MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_012582	AAG	2	6	1184455	1184460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23002	NC_012582	ATG	2	6	1184476	1184481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117460
23003	NC_012582	TTA	2	6	1184485	1184490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117460
23004	NC_012582	TC	3	6	1184561	1184566	0 %	50 %	0 %	50 %	227117460
23005	NC_012582	CAT	2	6	1184634	1184639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117460
23006	NC_012582	GC	3	6	1184733	1184738	0 %	0 %	50 %	50 %	227117460
23007	NC_012582	GAT	2	6	1184751	1184756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117460
23008	NC_012582	TGC	2	6	1184825	1184830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23009	NC_012582	TGA	2	6	1184960	1184965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117460
23010	NC_012582	CTG	2	6	1184995	1185000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23011	NC_012582	ACC	2	6	1185016	1185021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117460
23012	NC_012582	GCT	2	6	1185057	1185062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23013	NC_012582	ATC	2	6	1185094	1185099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117460
23014	NC_012582	GTG	2	6	1185121	1185126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117460
23015	NC_012582	GCCG	2	8	1185160	1185167	0 %	0 %	50 %	50 %	227117460
23016	NC_012582	CGA	2	6	1185278	1185283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23017	NC_012582	TGC	2	6	1185305	1185310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23018	NC_012582	TGC	2	6	1185386	1185391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23019	NC_012582	GTC	2	6	1185404	1185409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117460
23020	NC_012582	CGTG	2	8	1185412	1185419	0 %	25 %	50 %	25 %	227117460
23021	NC_012582	A	6	6	1185459	1185464	100 %	0 %	0 %	0 %	227117461
23022	NC_012582	TTA	2	6	1185465	1185470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117461
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23024	NC_012582	GTG	2	6	1185678	1185683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117461
23025	NC_012582	CGGT	2	8	1185793	1185800	0 %	25 %	50 %	25 %	227117461
23026	NC_012582	CAAG	2	8	1185845	1185852	50 %	0 %	25 %	25 %	227117461
23027	NC_012582	GAT	2	6	1185875	1185880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117461
23028	NC_012582	CG	3	6	1185966	1185971	0 %	0 %	50 %	50 %	227117461
23029	NC_012582	GAT	2	6	1185989	1185994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117461
23030	NC_012582	TGA	2	6	1186001	1186006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117461
23031	NC_012582	TC	3	6	1186109	1186114	0 %	50 %	0 %	50 %	227117461
23032	NC_012582	GGT	2	6	1186115	1186120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117461
23033	NC_012582	TG	3	6	1186329	1186334	0 %	50 %	50 %	0 %	227117461
23034	NC_012582	T	7	7	1186486	1186492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23035	NC_012582	AAC	2	6	1186509	1186514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23036	NC_012582	ACA	2	6	1186639	1186644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117462
23037	NC_012582	TGC	2	6	1186714	1186719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117462
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23039	NC_012582	TGTC	2	8	1186828	1186835	0 %	50 %	25 %	25 %	227117462
23040	NC_012582	TGT	2	6	1186956	1186961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117462
23041	NC_012582	A	6	6	1186967	1186972	100 %	0 %	0 %	0 %	227117462
23042	NC_012582	ATC	2	6	1187006	1187011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117462
23043	NC_012582	ATT	2	6	1187058	1187063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117462
23044	NC_012582	TGAT	2	8	1187085	1187092	25 %	50 %	25 %	0 %	227117462
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23046	NC_012582	GCG	2	6	1187195	1187200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117462
23047	NC_012582	GTTT	2	8	1187274	1187281	0 %	75 %	25 %	0 %	227117462
23048	NC_012582	ACC	2	6	1187282	1187287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117462
23049	NC_012582	A	6	6	1187567	1187572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23050	NC_012582	GCA	2	6	1187741	1187746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117463
23051	NC_012582	GAATAC	2	12	1187820	1187831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227117463
23052	NC_012582	CGT	2	6	1187897	1187902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117463
23053	NC_012582	ATCA	2	8	1187916	1187923	50 %	25 %	0 %	25 %	227117463
23054	NC_012582	ATC	2	6	1188016	1188021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117463
23055	NC_012582	GCA	3	9	1188146	1188154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117463
23056	NC_012582	AGA	2	6	1188158	1188163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117463
23057	NC_012582	TGA	2	6	1188197	1188202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117463
