MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_012582	TGC	2	6	1735555	1735560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33503	NC_012582	CCA	2	6	1735566	1735571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33504	NC_012582	ATT	2	6	1735580	1735585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33505	NC_012582	ACTG	2	8	1735616	1735623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33506	NC_012582	ATT	2	6	1735640	1735645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33507	NC_012582	GGC	2	6	1735849	1735854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33508	NC_012582	GAAC	2	8	1735901	1735908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33509	NC_012582	ATT	2	6	1735987	1735992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118001
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33512	NC_012582	AATG	2	8	1736065	1736072	50 %	25 %	25 %	0 %	227118001
33513	NC_012582	AAAC	2	8	1736111	1736118	75 %	0 %	0 %	25 %	227118001
33514	NC_012582	CCG	2	6	1736144	1736149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118001
33515	NC_012582	GCACG	2	10	1736211	1736220	20 %	0 %	40 %	40 %	227118001
33516	NC_012582	ATT	2	6	1736249	1736254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118001
33517	NC_012582	CGAA	2	8	1736280	1736287	50 %	0 %	25 %	25 %	227118001
33518	NC_012582	TCGATA	2	12	1736351	1736362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227118001
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33522	NC_012582	CAGCTA	2	12	1736443	1736454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227118001
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33532	NC_012582	AG	3	6	1736991	1736996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33533	NC_012582	ATG	2	6	1737093	1737098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33534	NC_012582	CTG	2	6	1737109	1737114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33535	NC_012582	TGA	2	6	1737142	1737147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33539	NC_012582	CCAT	2	8	1737379	1737386	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33540	NC_012582	CTC	2	6	1737424	1737429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33542	NC_012582	TTAA	2	8	1737487	1737494	50 %	50 %	0 %	0 %	227118002
33543	NC_012582	CAT	2	6	1737555	1737560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118002
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33554	NC_012582	GGC	2	6	1738266	1738271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118002
33555	NC_012582	TCT	2	6	1738294	1738299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118002
33556	NC_012582	GTT	2	6	1738455	1738460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118002
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33558	NC_012582	GTG	2	6	1738498	1738503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118002
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33566	NC_012582	ATTG	2	8	1738878	1738885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33567	NC_012582	AGA	2	6	1738886	1738891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33568	NC_012582	AAG	2	6	1738996	1739001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33590	NC_012582	GCCGA	2	10	1740228	1740237	20 %	0 %	40 %	40 %	227118004
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33602	NC_012582	AAGT	2	8	1741066	1741073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33603	NC_012582	GAAC	2	8	1741112	1741119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33604	NC_012582	GCT	2	6	1741208	1741213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118005
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33735	NC_012582	TCTTT	2	10	1747997	1748006	0 %	80 %	0 %	20 %	227118012
33736	NC_012582	ACA	2	6	1748043	1748048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118012
33737	NC_012582	TCAT	2	8	1748049	1748056	25 %	50 %	0 %	25 %	227118012
33738	NC_012582	CAT	2	6	1748119	1748124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118012
33739	NC_012582	GACC	2	8	1748203	1748210	25 %	0 %	25 %	50 %	227118012
33740	NC_012582	CGA	2	6	1748220	1748225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118012
33741	NC_012582	GCG	2	6	1748321	1748326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118012
33742	NC_012582	GCT	2	6	1748377	1748382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118012
33743	NC_012582	T	6	6	1748428	1748433	0 %	100 %	0 %	0 %	227118012
33744	NC_012582	GGC	2	6	1748468	1748473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118012
33745	NC_012582	CGG	2	6	1748476	1748481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118012
33746	NC_012582	ACC	2	6	1748486	1748491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118012
33747	NC_012582	TTG	2	6	1748523	1748528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118012
33748	NC_012582	GGC	2	6	1748540	1748545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118012
33749	NC_012582	GGT	2	6	1748560	1748565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118012
33750	NC_012582	TGGTGC	2	12	1748577	1748588	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	227118012
33751	NC_012582	TTG	2	6	1748610	1748615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118012
33752	NC_012582	AAG	2	6	1748808	1748813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118013
33753	NC_012582	GAT	2	6	1748875	1748880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118013
33754	NC_012582	GAT	2	6	1748920	1748925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118013
33755	NC_012582	CTG	2	6	1748999	1749004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118013
33756	NC_012582	GTG	2	6	1749038	1749043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118013
33757	NC_012582	TGC	2	6	1749081	1749086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118013
33758	NC_012582	TTC	2	6	1749116	1749121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118013
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33760	NC_012582	AGC	2	6	1749160	1749165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118013
