MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_012582	CAA	2	6	2446188	2446193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118656
47003	NC_012582	A	7	7	2446331	2446337	100 %	0 %	0 %	0 %	227118656
47004	NC_012582	TG	3	6	2446344	2446349	0 %	50 %	50 %	0 %	227118656
47005	NC_012582	CAGT	2	8	2446389	2446396	25 %	25 %	25 %	25 %	227118656
47006	NC_012582	T	6	6	2446412	2446417	0 %	100 %	0 %	0 %	227118656
47007	NC_012582	T	6	6	2446426	2446431	0 %	100 %	0 %	0 %	227118656
47008	NC_012582	TCC	2	6	2446542	2446547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47009	NC_012582	CAAT	2	8	2446592	2446599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47010	NC_012582	AGCTC	2	10	2446695	2446704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47011	NC_012582	A	7	7	2446724	2446730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47012	NC_012582	GTT	2	6	2446754	2446759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47013	NC_012582	GCT	2	6	2446824	2446829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47014	NC_012582	TAT	2	6	2446848	2446853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118657
47015	NC_012582	GA	3	6	2446859	2446864	50 %	0 %	50 %	0 %	227118657
47016	NC_012582	GTT	2	6	2446871	2446876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118657
47017	NC_012582	TAC	2	6	2447028	2447033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118657
47018	NC_012582	GGT	2	6	2447119	2447124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118657
47019	NC_012582	TCA	2	6	2447225	2447230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118657
47020	NC_012582	CAC	2	6	2447250	2447255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118657
47021	NC_012582	CT	3	6	2447584	2447589	0 %	50 %	0 %	50 %	227118657
47022	NC_012582	GCCA	2	8	2447599	2447606	25 %	0 %	25 %	50 %	227118657
47023	NC_012582	CCAT	2	8	2447675	2447682	25 %	25 %	0 %	50 %	227118657
47024	NC_012582	ATC	2	6	2447713	2447718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118657
47025	NC_012582	GTA	2	6	2447731	2447736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118657
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47028	NC_012582	CGT	2	6	2447935	2447940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47029	NC_012582	GA	3	6	2448027	2448032	50 %	0 %	50 %	0 %	227118657
47030	NC_012582	CAG	2	6	2448076	2448081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47031	NC_012582	T	7	7	2448108	2448114	0 %	100 %	0 %	0 %	227118657
47032	NC_012582	AGC	2	6	2448136	2448141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47033	NC_012582	CTG	2	6	2448166	2448171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47034	NC_012582	AAT	2	6	2448205	2448210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118657
47035	NC_012582	AAT	2	6	2448240	2448245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118657
47036	NC_012582	ATG	2	6	2448283	2448288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118657
47037	NC_012582	TCA	2	6	2448306	2448311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118657
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47039	NC_012582	TGC	2	6	2448377	2448382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47040	NC_012582	TTG	2	6	2448536	2448541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118657
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47042	NC_012582	TC	3	6	2448610	2448615	0 %	50 %	0 %	50 %	227118657
47043	NC_012582	TGC	2	6	2448663	2448668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118657
47044	NC_012582	T	6	6	2448675	2448680	0 %	100 %	0 %	0 %	227118657
47045	NC_012582	CAT	3	9	2448769	2448777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118657
47046	NC_012582	CTTC	2	8	2448915	2448922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47047	NC_012582	CAAAA	2	10	2448961	2448970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47048	NC_012582	CGA	2	6	2449021	2449026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47050	NC_012582	TAA	2	6	2449103	2449108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47051	NC_012582	CAAAT	2	10	2449113	2449122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47052	NC_012582	TAGA	2	8	2449160	2449167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47053	NC_012582	AG	3	6	2449188	2449193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47054	NC_012582	AG	3	6	2449254	2449259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_012582	G	6	6	2449294	2449299	0 %	0 %	100 %	0 %	227118658
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47058	NC_012582	TTTA	2	8	2449442	2449449	25 %	75 %	0 %	0 %	227118658
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47062	NC_012582	TGA	2	6	2449690	2449695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118658
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47064	NC_012582	ATC	2	6	2449725	2449730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118658
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47094	NC_012582	ATT	2	6	2451044	2451049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47099	NC_012582	GGCTTT	2	12	2451289	2451300	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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47102	NC_012582	TCA	2	6	2451397	2451402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47103	NC_012582	CA	3	6	2451490	2451495	50 %	0 %	0 %	50 %	227118660
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47107	NC_012582	TGC	2	6	2451654	2451659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118660
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47109	NC_012582	CAC	2	6	2451701	2451706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118660
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47114	NC_012582	CAG	2	6	2451950	2451955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118660
47115	NC_012582	CAT	2	6	2451973	2451978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47116	NC_012582	CAT	2	6	2452030	2452035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47117	NC_012582	TGGCG	2	10	2452104	2452113	0 %	20 %	60 %	20 %	227118660
47118	NC_012582	TGT	2	6	2452114	2452119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118660
47119	NC_012582	CAC	2	6	2452132	2452137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118660
47120	NC_012582	CAT	2	6	2452165	2452170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47121	NC_012582	ACG	2	6	2452211	2452216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118660
47122	NC_012582	GAT	2	6	2452217	2452222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118660
47123	NC_012582	ATC	2	6	2452226	2452231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47124	NC_012582	TCA	2	6	2452272	2452277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47125	NC_012582	ACG	2	6	2452281	2452286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118660
47126	NC_012582	CTT	2	6	2452330	2452335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118660
47127	NC_012582	CAT	2	6	2452342	2452347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118660
47128	NC_012582	GAT	2	6	2452366	2452371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118660
