MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_012582	A	6	6	2501958	2501963	100 %	0 %	0 %	0 %	227118707
48003	NC_012582	GAA	2	6	2502030	2502035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118707
48004	NC_012582	CTG	2	6	2502090	2502095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48005	NC_012582	T	7	7	2502106	2502112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48006	NC_012582	AG	3	6	2502217	2502222	50 %	0 %	50 %	0 %	227118708
48007	NC_012582	AGC	3	9	2502228	2502236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118708
48008	NC_012582	T	6	6	2502350	2502355	0 %	100 %	0 %	0 %	227118708
48009	NC_012582	TGA	2	6	2502361	2502366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118708
48010	NC_012582	GTG	2	6	2502408	2502413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118708
48011	NC_012582	CT	3	6	2502423	2502428	0 %	50 %	0 %	50 %	227118708
48012	NC_012582	AAG	2	6	2502606	2502611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118708
48013	NC_012582	TCT	2	6	2502693	2502698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118708
48014	NC_012582	ACC	2	6	2502749	2502754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118708
48015	NC_012582	CGC	2	6	2502827	2502832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118708
48016	NC_012582	ATGAG	2	10	2502855	2502864	40 %	20 %	40 %	0 %	227118708
48017	NC_012582	GCGT	2	8	2502930	2502937	0 %	25 %	50 %	25 %	227118708
48018	NC_012582	GAT	3	9	2503048	2503056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118708
48019	NC_012582	CGT	2	6	2503079	2503084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118708
48020	NC_012582	CAA	2	6	2503096	2503101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118708
48021	NC_012582	TGC	2	6	2503104	2503109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118708
48022	NC_012582	AAT	2	6	2503136	2503141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118708
48023	NC_012582	GAA	2	6	2503145	2503150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118708
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48025	NC_012582	GAT	2	6	2503169	2503174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118708
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48028	NC_012582	TCG	2	6	2503327	2503332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118708
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48033	NC_012582	GCT	2	6	2503633	2503638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118708
48034	NC_012582	CGG	2	6	2503678	2503683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118708
48035	NC_012582	TGA	2	6	2503705	2503710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118708
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48038	NC_012582	CGT	2	6	2503811	2503816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118708
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48041	NC_012582	TGA	2	6	2503864	2503869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118708
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48043	NC_012582	CCA	2	6	2503917	2503922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118708
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48054	NC_012582	GTC	2	6	2504463	2504468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118708
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48082	NC_012582	CCAG	2	8	2506034	2506041	25 %	0 %	25 %	50 %	227118712
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48101	NC_012582	A	6	6	2507030	2507035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48102	NC_012582	CTG	2	6	2507045	2507050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48104	NC_012582	TACG	2	8	2507082	2507089	25 %	25 %	25 %	25 %	227118713
48105	NC_012582	TGCGG	2	10	2507090	2507099	0 %	20 %	60 %	20 %	227118713
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48233	NC_012582	TTC	2	6	2514248	2514253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48234	NC_012582	TCCA	2	8	2514489	2514496	25 %	25 %	0 %	50 %	227118721
48235	NC_012582	T	6	6	2514527	2514532	0 %	100 %	0 %	0 %	227118721
48236	NC_012582	CA	3	6	2514539	2514544	50 %	0 %	0 %	50 %	227118721
48237	NC_012582	AGC	2	6	2514682	2514687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48238	NC_012582	CGG	2	6	2514725	2514730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48239	NC_012582	TGA	2	6	2514781	2514786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48240	NC_012582	TCT	2	6	2514817	2514822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118722
48241	NC_012582	TTC	2	6	2514886	2514891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118722
48242	NC_012582	GTTG	2	8	2514923	2514930	0 %	50 %	50 %	0 %	227118722
48243	NC_012582	GGC	2	6	2515116	2515121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118722
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48257	NC_012582	CG	3	6	2515736	2515741	0 %	0 %	50 %	50 %	227118722
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48265	NC_012582	A	9	9	2516095	2516103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48266	NC_012582	TTGC	2	8	2516151	2516158	0 %	50 %	25 %	25 %	227118723
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48275	NC_012582	TCT	2	6	2516640	2516645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48311	NC_012582	A	7	7	2518150	2518156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48312	NC_012582	GTC	2	6	2518202	2518207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48324	NC_012582	TCG	2	6	2518969	2518974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118725