23058	NC_012582	GTG	2	6	1188209	1188214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117463
23059	NC_012582	CAT	2	6	1188282	1188287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117463
23060	NC_012582	AAC	2	6	1188297	1188302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117463
23061	NC_012582	CG	3	6	1188320	1188325	0 %	0 %	50 %	50 %	227117463
23062	NC_012582	CCA	2	6	1188326	1188331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117463
23063	NC_012582	GAT	2	6	1188405	1188410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117463
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23065	NC_012582	TCT	2	6	1188463	1188468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117463
23066	NC_012582	AC	3	6	1188484	1188489	50 %	0 %	0 %	50 %	227117463
23067	NC_012582	AGC	2	6	1188516	1188521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117463
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23069	NC_012582	TCAG	2	8	1188589	1188596	25 %	25 %	25 %	25 %	227117463
23070	NC_012582	TGG	2	6	1188612	1188617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117463
23071	NC_012582	CGA	2	6	1188625	1188630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117463
23072	NC_012582	TCAG	2	8	1188646	1188653	25 %	25 %	25 %	25 %	227117463
23073	NC_012582	AG	3	6	1188652	1188657	50 %	0 %	50 %	0 %	227117463
23074	NC_012582	TGA	2	6	1188698	1188703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117463
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23077	NC_012582	TGC	2	6	1188900	1188905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117463
23078	NC_012582	ACG	2	6	1189023	1189028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117463
23079	NC_012582	TGA	2	6	1189049	1189054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117463
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23087	NC_012582	CGG	2	6	1189556	1189561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117463
23088	NC_012582	GTCAG	2	10	1189621	1189630	20 %	20 %	40 %	20 %	227117463
23089	NC_012582	ATC	2	6	1189635	1189640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117463
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23091	NC_012582	GC	3	6	1189702	1189707	0 %	0 %	50 %	50 %	227117463
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23099	NC_012582	TCAG	2	8	1190281	1190288	25 %	25 %	25 %	25 %	227117464
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23101	NC_012582	CA	4	8	1190468	1190475	50 %	0 %	0 %	50 %	227117464
23102	NC_012582	TGA	2	6	1190501	1190506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117464
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23105	NC_012582	TGG	2	6	1190659	1190664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117464
23106	NC_012582	GAT	2	6	1190730	1190735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117464
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23108	NC_012582	CGT	2	6	1190795	1190800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117464
23109	NC_012582	CAC	2	6	1190828	1190833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117464
23110	NC_012582	TGT	2	6	1191028	1191033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117464
23111	NC_012582	CAA	2	6	1191050	1191055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117464
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23113	NC_012582	TAAAAC	2	12	1191087	1191098	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227117464
23114	NC_012582	TAA	2	6	1191124	1191129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23115	NC_012582	A	7	7	1191141	1191147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23116	NC_012582	GTC	2	6	1191247	1191252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23119	NC_012582	TTG	2	6	1191404	1191409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23222	NC_012582	CAAT	2	8	1197736	1197743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23223	NC_012582	GC	3	6	1197821	1197826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23224	NC_012582	ACC	2	6	1197963	1197968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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23229	NC_012582	GCA	3	9	1198207	1198215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23233	NC_012582	CTT	2	6	1198439	1198444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23234	NC_012582	TA	3	6	1198455	1198460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23235	NC_012582	GCG	2	6	1198463	1198468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23347	NC_012582	ACAACC	2	12	1204562	1204573	50 %	0 %	0 %	50 %	227117477
23348	NC_012582	CAT	2	6	1204602	1204607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117477
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23350	NC_012582	CGTG	2	8	1204650	1204657	0 %	25 %	50 %	25 %	227117477
23351	NC_012582	G	6	6	1204680	1204685	0 %	0 %	100 %	0 %	227117477
23352	NC_012582	GAT	2	6	1204819	1204824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117477
23353	NC_012582	GC	3	6	1204861	1204866	0 %	0 %	50 %	50 %	227117477
