MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20004	NC_012582	GC	3	6	1028921	1028926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20005	NC_012582	TGA	2	6	1028934	1028939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20006	NC_012582	TG	3	6	1028963	1028968	0 %	50 %	50 %	0 %	227117308
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20119	NC_012582	ATG	2	6	1035022	1035027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117315
20120	NC_012582	TTA	2	6	1035058	1035063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117315
20121	NC_012582	GACA	2	8	1035114	1035121	50 %	0 %	25 %	25 %	227117315
20122	NC_012582	GTG	2	6	1035122	1035127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117315
20123	NC_012582	C	6	6	1035162	1035167	0 %	0 %	0 %	100 %	227117315
20124	NC_012582	AGTA	2	8	1035202	1035209	50 %	25 %	25 %	0 %	227117315
20125	NC_012582	TAAA	2	8	1035210	1035217	75 %	25 %	0 %	0 %	227117315
20126	NC_012582	ATGG	2	8	1035260	1035267	25 %	25 %	50 %	0 %	227117316
20127	NC_012582	CCA	2	6	1035312	1035317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117316
20128	NC_012582	CAC	2	6	1035344	1035349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117316
20129	NC_012582	AAG	2	6	1035396	1035401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117316
20130	NC_012582	GCCA	2	8	1035416	1035423	25 %	0 %	25 %	50 %	227117316
20131	NC_012582	AAT	2	6	1035476	1035481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117316
20132	NC_012582	AAAT	2	8	1035482	1035489	75 %	25 %	0 %	0 %	227117316
20133	NC_012582	TAG	2	6	1035497	1035502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117316
20134	NC_012582	TTC	2	6	1035527	1035532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117316
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20136	NC_012582	TG	3	6	1035591	1035596	0 %	50 %	50 %	0 %	227117316
20137	NC_012582	GAT	2	6	1035653	1035658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117316
20138	NC_012582	T	6	6	1035715	1035720	0 %	100 %	0 %	0 %	227117316
20139	NC_012582	GAA	2	6	1035737	1035742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117316
20140	NC_012582	CACAG	2	10	1035744	1035753	40 %	0 %	20 %	40 %	227117316
20141	NC_012582	AAG	2	6	1035813	1035818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117316
20142	NC_012582	TGC	2	6	1035836	1035841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117316
20143	NC_012582	GAAC	2	8	1035892	1035899	50 %	0 %	25 %	25 %	227117316
20144	NC_012582	AGG	2	6	1035935	1035940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227117316
20145	NC_012582	CCA	2	6	1035967	1035972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117316
20146	NC_012582	GC	3	6	1036042	1036047	0 %	0 %	50 %	50 %	227117316
20147	NC_012582	CAG	2	6	1036067	1036072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117316
20148	NC_012582	AC	4	8	1036074	1036081	50 %	0 %	0 %	50 %	227117316
20149	NC_012582	CAA	2	6	1036082	1036087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117316
20150	NC_012582	CGC	2	6	1036093	1036098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117316
20151	NC_012582	A	7	7	1036099	1036105	100 %	0 %	0 %	0 %	227117316
20152	NC_012582	GCA	2	6	1036116	1036121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117316
20153	NC_012582	ATG	3	9	1036161	1036169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117316
20154	NC_012582	GCCATG	2	12	1036173	1036184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227117316
20155	NC_012582	CAT	2	6	1036202	1036207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117316
20156	NC_012582	CAC	2	6	1036238	1036243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117316
20157	NC_012582	CTT	2	6	1036362	1036367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117317
20158	NC_012582	CTT	3	9	1036386	1036394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117317
20159	NC_012582	T	6	6	1036393	1036398	0 %	100 %	0 %	0 %	227117317
20160	NC_012582	GCC	4	12	1036453	1036464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117317
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20163	NC_012582	TGG	2	6	1036794	1036799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117317
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20167	NC_012582	CAT	2	6	1037029	1037034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117317
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20171	NC_012582	ATG	2	6	1037114	1037119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117317
20172	NC_012582	GTA	2	6	1037207	1037212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117317
20173	NC_012582	CGG	2	6	1037275	1037280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117317
20174	NC_012582	GTG	2	6	1037294	1037299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117317
20175	NC_012582	AGC	2	6	1037462	1037467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117317
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20177	NC_012582	GACTTC	2	12	1037572	1037583	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227117317
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20188	NC_012582	CAG	2	6	1038154	1038159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117317
20189	NC_012582	GGT	2	6	1038276	1038281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117318
20190	NC_012582	TAG	2	6	1038291	1038296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117318
