MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_012582	TCA	2	6	1839465	1839470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118088
35503	NC_012582	TCAA	2	8	1839644	1839651	50 %	25 %	0 %	25 %	227118089
35504	NC_012582	TTC	2	6	1839653	1839658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118089
35505	NC_012582	CTT	2	6	1839664	1839669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118089
35506	NC_012582	CAC	2	6	1839703	1839708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118089
35507	NC_012582	TTC	2	6	1839709	1839714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118089
35508	NC_012582	CAG	2	6	1839724	1839729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118089
35509	NC_012582	GCA	2	6	1839764	1839769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118089
35510	NC_012582	GGC	2	6	1839772	1839777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118089
35511	NC_012582	CGA	2	6	1839804	1839809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118089
35512	NC_012582	CGC	2	6	1839837	1839842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118089
35513	NC_012582	CG	3	6	1839844	1839849	0 %	0 %	50 %	50 %	227118089
35514	NC_012582	GCA	2	6	1839885	1839890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118089
35515	NC_012582	CG	3	6	1839933	1839938	0 %	0 %	50 %	50 %	227118089
35516	NC_012582	ACA	2	6	1840004	1840009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118089
35517	NC_012582	GTA	2	6	1840051	1840056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118089
35518	NC_012582	CCA	2	6	1840092	1840097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118089
35519	NC_012582	GCC	2	6	1840103	1840108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118089
35520	NC_012582	GCA	2	6	1840172	1840177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118089
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35523	NC_012582	CAAT	2	8	1840295	1840302	50 %	25 %	0 %	25 %	227118089
35524	NC_012582	GCCA	2	8	1840320	1840327	25 %	0 %	25 %	50 %	227118089
35525	NC_012582	T	6	6	1840342	1840347	0 %	100 %	0 %	0 %	227118089
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35527	NC_012582	CGC	2	6	1840408	1840413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118089
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35529	NC_012582	CTG	2	6	1840553	1840558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118089
35530	NC_012582	TGA	2	6	1840590	1840595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118089
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35533	NC_012582	C	6	6	1840758	1840763	0 %	0 %	0 %	100 %	227118089
35534	NC_012582	GCC	2	6	1840786	1840791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118089
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35536	NC_012582	CGG	2	6	1840851	1840856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118089
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35539	NC_012582	GA	3	6	1840998	1841003	50 %	0 %	50 %	0 %	227118089
35540	NC_012582	GTTAAG	2	12	1841050	1841061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35541	NC_012582	TAG	2	6	1841066	1841071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35542	NC_012582	A	6	6	1841076	1841081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35543	NC_012582	TAT	2	6	1841089	1841094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35544	NC_012582	CACG	2	8	1841098	1841105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35545	NC_012582	CAA	2	6	1841114	1841119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35546	NC_012582	TGC	2	6	1841190	1841195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118090
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35550	NC_012582	CCA	2	6	1841328	1841333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118090
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35552	NC_012582	GCTC	2	8	1841478	1841485	0 %	25 %	25 %	50 %	227118090
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35555	NC_012582	TG	3	6	1841811	1841816	0 %	50 %	50 %	0 %	227118090
35556	NC_012582	CGCT	2	8	1841921	1841928	0 %	25 %	25 %	50 %	227118090
35557	NC_012582	GCG	2	6	1842023	1842028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118090
35558	NC_012582	CAG	2	6	1842031	1842036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118090
35559	NC_012582	TTA	2	6	1842112	1842117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118090
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35573	NC_012582	TTAG	2	8	1842647	1842654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35574	NC_012582	AGTT	2	8	1842662	1842669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35575	NC_012582	AGTT	2	8	1842679	1842686	25 %	50 %	25 %	0 %	227118091
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35590	NC_012582	CAC	2	6	1843583	1843588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118092
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35592	NC_012582	TGT	2	6	1843684	1843689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118092
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35603	NC_012582	GCACC	2	10	1844383	1844392	20 %	0 %	20 %	60 %	227118092
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35605	NC_012582	CAA	2	6	1844495	1844500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118092
