MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012582	TCG	3	9	828088	828096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117127
16002	NC_012582	TG	3	6	828226	828231	0 %	50 %	50 %	0 %	227117128
16003	NC_012582	GAT	2	6	828312	828317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117128
16004	NC_012582	A	6	6	828334	828339	100 %	0 %	0 %	0 %	227117128
16005	NC_012582	TGGA	2	8	828363	828370	25 %	25 %	50 %	0 %	227117128
16006	NC_012582	GAG	2	6	828406	828411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_012582	TCAA	2	8	828412	828419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_012582	GCTT	2	8	828426	828433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16009	NC_012582	CTT	2	6	828469	828474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_012582	A	6	6	828478	828483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_012582	T	7	7	828502	828508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_012582	GA	3	6	828658	828663	50 %	0 %	50 %	0 %	227117129
16013	NC_012582	CAA	2	6	828708	828713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117129
16014	NC_012582	CTGG	2	8	828783	828790	0 %	25 %	50 %	25 %	227117129
16015	NC_012582	GCT	2	6	828882	828887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117129
16016	NC_012582	GC	3	6	828906	828911	0 %	0 %	50 %	50 %	227117129
16017	NC_012582	ATC	2	6	828939	828944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117129
16018	NC_012582	GAA	2	6	828957	828962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117129
16019	NC_012582	CGCCA	2	10	828967	828976	20 %	0 %	20 %	60 %	227117129
16020	NC_012582	GCA	2	6	828990	828995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117129
16021	NC_012582	TCA	2	6	829000	829005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117129
16022	NC_012582	CAAAGA	2	12	829043	829054	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	227117129
16023	NC_012582	TGC	2	6	829120	829125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117129
16024	NC_012582	GGT	2	6	829206	829211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117129
16025	NC_012582	ATG	2	6	829233	829238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117129
16026	NC_012582	GGC	2	6	829260	829265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117129
16027	NC_012582	TGC	2	6	829338	829343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117129
16028	NC_012582	CAT	2	6	829385	829390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117129
16029	NC_012582	GCG	2	6	829524	829529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117129
16030	NC_012582	ATG	2	6	829570	829575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117129
16031	NC_012582	CAA	2	6	829587	829592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117129
16032	NC_012582	AGA	2	6	829610	829615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117129
16033	NC_012582	TGC	2	6	829663	829668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117129
16034	NC_012582	CCTT	2	8	829738	829745	0 %	50 %	0 %	50 %	227117129
16035	NC_012582	CAGC	2	8	829813	829820	25 %	0 %	25 %	50 %	227117129
16036	NC_012582	GCA	2	6	829880	829885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117129
16037	NC_012582	TAA	2	6	829929	829934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_012582	GTTC	2	8	829977	829984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16039	NC_012582	GT	3	6	829999	830004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_012582	AGAA	2	8	830104	830111	75 %	0 %	25 %	0 %	227117130
16041	NC_012582	ACC	2	6	830166	830171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117130
16042	NC_012582	T	6	6	830270	830275	0 %	100 %	0 %	0 %	227117130
16043	NC_012582	AGA	2	6	830380	830385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117130
16044	NC_012582	GCC	2	6	830387	830392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117130
16045	NC_012582	TTC	2	6	830486	830491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117130
16046	NC_012582	ATTA	2	8	830537	830544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_012582	TTG	3	9	830629	830637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_012582	T	6	6	830752	830757	0 %	100 %	0 %	0 %	227117131
16049	NC_012582	GAA	2	6	830761	830766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117131
16050	NC_012582	TGA	2	6	830826	830831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117131
16051	NC_012582	CAA	2	6	830853	830858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117131
16052	NC_012582	CGG	2	6	830927	830932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117131
16053	NC_012582	GAT	2	6	830998	831003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117131
16054	NC_012582	CG	3	6	831004	831009	0 %	0 %	50 %	50 %	227117131
16055	NC_012582	GCA	2	6	831069	831074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117131
16056	NC_012582	AGAA	2	8	831149	831156	75 %	0 %	25 %	0 %	227117131
16057	NC_012582	CGT	2	6	831163	831168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117131
16058	NC_012582	GTG	2	6	831181	831186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117131
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16061	NC_012582	GAT	2	6	831327	831332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117131
16062	NC_012582	GGT	2	6	831441	831446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117131
16063	NC_012582	TGC	2	6	831503	831508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117131
