MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_012582	AGC	2	6	1549339	1549344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117836
30002	NC_012582	AAGC	2	8	1549371	1549378	50 %	0 %	25 %	25 %	227117836
30003	NC_012582	GATT	2	8	1549379	1549386	25 %	50 %	25 %	0 %	227117836
30004	NC_012582	TCA	2	6	1549391	1549396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117836
30005	NC_012582	TGA	2	6	1549442	1549447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117836
30006	NC_012582	ATT	2	6	1549474	1549479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117836
30007	NC_012582	TC	3	6	1549487	1549492	0 %	50 %	0 %	50 %	227117836
30008	NC_012582	TTA	2	6	1549506	1549511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117836
30009	NC_012582	GAC	2	6	1549596	1549601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117836
30010	NC_012582	CTG	2	6	1549688	1549693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117837
30011	NC_012582	GCA	3	9	1549738	1549746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117837
30012	NC_012582	GCA	2	6	1549867	1549872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117837
30013	NC_012582	GAAT	2	8	1549935	1549942	50 %	25 %	25 %	0 %	227117837
30014	NC_012582	GAA	2	6	1549985	1549990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117837
30015	NC_012582	ATGA	2	8	1550069	1550076	50 %	25 %	25 %	0 %	227117837
30016	NC_012582	AG	3	6	1550110	1550115	50 %	0 %	50 %	0 %	227117837
30017	NC_012582	TAA	2	6	1550119	1550124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117837
30018	NC_012582	TATT	2	8	1550132	1550139	25 %	75 %	0 %	0 %	227117837
30019	NC_012582	ACC	2	6	1550144	1550149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117837
30020	NC_012582	TGG	2	6	1550196	1550201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117837
30021	NC_012582	CGC	2	6	1550207	1550212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117837
30022	NC_012582	AAG	2	6	1550238	1550243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117837
30023	NC_012582	AAT	2	6	1550294	1550299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117837
30024	NC_012582	TCAA	2	8	1550331	1550338	50 %	25 %	0 %	25 %	227117837
30025	NC_012582	CCG	2	6	1550479	1550484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117837
30026	NC_012582	CAG	2	6	1550495	1550500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117837
30027	NC_012582	TTAA	2	8	1550513	1550520	50 %	50 %	0 %	0 %	227117837
30028	NC_012582	T	6	6	1550555	1550560	0 %	100 %	0 %	0 %	227117837
30029	NC_012582	TCTTG	2	10	1550614	1550623	0 %	60 %	20 %	20 %	227117837
30030	NC_012582	G	7	7	1550684	1550690	0 %	0 %	100 %	0 %	227117837
30031	NC_012582	CTG	2	6	1550714	1550719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117837
30032	NC_012582	AG	3	6	1550794	1550799	50 %	0 %	50 %	0 %	227117837
30033	NC_012582	ATT	2	6	1550863	1550868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117837
30034	NC_012582	TGA	2	6	1550878	1550883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117837
30035	NC_012582	CCA	2	6	1550932	1550937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117837
30036	NC_012582	GCA	2	6	1550984	1550989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30037	NC_012582	TGC	2	6	1551008	1551013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30038	NC_012582	GC	3	6	1551037	1551042	0 %	0 %	50 %	50 %	227117838
30039	NC_012582	CGG	2	6	1551141	1551146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117838
30040	NC_012582	CTTT	2	8	1551147	1551154	0 %	75 %	0 %	25 %	227117838
30041	NC_012582	GCC	2	6	1551155	1551160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117838
30042	NC_012582	CGA	2	6	1551168	1551173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117838
30043	NC_012582	TCT	2	6	1551287	1551292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117838
30044	NC_012582	T	6	6	1551355	1551360	0 %	100 %	0 %	0 %	227117838
30045	NC_012582	TTCTGC	2	12	1551388	1551399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227117838
30046	NC_012582	TGA	2	6	1551491	1551496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117838
30047	NC_012582	GTC	2	6	1551508	1551513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117838
30048	NC_012582	TTG	2	6	1551559	1551564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117838
30049	NC_012582	TGA	2	6	1551569	1551574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117838
30050	NC_012582	TGCG	2	8	1551576	1551583	0 %	25 %	50 %	25 %	227117838
30051	NC_012582	TGC	2	6	1551629	1551634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117838
