MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_012582	ACC	2	6	2105490	2105495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118325
40503	NC_012582	GAT	2	6	2105550	2105555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118325
40504	NC_012582	TGC	2	6	2105561	2105566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118325
40505	NC_012582	AGC	2	6	2105584	2105589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118325
40506	NC_012582	TGA	2	6	2105600	2105605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118325
40507	NC_012582	A	6	6	2105659	2105664	100 %	0 %	0 %	0 %	227118325
40508	NC_012582	GCCAC	2	10	2105792	2105801	20 %	0 %	20 %	60 %	227118325
40509	NC_012582	ACT	2	6	2105903	2105908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118325
40510	NC_012582	TGC	2	6	2105939	2105944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118325
40511	NC_012582	CAT	2	6	2105949	2105954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118325
40512	NC_012582	AGC	2	6	2105984	2105989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118325
40513	NC_012582	TCA	2	6	2106062	2106067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118325
40514	NC_012582	CAC	2	6	2106097	2106102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118325
40515	NC_012582	CCA	2	6	2106180	2106185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118325
40516	NC_012582	ACC	2	6	2106214	2106219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118325
40517	NC_012582	CAC	2	6	2106235	2106240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118325
40518	NC_012582	AGG	2	6	2106264	2106269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118325
40519	NC_012582	TGA	2	6	2106309	2106314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118325
40520	NC_012582	ATGG	2	8	2106366	2106373	25 %	25 %	50 %	0 %	227118325
40521	NC_012582	CAC	2	6	2106397	2106402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118325
40522	NC_012582	GATGC	2	10	2106417	2106426	20 %	20 %	40 %	20 %	227118326
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40524	NC_012582	GTTTT	2	10	2106559	2106568	0 %	80 %	20 %	0 %	227118326
40525	NC_012582	CGC	2	6	2106585	2106590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118326
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40527	NC_012582	CGCTGA	2	12	2106688	2106699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227118326
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40534	NC_012582	TCTGC	2	10	2107523	2107532	0 %	40 %	20 %	40 %	227118326
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40536	NC_012582	CGA	2	6	2107628	2107633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118326
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40544	NC_012582	CAC	2	6	2107860	2107865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118326
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40547	NC_012582	TAA	2	6	2108042	2108047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118326
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40549	NC_012582	AAG	2	6	2108152	2108157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40550	NC_012582	GCA	2	6	2108198	2108203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118327
40551	NC_012582	GCCA	2	8	2108222	2108229	25 %	0 %	25 %	50 %	227118327
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40553	NC_012582	GTG	2	6	2108448	2108453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118327
40554	NC_012582	ATC	2	6	2108461	2108466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118327
40555	NC_012582	AGCA	2	8	2108496	2108503	50 %	0 %	25 %	25 %	227118327
40556	NC_012582	CA	3	6	2108577	2108582	50 %	0 %	0 %	50 %	227118327
40557	NC_012582	TGG	2	6	2108616	2108621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118327
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40579	NC_012582	CT	3	6	2109880	2109885	0 %	50 %	0 %	50 %	227118327
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40582	NC_012582	A	6	6	2110149	2110154	100 %	0 %	0 %	0 %	227118327
40583	NC_012582	ATA	2	6	2110177	2110182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118327
40584	NC_012582	CCCAAC	2	12	2110331	2110342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118327
40585	NC_012582	GA	3	6	2110395	2110400	50 %	0 %	50 %	0 %	227118327
40586	NC_012582	AG	3	6	2110415	2110420	50 %	0 %	50 %	0 %	227118327
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40588	NC_012582	AG	3	6	2110989	2110994	50 %	0 %	50 %	0 %	227118329
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40590	NC_012582	T	6	6	2111064	2111069	0 %	100 %	0 %	0 %	227118329
40591	NC_012582	TAC	2	6	2111083	2111088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118329
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40594	NC_012582	GAAG	2	8	2111205	2111212	50 %	0 %	50 %	0 %	227118330