33761	NC_012582	T	6	6	1749194	1749199	0 %	100 %	0 %	0 %	227118013
33762	NC_012582	ATG	2	6	1749230	1749235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118013
33763	NC_012582	TCA	3	9	1749246	1749254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118013
33764	NC_012582	TGG	2	6	1749261	1749266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118013
33765	NC_012582	ATG	2	6	1749293	1749298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118013
33766	NC_012582	ACA	2	6	1749315	1749320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118013
33767	NC_012582	TGC	2	6	1749414	1749419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118013
33768	NC_012582	TGG	3	9	1749429	1749437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118013
33769	NC_012582	AAT	2	6	1749483	1749488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118013
33770	NC_012582	TGTTA	2	10	1749536	1749545	20 %	60 %	20 %	0 %	227118014
33771	NC_012582	AAC	2	6	1749553	1749558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118014
33772	NC_012582	TCA	2	6	1749614	1749619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118014
33773	NC_012582	TCC	2	6	1749663	1749668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227118014
33774	NC_012582	AG	3	6	1749692	1749697	50 %	0 %	50 %	0 %	227118014
33775	NC_012582	CGC	2	6	1749729	1749734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118014
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33777	NC_012582	AAAC	2	8	1749855	1749862	75 %	0 %	0 %	25 %	227118014
33778	NC_012582	CGG	2	6	1749941	1749946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118014
33779	NC_012582	T	7	7	1749997	1750003	0 %	100 %	0 %	0 %	227118014
33780	NC_012582	TGA	2	6	1750007	1750012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118014
33781	NC_012582	GCG	2	6	1750032	1750037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118014
33782	NC_012582	GC	4	8	1750040	1750047	0 %	0 %	50 %	50 %	227118014
33783	NC_012582	A	6	6	1750065	1750070	100 %	0 %	0 %	0 %	227118014
33784	NC_012582	TGG	2	6	1750150	1750155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118014
33785	NC_012582	CAAG	2	8	1750274	1750281	50 %	0 %	25 %	25 %	227118014
33786	NC_012582	CAA	2	6	1750581	1750586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118014
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33790	NC_012582	ATGA	2	8	1750806	1750813	50 %	25 %	25 %	0 %	227118015
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33795	NC_012582	GCGG	2	8	1751106	1751113	0 %	0 %	75 %	25 %	227118015
33796	NC_012582	AGA	2	6	1751246	1751251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118015
33797	NC_012582	CAT	2	6	1751270	1751275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118015
33798	NC_012582	GTG	2	6	1751344	1751349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118015
33799	NC_012582	TCG	2	6	1751374	1751379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118015
33800	NC_012582	ATG	2	6	1751472	1751477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118016
33801	NC_012582	ATC	2	6	1751484	1751489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118016
33802	NC_012582	TG	3	6	1751615	1751620	0 %	50 %	50 %	0 %	227118016
33803	NC_012582	TGA	2	6	1751666	1751671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118016
33804	NC_012582	AC	3	6	1751674	1751679	50 %	0 %	0 %	50 %	227118016
33805	NC_012582	CAT	2	6	1751741	1751746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118016
33806	NC_012582	GCT	2	6	1751759	1751764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118016
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33808	NC_012582	ATG	2	6	1751821	1751826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118016
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33810	NC_012582	ATT	2	6	1751916	1751921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118016
33811	NC_012582	TGAG	2	8	1751965	1751972	25 %	25 %	50 %	0 %	227118016
33812	NC_012582	TGG	2	6	1752077	1752082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118016
33813	NC_012582	TCAA	2	8	1752106	1752113	50 %	25 %	0 %	25 %	227118016
33814	NC_012582	A	7	7	1752267	1752273	100 %	0 %	0 %	0 %	227118017
33815	NC_012582	CAC	2	6	1752291	1752296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118017
33816	NC_012582	CTCACC	2	12	1752309	1752320	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	227118017
33817	NC_012582	CGC	2	6	1752378	1752383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118017
33818	NC_012582	ACG	2	6	1752546	1752551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118017
33819	NC_012582	AGCG	2	8	1752555	1752562	25 %	0 %	50 %	25 %	227118017
33820	NC_012582	A	6	6	1752588	1752593	100 %	0 %	0 %	0 %	227118017
33821	NC_012582	GTG	2	6	1752632	1752637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118017
33822	NC_012582	GCC	2	6	1752764	1752769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118017
33823	NC_012582	CAGC	2	8	1752801	1752808	25 %	0 %	25 %	50 %	227118018
33824	NC_012582	CACG	2	8	1752817	1752824	25 %	0 %	25 %	50 %	227118018
33825	NC_012582	CAA	2	6	1753029	1753034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118018
33826	NC_012582	GAA	2	6	1753129	1753134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33827	NC_012582	TGG	2	6	1753256	1753261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118019
33828	NC_012582	CTGTG	2	10	1753294	1753303	0 %	40 %	40 %	20 %	227118019
33829	NC_012582	T	6	6	1753314	1753319	0 %	100 %	0 %	0 %	227118019
33830	NC_012582	TTGC	2	8	1753346	1753353	0 %	50 %	25 %	25 %	227118019
33831	NC_012582	GCC	2	6	1753408	1753413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227118019
33832	NC_012582	CATG	2	8	1753472	1753479	25 %	25 %	25 %	25 %	227118019
33833	NC_012582	ATC	2	6	1753503	1753508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118019
33834	NC_012582	TTG	2	6	1753542	1753547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118019