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20192	NC_012582	CAC	2	6	1038331	1038336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117318
20193	NC_012582	GGCG	2	8	1038403	1038410	0 %	0 %	75 %	25 %	227117318
20194	NC_012582	CCA	2	6	1038425	1038430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117318
20195	NC_012582	CGATT	2	10	1038528	1038537	20 %	40 %	20 %	20 %	227117318
20196	NC_012582	CGG	2	6	1038618	1038623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117318
20197	NC_012582	CGA	3	9	1038662	1038670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117318
20198	NC_012582	CTT	2	6	1038684	1038689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117318
20199	NC_012582	CTT	2	6	1038782	1038787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117319
20200	NC_012582	GTC	2	6	1039011	1039016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117319
20201	NC_012582	AAAG	2	8	1039028	1039035	75 %	0 %	25 %	0 %	227117319
20202	NC_012582	ATC	2	6	1039076	1039081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20203	NC_012582	AGGT	2	8	1039139	1039146	25 %	25 %	50 %	0 %	227117320
20204	NC_012582	GCA	2	6	1039160	1039165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117320
20205	NC_012582	TGC	2	6	1039179	1039184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117320
20206	NC_012582	CCAA	2	8	1039248	1039255	50 %	0 %	0 %	50 %	227117320
20207	NC_012582	AGAGT	2	10	1039295	1039304	40 %	20 %	40 %	0 %	227117320
20208	NC_012582	TTG	2	6	1039373	1039378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117320
20209	NC_012582	TGAG	2	8	1039392	1039399	25 %	25 %	50 %	0 %	227117320
20210	NC_012582	AAT	2	6	1039424	1039429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117320
20211	NC_012582	CT	3	6	1039437	1039442	0 %	50 %	0 %	50 %	227117320
20212	NC_012582	CATC	2	8	1039501	1039508	25 %	25 %	0 %	50 %	227117320
20213	NC_012582	GGC	2	6	1039534	1039539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117320
20214	NC_012582	GCT	2	6	1039699	1039704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117320
20215	NC_012582	TGC	2	6	1039761	1039766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117320
20216	NC_012582	A	6	6	1040016	1040021	100 %	0 %	0 %	0 %	227117320
20217	NC_012582	T	6	6	1040038	1040043	0 %	100 %	0 %	0 %	227117320
20218	NC_012582	CTT	2	6	1040059	1040064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117320
20219	NC_012582	AGC	2	6	1040067	1040072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117320
20220	NC_012582	ACT	2	6	1040160	1040165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117321
20221	NC_012582	CTG	2	6	1040168	1040173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117321
20222	NC_012582	CTT	2	6	1040199	1040204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117321
20223	NC_012582	TCA	2	6	1040249	1040254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117321
20224	NC_012582	TGGC	2	8	1040309	1040316	0 %	25 %	50 %	25 %	227117321
20225	NC_012582	AGCT	2	8	1040317	1040324	25 %	25 %	25 %	25 %	227117321
20226	NC_012582	GTAGAT	2	12	1040538	1040549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117321
20227	NC_012582	TCT	2	6	1040558	1040563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117321
20228	NC_012582	GA	3	6	1040658	1040663	50 %	0 %	50 %	0 %	227117321
20229	NC_012582	TCA	2	6	1040724	1040729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117321
20230	NC_012582	TTA	2	6	1040792	1040797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117321
20231	NC_012582	CAG	2	6	1040970	1040975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117323
20232	NC_012582	TACG	2	8	1040999	1041006	25 %	25 %	25 %	25 %	227117323
20233	NC_012582	TGT	2	6	1041064	1041069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117323
20234	NC_012582	GCA	2	6	1041122	1041127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117323
20235	NC_012582	CCAC	2	8	1041209	1041216	25 %	0 %	0 %	75 %	227117323
20236	NC_012582	CG	3	6	1041288	1041293	0 %	0 %	50 %	50 %	227117323
20237	NC_012582	TCA	2	6	1041332	1041337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117323
20238	NC_012582	CAT	2	6	1041591	1041596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117323
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20267	NC_012582	T	6	6	1043251	1043256	0 %	100 %	0 %	0 %	227117323
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20471	NC_012582	T	6	6	1053333	1053338	0 %	100 %	0 %	0 %	227117332
20472	NC_012582	T	6	6	1053340	1053345	0 %	100 %	0 %	0 %	227117332
20473	NC_012582	TCT	3	9	1053362	1053370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117332
20474	NC_012582	CTT	2	6	1053414	1053419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117332
20475	NC_012582	TTC	2	6	1053421	1053426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117332
20476	NC_012582	TTTG	2	8	1053447	1053454	0 %	75 %	25 %	0 %	227117332
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20479	NC_012582	TCT	2	6	1053560	1053565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117332
20480	NC_012582	GAA	2	6	1053567	1053572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117332
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20482	NC_012582	CAA	2	6	1053709	1053714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20499	NC_012582	GAT	2	6	1054659	1054664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117335
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