16064	NC_012582	AAG	2	6	831622	831627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117131
16065	NC_012582	GTG	2	6	831704	831709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117131
16066	NC_012582	TGG	2	6	831737	831742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117131
16067	NC_012582	CAA	2	6	831877	831882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_012582	TCAAA	2	10	831900	831909	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16069	NC_012582	CAA	2	6	831961	831966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_012582	GTT	2	6	832052	832057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117132
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16075	NC_012582	TGA	2	6	832417	832422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117132
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16082	NC_012582	CCAG	2	8	832715	832722	25 %	0 %	25 %	50 %	227117132
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16086	NC_012582	GCG	2	6	832928	832933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117132
16087	NC_012582	CTG	2	6	832985	832990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117132
16088	NC_012582	TGA	2	6	832992	832997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117132
16089	NC_012582	A	6	6	833063	833068	100 %	0 %	0 %	0 %	227117132
16090	NC_012582	ACCTT	2	10	833204	833213	20 %	40 %	0 %	40 %	227117132
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16093	NC_012582	GC	3	6	833598	833603	0 %	0 %	50 %	50 %	227117133
16094	NC_012582	GGC	2	6	833637	833642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117133
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16098	NC_012582	TGC	2	6	833902	833907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117133
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16101	NC_012582	TTCG	2	8	834004	834011	0 %	50 %	25 %	25 %	227117133
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16105	NC_012582	TG	3	6	834138	834143	0 %	50 %	50 %	0 %	227117133
16106	NC_012582	TAA	2	6	834194	834199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117133
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16108	NC_012582	TCG	2	6	834259	834264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117133
16109	NC_012582	CG	3	6	834296	834301	0 %	0 %	50 %	50 %	227117133
16110	NC_012582	A	7	7	834310	834316	100 %	0 %	0 %	0 %	227117133
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16113	NC_012582	CGG	2	6	834629	834634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117134
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16118	NC_012582	TTGA	2	8	834916	834923	25 %	50 %	25 %	0 %	227117134
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16120	NC_012582	CT	3	6	835048	835053	0 %	50 %	0 %	50 %	227117134
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16122	NC_012582	TG	3	6	835094	835099	0 %	50 %	50 %	0 %	227117134
16123	NC_012582	GCG	2	6	835111	835116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117134
16124	NC_012582	ATT	2	6	835160	835165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117134
16125	NC_012582	GGC	3	9	835225	835233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117134
16126	NC_012582	ATG	2	6	835238	835243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117134
16127	NC_012582	AAC	2	6	835253	835258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117134
16128	NC_012582	AACC	2	8	835268	835275	50 %	0 %	0 %	50 %	227117134
16129	NC_012582	TGA	2	6	835316	835321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117134
16130	NC_012582	ATG	2	6	835393	835398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117134
16131	NC_012582	TGA	2	6	835451	835456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117134
16132	NC_012582	GGC	2	6	835468	835473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117134
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16134	NC_012582	ACT	2	6	835623	835628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117134
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16141	NC_012582	CTA	2	6	835800	835805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117135
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16145	NC_012582	TGC	2	6	836043	836048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117135
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16151	NC_012582	GT	3	6	836345	836350	0 %	50 %	50 %	0 %	227117136
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16173	NC_012582	CAT	2	6	837560	837565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16176	NC_012582	TGT	2	6	837669	837674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117137
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16181	NC_012582	TCGC	2	8	837883	837890	0 %	25 %	25 %	50 %	227117137
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16184	NC_012582	CGG	2	6	838046	838051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117137
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16221	NC_012582	CAAG	2	8	839574	839581	50 %	0 %	25 %	25 %	227117138
16222	NC_012582	TGA	2	6	839795	839800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117138
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16225	NC_012582	CA	3	6	839972	839977	50 %	0 %	0 %	50 %	227117138
16226	NC_012582	GC	3	6	840058	840063	0 %	0 %	50 %	50 %	227117138
