MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_012582	TTGTG	2	10	2159835	2159844	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41502	NC_012582	CCA	2	6	2160064	2160069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118372
41503	NC_012582	T	8	8	2160132	2160139	0 %	100 %	0 %	0 %	227118372
41504	NC_012582	ATG	2	6	2160226	2160231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118372
41505	NC_012582	TTG	2	6	2160244	2160249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118372
41506	NC_012582	CCAT	2	8	2160266	2160273	25 %	25 %	0 %	50 %	227118372
41507	NC_012582	TCG	2	6	2160274	2160279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118372
41508	NC_012582	TGT	2	6	2160291	2160296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118373
41509	NC_012582	TGAGCA	2	12	2160318	2160329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227118373
41510	NC_012582	GCT	2	6	2160361	2160366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118373
41511	NC_012582	TAAAGA	2	12	2160454	2160465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227118373
41512	NC_012582	TGG	2	6	2160468	2160473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118373
41513	NC_012582	A	6	6	2160681	2160686	100 %	0 %	0 %	0 %	227118373
41514	NC_012582	CTA	2	6	2160727	2160732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118373
41515	NC_012582	GCG	2	6	2160755	2160760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118373
41516	NC_012582	AGC	2	6	2160827	2160832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118373
41517	NC_012582	TGA	2	6	2160847	2160852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118373
41518	NC_012582	TCA	2	6	2160853	2160858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118373
41519	NC_012582	GTG	2	6	2160860	2160865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118373
41520	NC_012582	ATTT	2	8	2160909	2160916	25 %	75 %	0 %	0 %	227118373
41521	NC_012582	TTCC	2	8	2160969	2160976	0 %	50 %	0 %	50 %	227118373
41522	NC_012582	ATT	2	6	2161148	2161153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118373
41523	NC_012582	TGT	2	6	2161161	2161166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118373
41524	NC_012582	GCA	2	6	2161237	2161242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118373
41525	NC_012582	GCG	2	6	2161364	2161369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118373
41526	NC_012582	GGC	2	6	2161429	2161434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118373
41527	NC_012582	GCC	2	6	2161458	2161463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118373
41528	NC_012582	CCA	2	6	2161473	2161478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118373
41529	NC_012582	GAA	2	6	2161496	2161501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118373
41530	NC_012582	TC	3	6	2161504	2161509	0 %	50 %	0 %	50 %	227118373
41531	NC_012582	AGC	2	6	2161551	2161556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118373
41532	NC_012582	AGC	2	6	2161590	2161595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118373
41533	NC_012582	TGA	2	6	2161638	2161643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118373
41534	NC_012582	TGA	2	6	2161843	2161848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118373
41535	NC_012582	CAC	2	6	2161903	2161908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118373
41536	NC_012582	CAA	2	6	2161946	2161951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118373
41537	NC_012582	CAC	2	6	2161992	2161997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118373
41538	NC_012582	GC	3	6	2162006	2162011	0 %	0 %	50 %	50 %	227118373
41539	NC_012582	TG	3	6	2162060	2162065	0 %	50 %	50 %	0 %	227118374
41540	NC_012582	TGAT	2	8	2162075	2162082	25 %	50 %	25 %	0 %	227118374
41541	NC_012582	GCTC	2	8	2162106	2162113	0 %	25 %	25 %	50 %	227118374
41542	NC_012582	T	6	6	2162146	2162151	0 %	100 %	0 %	0 %	227118374
41543	NC_012582	CTG	2	6	2162170	2162175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118374
41544	NC_012582	ATG	2	6	2162339	2162344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118374
41545	NC_012582	TTGA	2	8	2162386	2162393	25 %	50 %	25 %	0 %	227118374
41546	NC_012582	ATT	2	6	2162488	2162493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118374
41547	NC_012582	CCG	2	6	2162501	2162506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118374
41548	NC_012582	GTTG	2	8	2162595	2162602	0 %	50 %	50 %	0 %	227118374
41549	NC_012582	TTG	2	6	2162645	2162650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118374
41550	NC_012582	GGTGC	2	10	2162662	2162671	0 %	20 %	60 %	20 %	227118374