23354	NC_012582	ATG	2	6	1204870	1204875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117477
23355	NC_012582	ATGA	2	8	1204915	1204922	50 %	25 %	25 %	0 %	227117477
23356	NC_012582	CTG	2	6	1204981	1204986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117477
23357	NC_012582	ACC	2	6	1204987	1204992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117477
23358	NC_012582	TGC	2	6	1205018	1205023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117477
23359	NC_012582	GTT	2	6	1205091	1205096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117477
23360	NC_012582	CG	3	6	1205121	1205126	0 %	0 %	50 %	50 %	227117477
23361	NC_012582	ATTT	2	8	1205141	1205148	25 %	75 %	0 %	0 %	227117477
23362	NC_012582	ATG	2	6	1205316	1205321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117478
23363	NC_012582	GC	3	6	1205354	1205359	0 %	0 %	50 %	50 %	227117478
23364	NC_012582	GCAG	2	8	1205366	1205373	25 %	0 %	50 %	25 %	227117478
23365	NC_012582	CGAG	2	8	1205452	1205459	25 %	0 %	50 %	25 %	227117478
23366	NC_012582	CTG	2	6	1205498	1205503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117478
23367	NC_012582	TGC	3	9	1205529	1205537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117478
23368	NC_012582	CCT	2	6	1205556	1205561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117478
23369	NC_012582	CCA	2	6	1205589	1205594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117478
23370	NC_012582	GAGCA	2	10	1205645	1205654	40 %	0 %	40 %	20 %	227117478
23371	NC_012582	GTG	2	6	1205663	1205668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117478
23372	NC_012582	ATGG	2	8	1205687	1205694	25 %	25 %	50 %	0 %	227117478
23373	NC_012582	GC	3	6	1205737	1205742	0 %	0 %	50 %	50 %	227117478
23374	NC_012582	TGG	2	6	1205751	1205756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117478
23375	NC_012582	ATG	2	6	1205757	1205762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117478
23376	NC_012582	GCG	2	6	1205873	1205878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117478
23377	NC_012582	TG	3	6	1205883	1205888	0 %	50 %	50 %	0 %	227117478
23378	NC_012582	CCA	2	6	1205926	1205931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117478
23379	NC_012582	TGC	2	6	1205980	1205985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117478
23380	NC_012582	GAT	2	6	1205989	1205994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117478
23381	NC_012582	AGTC	2	8	1205999	1206006	25 %	25 %	25 %	25 %	227117478
23382	NC_012582	GCT	2	6	1206031	1206036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117478
23383	NC_012582	TGA	2	6	1206046	1206051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117478
23384	NC_012582	GTT	2	6	1206106	1206111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117478
23385	NC_012582	AGC	2	6	1206153	1206158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117478
23386	NC_012582	ACC	2	6	1206184	1206189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117478
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23393	NC_012582	TGA	2	6	1206585	1206590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117479
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23397	NC_012582	ACTTAG	2	12	1206887	1206898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227117479
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23400	NC_012582	TTC	2	6	1207168	1207173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117480
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23402	NC_012582	TGA	2	6	1207276	1207281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117480
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23408	NC_012582	TGG	2	6	1207531	1207536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117480
23409	NC_012582	GGC	2	6	1207681	1207686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117480
23410	NC_012582	ACG	2	6	1207796	1207801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117480
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23413	NC_012582	CGA	2	6	1207919	1207924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117481
23414	NC_012582	CTG	3	9	1207926	1207934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117481
23415	NC_012582	CTT	2	6	1207976	1207981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117481
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23418	NC_012582	TTTG	2	8	1208058	1208065	0 %	75 %	25 %	0 %	227117481
23419	NC_012582	GCT	2	6	1208152	1208157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23420	NC_012582	TAC	2	6	1208200	1208205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23422	NC_012582	TGT	2	6	1208236	1208241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23423	NC_012582	TG	3	6	1208258	1208263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23424	NC_012582	CAAC	2	8	1208339	1208346	50 %	0 %	0 %	50 %	227117482
23425	NC_012582	GTT	2	6	1208371	1208376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117482
23426	NC_012582	GTCTG	2	10	1208421	1208430	0 %	40 %	40 %	20 %	227117482