16227	NC_012582	GTTTT	2	10	840118	840127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16228	NC_012582	GGTG	2	8	840181	840188	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16229	NC_012582	TA	3	6	840191	840196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16230	NC_012582	AGA	2	6	840240	840245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16231	NC_012582	TTAA	2	8	840285	840292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16232	NC_012582	GCG	2	6	840529	840534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117139
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16234	NC_012582	GAAATC	2	12	840564	840575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227117139
16235	NC_012582	AG	3	6	840620	840625	50 %	0 %	50 %	0 %	227117139
16236	NC_012582	CCAT	2	8	840633	840640	25 %	25 %	0 %	50 %	227117140
16237	NC_012582	GC	3	6	840676	840681	0 %	0 %	50 %	50 %	227117140
16238	NC_012582	TG	3	6	840702	840707	0 %	50 %	50 %	0 %	227117140
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16242	NC_012582	TGC	2	6	840924	840929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117140
16243	NC_012582	TGC	2	6	840945	840950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117140
16244	NC_012582	TCA	2	6	840978	840983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117140
16245	NC_012582	TGC	3	9	840987	840995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117140
16246	NC_012582	TGC	2	6	841065	841070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117140
16247	NC_012582	AAT	2	6	841075	841080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117140
16248	NC_012582	TGCT	2	8	841121	841128	0 %	50 %	25 %	25 %	227117140
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16251	NC_012582	CTG	2	6	841165	841170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117140
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16254	NC_012582	CTA	2	6	841330	841335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117140
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16256	NC_012582	CAAA	2	8	841558	841565	75 %	0 %	0 %	25 %	227117140
16257	NC_012582	CGG	2	6	841570	841575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117140
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16259	NC_012582	CTG	3	9	841601	841609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117140
16260	NC_012582	AAT	2	6	841646	841651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117140
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16262	NC_012582	CACC	2	8	841837	841844	25 %	0 %	0 %	75 %	227117140
16263	NC_012582	CATTT	2	10	841859	841868	20 %	60 %	0 %	20 %	227117140
16264	NC_012582	TAA	2	6	841874	841879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117140
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16267	NC_012582	ATA	2	6	841983	841988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16268	NC_012582	A	6	6	842013	842018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16269	NC_012582	A	6	6	842021	842026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16270	NC_012582	TCCG	2	8	842059	842066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16271	NC_012582	GTT	2	6	842118	842123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16272	NC_012582	TGT	2	6	842132	842137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16273	NC_012582	AAG	2	6	842166	842171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117141
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16280	NC_012582	GCT	2	6	842597	842602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117141
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16300	NC_012582	TAG	2	6	843784	843789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117142
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16320	NC_012582	TGA	2	6	844598	844603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117142
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16339	NC_012582	GA	3	6	845511	845516	50 %	0 %	50 %	0 %	227117143
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16351	NC_012582	A	6	6	845938	845943	100 %	0 %	0 %	0 %	227117143
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16485	NC_012582	GAGT	2	8	852071	852078	25 %	25 %	50 %	0 %	227117147
16486	NC_012582	GTG	2	6	852106	852111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117147
16487	NC_012582	TGT	2	6	852140	852145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117147
16488	NC_012582	GTTGC	2	10	852170	852179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16489	NC_012582	TAA	2	6	852230	852235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16490	NC_012582	GCAA	2	8	852238	852245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16491	NC_012582	TGA	2	6	852271	852276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16492	NC_012582	TTC	2	6	852339	852344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117148
16493	NC_012582	GGC	2	6	852415	852420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117148
16494	NC_012582	GTT	2	6	852436	852441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117148
16495	NC_012582	A	7	7	852493	852499	100 %	0 %	0 %	0 %	227117148
16496	NC_012582	TCAA	2	8	852537	852544	50 %	25 %	0 %	25 %	227117148
16497	NC_012582	ATC	2	6	852570	852575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117148
16498	NC_012582	CTG	2	6	852580	852585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117148
16499	NC_012582	GT	3	6	852666	852671	0 %	50 %	50 %	0 %	227117148
16500	NC_012582	CAG	2	6	852713	852718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117148

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