MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_012582	ATTC	2	8	2080170	2080177	25 %	50 %	0 %	25 %	227118303
40002	NC_012582	CTT	2	6	2080180	2080185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118303
40003	NC_012582	TTTAGC	2	12	2080234	2080245	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227118303
40004	NC_012582	AAATGG	2	12	2080290	2080301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227118303
40005	NC_012582	A	6	6	2080337	2080342	100 %	0 %	0 %	0 %	227118303
40006	NC_012582	CTT	2	6	2080389	2080394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118303
40007	NC_012582	TAAA	2	8	2080494	2080501	75 %	25 %	0 %	0 %	227118303
40008	NC_012582	CTC	2	6	2080586	2080591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118303
40009	NC_012582	ATC	2	6	2080601	2080606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118303
40010	NC_012582	AT	3	6	2080660	2080665	50 %	50 %	0 %	0 %	227118303
40011	NC_012582	CGG	2	6	2080790	2080795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118303
40012	NC_012582	GTA	2	6	2080796	2080801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118303
40013	NC_012582	GTT	2	6	2080822	2080827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118303
40014	NC_012582	ATA	2	6	2080867	2080872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118303
40015	NC_012582	CAC	2	6	2080883	2080888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40016	NC_012582	ATGGA	2	10	2080908	2080917	40 %	20 %	40 %	0 %	227118304
40017	NC_012582	CAC	2	6	2080925	2080930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118304
40018	NC_012582	TTG	2	6	2080948	2080953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118304
40019	NC_012582	GGC	3	9	2080986	2080994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118304
40020	NC_012582	TCA	2	6	2081082	2081087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118304
40021	NC_012582	ATT	2	6	2081235	2081240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118304
40022	NC_012582	TA	3	6	2081254	2081259	50 %	50 %	0 %	0 %	227118304
40023	NC_012582	ATG	2	6	2081362	2081367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118304
40024	NC_012582	CTG	2	6	2081436	2081441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118304
40025	NC_012582	ATTG	2	8	2081517	2081524	25 %	50 %	25 %	0 %	227118304
40026	NC_012582	CTCA	2	8	2081578	2081585	25 %	25 %	0 %	50 %	227118304
40027	NC_012582	TATT	2	8	2081620	2081627	25 %	75 %	0 %	0 %	227118304
40028	NC_012582	TGG	2	6	2081670	2081675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118304
40029	NC_012582	GAT	2	6	2081680	2081685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118304
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40031	NC_012582	GTG	2	6	2081757	2081762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118305
40032	NC_012582	CAT	2	6	2081765	2081770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118305
40033	NC_012582	ATT	2	6	2081776	2081781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118305
40034	NC_012582	TGA	2	6	2081782	2081787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118305
40035	NC_012582	GAA	2	6	2081831	2081836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118305
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40037	NC_012582	GC	3	6	2081896	2081901	0 %	0 %	50 %	50 %	227118305
40038	NC_012582	CGT	2	6	2081972	2081977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118305
40039	NC_012582	A	6	6	2082005	2082010	100 %	0 %	0 %	0 %	227118305
40040	NC_012582	GCG	2	6	2082125	2082130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118305
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40042	NC_012582	AAAAAT	2	12	2082184	2082195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	227118305
40043	NC_012582	AG	3	6	2082217	2082222	50 %	0 %	50 %	0 %	227118305
40044	NC_012582	TGAA	2	8	2082255	2082262	50 %	25 %	25 %	0 %	227118306
40045	NC_012582	TGA	2	6	2082268	2082273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118306
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40050	NC_012582	CGA	2	6	2082489	2082494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118307
40051	NC_012582	TGT	2	6	2082500	2082505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118307
40052	NC_012582	CTG	2	6	2082625	2082630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118307
40053	NC_012582	TGA	2	6	2082653	2082658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118307
40054	NC_012582	TGC	2	6	2082753	2082758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118307
40055	NC_012582	TTG	2	6	2082800	2082805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118307
40056	NC_012582	CAA	2	6	2082870	2082875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118307
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40060	NC_012582	GTT	2	6	2082994	2082999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118307
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40063	NC_012582	CATCTG	2	12	2083057	2083068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227118307
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40089	NC_012582	TCA	2	6	2084267	2084272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118307
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40099	NC_012582	TTG	2	6	2084694	2084699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40100	NC_012582	AAT	2	6	2084715	2084720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40101	NC_012582	ATG	2	6	2084899	2084904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118308
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40104	NC_012582	GAA	2	6	2085039	2085044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118308
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40109	NC_012582	CAACAC	2	12	2085487	2085498	50 %	0 %	0 %	50 %	227118308
40110	NC_012582	CGAT	2	8	2085544	2085551	25 %	25 %	25 %	25 %	227118308
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40112	NC_012582	CTTA	2	8	2085610	2085617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40113	NC_012582	T	6	6	2085644	2085649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40114	NC_012582	TAGG	2	8	2085667	2085674	25 %	25 %	50 %	0 %	227118309
40115	NC_012582	GTT	2	6	2085684	2085689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118309
40116	NC_012582	ATG	2	6	2085713	2085718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118309
40117	NC_012582	A	6	6	2085752	2085757	100 %	0 %	0 %	0 %	227118309
40118	NC_012582	ATG	2	6	2085815	2085820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118309
