MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_012582	AAG	2	6	2262672	2262677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118471
43502	NC_012582	AG	4	8	2262676	2262683	50 %	0 %	50 %	0 %	227118471
43503	NC_012582	TTG	2	6	2262684	2262689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118471
43504	NC_012582	CGG	2	6	2262755	2262760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118471
43505	NC_012582	TTG	2	6	2262841	2262846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118472
43506	NC_012582	GTA	2	6	2262864	2262869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118472
43507	NC_012582	GCA	2	6	2262934	2262939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118472
43508	NC_012582	ACG	2	6	2262957	2262962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118472
43509	NC_012582	TGT	2	6	2262994	2262999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118472
43510	NC_012582	CTT	2	6	2263045	2263050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118473
43511	NC_012582	CTT	2	6	2263095	2263100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118473
43512	NC_012582	AACT	2	8	2263198	2263205	50 %	25 %	0 %	25 %	227118473
43513	NC_012582	TCT	2	6	2263265	2263270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118473
43514	NC_012582	TAAG	2	8	2263285	2263292	50 %	25 %	25 %	0 %	227118473
43515	NC_012582	AAC	2	6	2263387	2263392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118473
43516	NC_012582	TCA	2	6	2263403	2263408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118473
43517	NC_012582	GACT	2	8	2263453	2263460	25 %	25 %	25 %	25 %	227118473
43518	NC_012582	GAT	2	6	2263489	2263494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118473
43519	NC_012582	A	6	6	2263615	2263620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43520	NC_012582	T	8	8	2263626	2263633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43521	NC_012582	AG	3	6	2263644	2263649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43522	NC_012582	TGC	2	6	2263679	2263684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43523	NC_012582	GAT	2	6	2263697	2263702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43524	NC_012582	GTAAA	2	10	2263704	2263713	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43525	NC_012582	CAA	2	6	2263759	2263764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43526	NC_012582	CGA	2	6	2263812	2263817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43527	NC_012582	GCT	2	6	2263883	2263888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118474
43528	NC_012582	ATC	2	6	2263948	2263953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118474
43529	NC_012582	ACT	2	6	2263966	2263971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118474
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43532	NC_012582	CACTG	2	10	2264147	2264156	20 %	20 %	20 %	40 %	227118474
43533	NC_012582	CGA	2	6	2264214	2264219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118474
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43538	NC_012582	GTA	3	9	2264807	2264815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118475
43539	NC_012582	T	6	6	2264870	2264875	0 %	100 %	0 %	0 %	227118475
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43542	NC_012582	CCA	2	6	2264991	2264996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118475
43543	NC_012582	CAC	2	6	2265146	2265151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118475
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43545	NC_012582	T	6	6	2265249	2265254	0 %	100 %	0 %	0 %	227118475
43546	NC_012582	A	6	6	2265267	2265272	100 %	0 %	0 %	0 %	227118475
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43550	NC_012582	ATC	2	6	2265504	2265509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43551	NC_012582	TTTA	2	8	2265515	2265522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43552	NC_012582	TTG	2	6	2265536	2265541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43553	NC_012582	T	6	6	2265543	2265548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43554	NC_012582	AAT	2	6	2265562	2265567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43555	NC_012582	AGT	2	6	2265685	2265690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43556	NC_012582	GCA	2	6	2265707	2265712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43557	NC_012582	AC	3	6	2265724	2265729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43558	NC_012582	TTG	2	6	2265743	2265748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43559	NC_012582	TCG	2	6	2265755	2265760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43560	NC_012582	CAA	2	6	2265909	2265914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43561	NC_012582	TA	3	6	2265931	2265936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43562	NC_012582	TTAA	2	8	2265967	2265974	50 %	50 %	0 %	0 %	227118477
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43568	NC_012582	TCG	2	6	2266374	2266379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118477
43569	NC_012582	ACTGA	2	10	2266399	2266408	40 %	20 %	20 %	20 %	227118477
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43574	NC_012582	GCCT	2	8	2266802	2266809	0 %	25 %	25 %	50 %	227118477
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43602	NC_012582	CGT	2	6	2268100	2268105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118477
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43604	NC_012582	AGA	2	6	2268156	2268161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118477
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43618	NC_012582	CTG	2	6	2268761	2268766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118477
43619	NC_012582	AGCC	2	8	2268806	2268813	25 %	0 %	25 %	50 %	227118477
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43623	NC_012582	TCAC	2	8	2268916	2268923	25 %	25 %	0 %	50 %	227118477
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43626	NC_012582	CTTT	2	8	2269151	2269158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43627	NC_012582	CAT	2	6	2269192	2269197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43632	NC_012582	CTT	2	6	2269480	2269485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118478
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43764	NC_012582	A	7	7	2275102	2275108	100 %	0 %	0 %	0 %	227118481
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43770	NC_012582	CAAA	2	8	2275268	2275275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43771	NC_012582	TTC	2	6	2275310	2275315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43774	NC_012582	ACGC	2	8	2275396	2275403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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43855	NC_012582	CAA	2	6	2280063	2280068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118485
43856	NC_012582	ATCG	2	8	2280069	2280076	25 %	25 %	25 %	25 %	227118485
43857	NC_012582	GCT	2	6	2280090	2280095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118485
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43859	NC_012582	GCG	2	6	2280311	2280316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118485
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43862	NC_012582	CT	3	6	2280491	2280496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43863	NC_012582	ACCT	2	8	2280517	2280524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43864	NC_012582	TCG	2	6	2280538	2280543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43873	NC_012582	TTGA	2	8	2281177	2281184	25 %	50 %	25 %	0 %	227118486
43874	NC_012582	TCA	2	6	2281253	2281258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118486
43875	NC_012582	T	6	6	2281283	2281288	0 %	100 %	0 %	0 %	227118486
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43882	NC_012582	TGC	2	6	2281695	2281700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118487
43883	NC_012582	TAAA	2	8	2281706	2281713	75 %	25 %	0 %	0 %	227118487
43884	NC_012582	TGG	2	6	2281742	2281747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118487
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43886	NC_012582	TGC	3	9	2281785	2281793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118487
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43969	NC_012582	CATAC	2	10	2286509	2286518	40 %	20 %	0 %	40 %	227118490
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43971	NC_012582	T	6	6	2286653	2286658	0 %	100 %	0 %	0 %	227118490
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43974	NC_012582	CTT	2	6	2286748	2286753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118490
43975	NC_012582	ACGA	2	8	2286764	2286771	50 %	0 %	25 %	25 %	227118490
43976	NC_012582	GAG	2	6	2286786	2286791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118490
43977	NC_012582	TCA	2	6	2286864	2286869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118490
43978	NC_012582	T	6	6	2286956	2286961	0 %	100 %	0 %	0 %	227118490
43979	NC_012582	TCGC	2	8	2286988	2286995	0 %	25 %	25 %	50 %	227118490
43980	NC_012582	AATA	2	8	2287016	2287023	75 %	25 %	0 %	0 %	227118490
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43982	NC_012582	CTT	2	6	2287147	2287152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118491
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43986	NC_012582	TAA	2	6	2287582	2287587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43987	NC_012582	AGTC	2	8	2287615	2287622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43988	NC_012582	ACG	2	6	2287626	2287631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43989	NC_012582	ATA	2	6	2287638	2287643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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