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35608	NC_012582	TGA	2	6	1844613	1844618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35609	NC_012582	GGA	2	6	1844633	1844638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35610	NC_012582	CGTT	2	8	1844712	1844719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35611	NC_012582	TC	3	6	1844736	1844741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35612	NC_012582	GCC	2	6	1844763	1844768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35615	NC_012582	CGC	2	6	1844811	1844816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35618	NC_012582	CAC	2	6	1845094	1845099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118093
35619	NC_012582	TCT	2	6	1845172	1845177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118093
35620	NC_012582	GTGAC	2	10	1845193	1845202	20 %	20 %	40 %	20 %	227118093
35621	NC_012582	CAT	2	6	1845220	1845225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118093
35622	NC_012582	CAG	2	6	1845233	1845238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118093
35623	NC_012582	TCA	2	6	1845297	1845302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118093
35624	NC_012582	CAT	2	6	1845368	1845373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118093
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35627	NC_012582	CAC	2	6	1845461	1845466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118093
35628	NC_012582	ATC	2	6	1845467	1845472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118093
35629	NC_012582	CAC	2	6	1845484	1845489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118093
35630	NC_012582	CA	3	6	1845535	1845540	50 %	0 %	0 %	50 %	227118093
35631	NC_012582	CTG	2	6	1845571	1845576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118094
35632	NC_012582	TAT	2	6	1845586	1845591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118094
35633	NC_012582	CA	3	6	1845600	1845605	50 %	0 %	0 %	50 %	227118094
35634	NC_012582	TTGC	2	8	1845623	1845630	0 %	50 %	25 %	25 %	227118094
35635	NC_012582	CGT	2	6	1845734	1845739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118094
35636	NC_012582	GC	3	6	1845822	1845827	0 %	0 %	50 %	50 %	227118094
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35639	NC_012582	CAA	2	6	1845957	1845962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118094
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35646	NC_012582	TATT	2	8	1846254	1846261	25 %	75 %	0 %	0 %	227118094
35647	NC_012582	ATTG	2	8	1846289	1846296	25 %	50 %	25 %	0 %	227118094
35648	NC_012582	GC	3	6	1846394	1846399	0 %	0 %	50 %	50 %	227118094
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35667	NC_012582	GCC	2	6	1847553	1847558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35702	NC_012582	AATG	2	8	1850223	1850230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35703	NC_012582	CCT	2	6	1850255	1850260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35721	NC_012582	AAAATC	2	12	1851465	1851476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227118099
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35725	NC_012582	CTC	2	6	1851646	1851651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118100
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35729	NC_012582	GTT	2	6	1852025	1852030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118100
35730	NC_012582	TC	3	6	1852035	1852040	0 %	50 %	0 %	50 %	227118100
35731	NC_012582	TTA	2	6	1852049	1852054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35732	NC_012582	TC	3	6	1852059	1852064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35733	NC_012582	TGA	2	6	1852082	1852087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35734	NC_012582	ATC	2	6	1852188	1852193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35735	NC_012582	GATG	2	8	1852305	1852312	25 %	25 %	50 %	0 %	227118101
35736	NC_012582	AAT	2	6	1852348	1852353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118101
35737	NC_012582	GTG	2	6	1852406	1852411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118101
35738	NC_012582	TTCTT	2	10	1852428	1852437	0 %	80 %	0 %	20 %	227118101
35739	NC_012582	GC	4	8	1852551	1852558	0 %	0 %	50 %	50 %	227118101
35740	NC_012582	CTG	2	6	1852565	1852570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118101
35741	NC_012582	TCC	2	6	1852592	1852597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118101
35742	NC_012582	ATC	2	6	1852617	1852622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118101
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35745	NC_012582	GCG	2	6	1852874	1852879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118101
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35770	NC_012582	CG	3	6	1853998	1854003	0 %	0 %	50 %	50 %	227118101
35771	NC_012582	CGAAA	2	10	1854045	1854054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35772	NC_012582	TCA	2	6	1854068	1854073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35774	NC_012582	TGC	2	6	1854249	1854254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35775	NC_012582	CTG	2	6	1854304	1854309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35776	NC_012582	TC	3	6	1854317	1854322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35777	NC_012582	ACA	2	6	1854380	1854385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118102