41551	NC_012582	TTGA	2	8	2162680	2162687	25 %	50 %	25 %	0 %	227118374
41552	NC_012582	GAGC	2	8	2162688	2162695	25 %	0 %	50 %	25 %	227118374
41553	NC_012582	CGATGC	2	12	2162798	2162809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227118374
41554	NC_012582	CTG	2	6	2162824	2162829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118374
41555	NC_012582	TGC	2	6	2162834	2162839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118374
41556	NC_012582	GCC	2	6	2162902	2162907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118374
41557	NC_012582	CTA	2	6	2162961	2162966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118374
41558	NC_012582	AG	3	6	2163013	2163018	50 %	0 %	50 %	0 %	227118374
41559	NC_012582	CCA	2	6	2163036	2163041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118374
41560	NC_012582	GCTT	2	8	2163110	2163117	0 %	50 %	25 %	25 %	227118374
41561	NC_012582	TGAA	2	8	2163236	2163243	50 %	25 %	25 %	0 %	227118374
41562	NC_012582	GTG	2	6	2163293	2163298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118374
41563	NC_012582	GCA	2	6	2163299	2163304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118374
41564	NC_012582	CCA	2	6	2163311	2163316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118374
41565	NC_012582	AG	3	6	2163381	2163386	50 %	0 %	50 %	0 %	227118374
41566	NC_012582	A	7	7	2163452	2163458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41567	NC_012582	TGA	2	6	2163532	2163537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118375
41568	NC_012582	AAT	2	6	2163596	2163601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118375
41569	NC_012582	GAGGAA	2	12	2163602	2163613	50 %	0 %	50 %	0 %	227118375
41570	NC_012582	CCCA	2	8	2163621	2163628	25 %	0 %	0 %	75 %	227118375
41571	NC_012582	TCA	2	6	2163652	2163657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41572	NC_012582	GCG	2	6	2163706	2163711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118375
41573	NC_012582	CAT	2	6	2163740	2163745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41574	NC_012582	GCAATC	2	12	2163777	2163788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227118375
41575	NC_012582	CGA	2	6	2163805	2163810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118375
41576	NC_012582	AGA	2	6	2163816	2163821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118375
41577	NC_012582	ACC	2	6	2163842	2163847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118375
41578	NC_012582	CAA	2	6	2163851	2163856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118375
41579	NC_012582	AAG	2	6	2163876	2163881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118375
41580	NC_012582	CAG	2	6	2163898	2163903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118375
41581	NC_012582	ATC	2	6	2163921	2163926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41582	NC_012582	ATG	2	6	2163978	2163983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118375
41583	NC_012582	ATG	2	6	2163993	2163998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118375
41584	NC_012582	CAT	2	6	2164012	2164017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41585	NC_012582	ACT	2	6	2164056	2164061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41586	NC_012582	A	6	6	2164133	2164138	100 %	0 %	0 %	0 %	227118375
41587	NC_012582	CCG	2	6	2164147	2164152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118375
41588	NC_012582	CTG	2	6	2164156	2164161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118375
41589	NC_012582	AAT	2	6	2164205	2164210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118375
41590	NC_012582	CAC	2	6	2164211	2164216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118375
41591	NC_012582	CAA	2	6	2164217	2164222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118375
41592	NC_012582	GCT	2	6	2164245	2164250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118375
41593	NC_012582	CTT	2	6	2164258	2164263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118375
41594	NC_012582	CAA	2	6	2164270	2164275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118375
41595	NC_012582	GCT	2	6	2164279	2164284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118375
41596	NC_012582	T	6	6	2164293	2164298	0 %	100 %	0 %	0 %	227118375
41597	NC_012582	CG	3	6	2164302	2164307	0 %	0 %	50 %	50 %	227118375
41598	NC_012582	GAT	2	6	2164322	2164327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118375
41599	NC_012582	ACA	2	6	2164356	2164361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118375