30052	NC_012582	CAG	2	6	1551894	1551899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30053	NC_012582	ACG	2	6	1551910	1551915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30054	NC_012582	TAA	2	6	1551932	1551937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30055	NC_012582	TTTG	2	8	1551947	1551954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_012582	GTT	2	6	1551999	1552004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30057	NC_012582	TAG	2	6	1552020	1552025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30058	NC_012582	TGT	2	6	1552051	1552056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30059	NC_012582	ATTTT	2	10	1552065	1552074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30060	NC_012582	GAC	2	6	1552086	1552091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117839
30061	NC_012582	ATG	2	6	1552097	1552102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117839
30062	NC_012582	TCTT	2	8	1552105	1552112	0 %	75 %	0 %	25 %	227117839
30063	NC_012582	T	6	6	1552111	1552116	0 %	100 %	0 %	0 %	227117839
30064	NC_012582	ATAA	2	8	1552133	1552140	75 %	25 %	0 %	0 %	227117839
30065	NC_012582	CTTT	2	8	1552168	1552175	0 %	75 %	0 %	25 %	227117839
30066	NC_012582	AAG	2	6	1552183	1552188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117839
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30070	NC_012582	TTTTA	2	10	1552279	1552288	20 %	80 %	0 %	0 %	227117839
30071	NC_012582	TGA	2	6	1552404	1552409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117839
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30082	NC_012582	CGT	2	6	1552799	1552804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117839
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30085	NC_012582	TGC	2	6	1553229	1553234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117839
30086	NC_012582	AGT	2	6	1553314	1553319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30087	NC_012582	GTT	2	6	1553342	1553347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30088	NC_012582	TCGCTC	2	12	1553356	1553367	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227117840
30089	NC_012582	TG	3	6	1553508	1553513	0 %	50 %	50 %	0 %	227117840
30090	NC_012582	TTC	2	6	1553519	1553524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117840
30091	NC_012582	AT	3	6	1553527	1553532	50 %	50 %	0 %	0 %	227117840
30092	NC_012582	CAT	2	6	1553561	1553566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117840
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30101	NC_012582	CCA	2	6	1553966	1553971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117840
30102	NC_012582	TTG	2	6	1554008	1554013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117840
30103	NC_012582	GGCC	2	8	1554082	1554089	0 %	0 %	50 %	50 %	227117840
30104	NC_012582	T	7	7	1554102	1554108	0 %	100 %	0 %	0 %	227117840
30105	NC_012582	ACGGCG	2	12	1554122	1554133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227117840
30106	NC_012582	TTG	2	6	1554242	1554247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117840
30107	NC_012582	TGA	2	6	1554283	1554288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117840
30108	NC_012582	TGT	2	6	1554300	1554305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117840
30109	NC_012582	TCC	2	6	1554330	1554335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117840
30110	NC_012582	GCT	2	6	1554388	1554393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117840
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30112	NC_012582	AC	4	8	1554411	1554418	50 %	0 %	0 %	50 %	227117840
30113	NC_012582	GCT	2	6	1554472	1554477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117840
30114	NC_012582	GGC	2	6	1554485	1554490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117840
30115	NC_012582	GTAAC	2	10	1554514	1554523	40 %	20 %	20 %	20 %	227117840
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30117	NC_012582	TG	3	6	1554597	1554602	0 %	50 %	50 %	0 %	227117840
30118	NC_012582	ACCG	2	8	1554647	1554654	25 %	0 %	25 %	50 %	227117840
30119	NC_012582	GCG	2	6	1554665	1554670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117840
30120	NC_012582	CTT	2	6	1554694	1554699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117840
30121	NC_012582	T	7	7	1554741	1554747	0 %	100 %	0 %	0 %	227117840
30122	NC_012582	GC	3	6	1554770	1554775	0 %	0 %	50 %	50 %	227117840
30123	NC_012582	CCA	2	6	1554780	1554785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117840
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30125	NC_012582	TGA	2	6	1554925	1554930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117840
