MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_012582	ACC	2	6	1159063	1159068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117436
22503	NC_012582	CAT	2	6	1159167	1159172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117436
22504	NC_012582	ACG	2	6	1159192	1159197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117436
22505	NC_012582	ATCA	2	8	1159207	1159214	50 %	25 %	0 %	25 %	227117436
22506	NC_012582	GATT	2	8	1159284	1159291	25 %	50 %	25 %	0 %	227117436
22507	NC_012582	CCA	2	6	1159331	1159336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117436
22508	NC_012582	TGG	2	6	1159337	1159342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117436
22509	NC_012582	AGT	2	6	1159443	1159448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22510	NC_012582	A	6	6	1159449	1159454	100 %	0 %	0 %	0 %	227117437
22511	NC_012582	AGT	2	6	1159585	1159590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117437
22512	NC_012582	AGC	2	6	1159617	1159622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117437
22513	NC_012582	GAT	2	6	1159691	1159696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117437
22514	NC_012582	GC	3	6	1159698	1159703	0 %	0 %	50 %	50 %	227117437
22515	NC_012582	GCA	2	6	1159729	1159734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117437
22516	NC_012582	TGCAT	2	10	1159785	1159794	20 %	40 %	20 %	20 %	227117437
22517	NC_012582	CTG	3	9	1159832	1159840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117437
22518	NC_012582	CAT	2	6	1159864	1159869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117437
22519	NC_012582	AAGTGC	2	12	1159911	1159922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227117437
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22521	NC_012582	TGT	2	6	1159997	1160002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117438
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22524	NC_012582	T	6	6	1160161	1160166	0 %	100 %	0 %	0 %	227117438
22525	NC_012582	GCTTG	2	10	1160238	1160247	0 %	40 %	40 %	20 %	227117438
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22532	NC_012582	GC	4	8	1160672	1160679	0 %	0 %	50 %	50 %	227117438
22533	NC_012582	TG	3	6	1160682	1160687	0 %	50 %	50 %	0 %	227117438
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22543	NC_012582	TTGT	2	8	1161129	1161136	0 %	75 %	25 %	0 %	227117438
22544	NC_012582	GAC	2	6	1161162	1161167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117438
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22547	NC_012582	AAT	2	6	1161268	1161273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22548	NC_012582	ATT	2	6	1161307	1161312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22549	NC_012582	TG	3	6	1161343	1161348	0 %	50 %	50 %	0 %	227117439
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22553	NC_012582	TGAC	2	8	1161456	1161463	25 %	25 %	25 %	25 %	227117439
22554	NC_012582	GTGA	2	8	1161473	1161480	25 %	25 %	50 %	0 %	227117439
22555	NC_012582	TGT	2	6	1161579	1161584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22556	NC_012582	TTCT	2	8	1161608	1161615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22557	NC_012582	AGCG	2	8	1161616	1161623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22558	NC_012582	ATT	2	6	1161661	1161666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22559	NC_012582	ATT	2	6	1161675	1161680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22560	NC_012582	GTTT	2	8	1161697	1161704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22561	NC_012582	TTTCT	2	10	1161762	1161771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22562	NC_012582	AATAA	2	10	1161795	1161804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22563	NC_012582	AAT	2	6	1161812	1161817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22564	NC_012582	TGCAG	2	10	1161881	1161890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22565	NC_012582	CAAT	2	8	1161895	1161902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22566	NC_012582	TGGT	2	8	1161916	1161923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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22576	NC_012582	TGG	2	6	1162396	1162401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22589	NC_012582	GGT	2	6	1163244	1163249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22591	NC_012582	CTT	2	6	1163275	1163280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22592	NC_012582	CAA	2	6	1163312	1163317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22593	NC_012582	CGG	2	6	1163320	1163325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22597	NC_012582	CGT	2	6	1163517	1163522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22600	NC_012582	CAT	2	6	1163612	1163617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22601	NC_012582	TGA	2	6	1163675	1163680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22602	NC_012582	CAC	2	6	1163766	1163771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22603	NC_012582	TTC	2	6	1163772	1163777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22604	NC_012582	TAC	2	6	1163820	1163825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22605	NC_012582	TGGC	2	8	1163831	1163838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22606	NC_012582	GCG	3	9	1163848	1163856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22610	NC_012582	GT	3	6	1164130	1164135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22611	NC_012582	A	6	6	1164177	1164182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22617	NC_012582	CTT	2	6	1164334	1164339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22618	NC_012582	ACCA	2	8	1164489	1164496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22619	NC_012582	GGT	2	6	1164516	1164521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22622	NC_012582	GCGG	2	8	1164696	1164703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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22976	NC_012582	TAT	2	6	1183340	1183345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117458
22977	NC_012582	GTT	2	6	1183356	1183361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117458
22978	NC_012582	CGC	2	6	1183409	1183414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117458
22979	NC_012582	ATT	2	6	1183426	1183431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117458
22980	NC_012582	TATT	2	8	1183468	1183475	25 %	75 %	0 %	0 %	227117458
22981	NC_012582	CTA	2	6	1183529	1183534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117458
22982	NC_012582	A	6	6	1183558	1183563	100 %	0 %	0 %	0 %	227117459
22983	NC_012582	GCG	2	6	1183573	1183578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117459
22984	NC_012582	CG	3	6	1183632	1183637	0 %	0 %	50 %	50 %	227117459
22985	NC_012582	TGTT	2	8	1183676	1183683	0 %	75 %	25 %	0 %	227117459
22986	NC_012582	GTC	2	6	1183705	1183710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117459
22987	NC_012582	GTGG	2	8	1183837	1183844	0 %	25 %	75 %	0 %	227117459
22988	NC_012582	CAT	2	6	1183866	1183871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117459
22989	NC_012582	ATG	2	6	1183951	1183956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117459
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22991	NC_012582	TCG	2	6	1184045	1184050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117459
22992	NC_012582	GCG	2	6	1184134	1184139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117459
22993	NC_012582	TG	4	8	1184142	1184149	0 %	50 %	50 %	0 %	227117459
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22995	NC_012582	CTG	2	6	1184224	1184229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117459
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22998	NC_012582	GC	3	6	1184306	1184311	0 %	0 %	50 %	50 %	227117459
22999	NC_012582	CGC	2	6	1184367	1184372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117459
23000	NC_012582	CGG	3	9	1184409	1184417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117459

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