MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_012582	GT	3	6	1081459	1081464	0 %	50 %	50 %	0 %	227117360
21002	NC_012582	ATG	2	6	1081536	1081541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117360
21003	NC_012582	TCA	2	6	1081543	1081548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117360
21004	NC_012582	ACC	2	6	1081662	1081667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117360
21005	NC_012582	TTG	2	6	1081677	1081682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117360
21006	NC_012582	CTT	2	6	1081688	1081693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117360
21007	NC_012582	TTG	2	6	1081791	1081796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117360
21008	NC_012582	TCAA	2	8	1081798	1081805	50 %	25 %	0 %	25 %	227117360
21009	NC_012582	CCG	2	6	1081814	1081819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117360
21010	NC_012582	CATT	2	8	1081865	1081872	25 %	50 %	0 %	25 %	227117360
21011	NC_012582	TCA	2	6	1081980	1081985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117361
21012	NC_012582	TCA	2	6	1082115	1082120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117361
21013	NC_012582	GAT	2	6	1082282	1082287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117361
21014	NC_012582	TG	3	6	1082432	1082437	0 %	50 %	50 %	0 %	227117361
21015	NC_012582	ACA	2	6	1082448	1082453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117361
21016	NC_012582	TTA	2	6	1082490	1082495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117361
21017	NC_012582	ATCAC	2	10	1082523	1082532	40 %	20 %	0 %	40 %	227117361
21018	NC_012582	ATCA	2	8	1082549	1082556	50 %	25 %	0 %	25 %	227117361
21019	NC_012582	T	6	6	1082600	1082605	0 %	100 %	0 %	0 %	227117361
21020	NC_012582	GATT	2	8	1082646	1082653	25 %	50 %	25 %	0 %	227117361
21021	NC_012582	GCG	2	6	1082679	1082684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117361
21022	NC_012582	GAA	2	6	1082712	1082717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117361
21023	NC_012582	GGAA	2	8	1082730	1082737	50 %	0 %	50 %	0 %	227117361
21024	NC_012582	TCA	2	6	1082799	1082804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117361
21025	NC_012582	CAC	3	9	1082815	1082823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117361
21026	NC_012582	TGA	2	6	1082941	1082946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117361
21027	NC_012582	CAT	2	6	1082968	1082973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117361
21028	NC_012582	CATA	2	8	1083004	1083011	50 %	25 %	0 %	25 %	227117361
21029	NC_012582	GCT	2	6	1083083	1083088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21030	NC_012582	CAA	2	6	1083246	1083251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21031	NC_012582	GTT	2	6	1083276	1083281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_012582	T	7	7	1083280	1083286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21033	NC_012582	CAT	2	6	1083288	1083293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21034	NC_012582	ATG	2	6	1083363	1083368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21035	NC_012582	A	7	7	1083430	1083436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21036	NC_012582	TC	3	6	1083438	1083443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21037	NC_012582	CGCTA	2	10	1083532	1083541	20 %	20 %	20 %	40 %	227117362
21038	NC_012582	GCG	2	6	1083548	1083553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117362
21039	NC_012582	CATTC	2	10	1083589	1083598	20 %	40 %	0 %	40 %	227117362
21040	NC_012582	ACT	2	6	1083637	1083642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117362
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21042	NC_012582	TCAA	2	8	1083755	1083762	50 %	25 %	0 %	25 %	227117362
21043	NC_012582	TCTT	2	8	1083767	1083774	0 %	75 %	0 %	25 %	227117362
21044	NC_012582	ATC	2	6	1083794	1083799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117362
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21046	NC_012582	TG	4	8	1084152	1084159	0 %	50 %	50 %	0 %	227117362
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21051	NC_012582	TGC	2	6	1084366	1084371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117362
21052	NC_012582	CGT	2	6	1084403	1084408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117362
21053	NC_012582	GTGG	2	8	1084415	1084422	0 %	25 %	75 %	0 %	227117362
21054	NC_012582	ATGCA	2	10	1084512	1084521	40 %	20 %	20 %	20 %	227117362
21055	NC_012582	GGTTTC	2	12	1084577	1084588	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227117362
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21057	NC_012582	CTT	2	6	1084681	1084686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117362
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21059	NC_012582	GAAACA	2	12	1084751	1084762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	227117362
21060	NC_012582	GGT	2	6	1084817	1084822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117362
21061	NC_012582	ACGTCT	2	12	1084858	1084869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227117362
21062	NC_012582	GAA	2	6	1084909	1084914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117362
21063	NC_012582	TCG	2	6	1084986	1084991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117362
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21066	NC_012582	GAT	2	6	1085202	1085207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117363
21067	NC_012582	AAG	2	6	1085246	1085251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117363
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21070	NC_012582	TCTG	2	8	1085440	1085447	0 %	50 %	25 %	25 %	227117364
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21077	NC_012582	TGCG	2	8	1085779	1085786	0 %	25 %	50 %	25 %	227117364
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21098	NC_012582	CAGT	2	8	1087110	1087117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21099	NC_012582	AT	3	6	1087142	1087147	50 %	50 %	0 %	0 %	227117365
