MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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26118	NC_012582	ATGG	2	8	1346560	1346567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26119	NC_012582	ACG	2	6	1346616	1346621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26120	NC_012582	AGCT	2	8	1346625	1346632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26121	NC_012582	ATG	2	6	1346673	1346678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26122	NC_012582	A	6	6	1346844	1346849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26123	NC_012582	AAT	2	6	1346864	1346869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26124	NC_012582	TAAA	2	8	1346886	1346893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26125	NC_012582	TGG	2	6	1346906	1346911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26126	NC_012582	GAT	2	6	1346935	1346940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117650
26127	NC_012582	TCA	2	6	1346995	1347000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117650
26128	NC_012582	CGT	2	6	1347062	1347067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117650
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26132	NC_012582	TTG	2	6	1347363	1347368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117650
26133	NC_012582	AGT	2	6	1347416	1347421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117650
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26141	NC_012582	TGG	2	6	1347740	1347745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117651
26142	NC_012582	ACT	2	6	1347748	1347753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117651
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26154	NC_012582	TG	3	6	1348655	1348660	0 %	50 %	50 %	0 %	227117651
26155	NC_012582	TAC	2	6	1348729	1348734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117651
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26158	NC_012582	T	6	6	1348994	1348999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26159	NC_012582	TC	3	6	1349008	1349013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26160	NC_012582	AG	4	8	1349035	1349042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26161	NC_012582	ATG	2	6	1349050	1349055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26182	NC_012582	CTG	2	6	1350068	1350073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117652
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26188	NC_012582	TCTA	2	8	1350428	1350435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26189	NC_012582	ACA	2	6	1350477	1350482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26197	NC_012582	AATCG	2	10	1350816	1350825	40 %	20 %	20 %	20 %	227117653
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26220	NC_012582	GCGT	2	8	1351877	1351884	0 %	25 %	50 %	25 %	227117655
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26228	NC_012582	CAT	2	6	1352188	1352193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117655
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26230	NC_012582	T	6	6	1352240	1352245	0 %	100 %	0 %	0 %	227117655
26231	NC_012582	CTT	2	6	1352287	1352292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117655
26232	NC_012582	CCA	2	6	1352311	1352316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117655
26233	NC_012582	GC	3	6	1352330	1352335	0 %	0 %	50 %	50 %	227117655
26234	NC_012582	AAG	2	6	1352415	1352420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117655
26235	NC_012582	GTT	2	6	1352428	1352433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117655
26236	NC_012582	CGC	2	6	1352450	1352455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117655
26237	NC_012582	GCA	2	6	1352463	1352468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117655
26238	NC_012582	CCG	2	6	1352488	1352493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117655
26239	NC_012582	GTC	2	6	1352507	1352512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117655
26240	NC_012582	CAA	2	6	1352635	1352640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117655
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26243	NC_012582	CAC	2	6	1352861	1352866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117655
26244	NC_012582	GGC	2	6	1352888	1352893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117655
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26248	NC_012582	CGC	2	6	1352984	1352989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117655
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26255	NC_012582	GGA	2	6	1353490	1353495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26256	NC_012582	AAG	2	6	1353520	1353525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26257	NC_012582	GCA	2	6	1353539	1353544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26258	NC_012582	TTTG	2	8	1353549	1353556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26259	NC_012582	CAA	2	6	1353574	1353579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26262	NC_012582	T	7	7	1353669	1353675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26263	NC_012582	TA	3	6	1353688	1353693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26264	NC_012582	GCA	2	6	1353714	1353719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117656
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26305	NC_012582	TGTA	2	8	1356018	1356025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26306	NC_012582	TAT	2	6	1356033	1356038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26314	NC_012582	GCG	2	6	1356208	1356213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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26322	NC_012582	TAAA	2	8	1356524	1356531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26323	NC_012582	A	7	7	1356529	1356535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26324	NC_012582	TTA	2	6	1356642	1356647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117661
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26342	NC_012582	GTTGA	2	10	1357679	1357688	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26343	NC_012582	CGG	2	6	1357768	1357773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117662
26344	NC_012582	TTGG	2	8	1357914	1357921	0 %	50 %	50 %	0 %	227117662
26345	NC_012582	CG	3	6	1357993	1357998	0 %	0 %	50 %	50 %	227117662
26346	NC_012582	CTT	2	6	1358147	1358152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117662
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26348	NC_012582	CCG	3	9	1358176	1358184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117662
26349	NC_012582	TAA	2	6	1358283	1358288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117662
26350	NC_012582	GTG	2	6	1358299	1358304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117662
26351	NC_012582	GTTTCT	2	12	1358311	1358322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227117662
26352	NC_012582	CGA	2	6	1358369	1358374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117662
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26354	NC_012582	G	6	6	1358475	1358480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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26472	NC_012582	G	6	6	1364735	1364740	0 %	0 %	100 %	0 %	227117667
26473	NC_012582	GT	3	6	1364771	1364776	0 %	50 %	50 %	0 %	227117667
26474	NC_012582	TGTAG	2	10	1365016	1365025	20 %	40 %	40 %	0 %	227117667
26475	NC_012582	TGGTT	2	10	1365178	1365187	0 %	60 %	40 %	0 %	227117667
26476	NC_012582	TGC	2	6	1365188	1365193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117667
26477	NC_012582	A	6	6	1365247	1365252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26478	NC_012582	T	7	7	1365274	1365280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26479	NC_012582	TTAGAT	2	12	1365284	1365295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26480	NC_012582	AAGG	2	8	1365330	1365337	50 %	0 %	50 %	0 %	227117668
26481	NC_012582	CTT	2	6	1365338	1365343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117668
26482	NC_012582	ATC	2	6	1365369	1365374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117668
26483	NC_012582	ATC	3	9	1365601	1365609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117668
26484	NC_012582	TGC	2	6	1365610	1365615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117668
26485	NC_012582	ATG	2	6	1365634	1365639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117668
26486	NC_012582	CAC	2	6	1365678	1365683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117668
26487	NC_012582	CTTCAC	2	12	1365713	1365724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	227117668
26488	NC_012582	TCAC	2	8	1365811	1365818	25 %	25 %	0 %	50 %	227117668
26489	NC_012582	CTT	2	6	1365857	1365862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117668
26490	NC_012582	GCA	2	6	1365866	1365871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117668
26491	NC_012582	CAG	2	6	1365882	1365887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117668
26492	NC_012582	ATGG	2	8	1365924	1365931	25 %	25 %	50 %	0 %	227117668
26493	NC_012582	AAATTG	2	12	1365984	1365995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227117668
26494	NC_012582	GC	3	6	1366056	1366061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26495	NC_012582	GTCA	2	8	1366171	1366178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26496	NC_012582	AGC	2	6	1366196	1366201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117669
26497	NC_012582	GCA	2	6	1366236	1366241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117669
26498	NC_012582	GTG	2	6	1366335	1366340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117669
26499	NC_012582	TGC	3	9	1366375	1366383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117669
26500	NC_012582	TGCG	2	8	1366437	1366444	0 %	25 %	50 %	25 %	227117669

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