MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48502	NC_012582	TAA	2	6	2527309	2527314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118733
48503	NC_012582	TTCG	2	8	2527444	2527451	0 %	50 %	25 %	25 %	227118733
48504	NC_012582	CAC	2	6	2527460	2527465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118733
48505	NC_012582	TCA	2	6	2527473	2527478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118733
48506	NC_012582	T	7	7	2527489	2527495	0 %	100 %	0 %	0 %	227118733
48507	NC_012582	AAG	2	6	2527501	2527506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118733
48508	NC_012582	CAC	2	6	2527673	2527678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118733
48509	NC_012582	TTTA	2	8	2527694	2527701	25 %	75 %	0 %	0 %	227118733
48510	NC_012582	TCA	2	6	2527854	2527859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118733
48511	NC_012582	TCAA	2	8	2527872	2527879	50 %	25 %	0 %	25 %	227118733
48512	NC_012582	TTG	2	6	2527910	2527915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118733
48513	NC_012582	AGAC	2	8	2527930	2527937	50 %	0 %	25 %	25 %	227118733
48514	NC_012582	GAC	2	6	2527949	2527954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118733
48515	NC_012582	GAAC	2	8	2528001	2528008	50 %	0 %	25 %	25 %	227118733
48516	NC_012582	GC	3	6	2528018	2528023	0 %	0 %	50 %	50 %	227118733
48517	NC_012582	GCT	2	6	2528053	2528058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118733
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48519	NC_012582	GAT	2	6	2528150	2528155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118733
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48521	NC_012582	TAA	3	9	2528207	2528215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48522	NC_012582	GAGC	2	8	2528256	2528263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48523	NC_012582	CGATC	2	10	2528290	2528299	20 %	20 %	20 %	40 %	227118734
48524	NC_012582	GCGG	2	8	2528327	2528334	0 %	0 %	75 %	25 %	227118734
48525	NC_012582	T	6	6	2528351	2528356	0 %	100 %	0 %	0 %	227118734
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48537	NC_012582	AGT	2	6	2528798	2528803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118735
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48543	NC_012582	CAGC	3	12	2529490	2529501	25 %	0 %	25 %	50 %	227118735
48544	NC_012582	AAGAG	2	10	2529502	2529511	60 %	0 %	40 %	0 %	227118735
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48547	NC_012582	AGCC	2	8	2529654	2529661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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48551	NC_012582	GTA	2	6	2529784	2529789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118736
48552	NC_012582	TCT	2	6	2529875	2529880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118736
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48615	NC_012582	TGCCAA	2	12	2533200	2533211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227118740
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48617	NC_012582	ATC	2	6	2533281	2533286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118740
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48723	NC_012582	GTC	2	6	2539350	2539355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118746
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48732	NC_012582	CTT	2	6	2539679	2539684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118746
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48734	NC_012582	CTTG	2	8	2539787	2539794	0 %	50 %	25 %	25 %	227118746
48735	NC_012582	TGG	2	6	2539841	2539846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118746
48736	NC_012582	CT	3	6	2539924	2539929	0 %	50 %	0 %	50 %	227118746
48737	NC_012582	TCG	2	6	2539930	2539935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118746
48738	NC_012582	ACTTC	2	10	2539939	2539948	20 %	40 %	0 %	40 %	227118746
48739	NC_012582	TCCT	2	8	2539974	2539981	0 %	50 %	0 %	50 %	227118746
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48745	NC_012582	CAA	2	6	2540287	2540292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48746	NC_012582	CAT	2	6	2540471	2540476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118747
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48777	NC_012582	TTG	2	6	2542339	2542344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118750
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48840	NC_012582	TAGCCC	2	12	2545515	2545526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227118755
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48845	NC_012582	GGC	3	9	2545763	2545771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118755
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48848	NC_012582	GATG	2	8	2546023	2546030	25 %	25 %	50 %	0 %	227118755
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48850	NC_012582	CAA	2	6	2546066	2546071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118755
48851	NC_012582	CAT	2	6	2546093	2546098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118755
48852	NC_012582	GATG	2	8	2546113	2546120	25 %	25 %	50 %	0 %	227118755
48853	NC_012582	TTTC	2	8	2546148	2546155	0 %	75 %	0 %	25 %	227118755
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48862	NC_012582	CACTT	2	10	2546540	2546549	20 %	40 %	0 %	40 %	227118756
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48869	NC_012582	CAAT	2	8	2546935	2546942	50 %	25 %	0 %	25 %	227118757
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48916	NC_012582	ATT	2	6	2549463	2549468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118762
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48967	NC_012582	GCA	2	6	2551921	2551926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118765
48968	NC_012582	TGC	2	6	2551980	2551985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118765
48969	NC_012582	CA	3	6	2551986	2551991	50 %	0 %	0 %	50 %	227118765
48970	NC_012582	CG	3	6	2551999	2552004	0 %	0 %	50 %	50 %	227118765
48971	NC_012582	T	6	6	2552071	2552076	0 %	100 %	0 %	0 %	227118765
48972	NC_012582	GCA	2	6	2552077	2552082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118765
48973	NC_012582	GC	3	6	2552164	2552169	0 %	0 %	50 %	50 %	227118765
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48980	NC_012582	GCC	2	6	2552679	2552684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118765
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48982	NC_012582	CCA	2	6	2552806	2552811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118765
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48990	NC_012582	GC	3	6	2553349	2553354	0 %	0 %	50 %	50 %	227118765
48991	NC_012582	CAG	2	6	2553362	2553367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118765
48992	NC_012582	CAT	2	6	2553395	2553400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118765
48993	NC_012582	CAAT	2	8	2553456	2553463	50 %	25 %	0 %	25 %	227118766
48994	NC_012582	GCTTG	2	10	2553490	2553499	0 %	40 %	40 %	20 %	227118766
48995	NC_012582	CCAT	2	8	2553527	2553534	25 %	25 %	0 %	50 %	227118766
48996	NC_012582	AAG	2	6	2553542	2553547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118766
48997	NC_012582	CGC	2	6	2553558	2553563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118766
48998	NC_012582	TGC	2	6	2553569	2553574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118766
48999	NC_012582	GAT	2	6	2553687	2553692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118766
49000	NC_012582	CGC	2	6	2553694	2553699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118766

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