33835	NC_012582	CAG	2	6	1753548	1753553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33836	NC_012582	TTG	2	6	1753554	1753559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118019
33837	NC_012582	ACC	2	6	1753572	1753577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118019
33838	NC_012582	AGC	2	6	1753579	1753584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33839	NC_012582	TTG	2	6	1753644	1753649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118019
33840	NC_012582	CAA	2	6	1753728	1753733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118019
33841	NC_012582	TGC	2	6	1753735	1753740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33842	NC_012582	GATG	2	8	1753828	1753835	25 %	25 %	50 %	0 %	227118019
33843	NC_012582	TGT	2	6	1753840	1753845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118019
33844	NC_012582	GAC	2	6	1753874	1753879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33845	NC_012582	CTT	2	6	1753928	1753933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227118019
33846	NC_012582	CAG	2	6	1753968	1753973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33847	NC_012582	T	6	6	1753974	1753979	0 %	100 %	0 %	0 %	227118019
33848	NC_012582	GC	3	6	1753991	1753996	0 %	0 %	50 %	50 %	227118019
33849	NC_012582	CAAA	2	8	1754009	1754016	75 %	0 %	0 %	25 %	227118019
33850	NC_012582	GCT	2	6	1754031	1754036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33851	NC_012582	GCA	2	6	1754048	1754053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33852	NC_012582	AGCG	2	8	1754082	1754089	25 %	0 %	50 %	25 %	227118019
33853	NC_012582	GCT	2	6	1754120	1754125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227118019
33854	NC_012582	GGC	2	6	1754130	1754135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118019
33855	NC_012582	AC	3	6	1754223	1754228	50 %	0 %	0 %	50 %	227118019
33856	NC_012582	CAA	2	6	1754247	1754252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118019
33857	NC_012582	GCG	2	6	1754281	1754286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33858	NC_012582	GCC	2	6	1754295	1754300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33859	NC_012582	TTG	2	6	1754339	1754344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227118020
33860	NC_012582	GC	4	8	1754370	1754377	0 %	0 %	50 %	50 %	227118020
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33863	NC_012582	GTG	2	6	1754445	1754450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118020
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33867	NC_012582	GC	3	6	1754602	1754607	0 %	0 %	50 %	50 %	227118020
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33870	NC_012582	GTA	2	6	1754801	1754806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118020
33871	NC_012582	TCA	2	6	1754850	1754855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227118020
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33882	NC_012582	CAC	2	6	1755622	1755627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227118020
33883	NC_012582	CAA	2	6	1755640	1755645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227118020
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33887	NC_012582	CT	3	6	1755753	1755758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33888	NC_012582	CTG	2	6	1755794	1755799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33889	NC_012582	T	6	6	1755816	1755821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33890	NC_012582	ACAAA	2	10	1755850	1755859	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33891	NC_012582	TGA	2	6	1756005	1756010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33895	NC_012582	TGG	2	6	1756242	1756247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118022
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33903	NC_012582	GGC	3	9	1756488	1756496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227118022
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33905	NC_012582	TGA	2	6	1756621	1756626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118022
33906	NC_012582	ATG	2	6	1756818	1756823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118022
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33922	NC_012582	TGG	2	6	1757996	1758001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118022
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33951	NC_012582	TCA	2	6	1759328	1759333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33952	NC_012582	TAA	2	6	1759336	1759341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33953	NC_012582	ATAC	2	8	1759359	1759366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33954	NC_012582	GCAT	2	8	1759375	1759382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33955	NC_012582	TGTT	2	8	1759391	1759398	0 %	75 %	25 %	0 %	227118024
33956	NC_012582	GAG	2	6	1759426	1759431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227118024
33957	NC_012582	GCA	2	6	1759474	1759479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227118024
33958	NC_012582	TACT	2	8	1759481	1759488	25 %	50 %	0 %	25 %	227118024
33959	NC_012582	CG	3	6	1759528	1759533	0 %	0 %	50 %	50 %	227118024
33960	NC_012582	T	7	7	1759535	1759541	0 %	100 %	0 %	0 %	227118024
33961	NC_012582	A	6	6	1759616	1759621	100 %	0 %	0 %	0 %	227118024
33962	NC_012582	TAA	2	6	1759623	1759628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227118024
33963	NC_012582	AGCCA	2	10	1759654	1759663	40 %	0 %	20 %	40 %	227118024
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33965	NC_012582	GGT	2	6	1759864	1759869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227118024
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33967	NC_012582	TTAA	2	8	1759888	1759895	50 %	50 %	0 %	0 %	227118024
33968	NC_012582	CAAC	2	8	1759959	1759966	50 %	0 %	0 %	50 %	227118024
33969	NC_012582	GAT	2	6	1760076	1760081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227118024
33970	NC_012582	GAA	2	6	1760224	1760229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227118024
33971	NC_012582	TTA	2	6	1760276	1760281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227118024
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