MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36004	NC_012582	TAGG	2	8	1866262	1866269	25 %	25 %	50 %	0 %	227118109
36005	NC_012582	TGT	2	6	1866304	1866309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118109
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36007	NC_012582	CATC	2	8	1866403	1866410	25 %	25 %	0 %	50 %	227118109
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36009	NC_012582	ATC	2	6	1866554	1866559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118109
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36012	NC_012582	TGA	2	6	1866601	1866606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118110
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36015	NC_012582	TGC	2	6	1866655	1866660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118110
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36102	NC_012582	ACCA	2	8	1871335	1871342	50 %	0 %	0 %	50 %	227118111
36103	NC_012582	GCT	2	6	1871379	1871384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118111
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36227	NC_012582	TATT	2	8	1877612	1877619	25 %	75 %	0 %	0 %	227118116
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36230	NC_012582	GCA	2	6	1877677	1877682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118116
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36232	NC_012582	CT	3	6	1877801	1877806	0 %	50 %	0 %	50 %	227118116
36233	NC_012582	GCTG	2	8	1877817	1877824	0 %	25 %	50 %	25 %	227118116
36234	NC_012582	A	6	6	1877836	1877841	100 %	0 %	0 %	0 %	227118116
36235	NC_012582	CAA	2	6	1877998	1878003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36236	NC_012582	AG	3	6	1878057	1878062	50 %	0 %	50 %	0 %	227118117
36237	NC_012582	CAA	2	6	1878078	1878083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118117
36238	NC_012582	ATG	2	6	1878126	1878131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118117
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36247	NC_012582	TGA	2	6	1878701	1878706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118119
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36257	NC_012582	T	6	6	1879224	1879229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36258	NC_012582	A	7	7	1879306	1879312	100 %	0 %	0 %	0 %	227118120
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36262	NC_012582	TTTGG	2	10	1879584	1879593	0 %	60 %	40 %	0 %	227118120
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36287	NC_012582	GAAG	2	8	1880932	1880939	50 %	0 %	50 %	0 %	227118121
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36308	NC_012582	CGG	3	9	1881943	1881951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118121
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36312	NC_012582	CCAT	2	8	1882156	1882163	25 %	25 %	0 %	50 %	227118121
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36315	NC_012582	TG	3	6	1882412	1882417	0 %	50 %	50 %	0 %	227118122
36316	NC_012582	AAC	2	6	1882459	1882464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118122
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36331	NC_012582	ATG	2	6	1883845	1883850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118124
36332	NC_012582	T	6	6	1883891	1883896	0 %	100 %	0 %	0 %	227118124
36333	NC_012582	CAA	3	9	1883993	1884001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118124
36334	NC_012582	CTT	2	6	1884070	1884075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118124
36335	NC_012582	GCA	2	6	1884076	1884081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118124
36336	NC_012582	CAT	2	6	1884094	1884099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118124
36337	NC_012582	TC	3	6	1884263	1884268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36338	NC_012582	A	6	6	1884286	1884291	100 %	0 %	0 %	0 %	227118125
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36341	NC_012582	CTG	2	6	1884577	1884582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118125
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36346	NC_012582	GA	3	6	1884765	1884770	50 %	0 %	50 %	0 %	227118125
36347	NC_012582	CAA	2	6	1884795	1884800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118125
36348	NC_012582	GGCA	2	8	1884805	1884812	25 %	0 %	50 %	25 %	227118125
36349	NC_012582	ATCA	2	8	1884847	1884854	50 %	25 %	0 %	25 %	227118125
36350	NC_012582	TGC	2	6	1884865	1884870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118125
36351	NC_012582	CTT	2	6	1884888	1884893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118125
36352	NC_012582	TCA	2	6	1884918	1884923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118125
36353	NC_012582	GAA	2	6	1884946	1884951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118125
36354	NC_012582	TCCA	2	8	1885024	1885031	25 %	25 %	0 %	50 %	227118125
36355	NC_012582	CAAA	2	8	1885071	1885078	75 %	0 %	0 %	25 %	227118125
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36362	NC_012582	CAC	2	6	1885491	1885496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118125
36363	NC_012582	CA	3	6	1885526	1885531	50 %	0 %	0 %	50 %	227118125
36364	NC_012582	ATA	2	6	1885565	1885570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118125
36365	NC_012582	TGTT	2	8	1885634	1885641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36366	NC_012582	AAAAT	2	10	1885662	1885671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36367	NC_012582	ATC	2	6	1885685	1885690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36368	NC_012582	GTTT	3	12	1885786	1885797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36369	NC_012582	TAA	2	6	1885838	1885843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36370	NC_012582	CAA	2	6	1885844	1885849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36371	NC_012582	CCTA	2	8	1885853	1885860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36372	NC_012582	GGC	2	6	1885888	1885893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36373	NC_012582	AGTG	2	8	1885895	1885902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36374	NC_012582	AACG	2	8	1886009	1886016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36375	NC_012582	GAC	2	6	1886061	1886066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36376	NC_012582	CTTC	2	8	1886119	1886126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36377	NC_012582	CAT	2	6	1886316	1886321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118126
36378	NC_012582	CT	3	6	1886430	1886435	0 %	50 %	0 %	50 %	227118126
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36381	NC_012582	TGA	2	6	1886490	1886495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118126
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36384	NC_012582	TGA	2	6	1886586	1886591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118126
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36389	NC_012582	GTA	2	6	1886788	1886793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118126
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36401	NC_012582	CGT	2	6	1887552	1887557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118126
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36409	NC_012582	A	7	7	1887835	1887841	100 %	0 %	0 %	0 %	227118127
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36468	NC_012582	GC	3	6	1891145	1891150	0 %	0 %	50 %	50 %	227118129
36469	NC_012582	TTC	2	6	1891213	1891218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118129
36470	NC_012582	GCTG	2	8	1891222	1891229	0 %	25 %	50 %	25 %	227118129
36471	NC_012582	GAA	2	6	1891246	1891251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118129
36472	NC_012582	A	6	6	1891261	1891266	100 %	0 %	0 %	0 %	227118129
36473	NC_012582	TTTGG	2	10	1891420	1891429	0 %	60 %	40 %	0 %	227118129
36474	NC_012582	ACC	2	6	1891496	1891501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118129
36475	NC_012582	CCA	2	6	1891515	1891520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118129
36476	NC_012582	GC	3	6	1891542	1891547	0 %	0 %	50 %	50 %	227118129
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36480	NC_012582	CTT	2	6	1891734	1891739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118129
36481	NC_012582	GGCT	2	8	1891742	1891749	0 %	25 %	50 %	25 %	227118129
36482	NC_012582	GTT	2	6	1891779	1891784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118129
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36491	NC_012582	ATC	2	6	1892410	1892415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118129
36492	NC_012582	TCA	2	6	1892483	1892488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118129
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36497	NC_012582	ATT	2	6	1892689	1892694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118129
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36499	NC_012582	TC	3	6	1892796	1892801	0 %	50 %	0 %	50 %	227118130
36500	NC_012582	GTT	2	6	1892918	1892923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118130

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