MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23503	NC_012582	GTG	2	6	1212116	1212121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117486
23504	NC_012582	TGC	2	6	1212126	1212131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117486
23505	NC_012582	TAC	2	6	1212173	1212178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117486
23506	NC_012582	TTG	2	6	1212209	1212214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117486
23507	NC_012582	ACT	2	6	1212249	1212254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117486
23508	NC_012582	AGC	2	6	1212271	1212276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117486
23509	NC_012582	AGA	2	6	1212286	1212291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117486
23510	NC_012582	GCA	2	6	1212310	1212315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117486
23511	NC_012582	CTG	2	6	1212364	1212369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117486
23512	NC_012582	CG	3	6	1212389	1212394	0 %	0 %	50 %	50 %	227117486
23513	NC_012582	TGA	2	6	1212396	1212401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117486
23514	NC_012582	GTA	2	6	1212420	1212425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117486
23515	NC_012582	GCAA	2	8	1212473	1212480	50 %	0 %	25 %	25 %	227117486
23516	NC_012582	TTA	2	6	1212482	1212487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117486
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23520	NC_012582	TAT	2	6	1212692	1212697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117487
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23522	NC_012582	TGC	2	6	1212869	1212874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117487
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23524	NC_012582	AGT	2	6	1212978	1212983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117487
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23530	NC_012582	ACCG	2	8	1213211	1213218	25 %	0 %	25 %	50 %	227117487
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23534	NC_012582	CG	3	6	1213501	1213506	0 %	0 %	50 %	50 %	227117487
23535	NC_012582	CGG	2	6	1213598	1213603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117487
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23551	NC_012582	TTGGT	2	10	1214227	1214236	0 %	60 %	40 %	0 %	227117488
23552	NC_012582	GGTT	2	8	1214251	1214258	0 %	50 %	50 %	0 %	227117488
23553	NC_012582	A	6	6	1214346	1214351	100 %	0 %	0 %	0 %	227117488
23554	NC_012582	CGC	2	6	1214396	1214401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117488
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23582	NC_012582	GCTG	2	8	1215563	1215570	0 %	25 %	50 %	25 %	227117491
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23588	NC_012582	TG	3	6	1215991	1215996	0 %	50 %	50 %	0 %	227117491
23589	NC_012582	AGA	2	6	1216004	1216009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117491
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23610	NC_012582	GC	3	6	1217076	1217081	0 %	0 %	50 %	50 %	227117492
23611	NC_012582	ATC	2	6	1217198	1217203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117492
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23616	NC_012582	TCA	2	6	1217707	1217712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117493
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23732	NC_012582	CGT	2	6	1223727	1223732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117498
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23852	NC_012582	ATC	2	6	1229301	1229306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117511
23853	NC_012582	GGC	2	6	1229367	1229372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117511
23854	NC_012582	TGC	2	6	1229395	1229400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117511
23855	NC_012582	TAT	2	6	1229402	1229407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117511
23856	NC_012582	AGGC	2	8	1229443	1229450	25 %	0 %	50 %	25 %	227117511
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23859	NC_012582	GGA	2	6	1229591	1229596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23871	NC_012582	CAA	2	6	1230073	1230078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23968	NC_012582	ATG	2	6	1234806	1234811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117521
23969	NC_012582	CGA	2	6	1234846	1234851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117521
23970	NC_012582	GCT	2	6	1234864	1234869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117521
23971	NC_012582	CCAAGA	2	12	1234987	1234998	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227117521
23972	NC_012582	TGA	2	6	1235026	1235031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117521
23973	NC_012582	GC	3	6	1235043	1235048	0 %	0 %	50 %	50 %	227117521
23974	NC_012582	CGC	2	6	1235079	1235084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117521
23975	NC_012582	GC	3	6	1235120	1235125	0 %	0 %	50 %	50 %	227117521
23976	NC_012582	TGG	2	6	1235171	1235176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117521
23977	NC_012582	GGC	2	6	1235348	1235353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117521
23978	NC_012582	TGA	2	6	1235386	1235391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117521
23979	NC_012582	CCG	2	6	1235427	1235432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117521
23980	NC_012582	GCAA	2	8	1235452	1235459	50 %	0 %	25 %	25 %	227117521
23981	NC_012582	GC	3	6	1235501	1235506	0 %	0 %	50 %	50 %	227117521
23982	NC_012582	CAT	2	6	1235548	1235553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117521
23983	NC_012582	CGTG	2	8	1235683	1235690	0 %	25 %	50 %	25 %	227117521
23984	NC_012582	TGAG	2	8	1235703	1235710	25 %	25 %	50 %	0 %	227117521
23985	NC_012582	GAA	3	9	1235720	1235728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117521
23986	NC_012582	ATG	2	6	1235931	1235936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117521
23987	NC_012582	TGGC	2	8	1235943	1235950	0 %	25 %	50 %	25 %	227117521
23988	NC_012582	CTGC	2	8	1235951	1235958	0 %	25 %	25 %	50 %	227117521
23989	NC_012582	TTG	2	6	1235988	1235993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117521
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23991	NC_012582	GTTG	2	8	1236203	1236210	0 %	50 %	50 %	0 %	227117522
23992	NC_012582	GTG	2	6	1236284	1236289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117522
23993	NC_012582	GATG	2	8	1236302	1236309	25 %	25 %	50 %	0 %	227117522
23994	NC_012582	CGC	2	6	1236398	1236403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117522
23995	NC_012582	A	6	6	1236424	1236429	100 %	0 %	0 %	0 %	227117522
23996	NC_012582	GC	3	6	1236434	1236439	0 %	0 %	50 %	50 %	227117522
23997	NC_012582	CTG	2	6	1236513	1236518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117522
23998	NC_012582	GCC	2	6	1236551	1236556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117522
23999	NC_012582	AAAC	2	8	1236674	1236681	75 %	0 %	0 %	25 %	227117522
24000	NC_012582	TGA	2	6	1236767	1236772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117522

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