41600	NC_012582	CGC	2	6	2164397	2164402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118375
41601	NC_012582	ACC	2	6	2164410	2164415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118375
41602	NC_012582	G	6	6	2164428	2164433	0 %	0 %	100 %	0 %	227118375
41603	NC_012582	CGC	2	6	2164472	2164477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118375
41604	NC_012582	ACC	2	6	2164536	2164541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118375
41605	NC_012582	CAT	2	6	2164574	2164579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41606	NC_012582	CCG	2	6	2164608	2164613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118375
41607	NC_012582	GAT	2	6	2164646	2164651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118375
41608	NC_012582	A	6	6	2164697	2164702	100 %	0 %	0 %	0 %	227118375
41609	NC_012582	CAA	2	6	2164837	2164842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118375
41610	NC_012582	TCA	2	6	2164843	2164848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118375
41611	NC_012582	AATA	2	8	2164862	2164869	75 %	25 %	0 %	0 %	227118375
41612	NC_012582	CCTTG	2	10	2164897	2164906	0 %	40 %	20 %	40 %	227118376
41613	NC_012582	CAT	2	6	2164916	2164921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118376
41614	NC_012582	TCT	2	6	2164965	2164970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118376
41615	NC_012582	CAG	2	6	2165048	2165053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118376
41616	NC_012582	GCA	2	6	2165143	2165148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118376
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41967	NC_012582	CAT	2	6	2184372	2184377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118397
41968	NC_012582	TGC	2	6	2184461	2184466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118397
41969	NC_012582	CTCA	2	8	2184499	2184506	25 %	25 %	0 %	50 %	227118397
41970	NC_012582	AAT	2	6	2184628	2184633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118397
41971	NC_012582	ACC	2	6	2184637	2184642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118397
41972	NC_012582	TCAA	2	8	2184706	2184713	50 %	25 %	0 %	25 %	227118397
41973	NC_012582	TTG	2	6	2184740	2184745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118397
41974	NC_012582	AGC	2	6	2184783	2184788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41975	NC_012582	AGA	2	6	2184933	2184938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118398
41976	NC_012582	CGC	2	6	2184942	2184947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118398
41977	NC_012582	CAC	2	6	2184998	2185003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118398
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41980	NC_012582	TCA	2	6	2185315	2185320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118398
41981	NC_012582	GGATC	2	10	2185424	2185433	20 %	20 %	40 %	20 %	227118398
41982	NC_012582	CG	3	6	2185434	2185439	0 %	0 %	50 %	50 %	227118398
41983	NC_012582	TGC	2	6	2185542	2185547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118398
41984	NC_012582	CCA	2	6	2185697	2185702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118398
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41986	NC_012582	TGG	2	6	2185888	2185893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118398
41987	NC_012582	CAC	2	6	2185904	2185909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118398
41988	NC_012582	ATC	2	6	2185921	2185926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118398
41989	NC_012582	CCCG	2	8	2185971	2185978	0 %	0 %	25 %	75 %	227118398
41990	NC_012582	CG	3	6	2186002	2186007	0 %	0 %	50 %	50 %	227118398
41991	NC_012582	CCG	2	6	2186051	2186056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118398
41992	NC_012582	CCA	3	9	2186062	2186070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118398
41993	NC_012582	GGCA	2	8	2186085	2186092	25 %	0 %	50 %	25 %	227118398
41994	NC_012582	AAACCA	2	12	2186143	2186154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118398
41995	NC_012582	ACC	2	6	2186197	2186202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118398
41996	NC_012582	GCT	2	6	2186213	2186218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118398
41997	NC_012582	TTG	2	6	2186226	2186231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118398
41998	NC_012582	CAGC	2	8	2186285	2186292	25 %	0 %	25 %	50 %	227118398
41999	NC_012582	TCT	2	6	2186359	2186364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118398
42000	NC_012582	AAG	2	6	2186416	2186421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118398

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