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21114	NC_012582	GA	3	6	1087916	1087921	50 %	0 %	50 %	0 %	227117365
21115	NC_012582	TTG	2	6	1087922	1087927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117365
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21119	NC_012582	CTG	2	6	1088060	1088065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117365
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21122	NC_012582	CTG	2	6	1088186	1088191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117365
21123	NC_012582	GAT	2	6	1088195	1088200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117365
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21130	NC_012582	TGA	3	9	1088347	1088355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117365
21131	NC_012582	TGA	2	6	1088419	1088424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117365
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21220	NC_012582	AAG	2	6	1092199	1092204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117366
21221	NC_012582	ATC	2	6	1092235	1092240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117366
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21223	NC_012582	ACC	2	6	1092312	1092317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117366
21224	NC_012582	TGA	2	6	1092404	1092409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117366
21225	NC_012582	CGTTAT	2	12	1092441	1092452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227117366
21226	NC_012582	A	6	6	1092529	1092534	100 %	0 %	0 %	0 %	227117366
21227	NC_012582	GCA	2	6	1092536	1092541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117366
21228	NC_012582	TGAT	2	8	1092664	1092671	25 %	50 %	25 %	0 %	227117366
21229	NC_012582	CAT	2	6	1092693	1092698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117366
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21231	NC_012582	GCG	3	9	1092798	1092806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117366
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21339	NC_012582	TGT	2	6	1099489	1099494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21342	NC_012582	GTT	2	6	1099593	1099598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117373
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21345	NC_012582	T	6	6	1099679	1099684	0 %	100 %	0 %	0 %	227117373
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21349	NC_012582	TCAC	2	8	1099972	1099979	25 %	25 %	0 %	50 %	227117373
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21464	NC_012582	CAG	2	6	1105416	1105421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117381
21465	NC_012582	A	6	6	1105446	1105451	100 %	0 %	0 %	0 %	227117381
21466	NC_012582	TGC	2	6	1105514	1105519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117381
21467	NC_012582	AAG	2	6	1105552	1105557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117381
21468	NC_012582	GAT	3	9	1105590	1105598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117382
21469	NC_012582	GGC	2	6	1105604	1105609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117382
21470	NC_012582	CGG	2	6	1105636	1105641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117382
21471	NC_012582	T	6	6	1105652	1105657	0 %	100 %	0 %	0 %	227117382
21472	NC_012582	CGT	2	6	1105666	1105671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21473	NC_012582	CTG	2	6	1105718	1105723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21474	NC_012582	T	6	6	1105772	1105777	0 %	100 %	0 %	0 %	227117382
21475	NC_012582	CGT	2	6	1105786	1105791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21476	NC_012582	GCTG	2	8	1105812	1105819	0 %	25 %	50 %	25 %	227117382
21477	NC_012582	CTG	2	6	1105838	1105843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21478	NC_012582	T	6	6	1105892	1105897	0 %	100 %	0 %	0 %	227117382
21479	NC_012582	GCTG	2	8	1105932	1105939	0 %	25 %	50 %	25 %	227117382
21480	NC_012582	CTGCT	2	10	1105958	1105967	0 %	40 %	20 %	40 %	227117382
21481	NC_012582	GGC	3	9	1105991	1105999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117382
21482	NC_012582	T	6	6	1106009	1106014	0 %	100 %	0 %	0 %	227117382
21483	NC_012582	GCTG	2	8	1106049	1106056	0 %	25 %	50 %	25 %	227117382
21484	NC_012582	CTG	2	6	1106075	1106080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21485	NC_012582	TAT	2	6	1106239	1106244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117382
21486	NC_012582	CAC	2	6	1106257	1106262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117382
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21488	NC_012582	GAGCT	2	10	1106345	1106354	20 %	20 %	40 %	20 %	227117382
21489	NC_012582	GCC	2	6	1106379	1106384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117382
21490	NC_012582	TGC	3	9	1106406	1106414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21491	NC_012582	GCG	2	6	1106423	1106428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117382
21492	NC_012582	CCG	2	6	1106434	1106439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117382
21493	NC_012582	CTTG	2	8	1106440	1106447	0 %	50 %	25 %	25 %	227117382
21494	NC_012582	GC	3	6	1106483	1106488	0 %	0 %	50 %	50 %	227117382
21495	NC_012582	T	6	6	1106489	1106494	0 %	100 %	0 %	0 %	227117382
21496	NC_012582	TTGGC	2	10	1106562	1106571	0 %	40 %	40 %	20 %	227117382
21497	NC_012582	TTC	2	6	1106669	1106674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117382
21498	NC_012582	CTG	2	6	1106696	1106701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117382
21499	NC_012582	ACT	2	6	1106768	1106773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117382
21500	NC_012582	CAT	2	6	1106855	1106860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117382

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