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30145	NC_012582	TGC	2	6	1555707	1555712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117840
30146	NC_012582	GAT	2	6	1555735	1555740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117840
30147	NC_012582	GCTGGC	2	12	1555769	1555780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227117840
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30154	NC_012582	TGG	2	6	1556149	1556154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117840
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30156	NC_012582	GTTC	2	8	1556274	1556281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30157	NC_012582	TCA	2	6	1556465	1556470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30159	NC_012582	GC	3	6	1556586	1556591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30160	NC_012582	CTT	2	6	1556598	1556603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30162	NC_012582	TGGC	2	8	1556658	1556665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30163	NC_012582	ACC	2	6	1556704	1556709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30187	NC_012582	GAAT	2	8	1558130	1558137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30188	NC_012582	CT	3	6	1558333	1558338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30189	NC_012582	GCA	2	6	1558379	1558384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30210	NC_012582	AT	3	6	1559257	1559262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30211	NC_012582	CA	3	6	1559263	1559268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30212	NC_012582	TCA	2	6	1559272	1559277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30213	NC_012582	GATA	2	8	1559289	1559296	50 %	25 %	25 %	0 %	227117841
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30232	NC_012582	CTG	2	6	1560271	1560276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117841
30233	NC_012582	CAT	2	6	1560285	1560290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117841
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30235	NC_012582	GAG	2	6	1560334	1560339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227117841
30236	NC_012582	TGG	2	6	1560362	1560367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117841
30237	NC_012582	CCG	2	6	1560396	1560401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117841
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30239	NC_012582	A	6	6	1560550	1560555	100 %	0 %	0 %	0 %	227117841
30240	NC_012582	GTTG	2	8	1560558	1560565	0 %	50 %	50 %	0 %	227117841
30241	NC_012582	CGG	2	6	1560588	1560593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117841
30242	NC_012582	TGA	2	6	1560624	1560629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117841
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30244	NC_012582	TGA	2	6	1560780	1560785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117841
30245	NC_012582	GCA	2	6	1560834	1560839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117841
30246	NC_012582	GCA	2	6	1560842	1560847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117841
30247	NC_012582	GAAT	2	8	1560916	1560923	50 %	25 %	25 %	0 %	227117842
30248	NC_012582	TG	3	6	1560935	1560940	0 %	50 %	50 %	0 %	227117842
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30251	NC_012582	GC	4	8	1561049	1561056	0 %	0 %	50 %	50 %	227117842
30252	NC_012582	GGC	2	6	1561144	1561149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117842
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30255	NC_012582	ACC	2	6	1561609	1561614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117843
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30257	NC_012582	GA	3	6	1561703	1561708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30258	NC_012582	CG	3	6	1561725	1561730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30259	NC_012582	TGAT	2	8	1561743	1561750	25 %	50 %	25 %	0 %	227117844
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30263	NC_012582	CTT	2	6	1561964	1561969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117844
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30268	NC_012582	GCCA	2	8	1562079	1562086	25 %	0 %	25 %	50 %	227117844
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30276	NC_012582	TGC	2	6	1562850	1562855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117847
30277	NC_012582	A	6	6	1562862	1562867	100 %	0 %	0 %	0 %	227117847
30278	NC_012582	TCGTTT	2	12	1562895	1562906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227117847
30279	NC_012582	ACGCA	2	10	1562952	1562961	40 %	0 %	20 %	40 %	227117847
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30283	NC_012582	GCAA	2	8	1563017	1563024	50 %	0 %	25 %	25 %	227117847
