MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46003	NC_012582	CTG	2	6	2394638	2394643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118607
46004	NC_012582	GAT	3	9	2394665	2394673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118607
46005	NC_012582	CTTT	2	8	2394716	2394723	0 %	75 %	0 %	25 %	227118607
46006	NC_012582	CAT	3	9	2394787	2394795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118607
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46117	NC_012582	GGC	2	6	2399979	2399984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118614
46118	NC_012582	CTGC	2	8	2399998	2400005	0 %	25 %	25 %	50 %	227118614
46119	NC_012582	CAC	2	6	2400014	2400019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118614
46120	NC_012582	GC	3	6	2400154	2400159	0 %	0 %	50 %	50 %	227118614
46121	NC_012582	TAC	2	6	2400209	2400214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118614
46122	NC_012582	CG	3	6	2400228	2400233	0 %	0 %	50 %	50 %	227118614
46123	NC_012582	TCA	2	6	2400249	2400254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118614
46124	NC_012582	ATC	2	6	2400255	2400260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118614
46125	NC_012582	GCAC	2	8	2400372	2400379	25 %	0 %	25 %	50 %	227118614
46126	NC_012582	TCGG	2	8	2400393	2400400	0 %	25 %	50 %	25 %	227118614
46127	NC_012582	GCC	2	6	2400437	2400442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118614
46128	NC_012582	CAT	2	6	2400472	2400477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118614
46129	NC_012582	CTT	2	6	2400592	2400597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118614
46130	NC_012582	CCA	2	6	2400598	2400603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118614
46131	NC_012582	TGC	2	6	2400675	2400680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118614
46132	NC_012582	GC	3	6	2400679	2400684	0 %	0 %	50 %	50 %	227118614
46133	NC_012582	TTG	2	6	2400719	2400724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118614
46134	NC_012582	CAT	2	6	2400778	2400783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118614
46135	NC_012582	CTT	2	6	2400823	2400828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118614
46136	NC_012582	CGC	3	9	2400845	2400853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118614
46137	NC_012582	TGC	2	6	2400867	2400872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118614
46138	NC_012582	CAT	2	6	2400944	2400949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118614
46139	NC_012582	CATAC	2	10	2400968	2400977	40 %	20 %	0 %	40 %	227118614
46140	NC_012582	ACG	2	6	2400996	2401001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46141	NC_012582	CGT	2	6	2401077	2401082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118615
46142	NC_012582	AAT	2	6	2401097	2401102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118615
46143	NC_012582	TTTA	2	8	2401167	2401174	25 %	75 %	0 %	0 %	227118616
46144	NC_012582	GC	3	6	2401210	2401215	0 %	0 %	50 %	50 %	227118616
46145	NC_012582	CGC	2	6	2401332	2401337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118617
46146	NC_012582	CTT	2	6	2401360	2401365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118617
46147	NC_012582	TAT	2	6	2401382	2401387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118617
46148	NC_012582	ATT	2	6	2401470	2401475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118617
46149	NC_012582	GTG	2	6	2401483	2401488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118617
46150	NC_012582	CAT	2	6	2401493	2401498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118617
46151	NC_012582	CTG	2	6	2401506	2401511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118617
46152	NC_012582	CCT	2	6	2401512	2401517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118617
46153	NC_012582	GCC	2	6	2401566	2401571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118617
46154	NC_012582	TCG	2	6	2401615	2401620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118617
46155	NC_012582	T	6	6	2401695	2401700	0 %	100 %	0 %	0 %	227118617
46156	NC_012582	TCCTA	2	10	2401709	2401718	20 %	40 %	0 %	40 %	227118617
46157	NC_012582	GTC	2	6	2401761	2401766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118617
46158	NC_012582	GCG	2	6	2401773	2401778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118617
46159	NC_012582	GCTTG	2	10	2401791	2401800	0 %	40 %	40 %	20 %	227118617
46160	NC_012582	CAA	2	6	2401919	2401924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118617
46161	NC_012582	A	7	7	2401934	2401940	100 %	0 %	0 %	0 %	227118617