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48334	NC_012582	CTG	2	6	2519421	2519426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118725
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48337	NC_012582	AAGTG	2	10	2519752	2519761	40 %	20 %	40 %	0 %	227118725
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48340	NC_012582	GAT	2	6	2519834	2519839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118725
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48342	NC_012582	CAC	2	6	2519881	2519886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118725
48343	NC_012582	CAA	2	6	2519893	2519898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118725
48344	NC_012582	GTGCT	2	10	2519906	2519915	0 %	40 %	40 %	20 %	227118725
48345	NC_012582	GCC	2	6	2519940	2519945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118725
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48347	NC_012582	A	6	6	2520140	2520145	100 %	0 %	0 %	0 %	227118725
48348	NC_012582	TGG	2	6	2520252	2520257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118725
48349	NC_012582	ACT	2	6	2520259	2520264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118725
48350	NC_012582	AAG	2	6	2520295	2520300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48351	NC_012582	T	6	6	2520319	2520324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48352	NC_012582	T	8	8	2520332	2520339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48353	NC_012582	GCT	2	6	2520383	2520388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48354	NC_012582	CT	3	6	2520429	2520434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48355	NC_012582	GTT	2	6	2520460	2520465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48356	NC_012582	TGC	2	6	2520473	2520478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48359	NC_012582	CTTG	2	8	2520623	2520630	0 %	50 %	25 %	25 %	227118726
48360	NC_012582	AAGG	2	8	2520658	2520665	50 %	0 %	50 %	0 %	227118726
48361	NC_012582	TG	4	8	2520723	2520730	0 %	50 %	50 %	0 %	227118726
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48383	NC_012582	TCT	2	6	2521912	2521917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118728
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48442	NC_012582	GCT	2	6	2524946	2524951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118731
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48462	NC_012582	GGGT	2	8	2525756	2525763	0 %	25 %	75 %	0 %	227118731
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48466	NC_012582	GCA	2	6	2525882	2525887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118731
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48468	NC_012582	ATA	2	6	2526027	2526032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48469	NC_012582	TTG	2	6	2526138	2526143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118732
48470	NC_012582	CAC	2	6	2526166	2526171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118732
48471	NC_012582	T	6	6	2526229	2526234	0 %	100 %	0 %	0 %	227118732
48472	NC_012582	CTG	2	6	2526282	2526287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118732
48473	NC_012582	CATCA	2	10	2526300	2526309	40 %	20 %	0 %	40 %	227118732
48474	NC_012582	A	6	6	2526321	2526326	100 %	0 %	0 %	0 %	227118732
48475	NC_012582	TGC	2	6	2526328	2526333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118732
48476	NC_012582	CTT	2	6	2526341	2526346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118732
48477	NC_012582	GCA	2	6	2526385	2526390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118732
48478	NC_012582	AAC	2	6	2526405	2526410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118732
48479	NC_012582	ATT	2	6	2526477	2526482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118732
48480	NC_012582	AG	3	6	2526504	2526509	50 %	0 %	50 %	0 %	227118732
48481	NC_012582	AACT	2	8	2526522	2526529	50 %	25 %	0 %	25 %	227118732
48482	NC_012582	CTGC	2	8	2526614	2526621	0 %	25 %	25 %	50 %	227118732
48483	NC_012582	CT	3	6	2526641	2526646	0 %	50 %	0 %	50 %	227118732
48484	NC_012582	CTG	2	6	2526694	2526699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118732
48485	NC_012582	GCC	2	6	2526766	2526771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118732
48486	NC_012582	GGA	2	6	2526777	2526782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118732
48487	NC_012582	T	6	6	2526813	2526818	0 %	100 %	0 %	0 %	227118732
48488	NC_012582	T	6	6	2526838	2526843	0 %	100 %	0 %	0 %	227118732
48489	NC_012582	AATC	2	8	2526853	2526860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48490	NC_012582	TGA	2	6	2526862	2526867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48491	NC_012582	TAC	2	6	2526869	2526874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48492	NC_012582	TCA	2	6	2526923	2526928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48493	NC_012582	C	8	8	2526932	2526939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48494	NC_012582	CT	4	8	2526963	2526970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48495	NC_012582	CATT	2	8	2526971	2526978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48496	NC_012582	AACA	2	8	2526996	2527003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48497	NC_012582	CGA	2	6	2527030	2527035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48498	NC_012582	ATG	2	6	2527065	2527070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48499	NC_012582	AG	3	6	2527080	2527085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48500	NC_012582	CCAT	2	8	2527100	2527107	25 %	25 %	0 %	50 %	227118733

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