47129	NC_012582	CTT	2	6	2452402	2452407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118660
47130	NC_012582	CAG	2	6	2452427	2452432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118660
47131	NC_012582	ATCA	2	8	2452481	2452488	50 %	25 %	0 %	25 %	227118660
47132	NC_012582	GTTTG	2	10	2452510	2452519	0 %	60 %	40 %	0 %	227118660
47133	NC_012582	GTA	2	6	2452520	2452525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118660
47134	NC_012582	AAT	2	6	2452568	2452573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118660
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47136	NC_012582	CAC	2	6	2452636	2452641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118660
47137	NC_012582	CAC	2	6	2452684	2452689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118660
47138	NC_012582	ACCTT	2	10	2452886	2452895	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47139	NC_012582	AAGGTT	2	12	2452896	2452907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47140	NC_012582	AGG	2	6	2452929	2452934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118661
47141	NC_012582	TCAA	2	8	2453012	2453019	50 %	25 %	0 %	25 %	227118661
47142	NC_012582	TG	3	6	2453173	2453178	0 %	50 %	50 %	0 %	227118661
47143	NC_012582	GC	3	6	2453201	2453206	0 %	0 %	50 %	50 %	227118661
47144	NC_012582	CAG	2	6	2453345	2453350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118661
47145	NC_012582	TGA	2	6	2453358	2453363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118661
47146	NC_012582	CTC	2	6	2453394	2453399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118661
47147	NC_012582	CT	4	8	2453434	2453441	0 %	50 %	0 %	50 %	227118661
47148	NC_012582	TTA	2	6	2453444	2453449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118661
47149	NC_012582	CAGCA	2	10	2453636	2453645	40 %	0 %	20 %	40 %	227118661
47150	NC_012582	ACA	2	6	2453655	2453660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118661
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47152	NC_012582	GGC	2	6	2453752	2453757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118661
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47154	NC_012582	TAG	2	6	2453775	2453780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118661
47155	NC_012582	G	7	7	2453795	2453801	0 %	0 %	100 %	0 %	227118661
47156	NC_012582	CCG	2	6	2453834	2453839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118661
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47158	NC_012582	GCT	2	6	2453923	2453928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118661
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47160	NC_012582	AAG	2	6	2454284	2454289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118661
47161	NC_012582	GTT	3	9	2454466	2454474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118661
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47165	NC_012582	TGA	2	6	2454768	2454773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118661
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47172	NC_012582	TGC	2	6	2455229	2455234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118661
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47180	NC_012582	ATTT	2	8	2455485	2455492	25 %	75 %	0 %	0 %	227118661
47181	NC_012582	ACA	2	6	2455493	2455498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118661
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47187	NC_012582	TGC	2	6	2455822	2455827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118662
47188	NC_012582	ACA	2	6	2455831	2455836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118662
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47193	NC_012582	CTT	2	6	2456118	2456123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47194	NC_012582	A	6	6	2456179	2456184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47195	NC_012582	AAAAG	2	10	2456188	2456197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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47204	NC_012582	CAGA	2	8	2456703	2456710	50 %	0 %	25 %	25 %	227118663
47205	NC_012582	AGT	2	6	2456850	2456855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118663
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47209	NC_012582	GT	3	6	2457000	2457005	0 %	50 %	50 %	0 %	227118663
47210	NC_012582	CAAC	2	8	2457087	2457094	50 %	0 %	0 %	50 %	227118663
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47220	NC_012582	GCC	2	6	2457821	2457826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118663
47221	NC_012582	GCTT	2	8	2457851	2457858	0 %	50 %	25 %	25 %	227118663
47222	NC_012582	CCA	2	6	2457882	2457887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118663
47223	NC_012582	GAG	2	6	2457909	2457914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118663
47224	NC_012582	CGA	2	6	2457918	2457923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118663
47225	NC_012582	CAG	2	6	2457970	2457975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118663
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47227	NC_012582	GC	3	6	2458148	2458153	0 %	0 %	50 %	50 %	227118663
47228	NC_012582	GT	3	6	2458270	2458275	0 %	50 %	50 %	0 %	227118663
47229	NC_012582	TTG	2	6	2458337	2458342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118663
47230	NC_012582	CGGTG	2	10	2458441	2458450	0 %	20 %	60 %	20 %	227118663
47231	NC_012582	CAC	2	6	2458674	2458679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118663
47232	NC_012582	AAG	2	6	2458710	2458715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118663
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47234	NC_012582	ACC	2	6	2458814	2458819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118663
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47236	NC_012582	ATA	2	6	2458898	2458903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118663
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47272	NC_012582	TA	3	6	2460974	2460979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47350	NC_012582	A	6	6	2465539	2465544	100 %	0 %	0 %	0 %	227118672
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47354	NC_012582	GC	3	6	2465711	2465716	0 %	0 %	50 %	50 %	227118672
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47380	NC_012582	CTG	2	6	2467775	2467780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118675
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47471	NC_012582	CGCA	2	8	2472107	2472114	25 %	0 %	25 %	50 %	227118678
47472	NC_012582	TCA	2	6	2472210	2472215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118678
47473	NC_012582	CAT	2	6	2472226	2472231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118678
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47475	NC_012582	CAA	2	6	2472295	2472300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118678
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47477	NC_012582	TAAATT	2	12	2472385	2472396	50 %	50 %	0 %	0 %	227118678
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47490	NC_012582	CAC	2	6	2473167	2473172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118679
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47497	NC_012582	TCA	2	6	2473527	2473532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118679
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