MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_012582	GGT	2	6	2134274	2134279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118349
41002	NC_012582	GCGATT	2	12	2134295	2134306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227118349
41003	NC_012582	TGG	2	6	2134380	2134385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118349
41004	NC_012582	CTG	3	9	2134409	2134417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118349
41005	NC_012582	TC	3	6	2134495	2134500	0 %	50 %	0 %	50 %	227118349
41006	NC_012582	TCA	3	9	2134533	2134541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118349
41007	NC_012582	ATG	2	6	2134620	2134625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118349
41008	NC_012582	TGA	2	6	2134648	2134653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118349
41009	NC_012582	CTG	2	6	2134685	2134690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118349
41010	NC_012582	GTG	2	6	2134719	2134724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118349
41011	NC_012582	CAC	2	6	2134726	2134731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118349
41012	NC_012582	GTTG	2	8	2134855	2134862	0 %	50 %	50 %	0 %	227118349
41013	NC_012582	AGA	2	6	2134936	2134941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118349
41014	NC_012582	GCC	2	6	2135033	2135038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118349
41015	NC_012582	ATT	2	6	2135063	2135068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118349
41016	NC_012582	GAA	2	6	2135096	2135101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118349
41017	NC_012582	GAA	2	6	2135123	2135128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118349
41018	NC_012582	TCT	2	6	2135160	2135165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118349
41019	NC_012582	TTG	2	6	2135169	2135174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118349
41020	NC_012582	TTA	2	6	2135178	2135183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118349
41021	NC_012582	TGAT	2	8	2135208	2135215	25 %	50 %	25 %	0 %	227118349
41022	NC_012582	ATTTG	2	10	2135371	2135380	20 %	60 %	20 %	0 %	227118349
41023	NC_012582	CTT	2	6	2135446	2135451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118349
41024	NC_012582	TC	3	6	2135488	2135493	0 %	50 %	0 %	50 %	227118349
41025	NC_012582	TCA	2	6	2135508	2135513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118349
41026	NC_012582	TGGT	2	8	2135544	2135551	0 %	50 %	50 %	0 %	227118349
41027	NC_012582	CAT	2	6	2135560	2135565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118349
41028	NC_012582	CAT	2	6	2135618	2135623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118349
41029	NC_012582	ACT	2	6	2135644	2135649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118349
41030	NC_012582	TGAAAC	2	12	2135674	2135685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41031	NC_012582	CTTTT	2	10	2135719	2135728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41032	NC_012582	ATCT	2	8	2135737	2135744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41033	NC_012582	TAT	2	6	2135752	2135757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118350
41034	NC_012582	TGC	2	6	2135800	2135805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118350
41035	NC_012582	TG	3	6	2135830	2135835	0 %	50 %	50 %	0 %	227118350
41036	NC_012582	CGC	2	6	2135918	2135923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118350
41037	NC_012582	CAC	2	6	2135941	2135946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118350
41038	NC_012582	TGC	2	6	2135975	2135980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118350
41039	NC_012582	CAG	2	6	2135990	2135995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118350
41040	NC_012582	GGT	2	6	2136149	2136154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118350
41041	NC_012582	CT	3	6	2136171	2136176	0 %	50 %	0 %	50 %	227118350
41042	NC_012582	GTC	2	6	2136234	2136239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118350
41043	NC_012582	ATCGC	2	10	2136271	2136280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41044	NC_012582	A	6	6	2136295	2136300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41045	NC_012582	T	6	6	2136316	2136321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41046	NC_012582	TGT	2	6	2136327	2136332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41047	NC_012582	CTG	2	6	2136335	2136340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41048	NC_012582	GCT	2	6	2136422	2136427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41049	NC_012582	TGC	2	6	2136438	2136443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41050	NC_012582	TTC	2	6	2136543	2136548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118351
41051	NC_012582	CAT	3	9	2136665	2136673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118351
41052	NC_012582	CGC	2	6	2136900	2136905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118351
41053	NC_012582	T	6	6	2136945	2136950	0 %	100 %	0 %	0 %	227118351
41054	NC_012582	CAT	2	6	2136960	2136965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118351
41055	NC_012582	CGACCA	2	12	2136983	2136994	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227118351
41056	NC_012582	GGC	2	6	2137021	2137026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118351
41057	NC_012582	CAG	2	6	2137085	2137090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41058	NC_012582	ACG	2	6	2137155	2137160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41059	NC_012582	AC	3	6	2137174	2137179	50 %	0 %	0 %	50 %	227118351
41060	NC_012582	CAGCG	2	10	2137180	2137189	20 %	0 %	40 %	40 %	227118351
41061	NC_012582	CAC	2	6	2137215	2137220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118351
41062	NC_012582	ATG	2	6	2137282	2137287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118351
41063	NC_012582	TCT	2	6	2137297	2137302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118351
41064	NC_012582	ACA	2	6	2137316	2137321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118351
41065	NC_012582	ATC	2	6	2137330	2137335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118351
