MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_012582	AAT	2	6	947505	947510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117229
18503	NC_012582	T	6	6	947603	947608	0 %	100 %	0 %	0 %	227117230
18504	NC_012582	GGGT	2	8	947667	947674	0 %	25 %	75 %	0 %	227117230
18505	NC_012582	TAT	2	6	947751	947756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117230
18506	NC_012582	ATG	2	6	947999	948004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117230
18507	NC_012582	CA	3	6	948072	948077	50 %	0 %	0 %	50 %	227117230
18508	NC_012582	GAA	2	6	948169	948174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117230
18509	NC_012582	A	6	6	948182	948187	100 %	0 %	0 %	0 %	227117230
18510	NC_012582	GGAA	2	8	948266	948273	50 %	0 %	50 %	0 %	227117230
18511	NC_012582	ATT	2	6	948299	948304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117230
18512	NC_012582	AGG	2	6	948318	948323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227117230
18513	NC_012582	A	6	6	948371	948376	100 %	0 %	0 %	0 %	227117230
18514	NC_012582	T	6	6	948410	948415	0 %	100 %	0 %	0 %	227117230
18515	NC_012582	TTTCA	2	10	948451	948460	20 %	60 %	0 %	20 %	227117230
18516	NC_012582	TCAAC	2	10	948478	948487	40 %	20 %	0 %	40 %	227117230
18517	NC_012582	TTA	2	6	948567	948572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117230
18518	NC_012582	TGG	2	6	948597	948602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117230
18519	NC_012582	TAA	2	6	948639	948644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117230
18520	NC_012582	TTTAAT	2	12	948655	948666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117230
18521	NC_012582	GATC	2	8	948675	948682	25 %	25 %	25 %	25 %	227117230
18522	NC_012582	GAAG	2	8	948718	948725	50 %	0 %	50 %	0 %	227117230
18523	NC_012582	TGA	2	6	948768	948773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117231
18524	NC_012582	TTGGT	2	10	948804	948813	0 %	60 %	40 %	0 %	227117231
18525	NC_012582	CTT	2	6	948918	948923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117231
18526	NC_012582	ATG	2	6	948978	948983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117231
18527	NC_012582	CTT	2	6	949151	949156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18528	NC_012582	CTT	2	6	949197	949202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117232
18529	NC_012582	CCAT	2	8	949215	949222	25 %	25 %	0 %	50 %	227117232
18530	NC_012582	CTTTTG	2	12	949231	949242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227117232
18531	NC_012582	GT	4	8	949322	949329	0 %	50 %	50 %	0 %	227117232
18532	NC_012582	A	7	7	949371	949377	100 %	0 %	0 %	0 %	227117232
18533	NC_012582	GCA	2	6	949513	949518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117232
18534	NC_012582	ATCA	2	8	949556	949563	50 %	25 %	0 %	25 %	227117233
18535	NC_012582	GGAT	2	8	949587	949594	25 %	25 %	50 %	0 %	227117233
18536	NC_012582	TTCTT	2	10	949647	949656	0 %	80 %	0 %	20 %	227117233
18537	NC_012582	TTC	2	6	949681	949686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117233
18538	NC_012582	CT	3	6	949694	949699	0 %	50 %	0 %	50 %	227117233
18539	NC_012582	TTTGA	2	10	949709	949718	20 %	60 %	20 %	0 %	227117233
18540	NC_012582	ACT	2	6	949886	949891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117233
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18542	NC_012582	ATT	2	6	949958	949963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117233
18543	NC_012582	GCA	2	6	950027	950032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117233
18544	NC_012582	GTC	2	6	950034	950039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117233
18545	NC_012582	TGC	2	6	950056	950061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117233
18546	NC_012582	TGG	2	6	950080	950085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117233
18547	NC_012582	ATC	3	9	950219	950227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117233
18548	NC_012582	TTGG	2	8	950235	950242	0 %	50 %	50 %	0 %	227117233
18549	NC_012582	GGC	2	6	950275	950280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117233
18550	NC_012582	CTGCG	2	10	950421	950430	0 %	20 %	40 %	40 %	227117233
18551	NC_012582	TAT	2	6	950506	950511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117233
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18553	NC_012582	TTA	2	6	950768	950773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117233
18554	NC_012582	ATT	2	6	950897	950902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117233
18555	NC_012582	TTC	2	6	950918	950923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117233
18556	NC_012582	TGG	3	9	950928	950936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117233
18557	NC_012582	GAT	3	9	950986	950994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117233
18558	NC_012582	TTGG	2	8	951018	951025	0 %	50 %	50 %	0 %	227117233
18559	NC_012582	CTG	2	6	951035	951040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117233
18560	NC_012582	GGCT	2	8	951155	951162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18561	NC_012582	TTTGT	2	10	951163	951172	0 %	80 %	20 %	0 %	227117234
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18564	NC_012582	ACT	2	6	951450	951455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117234
18565	NC_012582	ACC	2	6	951460	951465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117234
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18567	NC_012582	GC	3	6	951542	951547	0 %	0 %	50 %	50 %	227117234
18568	NC_012582	AGC	2	6	951592	951597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117234
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18573	NC_012582	T	6	6	951838	951843	0 %	100 %	0 %	0 %	227117235
18574	NC_012582	TTGA	2	8	951903	951910	25 %	50 %	25 %	0 %	227117235
18575	NC_012582	GACT	2	8	951943	951950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18578	NC_012582	TAT	2	6	952012	952017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18580	NC_012582	CA	3	6	952065	952070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18581	NC_012582	TTC	2	6	952085	952090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18582	NC_012582	CTT	2	6	952192	952197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117236
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18588	NC_012582	CATAGC	2	12	952375	952386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227117236
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18590	NC_012582	CTG	2	6	952409	952414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117236
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18593	NC_012582	T	6	6	952540	952545	0 %	100 %	0 %	0 %	227117236
18594	NC_012582	CAT	2	6	952577	952582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117236
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18596	NC_012582	GC	3	6	952652	952657	0 %	0 %	50 %	50 %	227117236
18597	NC_012582	CAT	2	6	952673	952678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117236
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18601	NC_012582	TTC	2	6	952880	952885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117236
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18606	NC_012582	CTG	2	6	953159	953164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117236
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18609	NC_012582	T	6	6	953294	953299	0 %	100 %	0 %	0 %	227117236
18610	NC_012582	TGC	2	6	953310	953315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117236
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18614	NC_012582	AATCC	2	10	953500	953509	40 %	20 %	0 %	40 %	227117236
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18620	NC_012582	TC	3	6	953711	953716	0 %	50 %	0 %	50 %	227117237
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18622	NC_012582	CAA	2	6	953925	953930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117238
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18740	NC_012582	AGT	2	6	960465	960470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117245
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18742	NC_012582	TCA	2	6	960660	960665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117245
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18745	NC_012582	TCT	2	6	960752	960757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117245
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18762	NC_012582	CTT	2	6	961789	961794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18764	NC_012582	TCAC	2	8	961866	961873	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18847	NC_012582	CTTA	2	8	965895	965902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18848	NC_012582	TTGG	2	8	965930	965937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18851	NC_012582	GTGAG	2	10	966108	966117	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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18867	NC_012582	TGGATG	2	12	967043	967054	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227117254
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18986	NC_012582	CTG	2	6	973919	973924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117263
18987	NC_012582	CTT	2	6	973930	973935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117263
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