30284	NC_012582	CTG	2	6	1563052	1563057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117847
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30290	NC_012582	TCAAA	2	10	1563330	1563339	60 %	20 %	0 %	20 %	227117847
30291	NC_012582	TGA	2	6	1563341	1563346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117847
30292	NC_012582	CAT	2	6	1563405	1563410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117847
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30294	NC_012582	CGT	2	6	1563481	1563486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117847
30295	NC_012582	TCA	3	9	1563500	1563508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117847
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30302	NC_012582	ATCAA	2	10	1564259	1564268	60 %	20 %	0 %	20 %	227117847
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30320	NC_012582	CAAA	2	8	1565127	1565134	75 %	0 %	0 %	25 %	227117847
30321	NC_012582	CG	3	6	1565137	1565142	0 %	0 %	50 %	50 %	227117847
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30326	NC_012582	GTG	2	6	1565274	1565279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117847
30327	NC_012582	GCCA	2	8	1565347	1565354	25 %	0 %	25 %	50 %	227117847
30328	NC_012582	AAACTC	2	12	1565401	1565412	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227117847
30329	NC_012582	TGG	2	6	1565534	1565539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117847
30330	NC_012582	TTAA	2	8	1565545	1565552	50 %	50 %	0 %	0 %	227117847
30331	NC_012582	T	6	6	1565610	1565615	0 %	100 %	0 %	0 %	227117847
30332	NC_012582	GCT	2	6	1565643	1565648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117847
30333	NC_012582	TGC	2	6	1565693	1565698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117847
30334	NC_012582	CTGC	2	8	1565722	1565729	0 %	25 %	25 %	50 %	227117847
30335	NC_012582	CG	3	6	1565749	1565754	0 %	0 %	50 %	50 %	227117847
30336	NC_012582	ATC	2	6	1565759	1565764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117847
30337	NC_012582	AG	3	6	1565808	1565813	50 %	0 %	50 %	0 %	227117847
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30339	NC_012582	GTG	2	6	1565927	1565932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117847
30340	NC_012582	AAGA	2	8	1565968	1565975	75 %	0 %	25 %	0 %	227117847
30341	NC_012582	AGC	2	6	1566011	1566016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117847
30342	NC_012582	TGAT	2	8	1566152	1566159	25 %	50 %	25 %	0 %	227117847
30343	NC_012582	GCG	2	6	1566173	1566178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117847
30344	NC_012582	GCG	2	6	1566200	1566205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117847
30345	NC_012582	AGT	2	6	1566273	1566278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117847
30346	NC_012582	ACA	2	6	1566320	1566325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117847
30347	NC_012582	AAGGT	2	10	1566341	1566350	40 %	20 %	40 %	0 %	227117847
30348	NC_012582	GC	3	6	1566468	1566473	0 %	0 %	50 %	50 %	227117847
30349	NC_012582	CAA	2	6	1566510	1566515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117847
30350	NC_012582	CAA	2	6	1566552	1566557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117847
30351	NC_012582	GCT	2	6	1566567	1566572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117847
30352	NC_012582	ATC	2	6	1566700	1566705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117847
30353	NC_012582	ATA	2	6	1566754	1566759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117848
30354	NC_012582	GCC	2	6	1566825	1566830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117848
30355	NC_012582	AAG	2	6	1566853	1566858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30356	NC_012582	CATT	2	8	1567020	1567027	25 %	50 %	0 %	25 %	227117849
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30474	NC_012582	GATA	2	8	1572978	1572985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30475	NC_012582	GCG	2	6	1573116	1573121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117857
30476	NC_012582	CGAC	2	8	1573134	1573141	25 %	0 %	25 %	50 %	227117857
30477	NC_012582	TAC	2	6	1573144	1573149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117857
30478	NC_012582	TGC	2	6	1573168	1573173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117857
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30480	NC_012582	TCA	2	6	1573343	1573348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117857
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30500	NC_012582	TGGCAG	2	12	1574439	1574450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227117857

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