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40601	NC_012582	ATC	2	6	2111814	2111819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118330
40602	NC_012582	CTG	3	9	2111882	2111890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118330
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40605	NC_012582	CG	3	6	2112063	2112068	0 %	0 %	50 %	50 %	227118330
40606	NC_012582	GAT	3	9	2112194	2112202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118330
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40609	NC_012582	GA	3	6	2112308	2112313	50 %	0 %	50 %	0 %	227118330
40610	NC_012582	AGC	2	6	2112345	2112350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118331
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40612	NC_012582	CGC	2	6	2112383	2112388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118331
40613	NC_012582	GTGA	2	8	2112401	2112408	25 %	25 %	50 %	0 %	227118331
40614	NC_012582	CCA	2	6	2112409	2112414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118331
40615	NC_012582	CG	3	6	2112536	2112541	0 %	0 %	50 %	50 %	227118331
40616	NC_012582	CCA	2	6	2112567	2112572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118331
40617	NC_012582	CCA	2	6	2112666	2112671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118331
40618	NC_012582	GCTT	2	8	2112768	2112775	0 %	50 %	25 %	25 %	227118331
40619	NC_012582	GCA	2	6	2112856	2112861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118331
40620	NC_012582	AGA	2	6	2112881	2112886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118331
40621	NC_012582	GAT	2	6	2112890	2112895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118331
40622	NC_012582	CTT	2	6	2112961	2112966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118331
40623	NC_012582	TGA	2	6	2112984	2112989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118331
40624	NC_012582	TAACG	2	10	2113009	2113018	40 %	20 %	20 %	20 %	227118331
40625	NC_012582	AGA	2	6	2113035	2113040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118332
40626	NC_012582	CCAC	2	8	2113141	2113148	25 %	0 %	0 %	75 %	227118332
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40630	NC_012582	GCT	2	6	2113245	2113250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118332
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40633	NC_012582	CAT	2	6	2113407	2113412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118332
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40635	NC_012582	CTGA	2	8	2113506	2113513	25 %	25 %	25 %	25 %	227118332
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40638	NC_012582	GCC	2	6	2113538	2113543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118332
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40642	NC_012582	AAGA	2	8	2113770	2113777	75 %	0 %	25 %	0 %	227118332
40643	NC_012582	TGT	2	6	2113846	2113851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118332
40644	NC_012582	CAA	2	6	2113866	2113871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118332
40645	NC_012582	CAC	2	6	2113899	2113904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118332
40646	NC_012582	TGG	2	6	2113929	2113934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118332
40647	NC_012582	GGT	2	6	2113983	2113988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118332
40648	NC_012582	TCA	2	6	2114066	2114071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118332
40649	NC_012582	CCG	2	6	2114114	2114119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118332
40650	NC_012582	ATGA	2	8	2114386	2114393	50 %	25 %	25 %	0 %	227118333
40651	NC_012582	CAC	2	6	2114413	2114418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118333
40652	NC_012582	AAC	2	6	2114534	2114539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118333
40653	NC_012582	CTG	2	6	2114629	2114634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118333
40654	NC_012582	CAA	2	6	2114650	2114655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118333
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40657	NC_012582	CGC	3	9	2114775	2114783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118333
40658	NC_012582	CTG	2	6	2114857	2114862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118333
40659	NC_012582	CT	3	6	2114897	2114902	0 %	50 %	0 %	50 %	227118333
40660	NC_012582	CAG	2	6	2114908	2114913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118333
40661	NC_012582	CTG	2	6	2114917	2114922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118333
40662	NC_012582	TGACTA	2	12	2114959	2114970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227118333
40663	NC_012582	CT	4	8	2114982	2114989	0 %	50 %	0 %	50 %	227118334
40664	NC_012582	A	6	6	2115015	2115020	100 %	0 %	0 %	0 %	227118334
40665	NC_012582	CAT	2	6	2115227	2115232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118334
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40669	NC_012582	CAG	2	6	2115410	2115415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118334
