MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_012582	T	6	6	804516	804521	0 %	100 %	0 %	0 %	227117099
15503	NC_012582	T	6	6	804553	804558	0 %	100 %	0 %	0 %	227117099
15504	NC_012582	GAA	2	6	804660	804665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117099
15505	NC_012582	ATC	2	6	804771	804776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117099
15506	NC_012582	GATT	2	8	804781	804788	25 %	50 %	25 %	0 %	227117099
15507	NC_012582	CGGTG	2	10	804836	804845	0 %	20 %	60 %	20 %	227117099
15508	NC_012582	CATC	2	8	804887	804894	25 %	25 %	0 %	50 %	227117099
15509	NC_012582	CAA	2	6	804950	804955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117099
15510	NC_012582	TAA	2	6	805046	805051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117099
15511	NC_012582	TAT	2	6	805118	805123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117100
15512	NC_012582	GCC	2	6	805126	805131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117100
15513	NC_012582	AAT	2	6	805142	805147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227117100
15514	NC_012582	CAG	2	6	805157	805162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117100
15515	NC_012582	TGG	2	6	805323	805328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117100
15516	NC_012582	AGGTG	2	10	805345	805354	20 %	20 %	60 %	0 %	227117100
15517	NC_012582	ATC	2	6	805377	805382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117100
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15519	NC_012582	GCC	2	6	805407	805412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117100
15520	NC_012582	GTG	2	6	805469	805474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117100
15521	NC_012582	GAT	2	6	805517	805522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117100
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15523	NC_012582	TGCG	2	8	805539	805546	0 %	25 %	50 %	25 %	227117100
15524	NC_012582	GCG	3	9	805544	805552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117100
15525	NC_012582	CGGG	2	8	805602	805609	0 %	0 %	75 %	25 %	227117100
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15533	NC_012582	GGC	2	6	806021	806026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117101
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15541	NC_012582	ATC	2	6	806210	806215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117101
15542	NC_012582	GGAT	2	8	806379	806386	25 %	25 %	50 %	0 %	227117101
15543	NC_012582	GAT	2	6	806417	806422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117101
15544	NC_012582	TGA	2	6	806460	806465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117101
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15549	NC_012582	GCG	2	6	806657	806662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_012582	AGC	2	6	806684	806689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15552	NC_012582	TAG	2	6	806718	806723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117102
15553	NC_012582	G	7	7	806753	806759	0 %	0 %	100 %	0 %	227117102
15554	NC_012582	CGTA	2	8	806760	806767	25 %	25 %	25 %	25 %	227117102
15555	NC_012582	AG	3	6	806790	806795	50 %	0 %	50 %	0 %	227117102
15556	NC_012582	ACT	2	6	806828	806833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117102
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15565	NC_012582	CAC	2	6	807220	807225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117102
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15569	NC_012582	GCG	2	6	807533	807538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_012582	GAT	2	6	807552	807557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117103
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15583	NC_012582	CTGC	2	8	808315	808322	0 %	25 %	25 %	50 %	227117104
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15589	NC_012582	TGA	2	6	808710	808715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15591	NC_012582	TAT	2	6	808753	808758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_012582	ACC	2	6	808764	808769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15601	NC_012582	GA	3	6	809157	809162	50 %	0 %	50 %	0 %	227117105
15602	NC_012582	AGA	2	6	809277	809282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117105
15603	NC_012582	AAC	2	6	809284	809289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227117105
15604	NC_012582	GAAGTT	2	12	809317	809328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117105
15605	NC_012582	CAG	2	6	809355	809360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227117105
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15608	NC_012582	A	6	6	809504	809509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_012582	AATT	2	8	809512	809519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_012582	A	6	6	809535	809540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_012582	AGT	2	6	809562	809567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_012582	ATG	2	6	809579	809584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_012582	TGA	2	6	809601	809606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15621	NC_012582	AGA	2	6	810283	810288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227117106
15622	NC_012582	TGG	2	6	810331	810336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117106
15623	NC_012582	TGG	2	6	810406	810411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117106
15624	NC_012582	CCT	2	6	810420	810425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227117106
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15629	NC_012582	AATTA	2	10	810825	810834	60 %	40 %	0 %	0 %	227117107
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15633	NC_012582	TTG	2	6	810928	810933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15635	NC_012582	AAGG	2	8	811098	811105	50 %	0 %	50 %	0 %	227117108
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15744	NC_012582	ACC	2	6	815845	815850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117113
15745	NC_012582	GCG	2	6	815872	815877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117113
15746	NC_012582	T	6	6	815914	815919	0 %	100 %	0 %	0 %	227117113
15747	NC_012582	ATCTTC	2	12	815932	815943	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227117113
15748	NC_012582	TGG	2	6	815963	815968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227117113
15749	NC_012582	CTT	2	6	816087	816092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227117113
15750	NC_012582	GCGAT	2	10	816101	816110	20 %	20 %	40 %	20 %	227117113
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15754	NC_012582	CTG	2	6	816297	816302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117114
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15782	NC_012582	CCA	2	6	817483	817488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227117115
15783	NC_012582	ACA	2	6	817586	817591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15784	NC_012582	ATC	2	6	817680	817685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227117116
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15851	NC_012582	A	8	8	820899	820906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15852	NC_012582	ATT	2	6	820952	820957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227117119
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15860	NC_012582	TTTG	2	8	821273	821280	0 %	75 %	25 %	0 %	227117119
15861	NC_012582	GTT	2	6	821346	821351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227117119
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15864	NC_012582	GAT	2	6	821508	821513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117119
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15883	NC_012582	CTG	2	6	822388	822393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117120
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15984	NC_012582	TGA	2	6	827269	827274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117126
15985	NC_012582	CT	3	6	827281	827286	0 %	50 %	0 %	50 %	227117126
15986	NC_012582	CCG	2	6	827312	827317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227117126
15987	NC_012582	GGC	2	6	827320	827325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227117126
15988	NC_012582	TGC	2	6	827329	827334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227117126
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15992	NC_012582	TGA	2	6	827587	827592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117126
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16000	NC_012582	TGA	2	6	827996	828001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227117127

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