46162	NC_012582	AGTGA	2	10	2402025	2402034	40 %	20 %	40 %	0 %	227118617
46163	NC_012582	GGC	2	6	2402084	2402089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118617
46164	NC_012582	TGG	2	6	2402113	2402118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118617
46165	NC_012582	CTG	2	6	2402133	2402138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118617
46166	NC_012582	TTCCGG	2	12	2402146	2402157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118617
46167	NC_012582	CAT	2	6	2402168	2402173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118617
46168	NC_012582	TGG	2	6	2402291	2402296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118617
46169	NC_012582	TCG	2	6	2402350	2402355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118617
46170	NC_012582	GAA	3	9	2402424	2402432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118617
46171	NC_012582	CAC	2	6	2402460	2402465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46172	NC_012582	TCT	2	6	2402522	2402527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118618
46173	NC_012582	GC	3	6	2402560	2402565	0 %	0 %	50 %	50 %	227118618
46174	NC_012582	TCG	2	6	2402622	2402627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118618
46175	NC_012582	TGA	2	6	2402645	2402650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118618
46176	NC_012582	T	6	6	2402668	2402673	0 %	100 %	0 %	0 %	227118618
46177	NC_012582	C	7	7	2402692	2402698	0 %	0 %	0 %	100 %	227118618
46178	NC_012582	T	6	6	2402749	2402754	0 %	100 %	0 %	0 %	227118618
46179	NC_012582	AAT	2	6	2402806	2402811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118618
46180	NC_012582	T	7	7	2402825	2402831	0 %	100 %	0 %	0 %	227118618
46181	NC_012582	GATG	2	8	2402943	2402950	25 %	25 %	50 %	0 %	227118618
46182	NC_012582	ATTTT	2	10	2402960	2402969	20 %	80 %	0 %	0 %	227118618
46183	NC_012582	GATT	2	8	2402979	2402986	25 %	50 %	25 %	0 %	227118618
46184	NC_012582	CTG	2	6	2403024	2403029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118619
46185	NC_012582	CAAAA	2	10	2403060	2403069	80 %	0 %	0 %	20 %	227118619
46186	NC_012582	A	6	6	2403066	2403071	100 %	0 %	0 %	0 %	227118619
46187	NC_012582	TTA	2	6	2403128	2403133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118620
46188	NC_012582	GGT	2	6	2403247	2403252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118620
46189	NC_012582	CAC	2	6	2403274	2403279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118620
46190	NC_012582	GTT	2	6	2403331	2403336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118620
46191	NC_012582	CGA	2	6	2403433	2403438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118620
46192	NC_012582	CCA	2	6	2403561	2403566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118620
46193	NC_012582	CAC	2	6	2403650	2403655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118620
46194	NC_012582	TCT	2	6	2403759	2403764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118620
46195	NC_012582	AC	3	6	2403784	2403789	50 %	0 %	0 %	50 %	227118620
46196	NC_012582	TCT	2	6	2403817	2403822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118620
46197	NC_012582	CGAC	2	8	2403891	2403898	25 %	0 %	25 %	50 %	227118620
46198	NC_012582	AC	3	6	2404007	2404012	50 %	0 %	0 %	50 %	227118620
46199	NC_012582	CCG	2	6	2404029	2404034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118620
46200	NC_012582	GC	3	6	2404067	2404072	0 %	0 %	50 %	50 %	227118620
46201	NC_012582	GAT	2	6	2404142	2404147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118620
46202	NC_012582	T	6	6	2404163	2404168	0 %	100 %	0 %	0 %	227118620
46203	NC_012582	TCAGC	2	10	2404171	2404180	20 %	20 %	20 %	40 %	227118620
46204	NC_012582	CTT	3	9	2404195	2404203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118620
46205	NC_012582	ACC	2	6	2404223	2404228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118620
46206	NC_012582	GGT	2	6	2404265	2404270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118620
46207	NC_012582	CGT	2	6	2404450	2404455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118620
46208	NC_012582	C	6	6	2404533	2404538	0 %	0 %	0 %	100 %	227118620
46209	NC_012582	ATCA	2	8	2404589	2404596	50 %	25 %	0 %	25 %	227118620
46210	NC_012582	TGC	2	6	2404607	2404612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118620
46211	NC_012582	TGG	2	6	2404653	2404658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118620
46212	NC_012582	CTG	2	6	2404706	2404711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118620
46213	NC_012582	AAT	2	6	2404745	2404750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118620