40119	NC_012582	GCA	2	6	2085849	2085854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118309
40120	NC_012582	ACG	2	6	2085889	2085894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118309
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40148	NC_012582	AAG	2	6	2087209	2087214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40165	NC_012582	TGT	2	6	2088026	2088031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40172	NC_012582	CTT	2	6	2088348	2088353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118312
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40193	NC_012582	GATCAA	2	12	2089476	2089487	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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40198	NC_012582	CGC	2	6	2089797	2089802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118313
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40221	NC_012582	GC	3	6	2091083	2091088	0 %	0 %	50 %	50 %	227118313
40222	NC_012582	ATC	2	6	2091138	2091143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118313
40223	NC_012582	TGCT	2	8	2091157	2091164	0 %	50 %	25 %	25 %	227118313
40224	NC_012582	T	6	6	2091263	2091268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40225	NC_012582	T	6	6	2091446	2091451	0 %	100 %	0 %	0 %	227118314
40226	NC_012582	AGGT	2	8	2091462	2091469	25 %	25 %	50 %	0 %	227118314
40227	NC_012582	AC	3	6	2091566	2091571	50 %	0 %	0 %	50 %	227118314
40228	NC_012582	CGA	2	6	2091582	2091587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118314
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40230	NC_012582	ACTCA	2	10	2091665	2091674	40 %	20 %	0 %	40 %	227118314
40231	NC_012582	ACG	2	6	2091722	2091727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118314
40232	NC_012582	CAA	2	6	2091738	2091743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118314
40233	NC_012582	ATC	2	6	2091796	2091801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118314
40234	NC_012582	TGG	2	6	2091807	2091812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118314
40235	NC_012582	TGG	2	6	2091821	2091826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118314
40236	NC_012582	ATC	2	6	2092000	2092005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118314
40237	NC_012582	CGT	2	6	2092015	2092020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118314
40238	NC_012582	TGA	2	6	2092046	2092051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118314
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40340	NC_012582	TGC	2	6	2097390	2097395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118317
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40343	NC_012582	GC	3	6	2097605	2097610	0 %	0 %	50 %	50 %	227118317
40344	NC_012582	A	6	6	2097630	2097635	100 %	0 %	0 %	0 %	227118317
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40349	NC_012582	GCT	2	6	2097739	2097744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118317
40350	NC_012582	CA	3	6	2097765	2097770	50 %	0 %	0 %	50 %	227118317
40351	NC_012582	GAA	2	6	2097788	2097793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118317
40352	NC_012582	A	6	6	2097909	2097914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40353	NC_012582	T	7	7	2097934	2097940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40354	NC_012582	CAT	2	6	2097978	2097983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118318
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40464	NC_012582	AGC	2	6	2103539	2103544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118322
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40468	NC_012582	CCGA	2	8	2103901	2103908	25 %	0 %	25 %	50 %	227118322
40469	NC_012582	GAT	3	9	2104057	2104065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118322
40470	NC_012582	A	6	6	2104068	2104073	100 %	0 %	0 %	0 %	227118322
40471	NC_012582	GAT	2	6	2104099	2104104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118322
40472	NC_012582	CAA	2	6	2104114	2104119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118322
40473	NC_012582	CGTT	2	8	2104204	2104211	0 %	50 %	25 %	25 %	227118322
40474	NC_012582	GAG	2	6	2104261	2104266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118322
40475	NC_012582	GGA	2	6	2104311	2104316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118322
40476	NC_012582	GAA	2	6	2104331	2104336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118322
40477	NC_012582	GA	3	6	2104337	2104342	50 %	0 %	50 %	0 %	227118322
40478	NC_012582	ACA	2	6	2104406	2104411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40479	NC_012582	TAA	2	6	2104423	2104428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40480	NC_012582	A	6	6	2104427	2104432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40481	NC_012582	T	6	6	2104449	2104454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40482	NC_012582	ACT	2	6	2104473	2104478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118323
40483	NC_012582	CAC	2	6	2104504	2104509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118323
40484	NC_012582	CTG	2	6	2104536	2104541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118323
40485	NC_012582	CGCAAC	2	12	2104555	2104566	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227118323
40486	NC_012582	AC	3	6	2104590	2104595	50 %	0 %	0 %	50 %	227118323
40487	NC_012582	TGGCT	2	10	2104628	2104637	0 %	40 %	40 %	20 %	227118323
40488	NC_012582	GCA	2	6	2104695	2104700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118323
40489	NC_012582	GC	3	6	2104869	2104874	0 %	0 %	50 %	50 %	227118323
40490	NC_012582	TCA	2	6	2104931	2104936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118323
40491	NC_012582	CAC	2	6	2104948	2104953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118323
40492	NC_012582	CGG	2	6	2104962	2104967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118323
40493	NC_012582	CCA	2	6	2104983	2104988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118323
40494	NC_012582	TGA	2	6	2105015	2105020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118323
40495	NC_012582	AC	3	6	2105035	2105040	50 %	0 %	0 %	50 %	227118323
40496	NC_012582	CAC	2	6	2105043	2105048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118323
40497	NC_012582	TCG	2	6	2105081	2105086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118323
40498	NC_012582	CATGCT	2	12	2105247	2105258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227118324
40499	NC_012582	CTT	2	6	2105291	2105296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118324
40500	NC_012582	CGA	2	6	2105384	2105389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118324

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