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40671	NC_012582	CTG	2	6	2115600	2115605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118334
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40675	NC_012582	CAGC	2	8	2115803	2115810	25 %	0 %	25 %	50 %	227118334
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40678	NC_012582	GAAT	2	8	2116015	2116022	50 %	25 %	25 %	0 %	227118334
40679	NC_012582	GGC	2	6	2116079	2116084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118334
40680	NC_012582	AGTCG	2	10	2116130	2116139	20 %	20 %	40 %	20 %	227118334
40681	NC_012582	GTT	2	6	2116166	2116171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118334
40682	NC_012582	CAA	2	6	2116224	2116229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118334
40683	NC_012582	CAG	2	6	2116258	2116263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118334
40684	NC_012582	CGC	2	6	2116344	2116349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118334
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40686	NC_012582	AGA	2	6	2116586	2116591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118334
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40688	NC_012582	GC	3	6	2116635	2116640	0 %	0 %	50 %	50 %	227118334
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40692	NC_012582	GT	3	6	2116854	2116859	0 %	50 %	50 %	0 %	227118334
40693	NC_012582	GC	3	6	2116895	2116900	0 %	0 %	50 %	50 %	227118334
40694	NC_012582	GCAA	2	8	2116924	2116931	50 %	0 %	25 %	25 %	227118334
40695	NC_012582	GCT	2	6	2116955	2116960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118334
40696	NC_012582	CAG	2	6	2116965	2116970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118334
40697	NC_012582	CT	3	6	2117118	2117123	0 %	50 %	0 %	50 %	227118334
40698	NC_012582	TTG	2	6	2117158	2117163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118334
40699	NC_012582	GAA	2	6	2117166	2117171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118334
40700	NC_012582	AAAAAG	2	12	2117191	2117202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227118334
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40702	NC_012582	GC	3	6	2117319	2117324	0 %	0 %	50 %	50 %	227118334
40703	NC_012582	GGT	2	6	2117403	2117408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118334
40704	NC_012582	TGA	2	6	2117536	2117541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118334
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40706	NC_012582	GT	3	6	2117574	2117579	0 %	50 %	50 %	0 %	227118334
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40711	NC_012582	CACG	2	8	2117816	2117823	25 %	0 %	25 %	50 %	227118334
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40713	NC_012582	GAT	2	6	2117961	2117966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118334
40714	NC_012582	TGC	2	6	2118010	2118015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118334
40715	NC_012582	ATTG	2	8	2118113	2118120	25 %	50 %	25 %	0 %	227118334
40716	NC_012582	CGC	2	6	2118143	2118148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118334
40717	NC_012582	CTGAA	2	10	2118169	2118178	40 %	20 %	20 %	20 %	227118334
40718	NC_012582	CTG	2	6	2118285	2118290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118334
40719	NC_012582	GATG	2	8	2118314	2118321	25 %	25 %	50 %	0 %	227118334
40720	NC_012582	CCAA	2	8	2118324	2118331	50 %	0 %	0 %	50 %	227118334
40721	NC_012582	GC	3	6	2118366	2118371	0 %	0 %	50 %	50 %	227118334
40722	NC_012582	GAA	2	6	2118395	2118400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118334
40723	NC_012582	TAC	2	6	2118415	2118420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118334
40724	NC_012582	ATTC	2	8	2118535	2118542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40725	NC_012582	A	6	6	2118556	2118561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40726	NC_012582	CTG	3	9	2118625	2118633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118335
40727	NC_012582	GGC	2	6	2118657	2118662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118335
40728	NC_012582	AGTG	2	8	2118717	2118724	25 %	25 %	50 %	0 %	227118335
40729	NC_012582	GCAG	2	8	2118766	2118773	25 %	0 %	50 %	25 %	227118335
40730	NC_012582	GCA	2	6	2119001	2119006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118335
40731	NC_012582	TTTG	2	8	2119101	2119108	0 %	75 %	25 %	0 %	227118335
40732	NC_012582	GAA	2	6	2119189	2119194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118335
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40734	NC_012582	GTG	2	6	2119301	2119306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118335
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40854	NC_012582	GGTC	2	8	2126436	2126443	0 %	25 %	50 %	25 %	227118342
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40856	NC_012582	ATCG	2	8	2126587	2126594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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