	240809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119412
4591	NC_012583	TGC	2	6	241069	241074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119413
4592	NC_012583	TGT	2	6	241075	241080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119413
4593	NC_012583	CGG	2	6	241149	241154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119413
4594	NC_012583	CGC	2	6	241249	241254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119413
4595	NC_012583	CAT	2	6	241282	241287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119413
4596	NC_012583	TG	3	6	241377	241382	0 %	50 %	50 %	0 %	227119413
4597	NC_012583	CCG	2	6	241416	241421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119413
4598	NC_012583	CGA	2	6	241516	241521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119413
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4601	NC_012583	CAGCA	2	10	241802	241811	40 %	0 %	20 %	40 %	227119413
4602	NC_012583	GGT	2	6	241822	241827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119413
4603	NC_012583	CTG	2	6	241868	241873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119413
4604	NC_012583	TCA	2	6	242016	242021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119413
4605	NC_012583	AACC	2	8	242034	242041	50 %	0 %	0 %	50 %	227119413
4606	NC_012583	CAT	2	6	242044	242049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119413
4607	NC_012583	CTCA	2	8	242057	242064	25 %	25 %	0 %	50 %	227119413
4608	NC_012583	GTG	2	6	242154	242159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119414
4609	NC_012583	ACC	2	6	242173	242178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119414
4610	NC_012583	AGA	2	6	242181	242186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119414
4611	NC_012583	GT	3	6	242216	242221	0 %	50 %	50 %	0 %	227119414
4612	NC_012583	A	6	6	242294	242299	100 %	0 %	0 %	0 %	227119414
4613	NC_012583	GCAG	2	8	242404	242411	25 %	0 %	50 %	25 %	227119414
4614	NC_012583	GCC	2	6	242582	242587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119414
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4617	NC_012583	AAATC	2	10	242804	242813	60 %	20 %	0 %	20 %	227119415
4618	NC_012583	GAT	2	6	242843	242848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119415
4619	NC_012583	AGCC	2	8	242877	242884	25 %	0 %	25 %	50 %	227119415
4620	NC_012583	CAG	2	6	242931	242936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119415
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4622	NC_012583	AAG	2	6	243094	243099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119415
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4627	NC_012583	AGCA	2	8	243292	243299	50 %	0 %	25 %	25 %	227119415
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4722	NC_012583	CA	3	6	248317	248322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4723	NC_012583	GCA	2	6	248356	248361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4733	NC_012583	GGC	2	6	248754	248759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4993	NC_012583	GTT	2	6	263335	263340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119431
4994	NC_012583	GTT	2	6	263343	263348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119431
4995	NC_012583	TCA	2	6	263386	263391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119431
4996	NC_012583	T	6	6	263433	263438	0 %	100 %	0 %	0 %	227119431
4997	NC_012583	CA	3	6	263530	263535	50 %	0 %	0 %	50 %	227119431
4998	NC_012583	TCA	2	6	263863	263868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119431
4999	NC_012583	ATT	2	6	263883	263888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119431
5000	NC_012583	CAC	2	6	263945	263950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119431

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