23427	NC_012582	GGC	2	6	1208439	1208444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117482
23428	NC_012582	TTTGGC	2	12	1208449	1208460	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227117482
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23430	NC_012582	CTG	2	6	1208476	1208481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117482
23431	NC_012582	GTGG	2	8	1208509	1208516	0 %	25 %	75 %	0 %	227117482
23432	NC_012582	GTC	2	6	1208518	1208523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117482
23433	NC_012582	ATG	2	6	1208621	1208626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117482
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23435	NC_012582	TGC	2	6	1208696	1208701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117482
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23438	NC_012582	GTG	2	6	1208797	1208802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117482
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23441	NC_012582	ATG	2	6	1208884	1208889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117482
23442	NC_012582	TCA	2	6	1208945	1208950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117482
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23449	NC_012582	CACC	2	8	1209133	1209140	25 %	0 %	0 %	75 %	227117482
23450	NC_012582	GCA	2	6	1209157	1209162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117482
23451	NC_012582	TTGA	2	8	1209215	1209222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23452	NC_012582	TCT	2	6	1209226	1209231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23453	NC_012582	A	6	6	1209308	1209313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23454	NC_012582	ACA	2	6	1209404	1209409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117483
23455	NC_012582	CAA	2	6	1209426	1209431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117483
23456	NC_012582	ATC	2	6	1209469	1209474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117483
23457	NC_012582	CATCG	2	10	1209501	1209510	20 %	20 %	20 %	40 %	227117483
23458	NC_012582	T	6	6	1209536	1209541	0 %	100 %	0 %	0 %	227117483
23459	NC_012582	ATT	2	6	1209727	1209732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117483
23460	NC_012582	CG	3	6	1209786	1209791	0 %	0 %	50 %	50 %	227117483
23461	NC_012582	AAC	2	6	1209855	1209860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117484
23462	NC_012582	TACA	2	8	1209933	1209940	50 %	25 %	0 %	25 %	227117484
23463	NC_012582	ATC	2	6	1209981	1209986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117484
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23466	NC_012582	GT	3	6	1210101	1210106	0 %	50 %	50 %	0 %	227117484
23467	NC_012582	GCG	2	6	1210130	1210135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117484
23468	NC_012582	TTG	2	6	1210185	1210190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117484
23469	NC_012582	CAC	2	6	1210309	1210314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117484
23470	NC_012582	CAC	2	6	1210338	1210343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117484
23471	NC_012582	ATC	2	6	1210376	1210381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117484
23472	NC_012582	GCC	2	6	1210394	1210399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117484
23473	NC_012582	GC	3	6	1210421	1210426	0 %	0 %	50 %	50 %	227117484
23474	NC_012582	GT	3	6	1210428	1210433	0 %	50 %	50 %	0 %	227117484
23475	NC_012582	TAA	2	6	1210535	1210540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117484
23476	NC_012582	T	6	6	1210544	1210549	0 %	100 %	0 %	0 %	227117485
23477	NC_012582	TGG	2	6	1210652	1210657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117485
23478	NC_012582	TCA	2	6	1210750	1210755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117485
23479	NC_012582	ATG	2	6	1210758	1210763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117485
23480	NC_012582	ATG	2	6	1210816	1210821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117485
23481	NC_012582	GAC	2	6	1210853	1210858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117485
23482	NC_012582	GCGT	2	8	1210944	1210951	0 %	25 %	50 %	25 %	227117485
23483	NC_012582	GCG	2	6	1211049	1211054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117485
23484	NC_012582	CT	3	6	1211066	1211071	0 %	50 %	0 %	50 %	227117485
23485	NC_012582	CG	3	6	1211105	1211110	0 %	0 %	50 %	50 %	227117485
23486	NC_012582	CGG	2	6	1211171	1211176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117485
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23490	NC_012582	GTG	2	6	1211415	1211420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117485
23491	NC_012582	CTG	2	6	1211439	1211444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117485
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23494	NC_012582	GCA	2	6	1211546	1211551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117485
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23500	NC_012582	GCAC	2	8	1211911	1211918	25 %	0 %	25 %	50 %	227117486

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