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35800	NC_012582	CGA	2	6	1855582	1855587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118102
35801	NC_012582	ACAA	2	8	1855600	1855607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35802	NC_012582	CTTG	2	8	1855743	1855750	0 %	50 %	25 %	25 %	227118103
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35816	NC_012582	ATTC	2	8	1856329	1856336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35817	NC_012582	ATT	2	6	1856371	1856376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35821	NC_012582	TGA	2	6	1856497	1856502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118104
35822	NC_012582	CAAC	2	8	1856556	1856563	50 %	0 %	0 %	50 %	227118104
35823	NC_012582	TGC	2	6	1856591	1856596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118104
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35828	NC_012582	ACC	2	6	1856804	1856809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118105
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35836	NC_012582	GCT	2	6	1857280	1857285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118105
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35838	NC_012582	T	6	6	1857316	1857321	0 %	100 %	0 %	0 %	227118105
35839	NC_012582	GTT	2	6	1857339	1857344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118105
35840	NC_012582	CAT	2	6	1857389	1857394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118105
35841	NC_012582	CT	3	6	1857506	1857511	0 %	50 %	0 %	50 %	227118105
35842	NC_012582	AC	3	6	1857521	1857526	50 %	0 %	0 %	50 %	227118105
35843	NC_012582	GAT	2	6	1857619	1857624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118105
35844	NC_012582	GTCA	2	8	1857653	1857660	25 %	25 %	25 %	25 %	227118105
35845	NC_012582	AC	3	6	1857733	1857738	50 %	0 %	0 %	50 %	227118105
35846	NC_012582	AAACTC	2	12	1857746	1857757	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227118105
35847	NC_012582	GAG	2	6	1857824	1857829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118105
35848	NC_012582	CAT	2	6	1857884	1857889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118105
35849	NC_012582	GCC	2	6	1857926	1857931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118105
35850	NC_012582	AG	3	6	1857981	1857986	50 %	0 %	50 %	0 %	227118105
35851	NC_012582	TCAAGC	2	12	1858003	1858014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227118105
35852	NC_012582	GA	3	6	1858074	1858079	50 %	0 %	50 %	0 %	227118105
35853	NC_012582	TGC	2	6	1858107	1858112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118105
35854	NC_012582	GC	3	6	1858120	1858125	0 %	0 %	50 %	50 %	227118105
35855	NC_012582	TTGC	2	8	1858229	1858236	0 %	50 %	25 %	25 %	227118105
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35972	NC_012582	CA	3	6	1864346	1864351	50 %	0 %	0 %	50 %	227118108
35973	NC_012582	CATCGC	2	12	1864370	1864381	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227118108
35974	NC_012582	GTTA	2	8	1864428	1864435	25 %	50 %	25 %	0 %	227118108
35975	NC_012582	CTTG	2	8	1864556	1864563	0 %	50 %	25 %	25 %	227118108
35976	NC_012582	CTC	2	6	1864584	1864589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118108
35977	NC_012582	TGC	2	6	1864736	1864741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118108
35978	NC_012582	TCG	2	6	1864768	1864773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118108
35979	NC_012582	T	6	6	1864912	1864917	0 %	100 %	0 %	0 %	227118109
35980	NC_012582	CTT	2	6	1865014	1865019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118109
35981	NC_012582	CTG	2	6	1865045	1865050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35982	NC_012582	GAC	2	6	1865099	1865104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35983	NC_012582	CAT	2	6	1865146	1865151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118109
35984	NC_012582	GCA	2	6	1865152	1865157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35985	NC_012582	CGA	2	6	1865236	1865241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35986	NC_012582	CAG	2	6	1865243	1865248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35987	NC_012582	TCT	2	6	1865322	1865327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118109
35988	NC_012582	CCA	2	6	1865374	1865379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118109
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35990	NC_012582	GAC	2	6	1865425	1865430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35991	NC_012582	GCG	2	6	1865478	1865483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118109
35992	NC_012582	TTC	2	6	1865534	1865539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118109
35993	NC_012582	CGA	2	6	1865554	1865559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118109
35994	NC_012582	CAA	2	6	1865588	1865593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118109
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35997	NC_012582	ATC	2	6	1865720	1865725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118109
35998	NC_012582	TGT	2	6	1865788	1865793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118109
35999	NC_012582	TTGC	2	8	1865826	1865833	0 %	50 %	25 %	25 %	227118109
36000	NC_012582	GCTG	2	8	1865896	1865903	0 %	25 %	50 %	25 %	227118109

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