46214	NC_012582	TGA	2	6	2404809	2404814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46215	NC_012582	GTAGA	2	10	2404962	2404971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46216	NC_012582	ATGGG	2	10	2405056	2405065	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46217	NC_012582	GC	3	6	2405083	2405088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46218	NC_012582	CGT	2	6	2405110	2405115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46219	NC_012582	A	6	6	2405154	2405159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46220	NC_012582	ATC	2	6	2405240	2405245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118621
46221	NC_012582	ACG	2	6	2405402	2405407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118621
46222	NC_012582	AGTG	2	8	2405445	2405452	25 %	25 %	50 %	0 %	227118621
46223	NC_012582	GCTT	2	8	2405487	2405494	0 %	50 %	25 %	25 %	227118621
46224	NC_012582	CGA	3	9	2405518	2405526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118621
46225	NC_012582	T	6	6	2405639	2405644	0 %	100 %	0 %	0 %	227118621
46226	NC_012582	CCA	2	6	2405728	2405733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118621
46227	NC_012582	TGCGCT	2	12	2405748	2405759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118621
46228	NC_012582	TG	3	6	2405762	2405767	0 %	50 %	50 %	0 %	227118621
46229	NC_012582	TGA	2	6	2405776	2405781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118621
46230	NC_012582	CTT	2	6	2405827	2405832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118621
46231	NC_012582	TC	3	6	2406061	2406066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46232	NC_012582	TTG	2	6	2406067	2406072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46233	NC_012582	GCC	2	6	2406136	2406141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118622
46234	NC_012582	TAAA	2	8	2406214	2406221	75 %	25 %	0 %	0 %	227118622
46235	NC_012582	AGTG	2	8	2406261	2406268	25 %	25 %	50 %	0 %	227118622
46236	NC_012582	CCAA	2	8	2406335	2406342	50 %	0 %	0 %	50 %	227118622
46237	NC_012582	AAT	2	6	2406348	2406353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118622
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46328	NC_012582	TTGA	2	8	2410589	2410596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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46344	NC_012582	GCG	2	6	2411592	2411597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118628
46345	NC_012582	TGG	2	6	2411602	2411607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118628
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46349	NC_012582	TGA	2	6	2411859	2411864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118628
46350	NC_012582	CTT	2	6	2411894	2411899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118628
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46352	NC_012582	A	6	6	2411925	2411930	100 %	0 %	0 %	0 %	227118628
46353	NC_012582	GCT	2	6	2411974	2411979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118628
46354	NC_012582	CGGGA	2	10	2412004	2412013	20 %	0 %	60 %	20 %	227118628
46355	NC_012582	A	6	6	2412171	2412176	100 %	0 %	0 %	0 %	227118628
46356	NC_012582	CCAA	2	8	2412386	2412393	50 %	0 %	0 %	50 %	227118629
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46376	NC_012582	TCG	2	6	2413102	2413107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118629
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46380	NC_012582	TG	3	6	2413244	2413249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46381	NC_012582	CGG	2	6	2413262	2413267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46382	NC_012582	TG	3	6	2413269	2413274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46383	NC_012582	T	6	6	2413454	2413459	0 %	100 %	0 %	0 %	227118630
46384	NC_012582	TTG	2	6	2413475	2413480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118630
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46415	NC_012582	TGT	2	6	2415110	2415115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46417	NC_012582	GGTT	2	8	2415171	2415178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46418	NC_012582	A	7	7	2415194	2415200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46419	NC_012582	AAAAT	2	10	2415274	2415283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46472	NC_012582	TCT	2	6	2417605	2417610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46477	NC_012582	T	6	6	2417709	2417714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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