41066	NC_012582	CCA	2	6	2137376	2137381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118351
41067	NC_012582	ACG	2	6	2137444	2137449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41068	NC_012582	GTC	2	6	2137450	2137455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41069	NC_012582	CG	3	6	2137747	2137752	0 %	0 %	50 %	50 %	227118351
41070	NC_012582	TCT	2	6	2137756	2137761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118351
41071	NC_012582	CGAT	2	8	2137771	2137778	25 %	25 %	25 %	25 %	227118351
41072	NC_012582	GAT	2	6	2137799	2137804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118351
41073	NC_012582	CAG	2	6	2137806	2137811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41074	NC_012582	TGC	2	6	2137879	2137884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118351
41075	NC_012582	GCC	2	6	2137927	2137932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118351
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41077	NC_012582	TCA	2	6	2138023	2138028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118351
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41079	NC_012582	TCT	2	6	2138071	2138076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118351
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41082	NC_012582	TTC	2	6	2138124	2138129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118351
41083	NC_012582	CAT	2	6	2138207	2138212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118351
41084	NC_012582	TTC	2	6	2138256	2138261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118351
41085	NC_012582	GC	3	6	2138286	2138291	0 %	0 %	50 %	50 %	227118351
41086	NC_012582	GGC	2	6	2138365	2138370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118351
41087	NC_012582	AATG	2	8	2138411	2138418	50 %	25 %	25 %	0 %	227118351
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41100	NC_012582	CTTT	2	8	2139127	2139134	0 %	75 %	0 %	25 %	227118351
41101	NC_012582	GAA	2	6	2139160	2139165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118351
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41103	NC_012582	CGC	2	6	2139306	2139311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41104	NC_012582	GTTT	2	8	2139315	2139322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41105	NC_012582	TTGG	2	8	2139423	2139430	0 %	50 %	50 %	0 %	227118352
41106	NC_012582	CTT	2	6	2139440	2139445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118352
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41109	NC_012582	GC	3	6	2139638	2139643	0 %	0 %	50 %	50 %	227118352
41110	NC_012582	CAA	2	6	2139662	2139667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118352
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41115	NC_012582	AT	3	6	2139839	2139844	50 %	50 %	0 %	0 %	227118352
41116	NC_012582	CTT	2	6	2139876	2139881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118352
41117	NC_012582	CCA	2	6	2139890	2139895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118352
41118	NC_012582	T	6	6	2139896	2139901	0 %	100 %	0 %	0 %	227118352
41119	NC_012582	TTA	2	6	2139910	2139915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41120	NC_012582	A	7	7	2139925	2139931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41121	NC_012582	TAC	2	6	2139934	2139939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41122	NC_012582	CTT	2	6	2139942	2139947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41123	NC_012582	AAC	2	6	2140004	2140009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41222	NC_012582	CTAAA	2	10	2145400	2145409	60 %	20 %	0 %	20 %	227118359
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41230	NC_012582	CAA	2	6	2146071	2146076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118359
41231	NC_012582	A	8	8	2146122	2146129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41232	NC_012582	TTGA	2	8	2146196	2146203	25 %	50 %	25 %	0 %	227118360
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41346	NC_012582	GTC	2	6	2152197	2152202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118366
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41349	NC_012582	GCC	2	6	2152329	2152334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118366
41350	NC_012582	CTG	2	6	2152337	2152342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118366
41351	NC_012582	TTTC	2	8	2152364	2152371	0 %	75 %	0 %	25 %	227118366
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41353	NC_012582	GCT	2	6	2152469	2152474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118366
41354	NC_012582	GTA	2	6	2152506	2152511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118366
41355	NC_012582	CTG	2	6	2152512	2152517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118366
41356	NC_012582	CAT	2	6	2152526	2152531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118366
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41360	NC_012582	GATC	2	8	2152634	2152641	25 %	25 %	25 %	25 %	227118366
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41376	NC_012582	TTCA	2	8	2153422	2153429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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41382	NC_012582	TTG	2	6	2153785	2153790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41383	NC_012582	A	8	8	2153830	2153837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41472	NC_012582	TCT	2	6	2158206	2158211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118370
41473	NC_012582	CAC	2	6	2158276	2158281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118370
41474	NC_012582	ACC	2	6	2158296	2158301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118370
41475	NC_012582	T	7	7	2158338	2158344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41476	NC_012582	AAAT	2	8	2158373	2158380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41477	NC_012582	GAT	2	6	2158387	2158392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41478	NC_012582	GAT	2	6	2158419	2158424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41479	NC_012582	TTA	2	6	2158460	2158465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118371
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